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Heatmap: Cluster_63 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.8 0.31 -1.01 -4.13 -0.11 0.56 0.53 0.38 0.64 0.29 0.36 0.6 -1.06 0.24 -0.01 0.07 0.17 0.07 0.3 -0.41 -0.33 0.95 -0.41 0.49 -1.01 0.09 -0.4 -0.48 0.45 -0.63 0.06 0.77 -0.06 1.27 0.15 -0.31 -0.25 0.91 -0.07 -0.42 -0.74 -0.37 -0.38 -0.63 0.11 -0.76 -0.62 -0.16 -0.63 -0.71 -0.62 -0.84 -0.97 -1.05
0.88 0.8 -0.81 -5.47 -1.11 0.26 0.66 0.7 0.39 0.43 0.65 0.45 -0.27 0.6 -0.12 -0.22 -0.13 -0.21 0.08 0.42 0.59 0.71 -0.29 0.08 -0.85 -0.14 -0.27 0.04 -0.04 -0.12 -0.68 -0.91 0.51 0.14 0.67 -1.04 0.01 -0.05 -0.17 -0.11 -0.11 0.08 -0.06 -0.54 -0.12 -0.44 0.1 -0.09 -0.55 -0.44 -0.32 -0.3 -0.83 -1.23
0.78 1.05 0.55 -5.06 0.08 0.34 0.81 0.21 0.3 0.26 0.12 0.21 -1.37 0.22 -0.32 -0.28 -0.25 -0.27 0.3 -0.3 -0.23 1.11 -0.55 0.92 -1.18 -0.39 -0.34 -0.3 -0.01 -0.56 0.17 -0.11 1.22 1.1 1.13 -1.44 -0.19 -0.06 -0.28 -0.13 -0.74 0.02 -0.34 -0.74 0.22 -1.05 -0.22 -0.25 -0.87 -0.72 -0.47 -1.43 -1.55 -1.75
0.26 0.72 1.14 -4.88 0.21 -0.12 -0.15 0.27 0.15 0.01 0.09 0.18 -1.1 0.36 -0.28 -0.29 -0.18 -0.26 0.53 0.14 -0.0 0.3 -0.47 0.57 -0.92 -0.47 -0.33 -0.06 0.06 -0.34 -0.02 0.08 0.9 0.9 0.96 -1.39 -0.27 -0.06 -0.43 -0.0 -0.33 0.19 0.11 -0.52 0.09 -0.45 0.16 0.08 -0.41 -0.43 -0.28 -0.5 -0.64 -0.97
1.04 0.13 - -4.24 -1.25 0.14 0.82 0.31 -0.09 0.49 0.31 -0.25 -1.82 1.49 0.14 0.1 0.22 0.07 -0.24 -0.73 -0.8 1.06 -0.57 1.02 -1.12 -0.24 -0.25 -0.33 0.01 -0.55 -0.2 0.26 1.01 1.24 1.15 -1.91 -0.33 -0.07 -0.45 -0.28 -0.65 0.11 -0.12 -0.76 0.44 -0.97 -0.23 0.1 -0.62 -0.72 -0.85 -0.69 -0.68 -0.65
0.91 0.44 0.19 -4.92 -0.61 0.05 0.66 0.68 0.36 0.41 0.58 0.32 -1.08 -0.04 -0.36 -0.34 -0.33 -0.39 -0.31 -0.49 -0.47 0.7 -0.37 0.81 -0.61 -0.26 0.23 -0.63 0.27 -0.48 0.23 1.13 0.4 1.15 0.78 -0.32 -0.62 0.39 -0.43 0.12 -0.55 -0.13 -0.52 -0.25 0.41 -0.7 -0.67 -0.26 -0.48 -0.68 -0.71 -1.03 -1.07 -0.98
3.11 2.32 -0.53 -2.24 - -1.38 -1.55 -2.14 -2.65 -1.29 -1.49 -4.7 -3.25 -1.01 -1.46 -3.77 -1.1 -1.34 -2.76 -0.71 -0.82 -1.78 -1.49 -0.34 -4.78 -1.38 1.8 0.27 -2.65 -0.38 -4.38 1.96 3.06 -1.34 2.14 -5.05 -1.26 -1.82 -2.4 -0.28 -2.76 1.66 -0.08 -3.41 -0.97 -4.04 0.21 -1.18 -2.47 -1.64 -1.56 -2.12 -1.92 -2.53
