Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
-6.72 -9.86 - 4.35 - - 4.68 - -1.0 - -1.33 - - -7.86 - - - - -3.27 -7.71 - - - -5.9 -5.94 -7.12 -4.97 -5.49 -0.63 - - - -9.01 -7.27 - -6.59 -5.63 -8.11 -9.35 -3.98 - -5.61 - - - - - -
- -5.79 2.4 3.89 3.26 2.6 3.45 -2.86 -4.04 -5.52 -1.98 - - - - - - - -2.83 -6.71 - - - -8.45 - -6.01 - - -3.68 - - - - - - - - -2.01 - -1.74 - - - - - - - -
- -3.06 2.64 3.31 3.14 1.82 3.91 -1.79 -1.76 -2.11 -4.08 -2.92 -4.89 -4.76 - - - - -1.06 -4.7 - -4.47 - -3.78 - -4.52 - -3.92 -0.16 -4.25 -4.47 - -5.3 -6.03 0.46 - - -2.4 -6.8 - - - - - - - - -
- -6.78 1.36 4.14 -0.08 - 3.98 - 1.95 - 2.53 - -4.94 - - - - - -4.48 -5.82 - - - -9.76 - - - - 0.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -12.45 -0.78 4.89 -1.4 -6.73 4.1 -10.08 -5.75 -8.35 -2.98 - - - -11.52 -13.5 - - -4.73 -11.24 - - - -13.89 - - - -11.47 - -9.2 - -14.59 - -14.58 -17.09 -11.58 - -16.94 -15.42 - - - - - - - - -12.72
- - - 4.17 2.11 - 4.44 - - - - - - - - - - - 1.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.39 - - 4.61 - 0.01 - -0.71 - - - - - - - - - - - - -6.83 - - - - 0.14 - - - -5.99 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.89 3.48 0.99 - 4.48 - - - -0.69 - - - - - - - 1.16 - - - - - - - - - - - - -2.3 - 0.37 - - - - - - - 2.67 - - - - - -
- -5.0 -3.35 4.38 -2.61 -4.53 4.45 - -3.5 - -1.87 - - -4.53 - -4.17 - - -5.77 -2.47 - 0.18 1.33 -9.66 -4.41 - - - - - - -1.08 - -3.4 -4.7 - - -3.42 -6.76 - - - - - - - -6.91 -
-5.47 -5.71 -1.71 4.62 -1.07 -1.12 4.43 - - - -3.38 - - - - -6.67 - - -1.03 -7.45 - - - - - - - - - - -6.03 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -5.78 -2.24 4.86 -2.38 -4.61 4.05 - -5.88 -6.98 -2.96 - -6.25 -6.5 - - - - -4.87 -4.71 -3.28 - -5.57 -11.06 - - -6.42 - 0.69 - - -7.24 - - - - - -9.9 -7.94 - - - - - - - - -
- -5.02 2.2 4.37 1.38 -1.24 4.16 - -2.58 -4.23 -1.57 -6.54 - -7.37 -5.05 - -6.32 - -1.73 -5.59 - - - -4.79 - -6.62 - - -0.38 - -5.62 - - - -7.23 - - -5.75 - - - - - -5.45 - - - -
- -2.8 1.29 3.03 1.75 -0.46 3.73 - - -1.0 - - 4.12 - - - - - -1.01 -2.36 - - - - - - - - - - -3.43 -2.62 - - -2.38 - - - - - - - - -0.31 - - - -
-3.78 -8.05 0.25 4.58 -1.18 -3.56 4.4 - -2.03 -4.63 -2.01 -3.27 - - - - - - -1.74 -7.32 - - - - - - - - -2.82 - -6.66 - -6.34 -5.52 - - - -5.82 -6.1 - - - - -3.61 - - - -
- -0.88 3.43 4.61 - - 1.61 - - - - - 2.31 - - - - - -0.37 -1.71 - - - -3.94 - - - - 0.23 0.77 - - - - - - - -2.12 - - - - - - - - - -
