Heatmap: Cluster_216 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg cell	Ovule	Uninucleate microspore (Col-0)	Uninucleate microspore (Ler-0)	Pollen (bicellular, Col-0)	Pollen (late bicellular, Col-0)	Pollen (bicellular, Ler-0)	Pollen (tricellular, Col-0)	Pollen (tricellular, Ler-0)	Pollen (mature, Col-0)	Pollen (mature, Ler-0)	Sperm	Pollen tube (Col-0)	Flower (receptacles)	Flower (floral buds)	Flower (sepals)	Flower (petals)	Flower (stamen filaments)	Flower (anthers)	Flower (carpels)	Flower (stigmatic tissue)	Pedicel	Axis of the inflorescence	Silique	Silique (senescent)	Pods of siliques	Pods of siliques (senescent)	Embryo	Endosperm	Seed	Seed (young)	Seed (germinating)	Seedling	Seedling (etiolated)	Meristem	Stem (internode)	Stem (internode, senescent)	Stems	Leaf (rosette)	Epidermis cells	Mature guard cells	Root (differentiation zone)	Root (elongation zone)	Root (meristematic zone)	Root (apex)	Root (stele)	Root (QC cells)	Root (tip)
AT1G09310	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.34	0.01	0.0	0.01	0.01	0.26	0.01	0.65	0.49	0.48	0.0	0.53	0.0	0.01	0.02	0.0	0.03	0.23	0.43	1.0	0.01	0.91	0.06	0.22	0.12	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT1G10560	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.06	0.14	1.0	0.24	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.04	0.0	0.06	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.0	0.02	0.08	0.09	0.09	0.0	0.12	0.07
AT1G11410	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.33	0.33	1.0	0.35	0.04	0.07	0.04	0.12	0.05	0.16	0.02	0.18	0.06	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.08	0.07	0.0	0.08	0.09	0.06	0.04	0.02	0.58	0.01	0.0	0.0	0.0	0.3	0.18	0.0
AT1G14700	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.09	0.0	0.0	0.07	0.09	0.02	0.01	0.34	0.29	0.03	0.03	0.14	0.11	0.05	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.57	1.0	0.9	0.23	0.31	0.02	0.23	0.15	0.12	0.0	0.17	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
AT1G15260	0.01	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.32	0.38	1.0	0.22	0.11	0.1	0.06	0.09	0.02	0.16	0.0	0.19	0.0	0.03	0.0	0.0	0.04	0.08	0.12	0.04	0.02	0.02	0.0	0.05	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0
AT1G45010	0.02	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.21	0.36	0.62	0.29	0.08	0.34	0.18	0.79	0.51	1.0	0.0	0.84	0.0	0.02	0.01	0.0	0.22	0.32	0.17	0.3	0.1	1.0	0.02	0.22	0.09	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
AT1G53230	0.01	0.44	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.15	0.17	0.57	1.0	0.34	0.21	0.37	0.4	0.03	0.02	0.39	0.03	0.49	0.08	0.23	0.07	0.02	0.35	0.59	0.43	0.32	0.03	0.03	0.02	0.1	0.21	0.04	0.07	0.07	0.03	0.01	0.11	0.0	0.0	0.01
AT1G54820	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.16	1.0	0.06	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.1	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
AT1G60590	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.04	0.03	0.07	0.06	1.0	0.06	0.01	0.02	0.02	0.1	0.01	0.08	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.1	0.01	0.05	0.02	0.0	0.03	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT1G66400	0.03	0.01	0.04	0.11	0.05	0.02	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.05	0.05	0.15	1.0	0.35	0.23	0.06	0.08	0.02	0.02	0.11	0.03	0.1	0.16	0.02	0.01	0.0	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.03	0.01	0.06	0.08	0.0	0.05
AT1G69530	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.36	0.16	1.0	0.69	0.13	0.04	0.12	0.01	0.01	0.19	0.01	0.49	0.03	0.01	0.01	0.0	0.02	0.56	0.34	0.07	0.07	0.05	0.01	0.08	0.05	0.02	0.01	0.08	0.25	0.02	0.01	0.0	0.09	0.04
AT1G70280	0.03	0.18	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.2	0.15	0.31	0.25	0.07	0.2	0.08	0.13	0.11	0.24	0.0	0.28	0.02	0.2	0.06	0.0	0.2	0.21	0.18	0.11	0.13	0.12	0.05	0.15	0.05	0.03	0.08	0.05	0.24	0.18	0.13	1.0	0.01	0.15
AT1G72240	0.02	0.07	0.0	0.0	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.22	1.0	0.96	0.04	0.21	0.38	0.26	0.1	0.23	0.0	0.2	0.0	0.02	0.01	0.0	0.13	0.04	0.02	0.02	0.01	0.27	0.02	0.06	0.02	0.0	0.0	0.26	0.18	0.0	0.28	0.06	0.0	0.1
