Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.08 0.0 0.2 0.0 0.32 0.31 0.0 0.0 0.05 0.1 0.01 1.0 0.01 0.04 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0
0.15 0.14 0.12 0.01 0.3 1.0 0.09 0.09 0.07 0.0 0.11 0.8 0.03 0.13 0.13 0.09 0.18 0.13 0.16
0.09 0.07 0.07 0.09 0.14 0.21 0.11 0.08 0.13 0.0 0.1 1.0 0.14 0.0 0.09 0.12 0.11 0.1 0.04
0.1 0.0 0.06 0.02 0.07 0.02 0.01 0.08 0.0 0.05 0.16 1.0 0.04 0.1 0.13 0.2 0.22 0.18 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 1.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0
0.24 0.36 0.08 0.05 0.13 0.17 0.06 0.2 0.05 0.07 0.23 1.0 0.01 0.62 0.25 0.62 0.46 0.37 0.18
0.0 0.02 0.02 0.02 0.13 0.04 0.0 0.02 0.0 0.09 0.11 1.0 0.07 0.17 0.19 0.13 0.17 0.17 0.2
0.03 0.02 0.0 0.04 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.27 0.15 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.29 0.14 0.0 1.0 0.13 0.22 0.0 0.39 0.18 0.53 0.01
0.1 0.14 0.2 0.16 0.18 0.3 0.63 0.36 0.99 0.18 0.55 0.64 0.61 0.97 1.0 0.88 0.54 0.74 0.68
0.34 0.3 0.0 0.29 0.89 0.7 0.25 0.4 0.37 0.45 0.41 0.89 0.15 0.52 0.7 0.9 0.74 1.0 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.41 0.0 0.9 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.13 0.05 0.02 1.0 0.31 0.05 0.02 0.27 0.21 0.12 0.14
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.13 0.26 0.12 0.32 0.56 0.39 0.21
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.18 0.0 1.0 0.0 0.04 0.02 0.07 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 1.0 0.0 0.09 0.19 0.02 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.04 0.06 0.16 0.14 0.34 0.04 0.19 0.1 0.18 0.35 1.0 0.27 0.33 0.34 0.52 0.61 0.41 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.24 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.09 0.04 0.0 0.02 0.03 0.0 0.04 1.0 0.0 0.2 0.13 0.06 0.09 0.38 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.21 0.0 0.11 1.0 0.13 0.17 0.25 0.33 0.44 0.0 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.28 0.0 0.09 0.41 0.26 0.21 0.24 0.08 0.08 0.47 0.8 0.15 0.47 0.4 1.0 0.53 0.52 0.23
0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.0 0.02 0.04 0.11 0.02 0.09 0.12
0.08 0.0 0.0 0.06 0.09 0.18 0.0 0.06 0.26 0.0 0.02 1.0 0.06 0.16 0.01 0.47 0.22 0.34 0.01
0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.09 0.03 0.18 0.03 1.0 0.01 0.0 0.07 0.1 0.1 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.0 0.04 0.08 0.02 0.12 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.18 0.02 0.01 0.05 0.02 0.04 0.08
0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.2 0.04 0.07 0.0 0.22 0.11 0.39 0.02 0.29 0.18 1.0 0.8 0.13 0.12
0.07 0.05 0.03 0.09 0.03 0.04 0.01 0.01 0.05 0.1 0.11 1.0 0.38 0.27 0.22 0.98 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.86 0.08 0.58 0.74 1.0 0.4 0.75 0.05
0.03 0.04 0.03 0.05 0.02 0.05 0.03 0.01 0.03 0.1 0.09 1.0 0.13 0.09 0.18 0.24 0.3 0.32 0.27
0.0 0.0 0.18 0.26 0.0 0.0 0.08 0.14 0.2 0.67 0.04 0.89 0.0 0.39 0.27 1.0 0.99 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.55 1.0 0.01 0.46 0.2 0.58 0.42 0.39 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.05 0.18 0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.14 1.0 0.04 0.32 0.46 0.81 0.47 0.37 0.08
0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.02 1.0 0.0 0.05 0.29 0.63 0.17 0.3 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.38 0.08 0.04
0.0 0.2 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.03 1.0 0.02 0.07 0.15 0.29 0.22 0.24 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.15 1.0 0.0 0.65 0.74 0.2 0.45 0.95 0.96 0.59 0.82 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 0.09 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01
0.0 0.05 0.0 0.0 0.14 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.01 0.04 0.0 0.14 0.12 0.1 0.03
0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 1.0 0.08 0.19 0.11 0.42 0.29 0.14 0.39
0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.07 1.0 0.0 0.14 0.23 0.41 0.31 0.11 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.06
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.06 0.2 0.07 0.18 0.23 0.33 1.0 0.0 0.19 0.36 0.15 0.04 0.14 0.31
0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.34 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.08 0.14 0.0 0.08 0.05 1.0 0.02 0.11 0.14 0.44 0.07 0.27 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 0.4 0.23 0.01 1.0 0.06 0.05 0.05 0.1 0.03 0.1 0.02
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.15 1.0 0.06 0.11 0.03 0.22 0.22 0.23 0.13
0.09 0.07 0.11 0.09 0.24 0.21 0.11 0.08 0.13 0.0 0.23 1.0 0.15 0.44 0.23 0.31 0.28 0.25 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 1.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 1.0 0.0 0.29 0.0 0.6 0.0 0.0 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.0 0.23 0.0 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 1.0 0.0 0.14 0.07 0.02 0.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.24 1.0 0.0 0.24 0.05 1.0 0.22 0.08 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 1.0 0.05 0.11 0.21 0.43 0.23 0.37 0.3
0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 1.0 0.0 0.01 0.03 0.11 0.07 0.27 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 1.0 0.05 0.1 0.2 0.34 0.32 0.2 0.12
0.12 0.09 0.18 0.09 0.06 0.16 0.08 0.07 0.02 0.04 0.42 1.0 0.17 0.26 0.48 0.42 0.57 0.37 0.73
0.18 0.0 0.3 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.19 0.02 0.13
0.0 0.07 0.25 0.1 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)