Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.31 0.24 0.44 0.0 1.77 0.36 0.97 0.64 0.76 0.72 0.29 0.09 0.0 0.21 0.22 0.18 0.28 0.55 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 1.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.1 0.03 0.13 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.1 0.01 0.0 0.01 0.09 0.01 0.06 0.05 0.03 0.05
4.03 6.28 1.58 6.61 4.74 8.05 2.49 0.48 1.22 0.26 1.05 0.1 0.6 2.17 6.39 0.72 2.51 3.72 0.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.03 0.19 0.05 0.0 0.0 0.12 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01
0.13 0.0 1.64 0.0 1.69 2.49 0.98 0.45 0.25 1.68 0.0 0.0 0.02 0.12 0.04 0.15 0.01 0.06 0.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 6.2 2.29 1.18 4.79 4.83 1.76 0.53 1.83 4.12 2.67 0.0 0.0 2.44 0.0 1.43 2.01 1.44 0.65
0.0 0.0 0.0 0.08 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.79 0.79 0.4 1.09 0.28 0.13 0.06 0.49 0.5 0.06 0.0 0.0 0.14 0.13 0.03 0.31 0.09 0.01
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0
1.02 0.48 0.19 0.48 0.95 0.31 0.08 0.27 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.31 0.28 0.17 0.19 0.31 0.09
0.05 0.03 0.1 0.0 0.09 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.05 0.04 0.08 0.0
0.0 0.42 0.0 0.17 0.35 0.0 0.0 0.06 0.0 0.1 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.47 0.0 0.18 0.49 0.43 0.77 0.02 0.42 0.76 0.19 0.0 0.21 0.21 0.24 0.0 0.08 0.15 0.02
0.11 0.19 0.03 0.0 0.0 0.2 0.04 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.18 0.07 0.04 0.08 0.09 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 2.19 0.0 0.42 1.18 0.96 0.49 0.0 0.67 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0
0.0 0.29 0.29 0.1 1.14 0.0 0.43 0.0 0.67 0.27 0.22 0.03 0.07 0.14 0.67 0.13 0.22 0.28 0.0
0.21 0.16 0.3 0.41 0.48 1.18 0.16 0.3 0.19 0.56 0.07 0.0 0.07 0.03 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0
1.06 0.66 3.01 1.64 1.69 1.87 0.9 0.14 0.19 0.8 0.18 0.0 0.18 0.38 0.65 1.56 1.07 1.83 0.12
0.36 0.62 0.15 0.0 0.48 0.25 0.0 0.0 0.0 0.21 0.1 0.06 0.14 0.07 0.43 0.16 0.28 0.12 0.31
0.0 0.33 0.03 0.1 0.0 0.17 0.03 0.06 0.12 0.07 0.08 0.0 0.01 0.11 0.04 0.0 0.05 0.07 0.02
0.31 1.81 1.4 1.9 1.97 0.94 0.8 0.65 1.67 0.45 0.1 0.0 0.06 0.22 0.0 0.07 0.05 0.57 0.09
0.0 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.42 0.04 0.3 0.51 0.09 0.23 0.61 0.2
0.0 0.26 0.17 0.0 0.48 0.08 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.27 0.0 0.25 0.8 0.61 2.03 0.0 2.6 0.28 0.38 0.0 0.0 0.19 0.81 0.15 0.36 0.93 0.06
0.0 0.35 0.0 0.0 0.16 0.31 0.18 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.15 0.0 0.1 0.14 0.16 0.0
2.67 4.68 1.48 7.5 2.8 8.51 2.79 1.74 6.32 1.41 3.1 0.0 0.99 4.02 2.61 2.73 3.66 2.63 1.96
6.18 0.0 0.0 0.0 5.75 0.0 0.0 0.61 0.37 0.0 0.21 0.0 0.54 0.17 0.21 0.0 1.97 0.03 0.08
0.05 0.0 0.14 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.0 0.09 0.36 0.51 0.04 0.17 0.0 0.07 0.0 0.51 0.0 0.28 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.77 0.0 1.29 0.53 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.05 0.13 0.28 0.09 0.0 0.47 0.13 0.51 0.44
0.01 0.5 1.1 0.0 4.4 0.98 0.43 0.0 1.12 0.54 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0
0.08 0.35 0.0 0.22 0.01 0.06 0.04 0.02 0.17 0.0 0.04 0.03 0.03 0.07 0.02 0.07 0.07 0.23 0.09
