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Heatmap: Cluster_139 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.69 1.14 1.68 -5.65 -1.2 0.22 0.14 0.49 0.95 0.21 0.23 1.06 -0.45 0.34 -0.17 -0.16 -0.18 -0.31 -0.83 1.14 1.04 -0.41 -0.27 -1.03 0.25 -0.85 -0.45 -0.39 -0.08 -0.4 0.14 -0.79 -0.98 -0.39 -1.13 -0.11 -1.23 -0.73 -1.18 -0.36 0.04 -0.27 -0.38 0.33 -0.17 0.05 -0.37 -0.24 -0.52 -0.35 -0.32 -0.08 0.05 -0.12
0.9 1.16 1.71 -5.47 -0.5 0.65 0.77 0.22 0.83 -0.04 0.08 0.82 -0.13 -0.27 -0.29 -0.29 -0.42 -0.46 -1.2 0.92 0.97 -0.17 -0.18 -1.09 -0.0 -0.86 -0.31 -0.24 0.01 -0.2 0.13 -0.84 -1.04 -0.31 -1.18 0.16 -1.06 -0.77 -1.28 -0.26 -0.09 -0.2 -0.36 0.19 -0.12 0.03 -0.31 -0.27 -0.43 -0.2 -0.28 -0.09 0.04 -0.14
0.86 0.73 1.34 -2.48 -0.62 0.44 1.18 0.83 0.86 0.62 0.72 1.04 -0.64 0.06 -0.62 -0.63 -0.45 -0.66 -0.69 0.05 0.17 0.78 -0.69 -0.91 -0.11 -0.11 -0.63 -0.89 -0.2 -0.31 0.2 -1.44 -1.04 0.42 -0.84 0.52 -0.44 0.26 -0.49 0.31 0.37 -0.43 -0.76 0.38 0.0 -0.16 -0.78 -0.36 -0.92 -0.59 -0.72 -0.74 -0.67 -0.79
0.21 1.34 2.44 -4.46 0.11 0.51 0.27 -0.89 0.03 -1.04 -0.92 -0.25 -1.2 -0.37 -0.41 -0.35 -0.42 -0.37 -0.3 -0.63 -0.55 -0.55 -0.51 -0.41 0.4 -0.41 -0.2 -0.68 -0.43 -0.7 0.6 -0.42 -0.11 -0.11 -0.12 1.06 -0.76 -0.2 -0.68 -0.62 1.19 -0.72 -0.63 0.97 -0.32 1.15 -0.76 -0.44 -0.6 -0.5 -0.45 -0.31 -0.21 -0.34
0.27 1.12 2.26 -5.4 0.22 0.35 0.55 -0.15 0.0 -0.46 -0.18 0.07 0.3 -0.06 -0.43 -0.39 -0.26 -0.43 -0.16 0.19 0.35 1.06 -0.61 -0.54 -0.08 -0.23 -0.64 -0.66 -0.01 -0.69 -0.23 -0.73 -0.78 -0.13 -0.68 0.29 -0.4 0.3 -0.42 -0.62 0.86 -0.55 -0.7 0.26 -0.11 0.9 -0.75 -0.56 -0.93 -0.95 -1.02 -0.38 -0.13 -0.17
0.29 1.28 2.32 -4.48 0.08 0.59 0.44 -0.31 0.17 -0.39 -0.41 -0.02 -0.72 -0.38 -0.3 -0.35 -0.37 -0.43 -0.26 -0.12 -0.0 -0.02 -0.59 -0.68 0.46 -0.23 -0.41 -0.86 -0.46 -0.82 -0.27 -0.68 -0.24 -0.13 -0.39 0.08 -0.3 0.18 -0.25 -0.47 0.94 -0.45 -0.69 0.69 -0.13 0.89 -0.8 -0.52 -0.82 -0.68 -0.55 -0.11 0.24 0.26
