Heatmap: Cluster_1 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
-0.39 -0.02 -0.41 -0.22 -0.27 0.38 -0.8 0.8 -1.04 -0.28 -0.41 1.68 -0.3 -0.48 -0.39 -0.18 0.13 -0.35 -0.19
-0.07 0.74 -0.89 0.35 0.11 0.42 -0.25 -1.78 -1.84 -5.5 0.01 1.54 -0.13 -0.26 0.08 0.35 -0.01 -0.0 -0.45
0.99 0.61 -0.62 -2.03 -0.09 1.02 -2.97 -1.71 -2.3 -3.06 -0.45 1.98 0.68 -1.12 -0.74 0.16 0.34 -0.33 -1.52
0.06 -0.06 -0.49 -0.56 -0.02 0.38 -0.7 -0.28 -0.26 -0.04 -0.7 1.71 0.03 -0.81 -0.48 0.23 0.03 0.08 -0.66
-0.18 0.11 -0.6 -0.52 -0.61 0.06 -0.77 -1.44 -0.86 -1.56 -0.45 1.67 0.31 0.02 0.08 0.45 0.31 0.46 -0.11
-0.6 0.2 -1.31 -0.44 -0.64 -0.16 -1.03 0.51 -0.68 -0.34 -0.72 2.02 -0.14 -0.44 -0.13 -0.24 0.47 0.02 -0.51
-0.06 0.33 -0.54 -0.26 -0.12 0.25 -0.15 -0.27 -0.18 -0.75 -0.36 1.12 0.04 -0.24 -0.08 0.26 0.08 0.16 -0.31
0.13 -0.06 -0.92 -0.48 0.15 0.45 -1.09 -1.55 -0.4 -0.24 -0.22 1.46 0.18 -0.34 -0.33 0.52 0.21 0.1 -0.26
-0.04 0.27 -0.26 -0.04 -0.46 0.4 -1.08 -0.12 -1.16 -1.07 -0.33 1.62 -0.17 -0.5 -0.09 0.21 0.05 0.12 -0.05
-28.54 2.54 - - -31.71 -1.15 - - -29.78 - -0.96 3.38 -5.07 -3.0 -2.91 -2.53 0.42 -4.96 -5.76
0.34 0.44 -0.56 -0.71 -0.04 0.53 -1.32 -2.56 -1.08 -1.6 -0.74 1.91 0.01 -0.42 -0.52 0.65 0.19 0.24 -0.73
0.17 -0.66 -0.33 0.5 0.03 0.41 -0.14 -1.12 -0.72 -2.68 0.16 1.31 0.11 0.1 0.1 -0.21 -0.29 0.1 -0.05
0.16 0.03 -0.64 -0.19 0.06 0.57 -0.61 -0.67 -0.58 -1.55 -0.5 1.39 0.24 -0.36 -0.19 0.53 0.08 0.32 -0.71
0.83 1.38 0.31 -0.63 0.12 0.94 -4.31 -2.42 -2.98 -1.35 -1.85 2.43 -3.02 -1.31 -1.12 -0.77 -0.5 -0.65 -1.4
0.41 0.41 -0.03 -0.26 -0.02 0.22 -0.4 -0.35 -0.3 -1.06 -0.43 1.27 0.04 -0.43 -0.09 -0.13 -0.26 0.05 -0.18
0.28 0.87 -0.49 -0.1 -0.28 0.34 -0.75 -0.69 -0.52 -1.32 -0.7 1.91 0.01 -0.7 -0.23 -0.39 -0.28 -0.17 -0.73
0.12 0.39 -0.13 -0.25 -0.33 0.2 -0.55 -0.29 -0.19 0.27 -0.43 1.1 -0.3 -0.3 -0.1 0.05 0.02 0.07 -0.33
0.36 0.96 -0.27 -0.8 -0.54 -0.02 -1.66 -0.6 -0.56 -0.47 -0.57 1.6 -0.36 -0.59 -0.44 0.32 0.44 0.37 -0.93
0.23 0.65 -2.3 -2.24 -1.03 0.78 -2.1 0.93 -0.75 -0.63 -1.87 2.46 -1.22 -0.7 -0.27 -0.59 -0.27 -0.46 -1.37
0.28 0.52 -0.26 0.07 -0.13 0.73 -1.51 -1.85 -1.15 -2.02 -0.28 1.89 -0.38 -0.51 -0.32 0.08 0.01 0.06 -0.62
