Heatmap: Cluster_237 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.27 0.07 1.04 1.35 1.21 0.19 1.09 0.0 0.03 0.05 0.03 0.03 0.02 0.29 0.08 0.12 0.0 0.03 1.46 0.21 0.0 0.04 0.0 0.11 1.84 0.1 0.25 0.04 1.82 1.06 0.02 3.68 1.49 1.55 0.01 0.56 17.46 0.46 90.65 2.7 0.36 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0
1.09 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.19 0.16 0.7 0.02 0.02 0.04 0.25 0.55 0.66 1.93 0.1 0.02 0.2 0.1 0.0 0.17 0.01 1.83 0.01 0.65 0.57 1.66 1.65 19.77 5.81 28.84 2.07 0.0 0.45 0.19 0.2 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 19.85 0.79 4.3 3.43 3.22 2.4 0.91 0.43 0.83 1.05 0.23 1.01 10.0 13.74 2.51 1.81 0.79 1.11 8.98 0.79 1.9 2.56 3.43 1.18 4.11 8.73 5.46 3.34 0.88 5.15 0.53 4.1 2.54 2.08 4.03 12.23 5.94 30.04 0.0 1.01 2.01 2.92 4.01 1.6 14.19 0.0 1.43
5.39 0.51 1.33 1.09 1.47 0.54 0.83 0.51 0.57 0.87 0.85 0.14 0.38 8.44 2.4 3.89 0.29 0.34 0.83 0.77 0.83 0.34 0.28 7.54 5.95 17.63 82.99 0.4 7.35 0.62 0.47 2.06 3.63 3.33 0.13 0.24 52.35 5.06 23.53 0.1 0.15 1.77 0.53 0.36 0.41 0.0 0.0 0.25
0.15 0.05 14.12 9.17 9.31 2.87 7.99 1.64 0.85 0.09 0.2 0.02 0.21 0.8 1.38 4.17 0.01 0.01 0.34 0.05 0.05 0.08 0.27 0.54 0.07 1.3 1.12 0.08 1.26 0.02 0.09 0.1 1.55 0.93 0.03 0.12 12.89 1.58 27.46 0.08 0.0 5.44 0.7 0.02 4.0 0.0 0.0 0.06
2.76 4.15 4.59 4.26 4.53 3.23 4.08 3.75 2.41 1.74 3.09 17.14 2.28 14.37 4.95 7.88 6.4 3.19 6.97 3.19 9.43 2.89 2.38 4.7 8.47 7.97 31.28 2.66 3.63 8.61 3.24 3.22 2.5 2.55 2.13 3.09 7.4 4.39 17.81 1.89 2.58 3.19 1.84 1.76 1.39 0.0 2.8 0.93
0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 1.45 0.15 0.0 0.03 0.21 0.0 0.22 0.0 0.43 0.0 0.4 0.16 0.0 0.0 0.0 3.3 0.03 0.85 0.03 0.15 1.99 23.2 11.82 67.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0
5.08 2.26 0.0 0.3 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.24 6.56 3.72 59.7 113.59 22.42 1.74 7.47 5.2 16.72 4.74 17.22 1.82 14.81 0.25 0.64 2.28 0.07 1.25 4.11 1.24 3.75 1.56 49.19 32.64 6.6 117.21 3.37 0.47 13.55 1.94 0.0 2.76 0.0 0.02 0.06
0.19 0.03 0.36 0.97 0.99 3.42 0.69 0.23 0.23 0.01 0.04 0.0 0.0 0.5 0.38 0.36 0.01 0.03 0.02 0.07 0.64 0.02 0.03 0.05 0.01 0.09 0.17 0.01 0.03 0.0 0.01 0.04 0.91 0.48 0.01 0.22 9.19 0.6 9.82 0.8 0.0 0.22 0.05 0.0 0.22 0.0 0.0 0.02
16.15 1.25 0.16 0.39 0.11 0.07 0.41 0.05 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 3.78 5.67 9.6 0.22 0.41 0.37 0.72 3.34 6.25 2.74 3.68 0.72 7.3 12.88 0.19 0.06 0.04 0.31 0.29 6.03 0.64 0.47 2.57 10.0 6.15 11.61 0.75 0.06 0.25 0.06 0.14 0.07 0.0 0.0 0.17
