Heatmap: Cluster_143 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.51 -0.63 -0.88 -5.77 -0.08 -0.01 -0.28 -1.23 -0.53 -1.72 -1.48 -0.65 -0.67 -2.14 -0.75 -0.6 -0.6 -0.54 0.11 -0.52 -0.15 -0.68 0.38 -1.16 1.07 -0.28 -0.01 0.78 -0.28 0.28 -0.09 -1.25 -0.86 -1.35 -1.0 0.31 0.05 -0.59 -0.22 -0.07 1.34 0.34 0.49 1.01 -0.13 1.25 0.72 0.24 0.0 0.64 0.92 0.58 0.9 1.02
-0.76 -0.22 -1.29 1.42 -2.64 0.52 -1.2 1.17 1.39 0.57 0.71 -0.25 -1.46 -0.52 - -0.22 0.63 0.46 - -1.51 - 2.04 -0.26 -2.12 0.38 1.86 -0.63 -1.95 -0.49 -1.13 -3.54 -0.9 -2.59 -2.6 -1.61 1.68 -0.15 1.75 1.35 -1.09 0.21 -1.76 -1.66 -2.02 0.73 -0.28 -2.75 -0.61 -2.61 -1.94 -0.18 0.1 -0.46 0.05
-1.87 -4.62 - -0.63 -5.02 -0.41 -2.92 0.48 0.62 -1.76 -0.78 1.15 -1.87 -0.84 -1.2 -0.6 0.11 0.16 -3.41 1.94 1.44 -2.91 -0.23 -2.95 -0.51 1.55 -0.05 -0.35 -2.13 -0.01 -0.55 -2.91 -4.19 -3.66 -4.52 -0.71 1.42 0.82 1.5 -0.85 -0.52 0.08 -0.55 -0.94 -0.5 -0.69 -1.02 -1.25 0.69 1.08 0.2 1.41 1.22 1.65
-1.03 -2.1 -3.37 -6.08 -1.4 -0.06 -0.09 -0.83 0.77 -0.97 -0.62 0.26 0.03 -0.95 -0.33 -0.3 -0.23 -0.47 -0.89 -0.11 -0.28 -1.39 0.52 -0.89 -0.37 1.04 0.7 0.3 -0.88 -0.06 -0.26 -1.09 -0.94 -2.19 -1.1 1.23 0.88 0.26 0.88 0.36 0.8 0.31 -0.19 -0.26 -0.01 0.95 -0.2 -0.17 0.57 0.45 0.49 0.16 0.82 1.12
-0.16 -0.04 0.37 -2.61 -0.68 -0.03 -0.78 -0.65 -0.38 -1.06 -0.96 -0.51 -0.92 -0.36 -1.03 -1.14 -0.94 -1.05 -0.64 0.7 0.43 -0.71 0.25 -0.6 0.6 0.8 0.35 -0.03 -0.03 -0.06 -0.44 -0.67 -0.66 -0.63 -0.82 0.86 0.69 0.71 0.71 -0.07 0.47 0.3 -0.12 0.57 0.02 0.39 -0.04 -0.03 -0.27 0.05 0.18 0.67 1.03 0.86
0.41 0.69 2.68 -3.78 -3.6 0.19 1.87 -1.34 0.49 -1.43 -0.39 0.17 0.1 -1.3 -1.38 -1.05 -1.06 -0.94 -0.15 -0.89 -0.39 -3.95 1.11 0.55 1.05 -2.08 -1.78 -0.07 -0.46 -0.24 0.37 0.66 -1.36 -0.43 -1.11 -0.07 -4.14 -3.67 -3.21 -2.79 0.31 -3.54 -1.23 0.9 -2.42 0.53 -2.21 -0.62 -0.41 0.12 0.65 1.04 0.93 1.0
-1.51 -0.43 -1.21 -1.51 -2.55 0.18 -0.3 -0.83 -1.36 -1.39 -1.0 -1.15 -1.55 -1.6 -0.73 -0.94 -1.14 -0.9 -1.12 -0.96 -0.53 -0.82 -0.01 -1.49 0.84 1.05 -0.32 -0.03 -0.87 -0.15 0.63 -1.5 -0.61 -0.69 -0.5 0.82 0.98 1.46 1.14 -0.32 0.75 -0.78 -0.02 1.14 0.08 0.88 0.33 0.16 -0.66 -0.56 0.3 1.06 1.23 1.67
