Heatmap: Cluster_10 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
1.69 1.37 1.67 1.21 0.7 0.35 0.91 -3.25 -3.54 -5.4 -6.29 -8.19 -5.15 0.49 -0.14 -1.3 -0.96 -1.45 -1.97 1.13 -0.59 0.18 1.39 -0.62 -3.49 -1.41 -3.16 1.38 -1.05 -3.84 0.85 -1.05 -0.91 -1.34 1.53 -0.47 -0.91 0.28 -2.58 -6.75 - -1.33 -0.01 1.4 -0.08 -2.8 0.75 0.34
1.59 1.14 1.22 0.74 0.92 0.25 1.08 -2.26 -2.3 -3.37 -2.8 -3.63 -4.34 0.07 0.17 -0.8 -0.01 -0.48 -1.62 1.09 0.33 0.04 0.76 -0.83 -1.69 -1.34 -4.23 0.22 -0.97 -1.8 0.27 -0.3 -0.96 -0.95 0.06 0.1 -0.6 0.3 -1.16 -2.42 -2.91 -1.5 0.29 1.79 -0.25 1.45 -0.38 0.52
1.39 -0.54 0.84 1.36 0.79 -0.29 1.19 -1.22 0.84 -1.25 0.66 3.36 0.64 -0.59 -1.0 -0.07 -2.39 -2.43 -0.27 -1.1 -1.76 -0.63 -1.2 -0.29 -1.44 -0.06 -0.56 -6.54 -0.56 0.69 -1.41 -1.84 -0.46 -2.05 -1.83 -0.77 1.6 -0.14 0.77 -1.18 -3.23 -2.49 -2.57 -3.98 -4.56 - - -5.39
-0.18 -0.26 0.13 - -1.26 -0.02 -1.33 -1.53 -1.43 -0.98 0.58 3.78 1.52 0.27 -0.2 -1.2 -0.78 -1.3 -0.84 -1.07 - -3.51 -2.48 -1.39 -1.45 -1.36 1.68 -3.96 1.75 -4.89 0.02 -5.77 -1.74 -1.75 -3.74 -1.49 2.44 -1.12 0.83 -3.04 0.5 -3.08 - - -3.98 - -7.76 -5.17
-1.99 0.34 -2.14 -2.31 -1.69 -0.57 -1.82 0.47 0.57 1.02 0.9 2.14 1.48 -0.07 0.23 0.1 0.25 -0.71 0.31 0.2 -0.67 -0.65 -0.4 -0.77 -0.88 -0.41 1.11 -1.03 -0.15 -1.37 -0.72 -0.7 -0.66 -0.1 -1.08 -0.83 -0.12 -0.38 1.0 -0.41 -0.26 0.51 0.21 -0.91 -0.77 1.26 -3.93 -1.61
2.47 -2.98 - - - - - - - - - 0.86 - - - - - - - -1.99 - - - -2.91 - - -0.49 - -1.63 - - - - -1.79 - -0.6 2.56 -2.65 -3.37 - - -1.61 - - 0.64 - 4.91 -
0.93 0.92 1.02 1.21 0.69 -0.38 1.06 -3.13 -1.93 -3.04 -2.06 2.11 -1.08 0.04 -0.85 -0.77 -1.07 -1.28 -1.14 1.16 -0.42 -0.12 -0.23 -0.35 -2.21 -0.74 -1.26 0.7 -1.45 -2.39 0.83 -1.09 -0.85 -0.52 0.74 -0.9 -0.52 0.19 -0.78 -1.28 -6.43 -0.92 -1.06 0.57 -1.37 - 2.46 -1.01
0.09 0.7 1.09 1.31 1.11 0.56 1.43 -1.25 -1.8 -2.46 -3.09 -8.54 -2.74 -0.07 0.77 -0.39 -0.32 0.05 0.12 0.43 -0.39 0.28 0.38 -0.06 -1.91 -0.24 -0.42 1.04 -0.22 -2.17 0.58 0.51 0.08 -0.07 0.52 -0.48 -0.49 0.0 -0.3 -4.25 -2.91 -0.62 -0.09 0.87 0.21 -3.82 -0.79 0.34
1.68 0.68 2.13 1.79 1.47 -0.39 1.65 -3.69 -4.59 -4.74 -4.35 -1.97 -5.72 -0.32 -0.24 -1.13 -1.67 -1.5 -1.26 0.67 -0.48 -0.17 0.43 -1.07 -0.3 -1.71 -3.54 1.1 -0.27 -0.26 0.06 -0.03 -0.86 -0.93 0.27 -1.1 0.03 -0.16 -1.47 -3.47 -2.9 -1.8 -0.57 1.65 -0.07 - 0.34 0.5
