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Heatmap: Cluster_75 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.14 -0.31 -0.86 -4.13 -0.86 0.78 1.36 0.52 0.61 0.25 0.41 0.63 0.13 0.04 -0.14 -0.14 -0.17 -0.23 -0.1 0.13 0.12 0.55 0.08 -2.1 0.61 -0.64 0.07 0.2 0.04 -0.01 -0.25 -1.39 -1.66 -1.39 -1.7 0.09 -0.58 -0.58 -0.48 0.17 0.68 -0.18 -0.17 0.72 0.23 0.8 -0.02 -0.02 -0.21 -0.07 -0.01 -0.19 -0.16 -0.15
-0.46 -1.39 -4.56 -7.07 -2.45 0.57 0.96 0.2 0.88 -0.49 0.01 0.65 -0.31 -0.1 -0.23 -0.19 -0.12 -0.31 0.24 -0.1 -0.11 0.68 0.22 -0.63 0.64 -0.39 0.14 -0.1 -0.37 -0.05 1.64 -0.56 -0.78 -0.99 -0.65 0.32 -0.68 -0.7 -0.45 -0.12 0.47 -0.52 -0.36 0.37 0.17 0.31 -0.49 -0.2 0.4 0.13 0.07 -0.1 0.51 0.69
-3.63 - -0.32 0.23 -6.07 2.7 -1.21 - 0.22 -1.61 -0.83 -1.42 -3.53 -5.02 - - -1.43 - -1.81 -2.75 - - 0.74 -0.75 0.18 -2.46 -2.26 0.13 -1.66 -1.84 0.36 2.62 0.39 0.23 0.94 -0.33 -4.82 -4.72 - -4.61 -1.66 -2.73 -2.51 -0.93 -2.61 -4.52 -2.34 -1.47 0.66 0.95 -0.39 2.84 2.71 1.82
-1.41 -1.69 -2.14 -3.93 -0.57 0.79 0.62 -0.24 1.19 0.34 0.22 1.14 -0.68 -1.45 -0.62 -0.67 -0.7 -0.64 -1.29 0.59 0.28 -0.88 -0.72 -3.37 1.27 0.18 -0.38 -1.01 -1.63 -0.67 -0.92 -1.55 -3.64 -2.16 -3.39 0.05 -0.12 -0.16 0.15 -0.26 1.96 -0.54 -1.15 1.49 -0.71 2.08 -1.24 -1.29 -0.76 -0.42 -0.42 0.92 1.11 0.97
-0.24 -0.07 -0.09 -3.73 -0.52 0.69 0.24 -0.47 0.87 0.36 -0.13 0.96 0.09 0.27 -0.27 -0.39 -0.38 -0.36 0.04 0.12 0.47 -0.62 -0.17 -0.89 0.51 -0.63 -0.16 -0.19 0.02 -0.5 0.86 0.04 -0.32 -0.23 -0.29 0.19 -0.65 -0.51 -0.63 -0.43 0.88 -0.09 -0.11 0.77 0.06 0.89 -0.12 -0.05 -0.54 -0.25 -0.22 -0.01 -0.26 -0.26
0.77 0.09 -0.77 -5.69 -1.65 0.69 1.29 0.45 0.78 0.01 0.29 0.46 0.28 -0.11 0.23 0.23 0.28 0.18 -0.2 0.04 0.02 -0.08 0.08 -0.56 0.86 -0.25 -0.38 -0.19 -0.44 -0.27 -0.26 -1.7 -0.7 -1.55 -0.65 -0.67 -0.4 -0.56 -0.41 -0.66 0.64 -0.54 -0.47 0.62 -0.64 0.51 -0.6 -0.47 0.07 0.11 0.06 0.17 0.51 0.52