0.48 0.31 -0.78 -3.93 -0.0 0.31 0.82 0.2 0.32 -0.05 0.03 0.36 -0.83 -0.24 -0.44 -0.61 -0.38 -0.32 -0.47 -0.04 0.04 0.22 -0.2 0.32 -0.1 -0.11 0.3 -0.01 -0.22 -0.18 0.02 0.15 0.78 0.22 0.63 -0.58 -0.19 -0.22 -0.13 0.37 0.33 0.24 -0.26 0.15 0.39 0.17 -0.11 0.05 -0.28 0.18 0.26 -0.67 -0.78 -0.94
0.99 0.74 0.95 -5.37 0.32 0.01 0.64 -0.01 0.03 -0.15 -0.36 0.36 -1.6 0.9 -0.27 -0.45 -0.19 -0.29 0.01 -0.49 -0.63 1.66 -0.58 0.01 -0.66 -0.34 0.02 -0.15 0.07 -0.28 -1.02 0.66 0.14 0.41 0.44 -1.08 -0.31 -0.17 -0.29 -0.02 -0.08 0.3 0.07 -0.44 0.35 -0.39 0.09 0.1 -0.08 -0.51 -0.58 -0.99 -1.12 -1.16
1.15 0.12 -2.56 -5.58 -0.25 0.59 0.81 0.46 1.06 -0.36 0.12 0.91 -0.83 -0.22 -0.3 -0.28 -0.12 -0.31 0.05 -0.33 -0.53 0.69 0.14 -0.51 -0.14 -0.41 -0.28 0.16 -0.01 -0.12 0.54 -0.5 -0.49 0.13 -0.52 -0.75 -0.73 -0.15 -0.68 0.07 0.27 -0.09 -0.01 0.39 0.42 -0.17 -0.15 0.18 -0.17 0.07 0.47 -0.36 -0.1 -0.35
-0.74 1.67 2.63 -1.06 -1.75 -1.14 -0.51 -1.58 -1.22 -1.41 -1.69 -1.86 -4.0 0.33 -0.83 -0.53 -1.56 -0.87 -1.66 -1.06 -0.17 -0.43 -0.41 0.8 -4.13 0.56 -0.2 0.46 -1.2 -0.04 -2.32 0.91 1.8 0.99 1.46 -3.99 0.72 -0.45 0.56 0.22 -1.55 1.22 0.28 -5.33 0.43 -5.07 1.26 0.28 -0.66 -0.74 -0.99 -1.41 -2.26 -2.19
0.93 0.59 -2.23 -5.63 -2.06 -0.1 0.8 0.67 -0.1 0.02 -0.04 -0.07 -0.92 -0.86 -0.95 -0.57 -0.68 -0.72 -0.93 -0.33 -0.34 0.11 -0.18 0.92 -1.29 0.25 -0.06 0.05 0.81 0.01 -0.54 -0.64 0.96 1.03 1.09 -0.06 0.06 1.11 0.27 0.49 -0.62 -0.0 0.23 -0.68 0.84 -1.07 -0.14 0.57 -0.25 -0.21 -0.05 -1.37 -1.27 -1.45
-0.03 0.64 1.85 -4.65 -2.05 -0.16 0.86 0.07 0.76 0.45 0.24 1.25 -0.8 1.08 -0.96 -1.07 -0.58 -1.15 -0.54 -1.45 -1.49 0.81 -0.69 1.11 -0.77 -1.32 -1.2 -0.53 -0.01 -0.31 0.5 -0.19 1.24 1.48 1.55 -2.24 -1.06 -0.27 -1.02 -0.3 -1.01 -0.59 -0.31 -0.69 -0.14 -1.31 -0.39 -0.19 -0.3 -0.89 -1.08 -0.47 -0.78 -0.59
0.19 0.24 -0.09 -3.56 0.47 0.22 0.5 0.07 0.49 -0.11 -0.04 0.78 -1.22 0.45 -0.08 -0.18 -0.21 -0.16 0.52 -0.09 -0.02 1.1 -0.65 -0.17 -0.37 -0.18 0.07 -0.34 0.29 -0.48 0.21 0.51 -0.06 0.64 0.08 -0.14 -0.2 0.43 -0.16 0.18 -0.06 0.13 -0.12 -0.14 0.51 -0.11 -0.24 -0.03 -0.72 -0.89 -0.68 -0.75 -0.86 -1.09
0.34 0.74 1.64 -4.97 -0.62 -0.3 0.26 0.45 -0.02 -0.63 -0.11 -0.13 -1.25 0.5 -0.84 -0.7 -0.72 -0.87 -0.35 -0.52 -0.64 0.38 -0.74 0.55 -0.3 0.14 -0.67 -0.31 0.04 -0.63 0.02 -1.76 1.06 0.74 1.31 -0.58 0.27 0.5 0.3 0.1 0.41 0.27 -0.03 0.07 0.59 0.32 0.01 0.22 -0.51 -0.9 -0.92 -1.83 -1.02 -0.78