0.12 -3.35 2.66 - 1.72 1.51 1.31 - - -1.67 - -0.39 -0.78 - 0.99 -1.1 - - -0.86 -1.49 - -0.04 - -2.21 - -2.23 - - 3.48 -0.87 -2.45 -0.36 -0.78 - -3.21 - 0.03 -2.81 -3.86 - - - - 1.59 - - 2.97 -
0.14 0.91 0.5 0.69 0.3 -0.28 0.39 -1.1 0.62 -1.56 0.53 2.29 -1.4 0.23 -0.91 0.18 -0.57 -1.12 -0.32 0.79 -0.57 0.3 0.31 -0.3 -2.14 -0.36 -0.72 0.26 0.15 -1.65 0.39 -0.96 -0.38 -0.08 -0.15 -0.17 0.81 0.19 1.46 -1.13 -2.7 -0.33 -1.2 0.39 -1.68 - -3.37 -1.59
-1.9 2.05 -6.27 -3.73 -6.31 -6.47 -4.48 - -9.01 -9.08 -8.18 - - 0.98 -0.01 -0.61 -3.24 -2.23 -1.75 1.96 -0.83 1.04 1.99 -0.66 -6.3 -0.87 -6.25 2.15 -1.78 -6.92 1.46 -0.41 -0.09 -1.93 2.22 0.3 -0.64 0.82 -2.46 -1.9 - -2.68 -2.06 1.4 -0.42 - 2.23 -0.26
-3.3 -0.24 -0.57 -0.28 -0.86 -1.19 -0.35 -2.49 -2.39 -3.09 -2.87 2.28 -1.06 0.1 0.06 -0.01 -0.36 -0.14 -1.12 0.05 -0.6 0.14 0.25 -0.36 -0.62 -0.18 0.6 0.5 -1.68 -0.53 -0.17 0.07 0.19 0.44 0.02 -0.02 0.45 0.34 1.11 -1.68 0.35 0.1 0.2 0.09 0.1 1.48 0.47 -0.05
-0.04 -0.11 -0.79 -1.47 -1.87 -3.98 -1.77 -0.81 0.33 0.35 1.05 1.75 -0.85 0.11 -0.46 -0.47 -0.16 -0.68 0.04 0.12 -0.63 -0.91 -0.38 -0.51 -1.78 -0.42 0.27 -0.5 0.45 -2.16 -0.5 -0.47 -0.77 0.04 -0.63 -0.08 0.49 -0.08 1.57 0.61 -0.58 1.18 0.69 -0.01 0.36 1.09 -0.04 -0.55
-3.82 0.34 -2.75 -1.87 -2.05 -1.78 -1.9 -1.55 -1.18 -2.02 -1.06 3.63 -0.25 0.29 -0.51 1.21 0.7 -0.16 -0.96 0.27 0.09 1.55 0.76 0.5 -2.85 1.15 -0.37 0.39 -1.37 -3.82 -0.93 0.38 0.43 -0.24 -0.72 -0.36 -0.57 0.34 0.12 -0.04 -5.56 -3.29 -4.12 -2.92 -4.4 -1.21 -9.94 -4.47
1.13 -0.08 1.91 1.97 1.66 0.86 2.1 -3.68 -2.37 -4.45 -2.95 -6.87 -1.35 -0.72 -1.69 -2.5 -1.92 -1.16 -2.08 -0.18 -1.3 -1.74 -0.11 -1.7 -1.8 -2.34 -2.22 0.12 -1.72 -1.39 -0.21 0.0 -1.48 -0.62 0.04 -1.5 -1.98 -0.6 -2.91 -3.28 -1.19 -0.23 0.59 1.65 0.8 1.0 0.62 1.64
0.38 -0.09 -0.25 0.74 -0.08 -2.0 0.55 -8.64 -6.07 -7.98 -6.56 -6.64 -7.8 0.24 -0.02 1.08 -0.23 -0.58 -1.72 0.72 0.07 0.98 1.12 0.06 0.06 0.6 1.31 0.05 -0.63 -0.04 -0.26 1.31 -1.23 -0.21 0.43 0.65 0.64 0.73 -1.05 -2.78 -2.32 -1.17 -0.91 0.55 -0.14 -4.68 1.64 -0.33
1.09 -0.09 0.55 0.5 0.35 0.53 0.5 0.9 0.83 -0.19 0.72 2.04 -0.18 -0.17 -0.35 -1.16 -0.85 -0.73 -0.2 -0.5 -1.31 -1.17 -1.76 -1.37 -1.95 -1.58 0.3 -1.18 0.03 -1.68 -1.45 -0.88 -1.8 -0.42 -1.08 -1.29 -0.5 -0.34 -0.32 -2.78 -3.29 0.21 0.68 0.0 -0.58 1.31 1.81 -0.03
