Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.41 0.0 1.03 0.0 1.63 1.59 0.0 0.0 0.25 0.54 0.04 5.18 0.03 0.2 0.06 0.15 0.08 0.07 0.02
2.44 2.29 2.0 0.22 5.11 16.83 1.44 1.58 1.24 0.0 1.93 13.45 0.52 2.24 2.25 1.55 3.06 2.11 2.64
0.62 0.52 0.54 0.63 1.01 1.52 0.81 0.57 0.92 0.0 0.74 7.18 0.97 0.0 0.62 0.84 0.77 0.69 0.29
0.31 0.0 0.2 0.07 0.24 0.07 0.04 0.24 0.0 0.15 0.51 3.22 0.12 0.31 0.43 0.64 0.7 0.57 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.89 0.0 0.19 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0
0.74 1.1 0.25 0.16 0.4 0.51 0.19 0.6 0.16 0.21 0.69 3.04 0.03 1.89 0.78 1.9 1.41 1.13 0.54
0.0 0.14 0.13 0.13 0.81 0.28 0.0 0.14 0.0 0.57 0.69 6.38 0.44 1.12 1.22 0.8 1.09 1.07 1.28
0.07 0.03 0.0 0.08 0.06 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 2.11 0.07 0.01 0.0 0.02 0.57 0.31 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 1.26 0.63 0.01 4.38 0.59 0.97 0.0 1.71 0.79 2.31 0.06
0.96 1.41 1.94 1.53 1.78 2.93 6.19 3.54 9.77 1.77 5.42 6.27 6.02 9.59 9.87 8.64 5.36 7.34 6.75
7.22 6.36 0.0 6.11 18.89 14.94 5.38 8.56 7.76 9.6 8.62 18.94 3.18 10.95 14.79 19.05 15.71 21.25 10.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.32 0.0 0.69 0.76 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12 0.05 0.01 0.9 0.28 0.05 0.02 0.24 0.19 0.11 0.12
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.08 0.14 0.28 0.13 0.35 0.6 0.42 0.23
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.55 0.01 3.02 0.0 0.13 0.05 0.2 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 1.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 1.87 0.0 0.16 0.35 0.04 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.99 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.48 0.44 0.62 1.84 1.56 3.82 0.49 2.14 1.14 2.08 3.98 11.27 3.07 3.67 3.85 5.89 6.86 4.65 5.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.2 0.0 0.0 0.8 0.0 0.06 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0
0.0 0.0 0.52 0.0 0.41 0.15 0.0 0.1 0.14 0.0 0.16 4.35 0.0 0.86 0.57 0.28 0.39 1.66 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.07 0.0 0.03 0.32 0.04 0.05 0.08 0.1 0.14 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.47 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 1.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 1.39 0.0 0.43 2.02 1.3 1.05 1.22 0.39 0.41 2.32 3.96 0.76 2.33 1.98 4.96 2.64 2.6 1.16
0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 1.29 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 3.33 0.0 0.05 0.15 0.36 0.07 0.3 0.42
0.13 0.0 0.0 0.1 0.13 0.27 0.0 0.09 0.39 0.0 0.03 1.52 0.09 0.25 0.02 0.71 0.34 0.52 0.02
0.29 0.52 0.0 0.0 0.0 0.12 0.17 0.71 0.22 1.42 0.21 7.88 0.04 0.03 0.56 0.79 0.75 0.17 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 2.07 0.64 0.0 0.09 0.17 0.04 0.25 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.95 1.42 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.24 0.0 0.26 17.54 3.11 0.32 0.13 0.82 0.32 0.73 1.49
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.16 0.03 0.06 0.0 0.18 0.09 0.31 0.01 0.23 0.15 0.81 0.65 0.11 0.1
0.49 0.34 0.21 0.65 0.2 0.32 0.07 0.06 0.38 0.77 0.8 7.45 2.83 2.04 1.64 7.31 0.0 0.14 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.78 0.07 0.52 0.67 0.9 0.36 0.67 0.05
0.59 0.71 0.49 0.99 0.29 0.88 0.6 0.17 0.61 1.85 1.65 18.03 2.41 1.59 3.32 4.36 5.44 5.73 4.9
0.0 0.0 0.74 1.07 0.0 0.0 0.34 0.59 0.82 2.81 0.17 3.73 0.0 1.62 1.14 4.19 4.15 0.41 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 1.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.27 0.49 0.01 0.22 0.1 0.29 0.21 0.19 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.03 0.1 0.04 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.04 0.32 0.01 0.1 0.15 0.26 0.15 0.12 0.03
0.0 0.0 0.08 0.1 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.02 1.29 0.01 0.06 0.37 0.81 0.22 0.38 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.85 0.41 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.31 0.0 0.14 4.3 0.07 0.29 0.63 1.26 0.93 1.05 1.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.3 2.04 0.0 1.32 1.5 0.41 0.91 1.94 1.96 1.21 1.67 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.3 0.18 0.0 0.07 0.0 2.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02
0.0 0.34 0.0 0.0 0.93 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.22 6.8 0.09 0.29 0.0 0.95 0.83 0.71 0.17
0.0 0.76 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.97 19.37 1.5 3.66 2.15 8.15 5.57 2.63 7.5
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.08 1.12 0.0 0.16 0.25 0.46 0.34 0.12 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.06
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.07 0.26 0.09 0.23 0.3 0.43 1.31 0.0 0.24 0.48 0.19 0.05 0.18 0.41
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.86 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.21 0.35 0.0 0.2 0.13 2.54 0.06 0.29 0.35 1.12 0.19 0.68 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0
0.16 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.08 0.08 1.21 0.69 0.03 3.02 0.2 0.14 0.16 0.29 0.09 0.31 0.06
0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.83 0.0 1.73 11.45 0.73 1.31 0.35 2.51 2.48 2.6 1.45
0.62 0.52 0.82 0.63 1.75 1.52 0.81 0.57 0.92 0.0 1.62 7.18 1.07 3.16 1.62 2.22 2.03 1.8 2.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.78 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22 0.0 0.06 0.0 0.28 0.0 0.27 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.23 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 1.6 0.0 0.23 0.12 0.04 0.0 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.3 0.0 0.07 0.02 0.3 0.07 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.26 3.53 0.18 0.39 0.75 1.51 0.79 1.3 1.07
0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 1.36 0.0 0.02 0.04 0.15 0.1 0.37 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.16 3.89 0.2 0.38 0.78 1.32 1.26 0.77 0.46
2.8 2.1 4.11 1.94 1.31 3.68 1.82 1.61 0.46 0.91 9.52 22.69 3.91 5.98 10.78 9.59 12.84 8.39 16.57
0.39 0.0 0.64 0.0 0.0 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 2.13 0.0 0.11 0.0 0.05 0.41 0.05 0.28
0.0 0.07 0.27 0.11 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.09 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)