37.06 14.3 0.4 0.13 0.41 0.14 0.19 0.0 0.02 0.01 0.05 0.0 0.0 21.67 28.75 76.75 39.0 4.63 11.06 23.97 4.46 7.86 3.88 29.13 50.96 27.59 77.99 0.71 3.09 29.6 7.49 6.54 7.65 9.24 5.68 23.15 221.05 20.66 275.47 6.35 3.66 8.97 2.0 0.0 3.88 34.24 0.01 0.06
0.25 0.5 0.14 0.11 0.2 0.16 0.02 0.07 0.0 0.01 0.03 0.05 0.19 6.56 0.91 2.85 0.1 0.11 0.23 1.11 0.1 1.73 1.71 2.82 0.82 3.34 1.61 1.41 0.12 0.97 0.12 2.2 12.44 11.27 0.45 12.56 62.84 10.98 63.07 4.14 0.17 22.43 2.19 0.84 3.49 0.0 0.01 0.28
0.0 0.02 0.0 0.2 0.06 1.55 0.13 2.75 0.45 0.1 0.05 0.0 0.33 0.12 0.31 4.86 0.0 0.0 0.0 0.31 9.06 0.0 0.98 0.13 0.04 0.06 0.0 0.0 0.02 0.03 1.06 0.02 0.86 0.16 0.4 0.49 1.27 2.86 21.03 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
0.13 0.31 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.71 0.8 15.24 0.14 0.0 0.02 0.83 0.05 1.6 2.82 4.92 0.03 7.7 0.2 0.07 1.0 0.04 0.44 0.35 4.52 0.43 0.86 12.64 64.74 27.37 277.41 14.57 13.58 1.02 0.17 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0
5.45 2.5 13.81 18.64 18.81 25.82 27.54 17.28 24.69 10.55 17.68 0.17 12.82 5.15 3.53 11.25 5.05 7.29 11.05 2.55 9.25 10.38 8.36 3.58 24.42 4.46 9.18 13.77 5.7 20.95 0.5 40.87 9.52 19.18 3.36 7.33 22.66 12.49 93.83 13.37 13.2 17.37 10.27 7.58 3.4 0.0 1.47 1.9
4.25 11.28 3.69 0.62 2.04 0.41 0.99 0.01 0.05 0.07 0.04 0.14 0.15 13.1 10.18 19.31 8.9 4.55 0.72 10.93 2.9 8.33 6.52 10.84 3.08 15.89 15.35 2.87 3.88 1.26 5.72 4.44 14.37 24.38 5.04 7.74 55.37 12.85 23.1 1.2 0.22 30.09 1.95 2.73 4.18 0.0 0.0 1.36
6.37 10.39 0.46 0.41 0.61 0.02 0.57 0.29 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 22.42 14.16 25.44 5.05 6.81 2.64 14.29 3.71 17.68 17.42 8.7 2.68 13.0 34.16 27.13 3.72 0.22 4.58 15.79 29.57 34.12 8.31 8.38 77.04 17.36 351.58 190.4 48.58 45.27 19.36 4.9 13.04 0.05 0.0 5.5
20.77 7.39 16.19 40.21 59.97 66.03 58.81 1.26 1.12 0.9 0.93 0.8 0.71 11.81 5.62 8.3 6.43 5.45 2.14 9.63 9.67 4.09 5.37 7.23 7.55 7.65 4.82 10.08 11.08 8.59 4.26 6.05 4.99 8.96 5.91 20.86 53.68 12.37 106.55 18.54 24.37 9.15 7.05 10.91 5.68 0.0 11.41 5.85
74.22 3.28 0.93 0.55 0.69 0.27 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 19.91 10.7 37.17 20.3 35.11 4.17 4.67 2.07 11.32 11.0 33.41 18.68 36.19 104.65 0.89 46.48 2.99 3.36 23.85 11.4 33.32 3.42 100.6 334.55 24.23 243.4 17.78 114.67 57.45 21.81 3.24 12.51 1.38 57.0 8.17
0.0 0.0 0.01 0.04 0.23 1.37 0.1 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.02 0.1 0.0 0.02 0.36 0.26 25.57 0.05 0.0 0.12 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01