0.54 0.64 2.31 -3.81 -0.26 0.62 -0.15 0.16 0.61 0.46 0.27 0.7 -1.74 0.23 -0.38 -0.74 -0.45 -0.53 -0.01 0.58 0.5 0.74 -0.79 -0.89 0.24 -0.99 -0.87 -0.62 -0.6 -1.13 -0.13 -0.16 -0.33 -0.3 -0.6 1.17 -1.08 -0.96 -1.27 -0.79 0.94 -0.04 -0.57 0.53 -0.42 0.5 -0.41 -0.68 -1.44 -1.31 -1.31 -0.2 -0.06 0.04
0.52 0.48 2.27 -3.39 0.0 0.47 0.92 -0.52 0.67 -0.74 -0.03 0.34 0.73 -0.14 -0.89 -0.93 -0.76 -0.89 -0.85 0.17 0.17 0.25 -0.37 -2.04 0.55 0.15 -0.33 -0.6 -0.6 -0.56 0.5 -1.62 -1.74 -1.94 -1.74 0.52 -0.07 0.34 0.06 -0.44 0.85 -0.47 -0.62 0.69 -0.16 0.88 -0.72 -0.42 -0.36 -0.31 -0.36 -0.43 -0.19 -0.29
0.02 1.39 2.28 -4.35 -0.0 0.32 0.07 -0.49 0.3 -0.7 -0.33 0.24 -0.68 -0.37 -1.11 -1.19 -1.24 -1.24 -1.29 -0.44 -0.37 0.47 -0.62 -1.1 0.53 0.28 -0.78 -0.74 -0.41 -0.68 -0.41 -0.42 -0.92 -0.3 -0.97 0.37 0.33 1.02 0.39 -0.34 1.46 -0.33 -0.66 0.85 -0.05 1.19 -0.66 -0.54 -0.95 -0.81 -0.7 -0.55 -0.03 -0.11
0.78 1.2 2.27 -4.65 -1.42 0.48 0.54 0.13 0.5 -0.47 0.17 0.47 -0.01 -0.69 -0.71 -0.67 -0.67 -0.76 -2.08 -0.03 -0.02 -0.5 -0.3 -1.01 0.6 0.11 -0.78 -0.93 -0.09 -0.99 1.0 -1.17 -1.17 0.19 -1.19 1.17 -0.43 0.39 0.02 -0.72 0.55 -1.24 -0.96 0.76 -0.06 0.68 -1.46 -0.54 -0.66 -0.39 -0.52 -0.24 -0.3 -0.23
0.34 0.88 1.04 -3.32 -0.26 0.37 0.32 -0.61 0.38 -0.39 -0.21 0.18 -0.47 -0.49 -0.5 -0.33 -0.65 -0.45 0.02 0.09 0.08 -0.58 -0.16 -0.88 0.46 0.23 -0.34 -0.39 -0.14 -0.57 0.27 -0.64 -0.44 -0.46 -0.69 0.83 0.17 0.41 0.14 -0.4 0.88 -0.07 -0.21 0.66 0.05 0.76 -0.3 -0.12 -0.6 -0.18 -0.09 0.09 0.12 0.07
0.8 1.1 1.39 -4.8 -0.23 0.46 0.69 -0.33 -0.01 -0.92 -0.49 0.01 -0.88 -0.44 -0.46 -0.23 -0.54 -0.27 0.02 0.05 0.27 -0.56 -0.41 -0.5 0.28 -0.12 -0.59 -0.38 -0.5 -0.3 0.52 -0.61 0.05 -0.42 -0.15 0.46 -0.02 -0.09 -0.18 -0.37 1.26 -0.41 -0.43 0.87 -0.33 0.86 -0.32 -0.25 -0.67 -0.54 -0.41 -0.31 -0.01 0.23