0.09 -0.07 -1.06 -5.06 -0.74 0.57 0.41 -0.27 0.63 -0.11 -0.21 0.81 0.32 -0.12 -0.27 -0.41 -0.19 -0.19 -0.02 0.55 0.66 0.13 -0.07 -2.08 0.66 -0.11 -0.07 -0.37 -0.22 -0.55 0.29 -0.27 -1.27 -1.48 -1.65 0.33 -0.23 0.05 -0.16 -0.47 1.11 -0.28 -0.34 0.77 -0.02 1.01 -0.38 -0.26 -0.31 -0.11 -0.16 0.59 0.25 0.31
0.42 0.28 -1.86 -6.24 -1.44 0.41 0.42 0.09 0.13 0.24 0.24 0.05 -1.92 -0.14 -0.14 0.17 0.04 -0.02 -0.24 -1.23 -1.52 0.09 -0.21 -1.19 0.87 -1.03 -1.1 -0.25 -0.16 -0.49 0.6 -0.97 -1.31 -0.18 -1.33 1.09 -0.75 -0.56 -0.89 -0.54 1.63 -0.68 -0.43 1.36 -0.45 1.71 -0.53 -0.17 -1.11 -0.6 -0.1 0.56 0.96 0.77
0.72 0.33 0.47 -2.6 0.36 0.95 0.62 -0.67 0.26 -1.02 -0.62 -0.35 -0.09 -0.56 0.5 0.05 0.07 0.1 0.11 -0.11 0.44 -0.34 0.13 -0.22 -0.04 -0.2 -0.75 -0.31 -0.89 -0.18 0.48 -0.5 0.03 -0.65 -0.19 -1.07 0.03 -0.4 0.04 -0.55 0.37 -0.42 -0.13 0.1 -0.65 0.48 -0.11 -0.07 -0.12 0.19 0.25 0.61 0.4 0.51
0.09 0.32 0.39 -3.7 -0.83 0.66 0.81 0.1 0.52 0.05 -0.0 0.31 -0.05 -0.18 -0.17 -0.16 -0.03 -0.14 0.1 0.31 0.38 0.26 -0.06 -0.35 0.89 -0.82 -0.77 -0.4 -0.48 -0.55 0.78 -0.51 -0.64 -0.54 -0.72 0.91 -0.97 -0.94 -0.85 -0.94 1.03 -0.91 -0.73 0.62 -0.79 1.1 -0.74 -0.64 -0.19 -0.04 0.05 -0.03 0.23 0.4
-0.22 0.01 -0.63 -4.87 0.06 1.1 0.66 -0.3 0.64 -0.33 -0.05 0.31 0.34 -0.47 -0.24 -0.5 -0.13 -0.05 0.53 0.4 0.14 -0.01 -0.45 -0.26 1.1 0.04 -0.81 -0.74 -0.72 -0.83 0.33 -1.22 -0.59 -0.63 -0.61 -0.55 -0.12 0.16 -0.13 -0.71 1.3 -0.61 -0.93 1.07 -0.7 1.29 -0.92 -0.92 -1.12 -0.91 -0.5 0.14 0.83 0.67
0.49 0.44 0.86 -3.72 -0.35 1.17 0.72 -0.52 0.6 -1.01 -0.61 0.31 0.14 -0.74 0.05 -0.03 0.11 0.0 0.31 -0.31 0.07 -0.06 0.22 -0.99 0.5 -0.12 -0.78 -0.24 -0.32 -0.51 0.67 -0.63 -0.68 -1.02 -1.21 1.03 -0.18 0.01 -0.17 -0.72 0.37 -0.81 -0.44 0.59 -0.54 0.45 -0.74 -0.35 -0.52 0.11 0.17 0.15 0.3 0.39
1.05 -0.46 -4.92 -5.13 -3.15 0.71 0.97 -0.16 0.78 -0.65 -0.05 0.42 -0.1 -0.08 -0.57 -0.44 -0.49 -0.24 -0.02 -0.49 -0.38 0.04 -0.1 -0.87 0.67 -0.46 0.04 -0.37 -0.37 -0.0 0.76 -0.23 -0.55 -0.55 -0.59 0.52 -0.44 -0.55 -0.5 0.24 0.9 -0.17 -0.28 0.88 0.23 0.85 -0.36 -0.18 -0.35 0.56 0.41 0.06 0.14 0.08