0.68 0.02 -0.63 -2.8 -1.08 -0.42 -0.33 -0.59 -0.2 -0.69 -1.47 -0.75 -0.86 -0.43 -0.43 -0.32 -0.63 -0.42 -1.26 -0.25 0.29 -1.32 0.22 -1.08 0.65 0.44 -0.01 0.11 -0.5 0.21 0.1 -1.13 -0.37 -1.18 -0.23 -0.84 0.37 -0.05 0.6 0.09 0.9 0.43 -0.01 1.25 0.22 0.26 -0.02 0.53 -0.04 0.24 0.39 0.91 1.21 0.87
0.06 -0.6 -1.29 -5.17 -1.9 -0.46 0.47 -1.12 0.34 -1.99 -1.01 0.36 -0.13 -0.35 -2.0 -0.95 -0.62 -1.24 -1.84 -0.09 -0.07 -0.68 0.53 -1.09 1.37 0.52 0.19 0.58 0.25 -0.09 0.63 -0.48 -0.66 -1.23 -0.72 0.07 0.18 0.25 -0.06 -0.32 0.6 0.31 -0.1 1.25 0.39 -0.03 -0.31 0.09 0.14 0.2 0.45 0.88 0.99 0.97
-0.04 -1.68 -1.62 -2.33 -3.65 0.05 0.07 -0.67 0.17 -1.1 -0.52 0.34 0.94 -2.82 -1.57 -1.83 -1.58 -1.11 -2.27 -0.16 -0.27 -0.78 0.83 -0.1 1.13 1.07 0.67 0.33 0.37 0.36 -0.42 -0.09 -0.97 -1.25 -1.23 1.52 -0.29 0.81 0.62 -0.57 0.83 -0.94 -0.5 0.7 0.5 0.69 -0.53 -0.4 -0.84 -0.0 0.46 0.42 0.5 0.97
- - - 1.84 - 0.47 -2.08 - - - - - 0.36 -0.28 - - - 1.69 - - - - 0.79 - - 2.04 0.93 0.84 - 1.19 - - -1.27 - 0.39 - 1.54 2.23 2.52 0.34 -0.26 0.96 0.12 -0.12 -0.24 - 0.21 -0.33 -0.29 -0.13 0.38 1.39 -0.02 0.08
- - - -5.21 -5.56 -0.16 -3.69 - -2.31 - - -2.37 -0.62 -0.65 -1.9 -0.37 -1.04 -1.67 - - -2.49 - 1.21 -0.73 0.78 1.84 0.69 -0.25 -0.42 0.03 -0.08 -0.56 -1.21 -1.83 -2.39 2.39 0.98 0.45 1.68 -0.36 0.57 -0.55 -0.35 1.47 -0.12 0.73 -0.39 -1.07 0.73 0.38 -0.36 0.47 1.29 2.21
0.47 0.42 -0.83 -3.0 -1.44 -0.43 -0.49 -0.32 -2.17 -1.06 -2.44 -0.64 -0.82 -3.02 -0.42 0.12 -0.94 -0.67 -1.61 -1.92 0.46 -0.8 0.55 -1.82 0.26 1.01 0.37 0.33 0.36 0.45 -1.35 -0.14 -1.39 -2.18 -0.6 -1.15 0.86 0.87 0.86 0.72 -0.02 0.5 -0.05 0.54 0.84 -0.62 0.26 0.48 0.18 -0.02 0.64 0.89 1.22 1.15
-2.55 - 0.34 -4.56 -1.26 -0.16 -1.03 -0.92 0.36 -0.8 - -0.43 -2.09 -0.97 -0.21 -0.2 -1.0 -0.01 -0.4 0.63 -0.55 - 0.36 -2.94 0.05 1.49 0.45 -0.26 -0.41 0.57 -1.93 -1.96 -2.33 -3.95 -2.88 0.44 0.84 0.99 1.12 -0.01 0.57 0.17 -0.15 0.06 -0.14 0.23 -0.15 0.08 0.71 1.04 0.67 1.61 1.37 1.15