-0.1 -0.12 -0.84 -0.48 -0.14 0.83 -0.7 -0.83 -0.45 -1.23 -0.86 1.89 -0.16 -0.17 -0.35 0.44 -0.12 -0.02 -0.4
0.22 -0.16 -0.63 -0.41 -0.42 -0.22 -0.51 0.67 -0.6 -0.66 -0.75 1.76 0.06 -0.44 -0.24 0.12 0.06 -0.22 -0.41
0.22 -0.16 -0.63 -0.41 -0.42 -0.22 -0.51 0.67 -0.6 -0.66 -0.75 1.76 0.06 -0.44 -0.24 0.12 0.06 -0.22 -0.41
0.16 0.02 -1.17 -0.81 -0.66 0.92 -1.76 -1.89 -0.95 -1.24 -0.2 1.77 0.46 0.05 -0.06 0.29 0.16 0.26 -0.64
-0.44 -0.57 -0.52 -0.62 -0.23 0.21 -0.48 0.37 -0.3 -0.48 -0.06 0.88 -0.19 -0.25 0.4 0.31 0.25 0.63 -0.19
-0.43 0.26 -0.69 -0.73 -0.16 0.24 -0.45 0.67 -0.59 -0.17 -0.66 1.57 -0.6 -0.72 -0.32 0.39 0.07 0.28 -0.6
-0.43 0.26 -0.69 -0.73 -0.16 0.24 -0.45 0.67 -0.59 -0.17 -0.66 1.57 -0.6 -0.72 -0.32 0.39 0.07 0.28 -0.6
0.13 0.48 -0.52 -0.71 -0.2 0.73 -0.64 -1.29 -0.85 -2.12 -0.72 1.64 0.23 -0.19 -0.14 0.22 -0.06 0.41 -0.52
0.28 0.08 -1.28 -0.04 -0.06 0.23 -0.3 -1.84 -0.58 -4.66 -0.42 1.79 -0.7 -0.16 0.14 0.21 0.12 0.19 0.28
-0.21 0.09 -0.7 -0.62 -0.4 0.07 -0.28 -0.79 -0.3 -2.24 -0.25 1.33 0.31 0.02 0.13 0.51 0.34 0.31 -0.07
0.44 0.47 -0.41 0.0 0.1 0.66 -0.8 -1.31 -0.78 -2.4 -0.87 1.73 0.37 -0.58 -0.61 0.13 -0.32 0.1 -0.63
0.08 0.1 -1.42 -0.91 0.06 0.74 -0.74 -0.57 -0.99 -2.5 -0.68 1.7 -0.19 -0.07 0.01 0.09 -0.27 0.68 0.15
0.16 0.25 -0.08 -0.04 0.04 0.27 -0.42 -0.48 -0.0 -0.42 -0.51 1.15 0.02 -0.33 0.04 -0.09 -0.16 0.02 -0.48
0.28 0.28 -0.43 -0.66 -0.58 -0.36 -0.97 0.9 -0.8 -1.66 -0.64 1.81 0.32 -0.66 0.08 -0.01 -0.14 -0.16 -0.73
-0.29 -0.18 -0.35 -0.33 0.04 0.21 -0.05 0.18 -0.56 -0.6 -0.37 1.33 -0.42 -0.34 -0.0 0.31 0.17 0.09 -0.25
-0.02 0.3 -0.36 -0.72 -0.31 0.26 -0.51 0.38 -0.13 -0.42 -0.64 1.4 -0.19 -0.34 -0.02 0.02 0.2 -0.04 -0.61
0.11 0.2 -0.4 -0.21 0.0 0.23 -0.28 0.08 -0.5 -1.48 -0.28 1.25 0.02 -0.31 0.09 0.16 0.02 0.16 -0.52
-0.09 0.13 -0.41 -0.22 0.05 0.22 -0.4 0.23 -0.27 -0.1 -1.0 1.54 -0.14 -0.66 -0.03 0.05 0.05 -0.0 -1.11
-0.32 -0.44 -0.56 -0.33 -0.01 0.31 -0.59 0.77 -1.14 -0.79 -0.15 1.3 -0.21 -0.4 0.24 0.19 0.09 0.01 -0.04
0.06 0.16 -1.27 -0.6 0.52 0.74 -1.24 -0.83 -1.36 -0.96 -0.63 1.52 0.47 -0.4 -0.07 0.34 0.01 0.14 -0.35