AT1G74670	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.32	0.45	1.0	0.11	0.01	0.01	0.03	0.01	0.0	0.55	0.0	0.98	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.28	0.03	0.0	0.06	0.0	0.08	0.14	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT1G76620	0.07	0.86	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.49	0.62	0.53	1.0	0.02	0.47	0.13	0.95	0.61	0.74	0.02	0.47	0.03	0.65	0.17	0.0	0.94	0.08	0.14	0.23	0.21	0.61	0.05	0.41	0.07	0.04	0.01	0.02	0.11	0.18	0.19	0.01	0.0	0.08
AT2G17300	0.07	0.19	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.13	0.3	1.0	0.54	0.03	0.11	0.06	0.09	0.07	0.25	0.0	0.22	0.06	0.02	0.07	0.0	0.1	0.05	0.09	0.15	0.04	0.28	0.02	0.12	0.01	0.0	0.01	0.1	0.45	0.08	0.25	0.16	0.0	0.13
AT2G30150	0.02	0.55	0.07	0.08	0.05	0.03	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.52	0.82	1.0	0.48	0.08	0.47	0.31	0.51	0.45	0.12	0.0	0.12	0.04	0.01	0.07	0.0	0.25	0.42	0.39	0.44	0.2	0.62	0.04	0.29	0.13	0.08	0.01	0.21	0.27	0.17	0.14	0.01	0.02	0.12
AT2G34170	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.13	0.12	0.11	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.0	0.08	0.0	0.07	0.03	0.0	0.02	0.04	0.09	0.03	0.02	0.01	0.0	0.02	0.04	0.03	0.0	0.01	0.04	0.12	0.07	1.0	0.0	0.05
AT2G44740	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.07	0.16	0.18	1.0	0.31	0.02	0.07	0.03	0.02	0.05	0.11	0.0	0.13	0.0	0.01	0.29	0.0	0.06	0.04	0.04	0.12	0.03	0.08	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.04	0.38	0.01	0.2	0.53	0.0	0.12
AT2G45560	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.13	0.07	1.0	0.21	0.08	0.02	0.02	0.1	0.04	0.03	0.11	0.05	0.01	0.0	0.0	0.14	0.01	0.05	0.04	0.02	0.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT2G46710	0.01	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.2	0.25	1.0	0.17	0.02	0.09	0.06	0.13	0.12	0.08	0.02	0.14	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.11	0.14	0.17	0.03	0.15	0.05	0.1	0.08	0.04	0.0	0.08	0.2	0.03	0.11	0.99	0.0	0.05
AT3G03770	0.01	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.26	0.21	1.0	0.13	0.04	0.15	0.09	0.19	0.25	0.21	0.02	0.32	0.03	0.25	0.03	0.01	0.11	0.15	0.12	0.03	0.18	0.19	0.07	0.22	0.07	0.11	0.0	0.06	0.05	0.06	0.04	0.0	0.0	0.03
AT3G15030	0.02	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.08	0.4	1.0	0.16	0.06	0.04	0.09	0.02	0.0	0.05	0.02	0.09	0.01	0.14	0.02	0.02	0.04	0.19	0.22	0.13	0.02	0.01	0.0	0.04	0.1	0.1	0.05	0.09	0.03	0.02	0.03	0.0	0.0	0.01
AT3G18850	0.31	0.53	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.29	0.23	0.68	1.0	0.25	0.43	0.11	0.39	0.31	0.18	0.0	0.13	0.0	0.07	0.13	0.01	0.2	0.02	0.04	0.05	0.11	0.11	0.02	0.12	0.01	0.05	0.03	0.0	0.01	0.07	0.01	0.0	0.0	0.03
AT3G26450	0.04	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.21	0.13	0.02	0.0	0.01	0.08	0.35	0.11	0.05	0.15	0.0	0.13	0.05	0.02	0.01	0.0	0.05	0.09	0.45	1.0	0.01	0.12	0.12	0.08	0.12	0.04	0.08	0.16	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
AT3G48350	0.13	0.68	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.25	0.27	0.79	0.03	0.01	0.15	0.03	0.38	0.08	0.42	0.38	0.07	0.0	0.01	0.0	0.01	0.04	0.0	0.42	1.0	0.73	0.83	0.12	0.21	0.02	0.27	0.11	0.01	0.05	0.57	0.17	0.03	0.18	0.0	0.0	0.02
AT3G49260	0.01	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.31	0.53	1.0	0.11	0.1	0.15	0.17	0.2	0.14	0.2	0.01	0.25	0.02	0.51	0.15	0.0	0.1	0.27	0.68	0.23	0.02	0.18	0.01	0.28	0.23	0.13	0.41	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
AT3G52720	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.04	0.0	0.72	0.55	0.31	0.37	0.0	0.03	0.11	0.34	0.11	0.08	0.21	0.29	0.01	0.0	0.18	0.05	0.15	0.0	0.3	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.19	0.33	0.74	0.03	0.19	0.2	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
AT3G56300	1.0	0.84	0.67	0.34	0.47	0.25	0.26	0.08	0.02	0.03	0.03	0.0	0.04	0.33	0.49	0.21	0.31	0.14	0.11	0.58	0.18	0.3	0.37	0.22	0.01	0.19	0.04	0.43	0.2	0.01	0.37	0.22	0.2	0.11	0.28	0.25	0.01	0.27	0.05	0.07	0.0	0.18	0.45	0.62	0.15	0.17	0.0	0.32
AT4G09640	0.83	0.63	0.47	0.35	0.61	1.0	0.36	0.03	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.41	0.35	0.32	0.31	0.25	0.1	0.62	0.25	0.35	0.41	0.46	0.02	0.43	0.07	0.52	0.43	0.02	0.42	0.27	0.25	0.21	0.38	0.63	0.34	0.36	0.31	0.06	0.0	0.14	0.27	0.38	0.16	0.71	0.16	0.2