-0.78 -0.05 -0.62 -1.27 -4.62 -0.74 - -0.66 -1.31 -1.48 0.12 0.22 -1.39 0.85 0.24 -1.47 0.04 -1.44 -1.74 -2.68 -1.48 - 0.47 -1.02 0.58 0.72 0.39 0.33 0.06 0.21 -0.31 -0.91 -0.84 -1.17 -1.68 0.47 0.81 0.07 0.66 0.14 1.47 0.66 0.14 0.58 0.92 0.67 0.41 0.78 -0.02 0.48 0.65 0.39 0.55 0.74
-0.86 -0.93 -2.51 0.75 - -0.22 -2.67 -1.35 -1.41 -2.58 -1.51 -0.12 -0.69 -2.73 -2.23 -1.02 0.08 -1.45 - -0.44 -1.0 - 0.47 -0.57 1.0 0.94 -0.29 0.33 0.07 0.21 -0.47 -1.69 -1.41 -1.8 -0.75 0.18 0.83 0.59 1.32 -0.48 1.5 0.05 -0.08 1.17 0.61 1.03 0.87 0.32 0.36 0.66 0.54 0.7 0.92 1.03
-1.04 -0.92 -2.17 -3.98 0.14 0.57 -1.08 -0.96 -0.48 -0.73 -0.73 -0.07 -1.51 -2.79 -0.25 -0.31 -0.28 -0.2 -0.3 -1.0 -0.66 -3.54 0.65 -0.57 0.31 -0.08 -0.93 0.25 -0.3 0.25 0.01 -0.99 -0.94 -0.46 -0.25 1.62 -0.33 -0.43 -0.33 -0.52 0.96 -0.1 -0.09 0.31 -0.36 0.51 0.1 0.33 0.31 0.25 0.34 0.61 1.37 2.36
-2.58 -1.06 -0.4 -0.42 -3.43 -0.34 -2.09 -0.35 -0.99 - - -0.04 -3.0 -2.06 -0.06 -1.39 -0.66 -0.33 - -2.3 -1.16 -0.35 0.0 0.45 -0.01 1.03 -0.57 0.5 -1.11 -0.5 0.29 -1.09 -0.33 0.69 -1.58 0.28 1.35 1.41 0.87 -0.78 1.8 -1.53 0.65 1.19 -1.1 0.84 0.39 -0.4 -0.47 -1.82 -1.83 0.61 1.99 1.67
-1.0 -1.37 - 0.68 -4.99 0.77 -0.49 0.4 -0.82 -0.45 -0.0 -1.87 0.17 -2.01 0.06 0.39 0.39 1.05 -0.25 0.17 1.01 0.05 -0.12 0.08 -0.43 1.48 -1.6 -0.13 -0.35 -0.3 -0.86 -0.67 -1.32 -0.67 -0.18 -0.2 1.06 1.45 1.35 -0.1 -0.6 -0.25 -0.69 -0.78 -0.89 -1.39 -0.81 -0.78 0.46 -0.4 -0.76 0.82 1.0 0.23
-4.13 - - 0.94 -5.89 0.07 -1.71 -0.07 -0.27 - -0.06 -1.13 -1.32 -4.61 - -0.03 -1.5 -1.46 -1.93 -0.32 -0.93 - 0.71 -0.98 0.3 1.41 -0.3 -0.11 0.3 0.09 -0.39 -2.33 -0.96 -1.48 -0.7 0.0 1.3 1.21 1.27 -0.27 0.55 0.41 -0.33 1.07 0.0 0.34 0.21 -0.13 0.48 0.01 0.48 1.47 1.54 1.44
-3.5 - - -0.72 -6.13 0.31 -0.28 -0.57 -2.43 -3.54 -0.12 0.51 -1.56 -1.5 -2.95 -1.15 -0.09 -0.29 -1.87 -0.1 -1.61 - 0.82 -1.11 0.43 1.65 0.02 0.23 -0.06 0.23 -0.24 -1.82 -0.94 -1.26 -0.23 -0.5 1.42 1.33 1.31 0.04 0.11 0.32 -0.34 0.32 0.4 0.24 0.22 -0.02 -0.07 0.68 0.59 1.49 1.06 1.02
- - - -0.66 - 0.76 -0.85 -2.07 -0.1 - - 0.85 -1.52 -4.75 -1.75 -2.83 - - - - - - 1.71 -0.72 1.49 1.31 1.53 0.89 -1.3 -0.64 -0.7 -0.44 -1.43 -2.63 -2.04 1.38 1.58 -0.68 0.13 -1.57 1.44 -0.25 -1.15 0.87 -1.61 1.37 -1.0 -0.54 -0.05 -0.12 1.77 1.22 0.92 1.64