1.67 1.15 -1.85 -4.31 -1.35 -0.82 -0.83 1.64 -0.22 1.36 1.1 0.18 -2.75 0.26 -0.92 -0.86 -0.94 -0.97 -0.7 1.06 0.78 0.0 -1.86 1.47 -4.27 -1.89 -0.72 -0.55 -1.11 -0.44 -3.86 0.62 2.13 1.46 2.19 -4.81 -1.74 -2.35 -1.89 -0.03 -3.33 0.7 -0.47 -4.16 -0.16 -3.83 0.03 -0.55 -0.63 -1.92 -1.67 -1.76 -2.0 -2.52
0.49 0.39 1.93 -3.99 0.02 0.65 1.18 0.37 1.04 0.15 0.18 1.36 -2.13 1.04 -1.25 -1.37 -1.09 -1.33 -0.56 -0.2 -0.3 1.75 -1.29 -0.69 -1.35 -0.44 -0.28 -1.0 1.05 -0.5 -1.41 0.41 -0.97 1.05 -0.55 -1.21 -0.55 0.39 -0.41 -0.18 -0.87 -0.43 -0.26 -0.73 0.93 -1.4 -0.75 0.16 -1.39 -1.25 -1.42 -0.75 -0.94 -1.2
1.25 1.46 2.92 -1.9 -3.94 -0.08 0.56 0.17 -1.17 0.86 0.69 -0.3 -2.38 1.61 -0.51 -1.47 -0.87 -0.5 -0.49 -0.28 -0.0 1.66 -1.66 0.25 -2.61 -1.45 -2.5 -0.73 -0.39 -0.37 -2.85 -1.2 0.88 1.32 1.12 -3.56 -0.34 -1.52 -0.03 -0.8 -3.5 -0.44 -0.11 -3.16 0.09 -3.3 0.5 0.09 -1.01 -1.94 -1.41 -1.85 -2.5 -2.67
0.25 0.19 0.25 -4.04 0.46 0.38 0.13 0.34 0.32 0.38 0.1 0.43 -1.35 0.27 -0.01 -0.0 0.05 -0.09 0.42 -0.16 -0.11 1.14 -0.76 -0.19 -0.92 -0.31 0.21 -0.17 0.21 -0.23 -0.51 0.88 0.31 0.85 0.34 -0.47 -0.07 0.24 -0.14 0.16 -0.36 0.29 -0.07 -0.49 0.39 -0.56 0.06 -0.15 -0.8 -0.77 -0.72 -0.65 -1.05 -1.31
0.55 -0.33 -0.65 -4.86 -1.84 -0.17 0.41 0.89 -0.03 0.04 -0.28 0.34 -1.11 1.06 -0.97 -0.68 -0.38 -0.76 -0.44 -0.54 -0.65 0.93 -0.41 0.74 -0.03 0.09 -0.4 0.15 0.14 -0.01 -0.21 -1.66 1.05 0.41 1.14 -0.49 0.13 0.1 0.19 0.26 0.13 0.55 0.14 0.14 0.38 -0.08 0.2 0.35 -0.42 -0.19 0.08 -1.3 -1.43 -1.73
0.1 1.42 2.32 -3.03 -1.1 -0.32 -0.23 0.0 -0.25 -0.41 0.12 -0.36 -1.09 0.19 -1.29 -1.07 -1.06 -1.2 -0.46 -1.22 -1.15 0.11 -0.78 1.51 -1.66 -0.99 -0.0 -0.36 0.25 -0.46 -0.91 0.13 1.56 1.8 1.82 -1.17 -0.89 -0.26 -0.89 0.38 -1.3 0.02 -0.17 -0.81 0.74 -1.47 -0.17 0.22 -0.35 -1.28 -1.47 -2.57 -1.94 -1.83
-0.18 0.67 2.37 -3.11 -1.14 -1.07 -1.35 -1.24 -1.55 -1.41 -1.29 -0.99 -1.57 -2.12 -2.35 -2.4 -1.95 -2.57 -1.8 -1.38 -1.37 -0.92 -0.72 1.86 -1.18 -0.31 0.9 -0.1 0.41 -0.21 0.19 0.78 1.27 1.53 1.68 -0.68 0.15 0.42 -0.01 0.91 -1.08 0.62 -0.0 -1.23 1.08 -0.75 -0.07 0.22 -0.33 -1.61 -1.4 -0.47 -0.42 -0.21
0.95 0.98 -0.19 -5.71 -0.38 0.37 0.74 0.58 0.7 1.41 0.89 0.82 -0.88 -0.25 -0.1 -0.22 0.07 0.04 0.18 -0.16 -0.18 1.0 -0.61 0.3 -0.93 -0.34 -0.22 -0.71 -0.27 -0.51 -0.9 0.24 0.01 1.44 0.26 -1.12 -0.47 0.24 -0.48 -0.1 -0.63 -0.09 -0.93 -0.42 0.03 -0.71 -0.63 -0.69 -0.46 -0.76 -0.71 -0.99 -1.07 -1.21