0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.62 0.34 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.37 0.18 0.0 0.27 0.42 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.46 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.35 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.82 0.96 0.53 0.24 1.5 0.0 0.13 0.0 0.2 0.19 0.11 0.0 0.0 0.19 0.24 0.33 0.02 0.17 0.08
0.33 1.73 0.0 0.0 3.27 0.0 0.84 0.79 0.59 0.85 0.72 0.1 0.0 0.18 2.11 0.81 0.5 0.25 0.46
0.07 0.16 0.07 0.1 0.28 0.27 0.07 0.02 0.03 0.39 0.02 0.0 0.04 0.01 0.01 0.12 0.01 0.01 0.01
2.16 0.0 3.23 2.94 2.43 1.35 1.03 0.46 0.0 0.38 0.51 0.06 0.27 1.18 0.38 0.93 0.56 1.14 1.02
0.94 1.52 0.27 1.05 0.89 2.13 0.4 2.45 0.22 4.68 0.25 1.08 0.08 0.61 0.99 1.24 0.57 0.66 0.1
0.0 0.0 0.02 0.0 0.14 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0
15.38 19.92 2.81 8.41 7.65 9.32 7.73 8.81 10.49 6.93 19.33 7.02 11.92 12.71 22.18 24.59 24.37 27.23 10.27
0.0 0.1 0.0 0.0 0.18 0.06 0.03 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.34 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.21 0.02 0.13 0.24
0.58 1.93 0.88 2.31 0.93 1.75 2.25 0.74 2.24 0.34 1.12 0.02 0.15 1.04 0.35 1.52 1.53 1.24 0.68
0.0 0.0 0.0 0.0 16.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.2 0.0 0.39
0.0 0.51 0.0 0.0 0.35 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.23 0.97 0.0 0.26 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.69 0.0 0.07 0.0 0.16 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.19 0.02 0.04 0.04 0.18 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.08 0.01 0.01 0.03 0.02 0.03
2.65 4.05 0.0 1.87 0.0 3.86 1.57 0.0 0.0 0.42 0.0 0.57 0.0 1.1 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.05 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.11 0.87 0.28 0.16 0.28 0.24 0.0 0.03 0.37 0.34 0.04 0.41 0.04 0.09
0.47 1.78 0.72 0.0 0.48 1.62 0.43 0.0 0.0 0.93 0.11 0.0 0.0 0.23 0.3 0.81 0.21 0.21 0.18
0.0 0.0 0.65 0.23 0.49 0.0 0.0 0.22 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.12 0.06 0.34 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.77 1.24 0.37 1.01 3.05 1.44 1.7 1.21 1.76 2.7 0.08 0.27 0.26 0.04 0.97 0.14 0.02 0.58 0.0
0.41 0.0 0.04 0.22 0.52 0.25 0.0 0.11 0.0 0.1 0.02 0.0 0.02 0.0 0.05 0.02 0.02 0.05 0.0
0.79 0.11 0.13 0.12 1.2 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.08 0.07 0.02 0.02 0.03 0.03 0.0 0.02 0.04 0.02 0.13 0.02 0.03 0.05
0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.1 0.1 0.3 0.36 0.32 0.05
5.01 7.04 0.0 6.08 26.37 5.27 1.58 1.47 1.7 8.12 0.66 0.0 0.0 0.56 0.27 0.0 1.98 3.0 0.0
0.0 0.26 0.07 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.96 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.23 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 3.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 4.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.0 0.09 0.19 0.32 0.03 0.0 0.16 0.04 0.06 0.03 0.04 0.02 0.21 0.11 0.12 0.05 0.02
0.0 0.04 0.0 0.08 0.11 0.04 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.39 1.07 0.0 0.0 0.2 0.22 0.16 0.14 0.25 0.16 0.22 0.0 0.17 0.66 0.7 1.55 1.47 1.38 0.34
2.49 10.84 0.84 9.26 1.57 3.59 0.71 0.0 0.38 1.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.36 0.0 0.0 1.84 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.01 1.02 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.33 0.0 0.16 0.14 0.12 0.39 0.04 0.23 0.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)