0.45 -0.71 -1.54 -5.39 -1.65 0.76 1.14 0.16 0.83 0.21 0.23 0.8 -0.25 0.01 -0.28 -0.39 -0.13 -0.72 -1.31 -0.91 -1.04 0.59 0.1 -1.49 0.91 0.14 0.62 -0.25 0.27 -0.16 -0.36 -1.6 -1.58 -1.03 -1.18 0.03 -0.47 -0.26 -0.05 0.49 0.64 0.05 -0.11 0.96 0.89 0.98 -0.61 0.12 -0.05 0.09 -0.05 -0.47 -0.32 -0.26
0.06 0.19 0.16 -4.1 -1.0 0.3 0.65 0.22 0.7 -0.01 -0.03 0.9 0.62 -0.39 -0.3 -0.23 -0.46 -0.34 -0.13 0.21 0.44 -0.65 0.17 -1.59 0.35 0.31 0.55 0.03 -0.0 -0.18 -0.73 -1.32 -0.97 -1.32 -1.19 0.93 0.12 -0.0 0.12 -0.02 0.24 0.04 0.06 0.38 0.46 0.29 0.05 0.11 -0.51 -0.67 -0.21 0.02 -0.03 -0.06
0.62 0.76 0.17 -4.89 -1.99 0.46 1.35 0.59 0.83 0.6 0.36 1.08 -0.02 0.02 -0.05 0.04 0.03 0.04 0.53 0.56 0.54 0.52 -0.21 -0.99 0.85 -0.21 -0.29 -0.87 -0.73 -0.59 0.26 -1.22 -1.41 -1.76 -1.5 -0.29 -0.7 -0.6 -0.44 -0.63 0.36 -0.84 -0.92 0.56 -0.31 0.46 -1.09 -0.58 -0.6 0.03 0.06 -0.12 -0.1 -0.21
0.82 0.33 -1.99 -3.61 0.51 1.38 1.29 -0.41 0.03 -0.68 -0.73 -0.01 -0.23 -0.55 0.62 0.57 0.61 0.43 0.3 0.15 0.27 -0.14 -0.04 -1.81 0.61 -0.45 -0.49 -0.3 -0.79 -0.43 0.53 -0.7 -1.38 -2.27 -1.61 -0.01 -0.53 -0.86 -0.42 -0.43 0.75 -0.27 -0.53 0.63 -0.28 0.66 -0.55 -0.2 -0.4 -0.13 0.0 0.18 0.41 0.49
-0.36 -0.65 -2.12 -4.12 -0.16 1.07 0.62 -0.33 -0.17 -0.38 -0.32 -0.33 0.73 -0.98 0.06 0.09 -0.06 -0.0 0.0 0.2 0.26 0.3 0.25 -1.68 0.94 -0.29 0.26 0.17 -0.52 0.28 -0.21 -1.6 -1.29 -2.1 -1.46 -0.52 0.12 -1.03 -0.08 0.17 0.64 -0.15 -0.39 0.45 -0.54 0.57 -0.16 -0.44 0.15 0.2 -0.01 1.31 0.91 0.91
0.2 0.2 0.92 -4.72 -0.21 1.18 0.76 -1.31 0.79 -0.8 -0.72 0.82 -0.11 -0.19 0.09 0.04 0.03 0.11 0.01 -0.26 -0.17 -0.48 -0.01 -2.31 0.46 0.18 -0.37 -0.75 -0.36 -0.64 0.81 -0.44 -1.67 -2.21 -2.16 1.25 -0.57 -0.12 -0.54 -0.94 0.93 -0.87 -0.69 0.76 -0.58 0.73 -0.82 -0.58 -0.81 -0.04 -0.06 0.72 0.64 0.55