- - -0.76 2.08 - -0.04 0.8 - -0.94 1.56 -0.61 - 4.94 - - - - - 2.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -9.25 2.29 4.31 2.08 -0.66 3.95 -5.71 -4.71 -3.23 -3.29 -7.23 1.02 - -5.88 - - - -0.58 -7.8 - -7.39 - - - - - - -5.22 - - - - - -10.12 - - - - - - - - - - - - -
1.03 - 3.49 3.01 3.32 0.27 3.04 - - - - -1.63 - - - - - - -0.48 -6.12 - - - -3.72 -3.01 -3.03 -0.3 -1.48 0.36 - - - -5.01 - - -2.6 1.27 -6.41 -0.3 - - - - - - - - -
- - - 2.83 - - 4.53 - 2.99 - 2.93 - - -2.51 - - - - - - - - - - - - - - 0.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-7.22 -6.43 0.01 4.6 -0.73 - 4.37 - - -6.78 -2.18 - - - -4.37 -6.36 - - -0.01 -7.01 - - - -5.67 - -5.23 -4.57 - -2.97 -7.19 - -6.44 - - - - - -6.82 - - - - - - -5.35 - - -
-9.1 -7.99 -1.16 4.89 -1.94 -4.53 4.13 - -6.92 - -3.52 - -5.81 -7.17 - - - - -6.79 -9.29 - - - -11.21 -7.11 - - - -8.15 - - - - - - - - -8.7 - - - - - - - - - -
-4.96 -3.18 -0.61 4.54 0.87 - 4.2 - - -2.08 - - - - - - - - 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.49 -7.09 - -1.14 -1.42 2.06 1.88 2.74 3.27 0.67 2.77 - 3.29 - 0.74 - - -3.61 0.26 -4.58 - - - -2.66 - -5.2 - - -1.26 - -3.36 - -5.57 - -5.0 - -3.36 -6.42 -3.14 - - - - - - - -3.46 -
-2.66 -4.44 -1.59 4.24 -0.91 -0.91 4.32 -2.62 -2.3 -2.61 - - - -1.35 -1.0 -1.75 - -2.27 -2.34 -2.87 - -0.89 0.27 -3.06 -1.79 -5.1 -0.36 - -0.34 -3.67 -4.35 -2.35 - -3.67 -3.55 - - -2.65 -2.62 - - - -1.86 -1.22 - - -5.17 -
- - - 1.02 - - - 1.82 3.88 1.61 2.58 - 3.89 - 1.1 - - - -0.56 - - - - - - - - - -0.36 - - -2.16 - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.82 -4.12 2.83 -2.43 1.76 -1.55 - -1.19 -1.61 - - -3.24 4.69 - -1.38 - - - -2.47 -6.02 - - - - - - - -2.32 -1.88 -4.16 -3.9 -1.57 -3.25 -2.78 -6.37 - - -6.8 - - - 0.55 - - 2.8 - - -
-4.74 -6.19 -0.51 3.97 0.2 -1.53 4.27 -1.88 1.45 -4.19 0.46 -2.59 1.68 - - - - - -0.78 -8.74 - - - -6.37 - - - - 1.14 - - - -7.12 -4.93 -6.48 - - -7.01 - - - - -5.2 - - - - -
- -6.06 2.37 4.16 0.85 - 4.45 - -3.45 -5.71 -2.15 - -3.34 - - - - - -2.85 -4.38 - - - - -4.34 -6.11 - - -2.03 -3.28 - - - -5.18 -5.45 - - -5.47 -6.64 - - - - - -2.98 - - -
- -3.9 2.76 3.33 3.1 1.95 3.58 -0.42 -3.6 - -1.56 - - -2.81 -0.2 - - - - -6.31 - - - -3.59 - -5.36 - - 1.34 - - - -3.12 - - - - -5.22 -3.54 - - -1.27 -0.61 -2.6 -2.18 - -8.14 -2.82
- - 2.56 3.65 3.31 1.15 3.54 - -0.2 - 0.03 1.16 - - - - - - -0.17 -3.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.56 - - - - - - -
- - -1.45 4.42 -0.82 - 4.66 - - - - - - -4.72 - - - - -1.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.77 - - - - - - - - - -