8.2 0.18 0.04 0.0 0.11 0.0 0.1 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 10.39 0.2 1.74 0.13 0.0 0.21 0.2 0.18 0.82 2.85 4.51 5.91 4.75 87.65 0.21 0.45 0.18 0.03 2.96 7.34 3.9 0.19 10.87 217.15 10.65 140.36 2.49 3.39 11.4 2.0 0.15 3.14 0.0 0.0 0.2
69.15 11.8 3.38 5.65 2.52 0.29 4.39 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 27.57 11.9 30.37 39.28 13.8 2.61 23.64 20.69 7.31 10.76 37.65 2.21 50.23 30.86 6.47 6.69 0.29 12.08 5.22 14.55 16.68 6.62 52.04 146.1 26.06 229.8 22.1 3.76 26.94 11.16 3.78 12.41 0.0 25.0 3.88
0.0 0.14 0.09 0.56 0.38 0.0 1.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.0 0.1 0.0 0.0 0.04 0.01 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 2.28 0.07 0.07 0.0 0.16 0.03 0.3 0.32 0.07 0.0 0.0 0.04 5.53 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.06 0.0 0.04 0.03
2.65 3.06 1.44 0.86 1.33 0.4 0.65 0.16 0.01 0.04 0.07 0.01 0.44 2.75 1.93 3.45 1.59 1.28 0.71 2.61 1.9 3.05 2.61 1.74 1.24 2.27 2.51 4.12 2.61 1.36 1.76 2.15 1.66 2.08 1.37 1.75 6.96 2.62 11.61 1.67 2.93 1.26 0.83 0.64 1.22 0.0 0.26 0.39
23.32 4.15 0.59 0.46 1.0 1.7 0.33 2.66 0.87 0.32 0.29 0.0 33.31 8.79 3.76 7.69 1.47 0.89 1.51 5.69 6.22 2.99 5.06 5.64 4.5 7.24 12.85 2.74 2.72 3.14 2.4 2.97 6.44 11.11 3.39 18.24 84.36 13.27 170.62 16.03 10.82 27.65 3.42 4.82 5.73 0.2 58.47 4.09
0.58 2.36 0.62 0.23 0.94 1.19 0.08 0.9 0.56 0.78 0.48 0.1 8.25 2.43 1.35 1.53 1.45 1.02 0.8 2.54 0.85 0.68 0.98 1.14 0.33 1.84 1.21 3.1 0.95 0.23 0.97 0.9 0.86 1.05 0.83 2.16 4.03 1.85 16.18 0.3 0.0 8.35 3.83 1.18 1.88 0.43 0.05 0.76
4.67 3.5 0.03 1.34 0.04 0.03 0.18 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 5.04 2.11 30.06 3.56 3.09 1.22 14.08 2.52 13.9 19.76 10.46 0.51 11.67 3.71 3.13 0.83 0.13 2.61 2.18 6.07 2.77 18.75 42.28 140.95 10.43 96.35 0.72 0.0 11.45 1.32 2.39 9.48 0.0 0.0 0.73
7.13 6.61 1.66 0.57 1.85 2.0 0.14 2.29 0.53 0.17 0.0 0.05 5.83 12.91 8.88 17.89 0.63 0.23 1.89 8.77 0.75 12.59 21.98 12.85 17.03 16.52 32.18 2.46 0.93 13.34 3.71 20.43 89.56 111.59 13.83 61.03 146.08 64.47 554.66 60.72 286.93 253.18 78.49 15.84 37.17 0.0 0.0 25.11
2.48 5.33 48.53 26.89 13.27 0.07 16.83 0.22 0.09 0.08 0.18 0.37 1.74 6.27 6.58 3.4 0.06 0.07 0.49 6.07 0.15 4.59 11.66 5.47 1.54 6.32 14.95 13.16 1.53 0.11 3.67 3.21 9.23 4.17 8.18 4.02 18.95 6.42 88.78 26.48 24.72 15.74 1.02 8.7 4.11 0.0 0.09 4.74
0.19 0.01 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.18 0.19 0.0 0.12 0.0 0.07 0.0 0.08 0.1 0.0 0.0 0.1 0.02 0.18 0.91 1.72 0.01 0.68 3.64 1.04 30.45 1.89 3.17 2.02 0.36 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0
