Heatmap: Cluster_62 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.81 2.76 - - - - - - - - - -6.54 - 3.14 - - - - - - - - - -3.0 - - - - - - - - 1.54 3.76 - - - 3.91 - - - - - - - - - -2.06
1.07 -0.91 - - - - - - - - - - - -2.4 - - - - - - - - - -6.66 - - - - - - - - 2.34 5.25 - - - -1.92 - - - - - - - - - 0.79
2.36 - 2.69 2.81 3.07 1.37 4.12 - - -1.52 - - - - - - - - -1.79 - - - - - - - - - -1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.71 -6.17 2.19 - 2.37 2.64 -6.31 0.15 - -2.86 - -5.91 1.23 -3.14 -3.87 -6.19 -6.02 -4.72 -1.58 -5.77 - - -5.87 -5.19 -4.61 -5.2 - - -1.68 -4.0 -8.56 -5.48 -5.97 -4.65 -6.88 -4.93 -1.04 -4.18 -2.08 -5.91 -2.75 -4.95 - - -3.85 - -8.67 -7.08
2.56 5.07 - - - - - - - - - -0.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.97 - - - - - - - - - -
1.55 -0.43 1.39 2.41 2.44 -2.64 1.32 -1.24 -3.53 -2.41 -3.25 1.98 0.78 -3.37 - -4.07 - -1.62 -1.93 0.55 - -1.52 1.19 -2.66 - -4.19 - 2.1 -0.98 -4.96 -2.6 -2.6 -2.67 -5.15 -0.18 - -0.89 -1.51 -4.36 - - -2.16 - 0.1 -3.07 2.95 - -1.21
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.97 2.46 - - 0.16 4.23 - 1.37 0.39 -0.83 - 2.64 1.06 - - - - - -0.86 - - - - -0.38 - - - - 2.61 - - - - - - - - -1.29 - - - - - - - - - -
5.37 -0.33 - - - - - - - - - 1.58 - -3.77 - - - - - - - - - -6.33 - - - - - - - - -1.51 0.83 - - - -1.2 - - - - - - - - - -2.37
5.33 2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.94 - - - - - - - - - -
5.51 - - - - - - - - - - 1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.06 - - - - - - - - - - 4.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.45 - - - - - - - - - - 2.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.52 4.61 - - - - - - - - - -0.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.39 - - - - - - - - - - 2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.81 -2.35 2.03 3.01 1.92 -0.68 2.45 -0.2 1.11 -0.6 0.41 3.45 -0.35 - - -0.85 - - 1.16 -3.33 - -0.73 - -4.01 - -1.66 -2.01 -1.77 - - -3.4 - - - - -1.89 1.87 -4.45 -4.52 - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.47 - - - - 3.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.45 - - - - - - - - - - -1.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.41 2.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.52 1.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.57 - - - - - - - - - - -0.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.49 - - - - - - - - - - 1.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.43 2.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.27 -5.48 - 3.0 - - 3.28 - -1.89 - -0.31 - - - - - - - -3.12 -5.09 - - - - - -2.59 - -1.37 2.91 - - -2.33 -2.91 -0.62 -3.97 - - 1.47 -4.11 - -1.34 1.08 0.92 0.17 0.17 - -2.83 -0.61
5.49 - - - - - - - - - - -0.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.17 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.11 -4.19 -1.53 0.29 -1.92 - -0.09 - - -8.1 -4.89 -6.97 - -5.78 -6.45 -6.7 - - -2.95 -5.89 - - -6.45 -3.93 1.63 -4.08 -1.63 -7.4 -2.35 2.25 -4.57 -3.84 -4.86 -4.32 -8.35 -7.52 -0.44 -2.99 -0.96 -4.2 - -4.52 -2.14 - -6.42 - - -
3.28 -0.33 1.2 0.98 2.12 1.02 2.09 - -0.71 - - - - -1.18 - -0.57 - - 1.07 -0.77 - - - -1.68 0.14 -1.07 - 0.52 2.5 0.93 - -0.73 -0.57 -1.02 -1.62 -0.6 1.01 -0.56 0.91 - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - -2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.56 - - - - - - - - - - -0.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.16 3.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - -
5.53 - - - - - - - - - - -0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.11 - - - - - - - - - -
4.59 -0.25 - - - - - - - - - - - 3.3 -0.78 - - - - - - - - -3.91 - - - - - - - - 1.08 3.21 - - - -0.47 -3.63 - - - - - - - - -1.38
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.48 - - - - - - - - - - 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.42 - - - - - - - - - - 2.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.43 2.21 - - - - - - - - - -2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.12 - - - - - - - - - -
5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.57 - - - - - - - - - -
5.53 - - - - - - - - - - 0.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.91 3.54 - - - - - - - - - 2.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.34 - - - - - - - - - -
3.99 2.4 - - - - - - - - - - - 2.8 - - - - - - - - - -0.19 - - - - - - - - 1.55 1.83 - - - 0.78 -1.15 - - - - - - - - 3.37
3.67 -0.79 -2.44 - -1.74 - -3.68 -3.86 - -5.05 - - - 1.96 -2.25 - - - - -4.88 -2.45 - - -1.49 0.25 -3.4 1.91 -3.2 1.35 -1.33 -4.14 -2.01 -0.03 3.08 -7.24 -1.73 0.88 1.1 -0.9 -0.47 -3.14 2.0 - -1.06 - - -2.08 0.19
4.85 -0.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.12 - - - 1.94 - - - - - - - - - 2.54