- -4.57 - 4.63 - - 4.51 - -2.1 - - - - - - - - - - -6.39 - - - - - - - - -4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.01
- -4.92 1.63 4.25 0.71 1.01 4.0 -2.27 -3.24 - -3.17 - 1.9 - - - - - -1.63 -4.14 -4.69 - - -2.37 - -3.32 - - 0.43 - -4.46 - -6.62 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.35 -4.16 2.55 3.58 2.57 1.86 4.03 - -0.49 - -2.21 - - - - - - - -0.15 - - - - -3.23 - -1.89 - -2.0 -0.84 - -4.73 -3.54 - - - - -2.01 - -4.74 - - - - - - - - -
-0.13 -3.51 -0.98 4.52 -3.69 - 4.28 - -1.56 - -3.28 - - -4.93 - - - - -1.04 -4.83 -1.77 -3.66 - -4.36 - - - - 0.7 - - - - - - -3.23 -0.15 -5.36 -6.87 - - - - - - - - -
- -7.93 1.49 4.64 1.02 -4.94 3.94 -6.18 - -4.01 -2.44 - - - - -6.68 - - 1.31 -6.19 - - - - - - - - -4.26 - - - -7.5 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.23 4.27 2.14 -3.27 3.61 - - -4.97 -1.67 - -0.75 -3.93 - - - - -0.23 - - - - -6.72 -4.78 -6.61 - - -0.81 -6.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.65 4.51 1.44 -5.38 4.14 - -3.33 -5.34 -4.04 - -1.37 - - -6.01 - - 0.06 -7.03 - - - - - - - - - - - - -6.83 - - - - - - - - - - - - - - -
-1.52 -4.94 2.6 3.82 2.77 0.97 3.99 - -2.0 -2.01 - - - - - - - - 0.19 -4.09 - - - - - - -1.54 - -1.45 - - - - - - -1.39 - -6.02 - - - - - - - - - -
-5.47 - -3.69 -2.15 -2.97 2.41 1.69 2.76 3.29 0.96 2.57 - 3.55 - -0.56 - - - 0.44 -5.72 - - -3.57 -5.86 - - - - -4.8 - - - -4.9 - -7.56 -3.65 -2.53 - -3.2 -3.6 - - - - - - -2.5 -
- - - 4.85 2.08 - 3.82 - - - - - - - - - - - -1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.96
- -5.46 - 4.32 - - 4.71 -3.48 -0.17 - -0.5 - - - - - - - - -6.26 - - - -8.02 - - - -16.42 -2.77 - -25.52 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.17 -5.01 0.41 4.03 -0.04 0.83 3.91 - - -2.99 -1.69 - - -2.1 1.54 -0.4 -0.14 0.22 - -4.67 - - -1.58 -1.51 - -0.23 -0.19 - -0.99 -3.5 -3.09 -1.19 -1.91 -2.76 -5.63 - -1.82 -2.06 -2.4 - - - -1.56 - - - - -2.78
- - - - - - - 2.94 5.16 - 2.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.98 1.5 3.75 2.08 0.29 4.32 0.74 0.99 -3.64 -1.48 - - - - - - - -2.15 -5.43 - - - -5.84 - - - - -0.66 - -4.36 -3.56 - -3.91 - - -2.08 -4.44 -5.52 - - - -0.83 - - - - -
- - -0.64 4.61 1.29 -1.04 4.31 - - - - - - - - - - - -2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -2.87 2.16 3.59 1.54 -1.07 4.42 - -2.96 - - - -3.44 -4.06 - - - - 0.47 -3.94 - - - - - -4.73 - - -0.31 - -2.98 -4.78 - - - -2.58 - - -6.34 -2.55 - - - - - - 1.79 -