-0.13 0.12 -0.82 -0.09 -0.01 0.24 -0.4 -0.44 -0.9 -2.16 -0.01 1.31 0.21 -0.11 0.52 0.08 0.1 0.22 -0.37
-0.43 0.02 0.15 -0.06 -0.29 0.32 -0.76 0.44 -1.34 -1.22 -0.23 1.63 -1.04 -0.11 0.08 0.02 0.07 -0.01 -0.21
0.36 0.63 -0.39 -0.15 -0.0 0.31 -0.63 -0.85 -0.07 -0.53 -0.56 1.24 0.19 -0.39 -0.42 0.14 0.04 -0.05 -0.67
-0.34 -0.27 -0.75 -0.45 -0.32 0.3 -0.7 0.91 -0.71 0.46 -0.76 1.66 0.12 -0.6 -0.04 -0.15 -0.19 -0.57 -0.69
-0.34 -0.27 -0.75 -0.45 -0.32 0.3 -0.7 0.91 -0.71 0.46 -0.76 1.66 0.12 -0.6 -0.04 -0.15 -0.19 -0.57 -0.69
0.68 1.73 -0.81 -1.39 -1.27 -0.83 -3.36 -3.86 -5.07 - -0.62 2.67 -3.52 -0.72 -0.19 -1.04 -0.7 -0.57 0.66
0.48 0.93 0.46 -0.2 0.04 0.46 -1.84 -0.95 -2.2 -2.28 -1.32 2.48 -1.18 -1.63 -0.99 -0.25 -0.43 -0.62 -1.55
0.16 0.14 -1.55 -1.57 -0.91 0.49 -1.41 -3.71 -1.31 -1.55 -0.73 2.02 0.85 -0.03 -0.13 0.45 0.23 0.4 -0.38
-1.39 -0.9 -0.98 -0.99 -0.74 -0.08 -0.34 0.89 -1.48 -2.3 0.09 1.69 0.4 -0.16 0.1 0.51 0.43 0.12 -0.17
-1.26 -0.97 -0.42 -0.44 -0.6 -0.03 -0.42 0.51 -1.25 -1.47 -0.11 1.77 -0.0 0.1 -0.28 -0.21 0.75 -0.57 0.61
-1.26 -0.97 -0.42 -0.44 -0.6 -0.03 -0.42 0.51 -1.25 -1.47 -0.11 1.77 -0.0 0.1 -0.28 -0.21 0.75 -0.57 0.61
-0.59 -0.36 -0.05 -0.1 -0.46 0.32 -0.16 0.57 -0.79 -1.32 -0.05 1.08 -0.28 0.09 0.12 0.16 0.32 -0.08 -0.04
0.08 0.63 -0.14 0.05 -0.05 0.43 -0.4 -0.17 -0.29 -0.61 -0.62 1.3 -0.33 -0.6 -0.24 0.11 -0.02 0.0 -0.9
-0.27 0.34 -0.74 -0.49 -0.18 0.41 -0.46 -0.02 -0.23 -0.39 -0.64 1.37 0.11 -0.55 -0.43 0.41 0.33 0.12 -0.61
-0.17 -0.44 -0.7 -0.08 -0.27 0.08 -0.12 0.77 -0.62 -1.88 -0.28 1.7 -0.22 -0.46 -0.31 0.1 0.16 -0.52 0.04
0.54 0.87 -0.27 0.01 -0.08 -0.05 -0.85 -1.57 -0.39 -2.8 -0.61 1.58 0.27 -0.39 -0.56 0.31 0.31 -0.19 -0.94
0.54 0.87 -0.27 0.01 -0.08 -0.05 -0.85 -1.57 -0.39 -2.8 -0.61 1.58 0.27 -0.39 -0.56 0.31 0.31 -0.19 -0.94
-0.1 0.09 0.11 0.1 -0.04 0.26 -0.73 0.08 -1.07 -1.47 -0.36 1.61 -0.16 -0.44 -0.23 0.04 0.02 -0.06 -0.22
-1.0 -0.27 -0.46 -0.43 -0.4 0.23 -0.04 0.5 -0.35 -0.44 -0.23 1.01 -0.54 -0.33 0.07 0.56 0.42 0.45 -0.34
-0.08 -0.09 -0.75 -0.31 0.1 0.14 -0.45 0.55 -0.73 -0.91 -0.49 1.44 -0.51 -0.26 0.22 0.24 0.0 0.11 -0.27