0.22 0.59 0.34 0.34 0.02 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 3.97 1.62 4.85 41.76 0.89 0.58 1.5 0.76 0.08 4.66 0.0 6.44 0.1 0.0 0.42 0.1 0.34 8.65 1.74 17.76 0.01 1.65 2.0 1.37 3.82 0.28 0.0 0.74 0.31 0.0 0.28 0.0 0.0 0.02
0.2 0.71 0.0 0.04 0.01 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.81 0.19 0.55 0.01 0.02 0.0 0.83 3.61 0.14 0.08 0.82 0.02 0.56 0.19 0.0 0.0 0.0 2.63 0.07 1.56 0.16 0.04 0.17 1.35 1.69 6.79 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
11.87 0.14 2.07 0.0 1.31 0.26 0.01 0.06 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.33 0.05 1.72 0.04 0.01 0.11 0.08 0.04 0.13 0.52 0.08 0.02 0.08 0.05 0.0 0.08 0.0 0.55 0.01 0.65 0.03 0.58 0.18 5.76 1.9 10.97 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
4.61 6.86 0.21 0.13 0.47 0.3 0.16 0.18 0.02 0.01 0.07 0.0 1.24 9.07 3.54 35.71 1.14 2.46 0.85 13.26 0.45 3.53 4.47 15.76 0.12 15.16 0.25 4.27 0.88 0.02 9.4 0.66 7.6 3.89 2.06 4.42 26.73 13.14 447.48 3.73 0.06 36.1 10.62 3.06 2.84 2.72 0.04 1.25
0.03 0.17 0.2 0.15 0.09 0.02 0.08 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.9 0.23 0.86 0.03 0.01 0.1 0.25 0.07 0.14 0.25 0.61 0.19 1.24 4.19 0.04 0.63 0.01 0.15 0.0 0.89 0.44 0.12 1.0 12.55 1.9 20.24 0.81 0.66 0.17 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0
5.71 0.07 0.47 0.0 1.19 0.0 0.0 0.53 0.0 0.13 0.0 0.0 16.84 2.46 0.38 11.42 0.17 0.0 0.88 0.4 0.0 0.65 1.31 2.14 2.71 2.93 5.27 0.2 0.0 0.74 0.95 2.16 0.63 0.91 0.61 11.73 40.5 13.43 101.23 2.11 0.25 1.1 0.0 0.0 0.0 0.0 17.28 0.0
61.51 7.16 6.78 5.22 5.95 3.74 4.21 0.93 0.1 0.27 0.17 22.47 2.53 4.77 8.74 33.68 7.13 4.87 1.99 17.93 4.38 4.33 3.55 15.94 4.77 13.61 19.1 0.72 13.58 3.33 6.1 1.71 3.46 6.68 0.91 21.77 254.9 16.28 265.14 3.98 6.57 18.83 3.89 0.9 3.15 0.0 0.01 0.87
0.12 0.05 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 1.06 0.07 0.04 0.08 0.0 0.05 0.21 0.17 1.24 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.12 0.2 0.13 0.0 0.13 0.07 0.0 0.23 0.04 0.09 0.0 0.19 0.0 0.08 1.94 8.88 4.17 114.34 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0
0.08 0.03 0.13 0.24 0.08 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.58 0.23 0.93 0.01 0.08 0.08 0.11 0.02 0.31 0.49 0.05 0.04 0.06 0.48 0.03 0.1 0.01 0.14 0.09 1.63 1.47 0.43 0.81 9.51 3.05 20.15 0.57 0.52 3.46 0.1 0.0 1.25 0.0 0.0 0.03
1.48 0.02 0.07 0.11 0.05 0.24 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.47 0.46 1.58 0.0 0.0 0.02 0.04 0.05 1.1 0.17 0.15 0.72 0.36 3.84 0.01 0.78 0.9 0.05 0.16 2.19 0.49 0.02 1.72 17.76 2.25 38.36 0.07 0.15 0.15 0.17 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