0.66 0.21 2.79 1.83 1.97 -0.48 1.69 -5.72 -6.17 -5.37 -4.45 -5.52 - -0.54 -0.67 -0.99 -2.62 -2.19 -2.34 0.29 -0.81 0.57 1.11 -1.69 0.43 -3.06 -4.35 0.48 -0.84 0.61 -0.47 0.67 -1.88 -2.44 0.14 -2.87 -4.85 -0.5 -2.76 -3.36 - -2.77 -0.69 1.77 0.12 - 0.56 0.97
0.79 0.7 0.39 0.21 0.13 0.49 0.26 -0.83 -2.3 -3.16 -2.87 -4.07 -2.53 0.15 0.52 0.26 -0.22 -0.43 -1.2 0.4 -0.25 0.6 0.65 -0.41 -2.5 -0.26 -0.73 0.67 -0.42 -2.7 0.15 0.6 -0.06 -0.36 0.15 -0.36 -0.56 -0.18 -0.61 -2.8 -0.42 -0.05 0.96 1.18 0.31 1.23 0.86 0.49
-4.95 -3.25 1.59 3.29 1.69 - 3.62 - - - -1.45 - 0.22 - - - - -1.79 -1.71 -3.88 -2.76 - - -2.67 - - - - 2.84 -3.18 -2.55 - - - -2.89 - -2.29 -5.28 -5.13 - - - - -1.73 - -0.98 3.08 -
-0.11 0.28 0.28 0.11 0.31 0.61 0.52 -0.35 -0.64 -1.38 -0.96 2.43 -0.82 -0.22 -0.1 0.73 0.27 0.19 -0.93 -0.15 0.28 0.49 0.11 0.17 -1.45 0.56 -0.45 0.26 -1.57 -2.51 -0.2 0.08 0.31 -0.18 -0.53 0.03 0.62 0.1 0.91 -2.95 - -0.38 -0.22 0.25 -0.51 -3.22 -3.79 -0.57
1.61 0.46 1.19 0.85 0.78 0.18 0.89 -0.81 -0.7 -2.5 -1.74 1.18 -3.08 -0.24 -0.54 -0.87 -0.83 -0.77 -0.97 -0.01 -0.68 -0.38 0.12 -0.74 -1.56 -1.01 -0.08 0.35 0.1 -2.15 0.14 0.01 -0.56 -0.81 -0.01 -0.74 -0.17 -0.37 -0.43 -1.72 -0.22 -0.45 -0.07 1.07 0.25 0.67 0.96 0.65
2.88 -1.13 0.55 0.03 -0.56 -2.17 -0.2 - - -5.16 - -6.27 - -2.54 -2.01 -4.04 -2.0 -3.73 -0.19 -1.38 - -4.58 -4.43 -3.45 -1.52 -5.51 -0.53 0.54 0.21 0.3 -0.71 -2.66 -4.05 -5.12 -3.83 -1.6 -0.61 -3.33 -3.02 0.31 -0.53 -2.09 -2.01 -2.73 -4.32 3.55 3.61 -3.91
0.66 0.49 1.16 0.59 0.89 0.27 0.63 -0.25 -0.35 -1.09 -0.82 1.06 -1.27 -0.11 0.36 -0.56 -0.39 -0.92 -0.39 0.44 -0.57 -0.43 0.1 -0.61 -1.43 -0.86 -0.08 0.83 0.84 -1.31 -0.03 -0.11 -0.44 -0.41 0.6 -0.69 -0.4 -0.05 0.25 -0.65 -2.3 0.16 0.1 0.79 -0.2 -3.83 0.06 0.08
-0.84 -0.8 -1.88 -2.37 -1.96 -1.05 -2.06 1.46 1.62 2.03 2.3 2.12 1.74 -0.6 -0.93 -1.28 -0.63 -1.19 1.08 -0.5 -0.88 -1.28 -1.11 -1.52 -0.94 -1.5 0.02 -1.95 -2.52 -1.04 -1.39 -0.57 -1.34 -0.22 -1.4 -0.87 0.11 -0.82 -0.14 -1.67 -1.03 -0.43 -0.08 -0.25 -0.88 0.88 -0.1 -1.31