0.88 0.84 -2.27 -2.27 -0.58 0.86 -2.21 -2.54 -1.87 -3.42 -1.03 1.83 0.47 -0.15 0.06 0.52 0.23 0.36 -1.11
-0.03 0.38 -0.12 -0.34 -0.67 0.48 -1.46 -1.39 -1.16 -1.07 -0.55 1.98 0.24 -0.43 -0.6 0.1 0.19 -0.41 0.18
0.09 0.7 -0.06 -0.59 -0.21 0.68 -2.26 -1.46 -1.17 -0.63 -0.83 2.14 -1.19 -0.46 -0.64 -0.01 0.15 0.08 -0.7
-0.82 0.46 -1.26 -1.54 -0.47 0.67 -2.46 -0.23 -2.23 -0.39 -1.03 2.34 -1.66 -0.34 -0.08 0.31 0.25 0.18 -0.33
-0.82 0.46 -1.26 -1.54 -0.47 0.67 -2.46 -0.23 -2.23 -0.39 -1.03 2.34 -1.66 -0.34 -0.08 0.31 0.25 0.18 -0.33
-0.33 0.32 -3.5 -2.21 -1.62 0.86 -2.57 -0.53 -1.77 -0.19 -1.47 2.45 -1.76 -0.4 -0.03 0.55 0.61 0.3 -1.33
-0.19 0.21 -0.69 -0.74 -0.85 0.05 -1.35 0.28 -0.56 0.04 -0.57 1.79 -0.43 -0.32 0.2 0.14 0.19 0.19 -0.64
-0.09 -0.19 -0.64 -0.52 -0.26 0.01 -0.38 -0.77 -0.69 -2.61 -0.18 1.49 0.25 0.06 0.14 0.29 0.2 0.22 0.39
-0.09 -0.19 -0.64 -0.52 -0.26 0.01 -0.38 -0.77 -0.69 -2.61 -0.18 1.49 0.25 0.06 0.14 0.29 0.2 0.22 0.39
-0.16 -0.12 -0.71 -0.6 -0.72 0.19 -1.04 0.52 -0.42 -0.36 -0.58 1.68 0.22 -0.31 -0.09 -0.16 0.28 -0.08 -0.17
0.44 0.24 -1.3 -1.88 -0.22 -0.25 -2.68 -3.69 -1.68 -2.39 -0.96 2.11 0.18 -0.29 -0.41 1.0 0.84 0.49 -0.72
-0.18 -0.2 -0.46 -0.12 -0.07 0.36 -0.92 -1.3 -0.82 -0.51 -0.4 1.71 0.47 -0.49 -0.55 0.45 0.26 0.02 -0.39
0.49 0.36 -0.2 -0.09 -0.08 0.23 -0.45 -0.95 -0.36 -1.7 -0.12 1.0 0.29 -0.53 -0.16 0.39 0.43 -0.2 -0.38
-0.44 0.18 -0.4 -0.6 -0.5 -0.1 -0.47 0.48 -0.2 -0.12 -0.47 1.6 -0.43 -0.36 -0.19 0.36 -0.16 0.18 -0.49
0.1 0.16 -0.75 -0.36 -0.13 0.42 -1.27 -1.91 -0.87 0.02 -0.42 1.77 0.46 -0.52 -0.69 0.32 0.26 -0.08 -0.54
-0.18 0.12 -0.39 -0.23 -0.15 0.44 -0.69 -0.14 -0.75 -1.01 -0.46 1.82 -0.83 -0.51 -0.13 0.31 0.03 0.19 -0.5
-0.18 0.12 -0.39 -0.23 -0.15 0.44 -0.69 -0.14 -0.75 -1.01 -0.46 1.82 -0.83 -0.51 -0.13 0.31 0.03 0.19 -0.5
1.02 1.12 -0.19 -1.16 -0.11 0.36 -2.71 -3.36 -2.96 -4.69 -0.84 1.89 -1.3 -0.76 -0.87 0.63 0.59 0.15 -0.22
-0.3 -0.17 -0.22 -0.02 -0.26 0.24 -0.0 0.52 -0.76 -0.32 0.01 0.85 -0.62 -0.1 -0.2 0.35 0.24 -0.03 -0.11
0.37 -0.02 -0.22 0.06 -0.4 0.44 -0.68 -0.16 -0.64 -1.56 -0.22 1.15 0.16 -0.42 -0.11 0.38 0.18 0.14 -0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.