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.47 - - - - - - - - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.88 5.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.85 - - - - - - - - - -
- 4.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.2 - - - - - - - - - 3.39
5.2 - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.55 5.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.58
3.92 - - - - - - - - - - 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.78 3.74 - - - - - - - - - -3.14 - 1.45 - - - - - - - - - -0.94 - - - - - - - - -1.59 3.06 - - - 0.64 - - - - - - - - - 2.88
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - -2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.35 0.51 2.0 0.43 1.9 - 0.15 - - - -2.4 - - 1.6 0.71 1.11 -1.49 -1.18 -1.16 0.61 - -2.31 -2.29 -1.37 - -2.14 -1.48 -2.24 2.92 - -0.35 -4.0 -2.46 -3.51 0.41 - 0.97 0.29 0.29 - - - - -1.68 - - - -3.36
1.69 - - - - - - - - - - 5.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.33 - - - - - - - - - - 1.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.34 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.41 -2.73 - -4.0 - -2.4 - -5.6 - -3.68 - 0.82 1.11 -3.28 -1.69 -0.51 3.34 0.73 -0.26 -1.39 -1.63 -5.52 -1.37 -0.75 -0.94 0.15 1.77 -4.97 2.56 -3.86 -2.63 -2.54 -5.42 -1.49 -2.63 -3.08 -0.24 -2.68 -0.74 -4.89 - 1.04 -1.69 -1.24 -2.0 -2.66 -2.93 -1.01
5.25 3.26 - - - - - - - - - -2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.77 - - - - - - - - - -
4.33 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.71 - - - - - - - - - -
3.08 3.73 0.37 -1.06 0.98 1.59 0.44 - -2.26 - -2.25 -2.34 - 2.33 -0.08 - - - - - - - - -1.03 - - - - 1.76 - - - 1.24 0.91 - - - 0.8 -2.71 - - - - - - - - 0.59
5.55 -0.18 - - - - - - - - - -3.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.12 - - - - - - - - - -
5.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.07 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.33 2.57 2.34 0.21 0.44 1.44 -0.78 - - - - - - -2.85 - -1.84 - -0.28 -1.76 0.8 - - 0.74 -1.51 - -2.86 - -0.7 3.26 -1.64 1.41 -3.01 - -1.98 -0.19 -0.81 - -3.12 -4.43 - - - -0.76 - - - - -
2.77 -3.46 2.09 1.26 2.24 2.34 1.89 1.43 0.46 -2.86 -3.84 0.0 -8.23 -2.31 -0.54 -3.64 -4.16 -2.46 -1.51 -3.64 -1.11 -4.64 -4.64 -1.55 -3.81 -1.29 -4.41 -1.13 2.05 -1.88 -1.93 -2.11 -1.17 0.37 -2.81 -3.67 -3.3 -1.93 -4.04 -4.34 -1.09 -1.43 -1.61 -2.14 -3.76 0.98 0.14 -1.96
4.31 4.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.29 - - - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.56 4.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.37 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.55 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.25 - - - - - - - 3.14 - - 0.18 - - - - - - - - -
-1.77 - - - - - - - - - - 1.63 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - 5.37 - - - 1.03 - - - - - - - - - -
4.59 3.02 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - -
4.64 4.07 - - - - - - - - - 0.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.36 - - - - - - - - - -
- 0.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.52 - - - - - - - - - -
4.43 2.55 - - - - - -0.84 1.9 - 0.57 - - -0.09 -9.15 - - - -3.06 0.31 - - - -4.33 - - - - - - 3.63 - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.63 1.25 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.72 0.44 - - - - - - - 4.08 - - - 2.27 - - - - - 1.09 0.18 - - - - - - - - -
-0.8 0.25 -0.67 -1.39 -0.2 -2.44 -2.68 -1.74 0.48 -3.55 0.08 - - 1.91 2.48 -0.86 -1.52 -1.85 0.01 -0.54 -2.84 -2.23 -3.74 0.86 - -0.79 -0.24 -0.6 1.54 -2.95 1.81 -2.21 0.92 0.36 -3.37 0.37 0.75 -0.34 2.12 -0.09 -1.47 1.67 -1.63 -2.04 -1.04 - -0.43 -2.44
- -1.79 0.54 - -0.82 0.96 - -0.73 2.43 - 1.71 - - 1.8 - - - - 0.38 -0.12 - 0.35 - -0.35 - -1.25 1.91 1.49 - -1.99 -0.08 - -2.05 0.88 - - 2.63 -1.94 1.44 1.82 - 0.78 - - -0.12 - 0.16 -
4.0 -1.94 -0.32 2.41 1.68 - - 1.68 - -1.38 -0.23 3.35 2.22 - - - - - -0.02 -1.63 - - - - - - - - 0.55 -1.96 - - - - - - - -4.6 - - - - - - - - - -
-2.91 -1.22 - - - - - - - - - - - 3.49 - - - - - - - - - -3.1 - - - - - - - - 4.15 3.9 - - - 1.7 -2.56 - - - - - - - - -
5.05 3.02 - - - - - - - - - -1.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.66 - - - - - - - - - -
5.11 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - -2.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.56 - - - - - - - - - - -1.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.32 - - - - - - - - - -
5.51 -0.47 - - - - - - - - - -4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.69 - - - - - - - - - -
5.56 -0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.74 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.54 - - - - - - - - - - 0.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - -
5.54 - - - - - - - - - - 0.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.35 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.