32.56 1.27 0.98 1.23 1.31 2.41 4.27 0.12 1.96 0.08 0.19 0.03 0.0 1.94 0.51 28.75 0.08 0.26 1.16 4.15 0.12 2.08 2.89 6.57 0.37 6.5 0.48 2.52 7.57 0.14 3.4 0.94 2.27 3.09 0.28 5.09 37.04 28.42 57.61 8.11 0.0 70.91 15.38 0.54 10.04 0.52 136.01 0.23
0.74 21.83 0.37 0.16 0.66 0.35 0.29 0.07 0.11 0.03 0.07 0.22 0.0 22.48 5.14 11.73 2.23 2.27 4.69 21.3 2.74 19.0 14.76 9.24 6.33 14.92 52.29 20.37 2.41 3.61 11.07 11.25 16.2 18.49 13.01 10.77 78.05 25.56 34.1 0.7 1.45 62.92 37.45 4.04 15.53 0.0 0.0 6.1
3.11 15.89 7.31 5.21 6.74 5.64 6.54 0.43 0.25 0.16 0.19 0.0 0.37 11.58 9.79 8.26 5.41 6.36 7.67 12.7 8.35 7.86 6.57 7.26 4.18 8.1 34.54 15.72 8.41 2.14 7.74 8.23 10.56 21.73 7.94 6.0 57.11 13.63 20.87 0.7 0.48 173.64 30.76 16.59 19.87 8.18 0.34 10.77
1.64 0.96 0.95 0.09 0.8 0.22 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.62 0.76 19.35 0.16 0.07 0.5 6.23 0.08 6.34 14.87 3.42 0.21 2.78 0.45 0.49 1.54 0.0 1.88 0.58 7.11 1.4 1.13 22.17 86.4 42.43 548.11 10.49 0.0 7.27 1.92 0.15 1.74 0.0 0.0 0.47
0.72 0.49 10.32 8.11 6.7 4.19 6.96 3.03 4.28 0.98 1.76 0.03 3.76 1.43 0.7 1.28 0.25 0.37 1.56 1.02 0.51 1.17 0.5 0.78 0.27 0.88 1.12 1.63 0.4 0.17 0.41 2.17 2.17 3.55 1.31 2.9 5.46 4.1 6.48 0.51 2.68 24.2 5.48 0.27 3.84 0.6 0.01 0.44
3.91 3.74 0.98 2.2 1.28 0.58 2.28 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 4.32 6.0 2.36 6.76 8.69 1.3 3.61 19.07 1.27 1.09 4.23 4.98 5.04 6.66 0.74 1.82 5.84 2.82 1.16 1.62 2.53 1.23 0.86 11.57 2.56 5.21 0.06 0.33 2.74 0.25 0.14 2.8 0.0 0.0 0.06
2.75 5.82 4.44 3.88 3.29 1.17 2.56 0.0 0.05 0.02 0.07 0.04 0.0 4.09 7.1 4.78 6.28 4.04 1.02 5.26 4.41 4.9 6.1 3.81 1.14 4.47 2.4 2.2 1.38 0.82 5.15 3.27 4.43 4.4 3.48 6.18 8.12 5.56 4.92 3.46 0.0 3.65 6.63 5.31 4.66 0.0 0.0 3.01
40.56 15.09 29.47 20.99 20.1 9.06 21.39 1.87 0.73 0.45 0.2 0.0 0.93 19.0 16.04 23.75 15.17 6.17 11.47 26.15 23.75 7.7 9.18 21.74 13.32 29.49 36.69 20.51 28.75 13.66 10.09 13.99 11.93 14.49 4.94 50.21 75.7 14.63 211.38 50.56 16.32 24.31 6.89 3.47 8.03 12.27 39.93 1.47
0.04 0.02 0.7 0.18 0.37 0.05 0.18 0.0 0.0 0.0 0.02 0.41 0.13 0.75 0.08 0.99 0.06 0.02 0.02 0.05 0.04 0.12 0.07 0.61 0.7 1.31 3.99 0.05 0.02 0.62 0.0 1.18 2.63 4.96 0.19 0.63 25.57 3.12 53.29 4.08 4.69 9.94 1.18 0.04 0.95 0.0 0.0 0.05
87.13 124.64 13.44 10.9 15.39 6.05 10.27 0.15 0.11 0.2 0.4 0.18 0.39 123.24 62.43 141.48 282.25 137.71 39.7 162.74 49.19 64.9 37.55 119.67 70.69 120.15 372.2 69.01 269.82 42.07 50.28 48.19 61.14 85.76 27.01 127.86 466.54 111.46 564.49 52.57 57.17 169.98 109.58 9.63 44.49 255.03 11.74 20.55

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)