0.66 -0.17 -3.03 -2.52 -2.75 0.54 0.79 0.12 0.64 -0.25 0.21 0.05 -0.14 -0.28 -0.53 -0.38 -0.29 -0.23 0.07 0.39 0.31 1.28 -0.23 -0.73 1.03 0.4 0.15 -0.38 -0.73 -0.31 -0.26 -1.53 -1.06 -0.97 -1.0 -0.51 -0.03 0.28 0.02 -0.05 0.85 -0.15 -0.61 1.1 -0.01 0.92 -0.69 -0.68 -0.57 -0.48 -0.33 0.15 0.5 0.44
0.46 0.34 0.04 -5.22 -0.34 0.59 0.89 0.06 0.64 0.77 0.71 0.51 -0.23 -0.48 0.21 0.16 0.23 0.22 0.2 -0.22 -0.06 -0.02 -0.27 -0.17 0.67 0.2 -0.58 -0.82 -1.09 -0.71 0.56 -0.91 -0.41 -0.74 -0.23 -0.15 -0.16 -0.48 -0.01 -0.5 0.93 -0.72 -1.12 0.55 -0.86 0.76 -1.04 -0.93 -0.86 -0.51 -0.32 0.34 0.29 0.24
0.13 0.06 -0.37 -4.87 -1.28 0.9 1.03 -0.11 0.71 -0.31 -0.1 0.57 0.02 -0.37 -0.38 -0.45 -0.3 -0.42 -0.44 -0.11 0.07 -0.01 -0.02 -1.18 0.81 -0.64 -0.31 -0.47 -0.24 -0.45 0.88 -0.58 -1.08 -0.6 -1.22 0.32 -0.6 -0.59 -0.49 -0.32 1.13 -0.51 -0.51 1.09 -0.12 1.22 -0.64 -0.19 -0.55 -0.17 0.05 0.3 0.72 0.43
0.48 0.3 -0.65 -5.45 -1.86 0.8 1.04 -0.02 0.7 -0.25 0.02 0.69 -0.09 -0.33 -0.27 -0.3 -0.24 -0.2 -0.05 0.32 0.46 0.31 -0.22 -0.51 0.84 -0.33 -0.28 -0.36 -0.37 -0.27 0.86 0.06 -0.5 -0.83 -0.57 -0.73 -0.45 -0.73 -0.46 -0.21 0.68 -0.38 -0.44 0.82 -0.28 0.52 -0.29 -0.2 -0.34 -0.29 -0.33 0.12 0.41 0.44
0.75 0.57 -0.99 -4.5 -1.32 0.85 1.29 0.34 0.52 0.18 0.77 0.44 0.09 0.28 -0.11 -0.17 0.15 0.1 0.24 0.84 0.51 0.15 -0.44 -0.95 0.65 -0.28 -1.76 -0.88 -1.04 -0.69 0.29 -2.26 -0.77 -0.75 -0.86 0.53 -0.54 -0.82 -0.55 -1.08 0.87 -0.92 -0.71 0.84 -1.31 0.73 -0.58 -0.5 -0.5 -0.12 -0.14 -0.21 0.46 0.46
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-0.28 -0.69 -3.27 -4.17 -1.22 0.5 0.92 0.58 0.51 0.13 0.45 0.72 0.02 0.35 -1.23 -1.22 -0.9 -1.17 -0.09 0.29 -0.11 1.47 -0.3 -0.97 0.28 -0.09 0.0 -0.1 -0.04 -0.11 -0.72 -0.96 -0.61 -0.63 -0.72 -0.21 0.05 0.07 0.04 0.1 0.92 0.18 -0.06 0.44 0.29 1.03 0.04 -0.11 -0.24 -0.63 -0.63 -0.44 0.39 0.6
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-0.13 -0.72 -1.97 -4.99 -1.13 0.4 0.76 0.31 0.63 -0.0 0.2 0.67 0.28 -0.28 -0.32 -0.3 -0.25 -0.42 -0.57 0.16 0.24 0.85 -0.13 -1.08 0.04 -0.05 -0.38 -0.11 0.4 0.02 -0.12 -1.24 -0.69 -0.51 -0.7 0.85 0.03 0.19 0.15 0.18 0.68 -0.11 0.15 0.45 0.36 0.56 0.06 0.56 -0.07 -0.04 -0.31 -0.5 -0.44 -0.24