- - - 4.58 - - 4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.7 1.22 -0.52 3.84 1.88 - 4.43 - - - - - - - - - - - -0.56 -1.75 - - - 0.05 - - - -0.2 - - 0.42 - - - - - - -0.17 - - - - - - - - - -
- -5.73 -0.36 4.33 - - 4.59 - - -3.81 -1.51 - -1.32 -4.5 - - - - -2.28 - - - - -7.98 - - 0.47 - -2.89 - - - - - - - - -2.91 - - - - - -1.8 - - - -
2.14 -3.01 0.35 3.78 -0.04 -0.96 3.82 - -0.41 -5.14 -1.6 -4.14 -2.67 -0.26 -1.49 -4.47 -2.09 - -3.1 -3.33 - -3.51 -3.49 -1.17 - -0.86 -1.43 -2.44 -2.85 -1.76 -6.08 - -1.18 -4.43 -3.15 -1.55 0.33 -0.36 0.03 1.53 - -0.56 -3.49 - - - - -4.56
- - -2.38 -3.5 - 1.89 1.5 2.97 2.21 0.93 2.4 - 4.21 - -0.54 - - - 1.02 -4.98 - - - -5.67 - - - - -5.54 - - - -3.44 - -7.44 - - -9.34 -7.18 - - - - - - - -2.83 -
- -6.53 -1.95 4.73 -1.36 -2.98 4.34 - -3.68 - -2.13 - - -7.93 - - - - -6.03 -8.6 - -6.33 -5.91 -10.4 - - - - -7.24 -7.75 - -6.79 -7.12 -7.66 - - - -8.05 -8.62 - - - - - - - - -
- -4.67 1.54 4.42 1.41 - 4.31 - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -6.25 - - - - - - - - - -
0.21 -2.13 2.23 3.35 1.79 - 4.34 -0.62 - - - 0.94 - -0.52 - - - - - - - - -0.39 - - - - - -0.79 - - - - 0.69 - - - -1.97 -3.67 - - 0.63 - - - - - -
-1.29 -0.6 -1.48 4.32 -2.09 - 4.48 - -4.33 - -3.78 - - -3.53 -2.34 -4.43 -3.02 -5.19 -3.63 -1.16 -3.97 -3.17 -3.12 -3.51 - -2.52 -4.73 -3.03 -1.91 - -0.17 -2.31 -2.58 -3.88 -5.3 -4.72 -4.76 -3.43 -3.5 - - -3.15 - -5.06 -3.06 - -11.17 -
- - 2.07 4.55 1.09 -5.71 4.09 - - -6.77 -5.48 - - -7.07 - - - - 0.19 -8.02 - - - -8.74 - -8.51 - - -6.77 - - - -6.32 -8.7 - - - -8.64 - - - - - - - - - -
1.74 1.11 - - - - - - -0.32 -1.54 - 1.93 4.84 0.01 - - - - - -3.23 - - - -0.06 - -2.05 - - -1.2 - 2.61 - - - - - - -4.29 - - - - - - - - - -
- -9.16 1.22 4.22 0.59 -6.28 4.34 -4.83 -1.45 -4.5 -1.74 -4.64 -4.28 - -4.83 - - - 2.08 -8.58 - - - -7.06 - - - - -4.33 - - - - - - - -5.79 -9.35 - - - - - - - - - -
-3.7 -5.96 1.16 4.5 0.63 0.01 4.22 -1.51 -4.81 -3.38 -2.3 -3.4 -4.5 -7.05 - - - - -1.07 -6.86 - - - -5.37 - -8.55 - - -1.13 - -6.64 - - - - - - -10.66 - - - - - - - - - -
-13.14 -10.22 2.4 4.31 1.4 -1.72 4.23 -7.57 -3.35 -5.97 -2.9 -9.35 -9.62 -14.16 - -10.15 - -11.3 -0.07 -8.96 -12.04 -10.58 -11.28 -11.46 -11.28 -11.81 - -12.79 -11.99 -10.05 - -10.62 -9.73 -11.19 -13.04 -12.9 -10.47 -13.4 - -11.79 - - -11.82 - -10.81 - -12.07 -14.0
-7.92 -8.86 2.54 4.27 1.72 -0.78 4.16 -6.76 -3.89 -5.66 -3.16 -7.46 -8.42 -7.12 -10.2 -9.38 -12.35 -11.73 -0.9 -8.84 - -8.43 -9.08 -6.68 -10.27 -7.33 -9.64 -2.8 -6.76 -8.03 -9.84 -8.16 -4.64 -10.27 -11.08 -11.27 -10.67 -8.48 -8.46 -6.2 -10.34 -10.28 -10.61 -11.6 - - -2.97 -10.06