AT4G22200	0.01	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.46	0.51	1.0	0.46	0.1	0.11	0.14	0.23	0.19	0.09	0.02	0.15	0.29	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.13	0.01	0.02	0.22	0.45	0.08	0.15	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT4G23670	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.27	0.37	0.06	0.15	0.01	0.23	0.05	0.08	0.06	0.31	0.0	0.36	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.24	0.41	1.0	0.02	0.12	0.18	0.13	0.05	0.1	0.0	0.07	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
AT4G28780	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.09	0.28	1.0	0.02	0.05	0.04	0.17	0.16	0.0	0.47	0.0	0.39	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.01	0.18	0.02	0.01	0.33	0.0	0.07	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT4G37080	0.01	0.12	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.2	0.19	0.76	0.04	0.02	0.08	0.05	0.08	0.11	0.07	0.0	0.08	0.04	0.05	0.04	0.0	0.06	0.04	0.1	0.04	0.06	0.17	0.06	0.07	0.05	0.02	0.0	0.02	0.07	0.04	0.05	1.0	0.0	0.04
AT4G37800	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.01	1.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.28	0.14	0.02	0.01	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT4G38950	0.02	0.1	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.3	0.1	1.0	0.02	0.02	0.1	0.07	0.02	0.03	0.02	0.0	0.02	0.0	0.15	0.01	0.0	0.05	0.03	0.06	0.02	0.05	0.03	0.0	0.03	0.01	0.04	0.0	0.2	0.03	0.02	0.04	0.72	0.0	0.01
AT5G01015	0.02	0.27	0.02	0.02	0.02	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.22	0.92	0.25	0.25	0.05	0.35	0.15	1.0	0.56	0.5	0.0	0.73	0.0	0.02	0.05	0.0	0.06	0.07	0.35	0.03	0.18	0.34	0.0	0.18	0.12	0.11	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.14	0.3	0.01
AT5G03140	0.04	0.23	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.11	0.2	0.26	0.21	0.03	0.19	0.48	0.12	0.12	0.25	0.03	0.28	0.04	0.2	0.14	0.02	0.22	0.04	0.11	0.11	0.1	0.14	0.19	0.12	0.05	0.01	0.01	0.1	0.13	0.07	0.16	1.0	0.0	0.07
AT5G15310	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.73	0.87	1.0	0.18	0.11	0.34	0.04	0.25	0.16	0.51	0.0	0.53	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.1	0.26	0.12	0.03	0.06	0.03	0.07	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G16190	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.13	0.19	1.0	0.04	0.01	0.09	0.18	0.07	0.14	0.06	0.0	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.03	0.02	0.02	0.08	0.02	0.04	0.01	0.0	0.0	0.02	0.1	0.13	0.05	0.0	0.0	0.07
AT5G17700	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.09	0.03	1.0	0.08	0.02	0.04	0.11	0.02	0.0	0.07	0.05	0.09	0.0	0.1	0.07	0.03	0.0	0.05	0.03	0.08	0.0	0.01	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G21100	0.0	0.16	0.02	0.0	0.02	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.14	0.09	0.22	0.43	1.0	0.19	0.04	0.16	0.36	0.26	0.24	0.18	0.01	0.38	0.03	0.02	0.02	0.01	0.11	0.11	0.16	0.1	0.1	0.07	0.08	0.09	0.05	0.05	0.01	0.04	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
AT5G25840	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.03	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.06	0.0	0.07	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
AT5G41050	0.16	0.81	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.89	0.8	1.0	0.21	0.5	0.52	0.17	0.86	0.25	0.56	0.0	0.61	0.01	0.01	0.01	0.0	0.81	0.32	0.5	0.17	0.07	0.35	0.02	0.21	0.18	0.04	0.07	0.01	0.02	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0
AT5G49170	0.01	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.04	0.13	0.14	0.03	0.11	0.06	0.14	0.1	0.02	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.15	0.11	0.07	0.04	0.06	0.0	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.02	1.0	0.0	0.02
AT5G50610	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	1.0	0.38	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.13	0.0	0.02	0.0	0.0	0.03
AT5G50710	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	1.0	0.38	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.13	0.0	0.02	0.0	0.0	0.03
AT5G62100	0.01	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.17	0.09	0.57	0.09	0.01	0.09	0.0	0.02	0.01	0.14	0.05	0.16	0.0	0.03	0.03	0.01	0.06	0.05	0.19	0.11	0.02	0.08	0.0	0.03	0.06	0.01	0.05	0.14	0.05	0.0	0.02	1.0	0.0	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)