-0.13 -0.72 -1.97 -4.99 -1.13 0.4 0.76 0.31 0.63 -0.0 0.2 0.67 0.28 -0.28 -0.32 -0.3 -0.25 -0.42 -0.57 0.16 0.24 0.85 -0.13 -1.08 0.04 -0.05 -0.38 -0.11 0.4 0.02 -0.12 -1.24 -0.69 -0.51 -0.7 0.85 0.03 0.19 0.15 0.18 0.68 -0.11 0.15 0.45 0.36 0.56 0.06 0.56 -0.07 -0.04 -0.31 -0.5 -0.44 -0.24
0.25 0.63 0.02 -4.95 0.21 1.74 1.37 -0.55 0.33 -1.04 -0.52 0.07 -0.6 0.02 0.15 0.12 0.01 0.04 0.05 -0.22 -0.11 0.22 -0.54 -0.64 0.77 -1.06 -1.55 -0.78 -0.43 -0.87 1.23 -0.6 -0.65 -0.35 -0.77 0.49 -0.99 -0.8 -1.09 -1.39 1.06 -1.26 -0.92 0.99 -1.14 1.0 -0.85 -0.6 -0.86 -0.59 -0.5 0.57 0.54 0.53
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0.34 -0.44 -2.39 -4.82 -1.12 0.53 0.86 -0.27 0.25 -0.36 -0.09 -0.07 -0.2 -0.85 -0.71 -0.42 -0.42 -0.44 -1.17 0.14 -0.1 -0.03 -0.09 -0.33 1.1 -0.57 -0.29 -0.36 -0.69 -0.1 0.27 -0.64 -0.52 -0.62 -0.45 0.47 -0.65 -0.59 -0.57 -0.19 1.28 -0.21 -0.36 1.38 -0.61 1.2 -0.26 -0.47 0.39 0.16 0.17 0.38 0.86 0.94
-1.36 -0.88 - -0.79 -5.62 2.01 -0.6 -1.9 -0.92 - -1.19 0.02 - -3.58 0.06 1.38 0.27 0.59 - -2.3 - -1.87 1.01 -3.43 - -1.72 -1.28 1.13 -0.97 0.71 -2.99 -3.2 0.58 -2.43 -1.47 -3.03 -1.15 -2.35 -2.66 -0.81 -2.61 -1.23 0.3 -4.02 -1.16 - 0.4 -0.1 1.26 0.11 0.32 1.87 2.65 3.09
-0.08 -0.03 -2.9 -5.5 -2.78 0.98 1.33 0.32 0.61 0.68 0.41 0.64 -0.15 0.4 0.07 -0.08 0.11 0.11 0.06 0.27 0.34 0.84 0.06 -1.72 -0.01 -0.48 0.05 -0.24 -0.21 -0.17 -0.42 -0.11 -1.28 -1.52 -1.4 0.65 -0.68 -0.5 -0.53 -0.08 0.37 -0.42 -0.4 0.05 -0.07 0.27 -0.36 -0.2 -0.27 -0.02 -0.12 0.4 0.43 0.31
-0.1 -0.58 -2.83 -3.76 -0.08 1.11 0.81 -0.52 0.4 -0.46 -0.56 0.46 -0.26 -0.02 -0.22 -0.24 -0.23 -0.22 -0.24 0.13 0.13 0.76 -0.32 -1.07 1.11 -0.95 -0.42 -0.79 -0.27 -0.66 0.61 0.06 -0.69 -0.49 -0.6 0.34 -0.96 -0.88 -0.75 -0.81 1.15 -0.64 -0.62 1.05 -0.21 1.31 -0.65 -0.37 -0.57 -0.54 -0.63 0.56 0.89 1.08
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.