Heatmap: Cluster_231 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg cell	Ovule	Uninucleate microspore (Col-0)	Uninucleate microspore (Ler-0)	Pollen (bicellular, Col-0)	Pollen (late bicellular, Col-0)	Pollen (bicellular, Ler-0)	Pollen (tricellular, Col-0)	Pollen (tricellular, Ler-0)	Pollen (mature, Col-0)	Pollen (mature, Ler-0)	Sperm	Pollen tube (Col-0)	Flower (receptacles)	Flower (floral buds)	Flower (sepals)	Flower (petals)	Flower (stamen filaments)	Flower (anthers)	Flower (carpels)	Flower (stigmatic tissue)	Pedicel	Axis of the inflorescence	Silique	Silique (senescent)	Pods of siliques	Pods of siliques (senescent)	Embryo	Endosperm	Seed	Seed (young)	Seed (germinating)	Seedling	Seedling (etiolated)	Meristem	Stem (internode)	Stem (internode, senescent)	Stems	Leaf (rosette)	Epidermis cells	Mature guard cells	Root (differentiation zone)	Root (elongation zone)	Root (meristematic zone)	Root (apex)	Root (stele)	Root (QC cells)	Root (tip)
AT1G01980	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.17	1.0	0.32	0.01	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.01	0.76	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT1G04470	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.26	0.54	1.0	0.75	0.01	0.04	0.01	0.07	0.0	0.0	0.01	0.82	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT1G11770	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.38	0.43	1.0	0.48	0.0	0.34	0.0	0.11	0.0	0.0	0.01	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT1G49490	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.18	0.28	1.0	0.36	0.0	0.21	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.94	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT1G72330	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.39	0.91	1.0	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.51	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.0	0.01	0.02	0.02	0.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01
AT1G79860	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.53	0.64	1.0	0.62	0.01	0.04	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.83	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
AT2G15880	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.23	0.56	1.0	0.87	0.0	0.26	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.78	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
AT2G18470	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.19	0.02	0.37	0.51	1.0	0.73	0.0	0.16	0.01	0.07	0.0	0.0	0.01	0.7	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT2G31830	0.01	0.02	0.04	0.04	0.14	0.35	0.11	0.68	0.92	0.9	0.9	0.01	0.12	0.02	0.15	0.01	0.0	0.01	1.0	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03	0.01	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01
AT2G33100	0.02	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.21	0.32	1.0	0.44	0.0	0.06	0.01	0.04	0.0	0.0	0.01	0.78	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT2G33420	0.13	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.22	0.6	1.0	0.83	0.01	0.13	0.01	0.07	0.0	0.0	0.0	0.69	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT2G38500	0.0	0.0	0.08	0.08	0.09	0.16	0.12	0.44	0.63	1.0	0.95	0.07	0.1	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.74	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.1	0.04	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0
AT2G46360	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.18	0.6	0.91	1.0	0.0	0.22	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT2G47030	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.48	0.38	1.0	0.63	0.0	0.21	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT2G47340	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.31	0.69	1.0	0.78	0.0	0.02	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G04360	0.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.25	0.76	0.99	1.0	0.02	0.38	0.01	0.07	0.0	0.0	0.01	0.89	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08	0.01	0.01	0.0	0.01	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.23	0.0
AT3G05610	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.29	0.48	1.0	0.7	0.0	0.49	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.69	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G07820	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.16	0.01	0.54	0.63	1.0	0.81	0.0	0.4	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G18810	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.29	0.38	1.0	0.65	0.0	0.27	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.7	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G19020	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.26	0.34	1.0	0.43	0.02	0.19	0.0	0.03	0.0	0.0	0.01	0.87	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G20580	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.3	0.63	1.0	0.88	0.0	0.51	0.01	0.06	0.0	0.0	0.01	0.87	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G21180	0.0	0.0	0.01	0.03	0.07	0.24	0.1	0.58	0.77	1.0	0.81	0.01	0.44	0.01	0.17	0.0	0.01	0.01	0.91	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.05	0.0	0.06	0.0	0.0	0.01
AT3G21570	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.42	0.96	0.96	1.0	0.0	0.02	0.0	0.1	0.0	0.0	0.01	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G23170	0.03	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.26	0.35	1.0	0.81	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.67	0.01	0.0	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.03	0.05	0.02	0.06	0.0	0.0	0.03	0.02	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0
AT3G24715	0.07	0.01	0.08	0.03	0.04	0.05	0.03	0.56	0.69	1.0	0.64	0.02	0.16	0.01	0.22	0.0	0.02	0.05	0.79	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.1	0.0	0.06	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.16	0.01	0.05	0.24	0.0	0.02
AT3G25165	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.24	0.54	1.0	0.81	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.01	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G28810	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.34	0.02	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.01	0.96	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G52600	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.46	0.24	1.0	0.21	0.0	0.01	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G59290	0.12	0.04	0.01	0.02	0.02	0.06	0.03	0.34	0.62	0.93	1.0	0.0	0.05	0.04	0.08	0.02	0.03	0.04	0.78	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.06	0.0	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.06	0.04	0.2	0.05	0.05	0.03	0.05	0.11	0.05	0.02
AT4G00350	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.33	0.29	1.0	0.32	0.0	0.01	0.0	0.08	0.0	0.0	0.01	0.81	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT4G10010	0.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.07	0.02	0.33	0.82	1.0	0.75	0.01	0.26	0.01	0.2	0.0	0.0	0.01	0.85	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT4G14810	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.12	0.05	0.93	0.1	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT4G33970	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.23	0.67	0.95	1.0	0.15	0.34	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.74	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT4G38190	0.01	0.0	0.01	0.02	0.03	0.1	0.06	0.51	0.68	1.0	0.71	0.0	0.19	0.0	0.08	0.0	0.0	0.01	0.86	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT4G39110	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.35	0.46	1.0	0.64	0.0	0.35	0.01	0.12	0.0	0.0	0.01	0.82	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G01610	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.37	0.68	0.84	1.0	0.11	0.22	0.04	0.08	0.05	0.11	0.1	0.91	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.09	0.01	0.0	0.0	0.02	0.04	0.02	0.05	0.0	0.05	0.05	0.02	0.05	0.0	0.0	0.31	0.1	0.0	0.12	0.0	0.03	0.02
AT5G12000	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.23	0.43	1.0	0.64	0.11	0.2	0.01	0.12	0.0	0.0	0.01	0.79	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G19580	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.23	0.03	0.58	0.32	1.0	0.26	0.0	0.27	0.0	0.07	0.0	0.0	0.01	0.87	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G23270	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.12	0.4	1.0	0.73	0.0	0.01	0.01	0.03	0.0	0.0	0.01	0.74	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G27870	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.33	0.23	0.91	0.22	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G43185	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.29	0.54	1.0	0.79	0.01	0.17	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G48140	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.41	0.24	1.0	0.26	0.0	0.37	0.0	0.08	0.0	0.0	0.01	0.71	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G54780	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.37	0.71	1.0	0.87	0.08	0.1	0.04	0.1	0.03	0.05	0.03	0.94	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.16	0.1	0.08	0.03	0.04	0.0	0.0	0.02
AT5G58050	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.41	0.37	1.0	0.37	0.0	0.35	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.74	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)