0.7 1.06 1.79 -3.76 -0.14 0.47 0.4 0.13 0.15 -0.26 -0.04 0.31 -0.17 -0.74 -0.57 -0.33 -0.67 -0.55 -0.25 -0.08 -0.05 -0.49 -0.36 -0.47 0.7 -0.34 -0.54 -0.49 -0.57 -0.7 0.34 -0.31 -0.12 -0.27 -0.35 0.85 -0.52 -0.38 -0.59 -0.65 0.92 -0.34 -0.64 0.73 -0.35 1.15 -0.57 -0.57 -0.74 -0.53 -0.36 -0.2 0.06 0.09
-0.31 1.2 2.75 -2.1 0.09 0.34 -0.03 -0.15 0.42 -0.48 -0.25 0.44 -0.88 -0.26 -0.49 -0.67 -0.64 -0.61 -0.22 0.5 0.61 -0.28 -0.95 -2.11 0.08 -0.37 -0.88 -0.98 -0.28 -1.0 -0.67 -1.03 -1.44 -1.68 -1.75 2.25 -0.41 0.01 -0.4 -0.58 0.82 -0.64 -0.51 0.57 -0.44 0.56 -0.69 -0.42 -0.93 -0.76 -1.03 -1.03 -0.45 -0.26
0.67 0.65 1.28 -4.09 -0.18 0.42 0.97 0.28 0.7 0.06 0.21 0.71 0.41 0.31 -0.42 -0.36 -0.26 -0.38 -0.23 0.17 0.42 0.44 -0.28 -0.8 0.27 -0.12 -0.66 -0.47 -0.23 -0.61 0.03 -0.87 -0.56 -0.95 -0.57 0.52 -0.23 0.11 -0.13 -0.55 0.35 -0.56 -0.31 0.28 -0.21 0.25 -0.49 -0.21 -0.52 -0.3 -0.23 -0.1 -0.37 -0.5
0.9 1.0 1.5 -3.97 -0.66 0.38 0.99 1.12 -0.06 0.47 1.06 -0.31 -0.35 -0.65 -0.97 -0.87 -0.67 -0.95 -0.05 -0.13 -0.18 0.52 -0.46 -0.45 -0.12 0.09 0.04 -0.51 0.1 -0.38 -0.22 -0.51 -0.26 0.27 -0.32 0.35 -0.13 0.37 0.02 0.18 -0.02 -0.19 -0.43 0.06 0.38 -0.12 -0.47 -0.33 -0.86 -0.56 -0.46 -0.77 -0.7 -1.01
0.9 1.32 2.18 -3.58 -0.27 0.42 0.81 0.03 0.74 0.26 0.36 0.69 -0.22 -0.14 -0.3 -0.24 -0.35 -0.33 -0.31 -0.33 -0.31 -0.05 -0.11 -0.68 0.39 -1.38 -0.48 -0.61 -0.17 -0.62 0.38 -0.56 -0.61 0.09 -0.68 -0.16 -1.36 -1.05 -1.54 -0.61 0.78 -0.71 -0.59 0.55 -0.2 0.6 -0.85 -0.46 -0.62 -0.32 -0.26 -0.3 -0.4 -0.43
0.79 1.03 1.75 -3.33 -0.64 0.4 0.95 -0.22 -0.21 -0.68 -0.61 -0.19 -0.69 0.22 -0.2 -0.31 -0.07 -0.04 -0.04 -0.25 -0.07 0.68 -0.2 -0.8 0.34 -0.2 -0.25 -0.49 -0.21 -0.53 0.16 -0.53 -0.33 -0.4 -0.43 0.1 -0.4 -0.13 -0.28 -0.32 0.83 -0.39 -0.52 0.64 0.05 0.64 -0.59 -0.21 -0.61 -0.27 -0.18 -0.16 -0.05 -0.1
0.38 0.88 2.15 -0.66 -0.98 0.42 0.61 -0.29 0.56 -0.37 -0.09 0.67 0.4 -0.17 -0.58 -0.65 -0.38 -0.39 -0.73 -0.09 0.15 -0.43 -0.04 -1.18 -0.19 -0.48 -0.32 -0.36 0.12 -0.11 -0.47 0.05 -1.31 -0.11 -1.28 0.45 -0.61 -0.42 -0.58 0.27 0.36 -0.48 -0.23 0.52 0.11 0.22 -0.33 -0.01 -0.74 -0.31 -0.28 -0.01 0.01 0.08