0.8 1.12 1.02 1.54 0.35 -2.33 1.01 - - -7.25 -5.87 - - -0.35 0.88 -1.75 -1.54 -0.57 -1.76 0.96 -0.65 0.69 1.44 -0.33 -3.31 -1.14 -4.58 0.53 0.1 -3.73 1.52 -0.08 -0.96 -0.38 1.19 -0.29 -0.4 0.09 -2.03 - - -0.92 0.35 1.69 1.21 - -1.52 1.36
-0.96 2.68 0.02 -0.03 1.01 1.39 -0.25 -1.8 -1.73 -4.14 -7.18 -5.54 -4.33 -1.86 0.46 -2.57 -3.06 -1.52 -1.99 2.46 0.6 -4.08 -0.45 -1.12 -5.81 -3.36 -6.13 2.44 -2.77 - 1.42 -0.45 -1.68 -1.15 1.53 - -7.02 0.59 -4.79 -0.9 - -6.14 -4.26 1.58 -0.78 - 1.6 -0.77
1.33 -0.74 2.14 1.15 1.2 0.22 1.02 -0.19 0.58 -0.21 0.87 1.95 -0.31 -1.14 -1.07 -1.67 -2.34 -1.59 0.52 -0.63 -0.52 -0.56 -0.38 -1.09 -1.67 -1.67 -0.43 -0.3 -0.37 -2.12 -0.22 0.33 -1.32 -1.57 0.34 -0.37 -0.07 -0.99 -1.2 -1.83 -1.37 -1.05 -0.74 0.33 -0.12 -6.57 0.94 -0.42
1.66 -0.01 -1.01 -0.57 -1.33 -0.88 -0.81 0.45 0.5 -0.96 -0.06 1.53 -0.82 -0.18 -0.34 -0.67 -0.48 -0.45 -0.21 -0.04 -0.31 -0.75 -0.56 -0.67 -1.66 -0.6 0.65 -0.18 0.27 -2.62 -0.08 -0.44 -1.09 -0.54 -0.47 -0.04 0.86 -0.43 0.7 1.18 -1.41 0.25 0.14 -0.42 0.24 1.16 1.0 -0.9
1.07 -5.87 3.01 -0.48 1.9 0.31 -1.09 -2.37 -6.19 -5.98 -6.68 -8.03 0.55 -2.05 -6.79 -3.4 - -9.9 -2.31 -6.72 - -6.32 -7.39 -4.83 -3.82 -4.72 0.3 -5.87 -1.25 - -4.35 -4.89 -3.4 -3.33 -5.01 -4.49 -3.47 -3.15 -1.67 0.23 3.31 -3.05 -4.46 -5.31 -2.99 3.45 2.13 -7.04
-1.16 1.72 3.35 3.43 2.75 -0.0 3.01 - -5.21 -4.07 -4.76 - - -1.25 -0.64 - -5.08 -5.34 -1.06 0.23 - - - -1.52 - -4.91 - - -4.31 - 1.96 - - - -6.3 - - -1.74 - - - - - - - - - -5.98
-0.57 0.1 1.94 2.19 1.62 0.61 1.79 -2.72 -4.23 -3.39 -4.38 0.45 -2.39 -0.63 -1.26 -2.56 -2.45 -0.88 -0.98 0.3 -1.52 -0.58 0.5 -0.41 -4.51 -1.8 -6.06 1.23 0.9 -7.74 0.68 0.0 -1.27 -0.9 1.52 -0.48 -5.29 0.2 -4.16 -7.18 - -1.15 0.41 1.22 0.44 -6.88 -0.21 0.79
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0.99 2.04 0.32 1.11 -0.07 -0.88 0.78 -1.62 -0.1 -1.1 -0.21 2.93 1.06 0.3 0.12 -1.9 -3.23 -1.51 -1.16 1.19 -1.69 0.24 0.63 -1.79 -1.93 -2.48 -3.83 -0.51 1.39 -2.75 0.52 -2.61 -1.03 -1.23 -0.11 -0.65 -4.26 -0.21 -0.97 -1.73 -3.81 -1.23 -0.77 0.61 -1.39 - -0.93 -0.86
-0.39 0.03 -0.18 -0.12 -0.37 -1.03 -0.24 -2.37 -2.15 -2.74 -2.08 2.81 -1.6 0.17 -0.24 0.36 -0.53 -0.49 -1.23 -0.02 -0.41 0.89 0.66 -0.11 -0.04 0.04 -0.01 1.21 -0.97 0.01 -0.44 0.61 0.49 0.38 0.21 -0.14 -0.15 0.31 1.06 -1.89 -2.71 -1.09 -1.22 -0.03 -0.98 -2.49 0.53 -1.07