0.62 0.58 -0.6 -4.51 0.21 0.34 0.51 0.82 0.64 0.83 0.88 0.66 -0.95 0.56 -0.05 -0.1 -0.07 -0.19 0.25 -0.35 -0.43 0.63 -0.46 0.05 -1.33 -0.25 -0.33 -0.49 0.18 -0.22 -0.02 -0.12 0.01 1.26 0.19 -1.24 -0.22 0.15 -0.14 0.48 -1.25 -0.24 -0.36 -1.05 0.46 -1.27 -0.38 -0.08 -0.01 -0.68 -0.98 -0.92 -0.42 -0.24
0.03 0.45 1.49 -3.08 0.74 0.4 0.25 0.48 -0.02 0.72 0.28 0.2 -1.2 0.34 0.09 0.19 0.18 0.06 0.68 -0.58 -0.49 0.7 -0.58 0.61 -1.46 -0.17 -0.5 -0.34 -0.06 -0.31 -0.76 -0.25 0.71 0.5 0.81 -1.09 -0.1 0.2 -0.14 0.04 -1.0 0.04 -0.26 -1.11 0.2 -1.35 -0.15 -0.03 -0.14 -0.64 -0.91 -1.18 -0.79 -0.7
0.62 0.5 -0.59 -4.33 -1.67 0.36 0.66 0.3 0.41 0.48 0.06 0.55 -0.52 0.63 -0.08 -0.03 0.08 0.03 0.06 -0.33 -0.23 0.86 -0.34 0.96 -0.42 -0.86 -0.19 -0.31 -0.11 -0.34 0.52 0.25 0.96 0.78 1.22 -0.8 -1.0 -0.56 -0.92 -0.17 -0.28 -0.34 -0.38 -0.4 -0.06 -0.33 -0.34 -0.2 -0.03 -0.46 -0.54 -0.83 -0.76 -0.67
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1.27 -0.5 -8.81 -7.25 -3.18 0.42 0.67 0.68 0.59 0.12 0.2 0.63 -0.05 0.09 -0.66 -0.31 -0.53 -0.55 -0.62 -0.62 -0.45 1.08 0.02 0.54 -0.33 -0.89 -0.44 -0.23 0.75 -0.37 0.45 -1.04 0.59 1.11 0.71 -1.63 -0.92 -0.28 -0.79 -0.53 0.26 -0.46 0.2 0.08 0.93 -0.12 -0.39 0.49 -0.11 0.04 -0.2 -0.87 -0.62 -0.24
2.46 0.55 - 0.67 - 0.71 1.57 0.38 -0.84 -2.02 -0.36 -2.9 0.46 1.52 -2.18 -4.24 -2.36 -3.41 -2.28 -0.59 -1.43 -0.98 -0.4 1.7 0.3 -1.25 -0.88 -0.9 -0.08 -1.87 0.44 -1.47 2.27 1.31 1.96 -3.57 -1.87 -1.72 -1.38 -3.01 -0.38 -0.23 -0.94 -0.06 -0.58 0.31 -1.96 -0.05 -1.31 -0.64 -0.59 -0.58 -1.82 -1.67
0.3 -0.26 -0.69 -1.72 -0.94 0.4 -0.18 -0.49 -0.57 -0.64 -0.62 -0.79 -1.91 -0.08 -0.1 -0.55 0.08 -0.1 -0.05 -1.2 -0.75 0.17 0.06 1.73 -0.96 -0.73 -0.54 0.04 0.39 -0.14 0.97 1.03 1.73 1.44 1.51 -0.94 -0.39 -0.54 -0.6 -0.26 -0.6 -0.32 0.12 -0.78 -0.29 -1.04 0.19 0.38 -0.57 -0.19 -0.25 -0.28 -0.58 -0.78
0.69 1.41 1.67 -4.78 -0.43 0.23 0.7 0.07 0.3 0.41 0.29 0.4 0.17 0.19 0.13 -0.14 0.25 0.09 -0.21 -0.21 0.03 0.33 -0.15 -0.42 -0.75 -0.99 -0.5 -0.09 -0.42 0.34 -0.72 0.25 0.01 -0.38 0.23 -1.71 -0.67 -1.15 -0.7 0.27 -0.37 -0.08 -0.2 -0.76 -0.5 -0.37 0.14 -0.12 -0.42 -0.01 -0.1 0.43 -0.67 -0.77

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.