0.35 0.56 0.87 -4.19 -0.01 0.13 0.58 -0.4 0.52 -0.56 -0.46 0.59 -0.61 0.07 -0.3 -0.26 -0.3 -0.3 0.07 -0.12 -0.19 -0.34 -0.07 -0.31 0.04 -0.33 -0.1 -0.21 0.09 -0.15 0.47 -0.12 0.13 0.08 0.05 0.71 -0.4 -0.12 -0.36 -0.04 0.42 -0.18 -0.03 0.27 0.12 0.43 -0.11 -0.01 -0.33 -0.09 -0.02 -0.03 -0.13 -0.31
0.43 0.95 1.44 -4.34 0.28 0.47 0.76 -0.4 0.18 -0.87 -0.31 -0.11 -0.36 -0.67 -0.42 -0.39 -0.35 -0.27 -0.31 0.11 0.1 -0.01 -0.14 -1.14 0.87 -0.74 -0.27 -0.11 -0.07 -0.22 0.13 -0.86 -0.54 -0.67 -0.71 -0.98 -0.57 -0.66 -0.63 -0.16 1.34 -0.11 -0.19 1.06 -0.11 1.0 -0.06 -0.02 -0.71 -0.19 -0.2 -0.16 0.17 0.07
0.44 1.05 1.75 -5.19 -0.11 0.58 0.75 -0.55 0.39 -0.58 -0.3 0.06 -0.68 0.02 -0.38 -0.43 -0.48 -0.45 -0.12 -0.14 -0.25 0.01 -0.35 -0.49 0.59 -0.29 -0.57 -0.67 -0.46 -0.9 0.63 -0.47 -0.38 -0.12 -0.53 1.23 -0.57 -0.13 -0.61 -0.7 0.94 -0.8 -0.72 0.92 -0.28 1.0 -0.86 -0.41 -0.68 -0.6 -0.43 -0.33 0.05 0.12
0.8 1.12 1.75 -3.42 0.01 0.88 0.69 -0.66 0.39 -0.98 -0.78 0.13 -0.66 -0.06 -0.14 -0.16 -0.25 -0.17 -0.03 0.02 0.25 0.18 -0.66 -0.85 0.44 -0.15 -1.83 -0.87 -0.81 -0.96 1.22 -0.95 -0.51 -0.7 -0.71 1.09 -0.34 -0.08 -0.34 -1.56 1.16 -1.35 -0.81 0.83 -1.24 0.76 -1.0 -0.64 -0.96 -0.56 -0.53 0.1 0.18 0.23
0.87 1.2 1.9 -4.06 -0.36 0.4 0.79 0.21 0.54 0.19 0.3 0.63 -0.36 0.15 -0.42 -0.49 -0.54 -0.46 -0.13 0.11 0.13 0.67 -0.39 -1.06 -0.05 -0.3 -0.28 -0.27 -0.25 -0.25 -0.55 -0.83 -0.74 -0.79 -0.77 0.52 -0.54 -0.14 -0.39 -0.14 0.49 -0.3 -0.45 0.32 -0.13 0.56 -0.46 -0.36 -0.47 -0.43 -0.42 -0.4 -0.61 -0.99
0.34 0.65 1.87 -2.08 -0.07 0.53 0.52 -0.07 0.58 -0.01 0.04 0.6 -0.88 0.52 -0.49 -0.67 -0.65 -0.64 -0.39 0.47 0.09 0.39 -0.52 -1.18 0.46 -0.27 -0.76 -0.51 -0.59 -0.47 -0.45 -0.88 -0.93 -0.88 -0.95 0.54 -0.24 -0.22 -0.4 -0.63 1.16 -0.41 -0.5 0.77 -0.49 1.01 -0.23 -0.51 -1.02 -0.91 -0.58 -0.01 0.34 0.33