-7.02 - -1.28 4.59 0.38 - 4.4 - -3.28 - -1.41 - - - - - - - -0.91 - - - - - - - - - -4.29 - - -3.56 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.12 - - 4.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.54 3.73 3.28 1.76 3.12 - - - - - - - - - - - -1.39 -2.16 - -0.35 - - - -1.47 - 0.03 - - - - - - -3.93 - 1.53 -2.64 - - - - - 0.27 - - - -
- - - 3.59 - - 4.97 - 0.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -5.36 - 4.64 - - 4.32 - -1.46 - - - 0.64 - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - -4.51 - - - -4.91 - - - - - - - - - - - -5.32 -
- -5.36 - 4.64 - - 4.32 - -1.46 - - - 0.64 - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - -4.51 - - - -4.91 - - - - - - - - - - - -5.32 -
0.79 -3.81 -4.26 4.72 - - 4.13 - -1.82 - -1.59 -5.72 -6.06 -4.43 -5.34 -4.9 - -4.15 -4.28 -4.96 - - - -5.27 -6.68 -4.77 -6.54 - -0.48 - -4.55 - -7.52 -4.01 -9.67 - -5.0 -5.84 -5.34 -2.31 -6.24 -4.42 - - -4.01 -2.4 - -
- -3.89 2.52 1.58 -0.31 - 0.85 -1.0 -0.2 -0.91 - 1.57 4.65 - - - - -1.95 2.42 -2.17 - - - -3.96 - -3.98 - - - -0.61 - - - - -4.89 - - - -5.52 - - - - - - - - -
-4.78 - 1.52 4.34 1.8 - 4.35 - -1.65 - -2.32 - - - - - - - -1.7 - - - - - - - - - -3.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -5.58 2.24 3.9 0.94 -2.56 3.91 - 2.14 - 2.52 -1.93 - - - - - - -2.9 - - - - -7.79 - - - - -1.72 - - - - -3.27 - - - - - - - - - - -2.19 - - -
- -9.8 -2.05 4.72 0.1 -7.92 4.31 - -4.83 -7.1 -3.34 - -4.1 - - - - - -2.21 -9.27 - - - -9.81 - - - - - - - -8.4 - - - - -8.71 - - - - - - - - - - -
- -1.33 1.75 3.91 1.71 - 4.54 - - -2.55 - - - - - - - - -0.83 - - - - - - - - -1.09 -0.98 - -3.73 - - - - - -1.1 -5.63 - -1.01 - - - - - - - -
- -7.96 1.94 4.47 2.03 0.12 3.92 - - - -0.48 -1.8 - - - - - - -1.84 - - - - -4.3 - - - - -1.59 - - - - - - - - -9.02 - - - - - - - - - -
- -1.59 1.32 3.48 3.58 2.18 3.93 - - -1.72 - -0.16 - - - - - - -0.82 - - - - - - - - - -1.66 - - - - - - - - -2.55 - - - - - - - - - -
1.71 -5.98 1.5 4.3 1.59 -0.32 4.03 -3.18 -1.37 -6.38 -2.85 - - -7.21 - - - -5.82 0.28 -5.83 - - - -10.87 - - - - -5.1 -8.11 -6.2 - - - -8.91 - - -9.18 - - - - - - -4.68 - -10.67 -7.46
- -7.79 1.8 3.95 1.59 -0.07 4.26 -1.05 -1.54 -1.69 -1.11 0.67 -2.2 -5.58 - - - - 0.38 -6.14 - - - -2.07 - -2.21 - - -0.71 - - - -5.68 - - - - -4.68 -7.58 - - - - - - - - -
- -7.82 0.59 3.86 2.86 2.09 4.25 -5.08 -3.91 -2.44 -0.67 -6.84 -1.68 - - - - - - -8.24 - - -3.54 -6.04 - - - -4.45 - -4.77 - - - - -7.27 -4.55 - -6.25 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.