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2.55 -0.74 -3.79 - -2.52 -0.5 -6.09 -3.5 - - - - -0.15 -2.13 -5.11 - - - -8.12 -0.24 -4.79 - - -0.8 -6.59 -1.64 - 2.81 0.34 -6.94 -3.88 -0.86 -1.92 -2.16 2.77 - -6.35 -0.05 -10.04 - - -2.37 -1.46 3.4 -0.28 - 2.87 0.22
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1.19 1.65 -6.97 -5.34 -6.39 -4.76 -5.51 - - - - - - 1.04 1.7 -0.19 -1.32 -1.54 -1.8 1.2 -0.79 -0.65 0.03 0.13 -1.14 -0.0 -1.48 1.57 -1.54 -0.92 1.38 -0.75 -0.1 -0.93 0.85 -0.84 0.2 0.09 0.62 -0.54 -4.94 0.52 -1.0 1.06 -0.73 - 2.81 -0.18
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0.68 0.79 0.32 -0.15 -0.48 -4.11 -0.35 -9.28 -9.09 -7.74 -7.46 - -8.01 0.21 -0.8 -0.29 -0.92 -1.29 -1.7 0.9 -0.43 0.08 0.86 -0.47 -1.2 -0.75 -0.61 0.74 -0.14 -1.51 0.81 0.28 -0.29 -0.14 1.13 -0.05 0.84 0.45 0.16 -0.78 -1.97 1.46 0.44 1.77 0.5 0.45 0.62 0.64
1.82 0.58 -0.02 -0.12 -0.11 -0.45 -0.12 -0.81 -1.03 -2.26 -1.6 2.28 -1.22 0.15 0.11 -0.28 0.13 -0.72 -1.32 0.28 -0.39 -0.34 0.01 -0.22 -2.44 -0.04 0.18 -0.5 -0.05 -3.1 -0.12 -0.41 -0.67 -0.28 -0.75 0.12 0.62 0.04 0.76 -1.23 -2.35 0.23 0.51 0.22 0.3 1.12 -2.54 -0.45
1.66 0.12 -0.87 -1.32 -1.21 -1.38 -1.33 -0.24 0.56 0.5 1.1 2.01 -1.14 -0.25 0.16 -0.88 -0.72 -1.45 0.22 0.41 -0.87 -0.89 -0.49 -0.62 -0.8 -0.5 -0.02 -0.91 -0.62 -0.37 -0.36 -0.77 -1.28 -0.64 -0.56 0.24 0.94 -0.62 1.61 -0.1 -1.32 -0.21 -0.11 -0.13 -0.79 0.65 1.07 -1.41
2.1 0.62 1.06 1.14 1.08 0.73 1.35 -0.61 -1.51 -3.23 -2.75 - -3.29 -0.21 -0.67 -0.42 -0.49 -0.95 -1.1 0.41 -0.02 -0.03 0.21 -0.52 -2.21 -0.58 -1.08 -0.14 -0.01 -2.24 0.44 -0.21 -0.85 -0.68 0.7 -0.04 -0.18 0.07 -0.58 -1.05 -2.9 -0.03 -0.01 0.93 0.19 -3.28 1.18 0.05
0.77 0.84 0.95 0.45 0.53 0.61 0.31 -0.48 -0.94 -1.42 -1.0 1.89 0.66 0.02 -0.69 0.07 -0.16 -0.91 -0.77 1.03 0.4 0.57 0.52 -0.17 -2.42 -0.27 -1.68 0.33 0.1 -2.14 0.63 -0.4 -0.83 -1.03 -0.12 0.24 0.16 0.12 -0.62 -0.48 -0.98 -1.48 -0.47 0.81 -0.65 -4.75 - -0.33
-0.49 0.3 -0.98 -1.62 -1.17 -1.74 -1.55 -0.74 0.07 -0.54 0.15 2.42 -0.52 0.55 0.42 -0.28 0.2 -0.4 0.12 0.08 -0.37 -1.23 -1.31 -0.68 -1.73 -0.56 0.56 -0.74 -2.64 -0.72 -0.67 -0.98 -1.02 0.17 -1.18 0.06 0.97 0.12 1.48 -3.58 -1.75 1.59 0.65 -0.15 0.01 0.94 0.67 -1.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.