0.58 0.85 2.08 -2.8 -0.55 0.32 0.64 -0.31 0.48 -0.31 -0.1 0.47 -0.27 -0.25 -0.31 -0.5 -0.53 -0.51 -0.26 -0.4 -0.29 0.1 -0.13 -0.18 -0.01 -0.26 -0.46 -0.36 -0.09 -0.36 0.64 -0.35 0.01 0.04 -0.12 0.47 -0.55 -0.04 -0.37 -0.41 0.19 -0.57 -0.43 0.13 -0.08 0.15 -0.62 -0.26 -0.04 -0.08 -0.14 -0.24 -0.11 -0.08
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0.46 0.57 1.2 -3.56 -0.48 -0.03 0.61 -0.09 0.46 -0.08 -0.07 0.47 -0.62 -0.55 -0.64 -0.67 -0.48 -0.59 -0.72 -0.33 -0.34 -0.25 -0.2 -0.1 0.53 -0.15 -0.32 -0.23 -0.11 -0.35 1.03 0.17 -0.14 0.39 -0.12 0.71 -0.33 -0.08 -0.37 -0.35 0.79 -0.42 -0.35 0.62 -0.05 0.72 -0.44 -0.23 -0.29 -0.22 -0.16 -0.26 -0.2 -0.17
0.69 1.05 2.34 -1.39 0.25 0.15 0.53 0.06 0.05 -0.35 -0.16 0.07 -1.02 -0.7 -0.42 -0.24 -0.38 -0.31 0.22 -0.25 -0.21 0.27 -0.71 -0.19 0.34 -0.43 -0.7 -0.44 -0.58 -0.73 0.48 -1.04 0.29 -0.34 0.22 0.61 -0.56 -0.5 -0.59 -0.73 0.87 -0.37 -0.43 0.69 -0.44 0.75 -0.38 -0.47 -0.82 -0.63 -0.47 -0.66 -0.68 -0.95
0.34 1.15 2.41 -3.6 -0.22 0.35 0.35 -0.03 0.13 -0.08 -0.13 -0.12 -0.95 -0.45 -0.49 -0.45 -0.36 -0.39 -0.09 -0.17 -0.16 0.23 -0.72 -1.04 0.08 0.34 -0.61 -0.79 -0.62 -0.95 -0.93 -1.09 -0.7 -0.61 -0.68 1.47 0.06 0.57 0.25 -0.29 1.2 -0.37 -0.66 0.68 -0.25 0.68 -0.74 -0.58 -0.93 -0.72 -0.51 -0.69 -0.66 -0.74
0.71 0.96 1.6 -2.6 -0.74 0.49 0.68 0.34 0.25 -0.08 0.08 0.31 -0.49 0.39 -0.15 -0.24 -0.08 -0.16 -0.14 -0.11 0.06 0.56 -0.24 -0.77 -0.01 0.05 -0.19 -0.48 -0.3 -0.66 -0.01 -0.89 -0.53 -0.48 -0.55 0.09 -0.34 0.17 -0.24 -0.4 0.61 -0.12 -0.43 0.34 0.08 0.44 -0.67 -0.3 -0.32 -0.04 -0.21 -0.51 -0.27 -0.36
0.73 0.4 1.67 -3.16 -0.77 0.54 1.11 0.3 0.36 -0.19 0.25 0.23 0.15 0.01 -0.23 -0.21 -0.24 -0.27 -0.27 0.04 0.35 0.52 -0.06 -1.33 0.55 -0.83 -0.42 -0.42 -0.12 -0.46 0.44 -1.09 -0.99 -0.86 -1.05 0.8 -0.93 -0.62 -0.85 -0.56 0.77 -0.63 -0.47 0.75 -0.17 0.52 -0.61 -0.23 -0.48 -0.33 -0.34 -0.33 0.05 -0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.