0.27 -0.08 0.16 -3.42 0.57 0.1 0.97 -0.78 -0.6 -0.85 -0.84 -1.19 -1.11 -1.79 -1.0 -1.07 -1.01 -1.27 -0.92 -0.88 -0.72 -0.27 0.06 -1.09 0.37 0.12 0.43 0.37 -0.44 0.11 -0.75 -0.75 -0.5 -0.53 -0.76 -0.88 0.55 0.3 0.61 0.8 1.26 0.58 0.1 1.0 0.13 1.27 0.49 0.04 -0.69 0.02 0.38 0.61 0.6 0.32
- - -2.47 -1.75 -0.06 1.44 -2.09 1.14 0.21 0.63 -2.06 -0.43 -3.38 -1.44 -0.15 1.19 -0.09 0.83 -0.81 1.09 1.62 1.39 -0.59 -1.4 -0.73 0.16 -0.59 -1.94 -2.34 -3.59 -0.48 -0.95 -2.2 - -1.8 0.55 -0.99 -1.46 -0.48 -2.5 -0.28 -0.76 -1.7 -0.16 -1.66 0.05 -1.91 -1.91 1.05 0.24 -0.82 -0.26 2.07 2.74
-0.28 -1.28 -5.04 1.34 -8.63 0.69 0.21 -0.64 1.23 0.75 -0.12 1.33 -1.13 -0.99 -0.12 -0.21 0.33 0.33 0.63 -2.28 -1.31 0.85 -1.05 -2.39 -0.38 0.85 -0.91 -0.48 -0.71 -0.32 -1.63 -1.86 -1.4 -0.85 -1.44 -0.23 0.87 2.13 0.95 0.63 0.9 -0.24 -0.75 0.04 0.11 0.36 -0.62 -0.22 -0.53 -1.4 -1.64 -0.64 -0.26 -0.51
-0.46 -0.16 1.25 -0.79 -1.97 0.26 -0.18 -1.27 0.27 -1.12 -1.21 0.42 -0.8 -1.22 -0.86 -1.27 -1.57 -0.8 -1.49 -0.61 -0.27 0.21 0.48 -1.06 0.4 1.03 0.13 -0.49 -0.87 -0.49 -0.37 -0.1 -1.2 -2.11 -1.61 -0.14 0.9 0.84 0.84 -0.6 0.95 -0.19 -0.68 0.78 -0.56 0.45 -0.66 -0.86 -0.56 -0.12 -0.02 1.29 1.52 1.62
0.04 0.31 0.77 -4.28 -0.35 1.05 0.05 -0.48 0.33 -0.55 -0.25 0.16 0.09 0.29 -0.23 -0.73 -0.46 -0.29 0.04 -0.18 0.0 0.2 0.15 -0.37 -0.19 -1.24 -0.29 -0.25 -0.1 -0.62 -0.13 -0.13 -0.18 0.1 -0.2 1.26 -1.07 -0.49 -1.28 -0.77 0.46 -0.58 -0.37 0.33 -0.27 0.42 -0.4 -0.22 0.31 -0.88 -0.99 -0.68 0.34 2.14
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-9.58 1.03 0.64 -5.1 -0.6 0.69 0.2 0.04 0.93 -0.28 -0.15 0.71 -0.55 -1.99 -10.45 0.56 - 0.61 0.77 0.29 0.36 0.6 0.24 -0.45 -0.05 -0.16 -0.1 0.25 0.2 0.22 -0.22 -0.42 -0.23 -0.48 -0.46 -0.82 -0.21 -0.19 -0.12 0.13 0.0 -0.16 0.0 -0.08 0.11 -0.12 -0.02 0.26 -0.0 0.44 0.4 0.02 -0.07 -0.16
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-12.2 1.27 1.61 -2.99 -0.29 0.69 -0.1 -0.16 0.28 -0.69 -0.42 0.16 -0.51 -1.51 -8.47 0.3 - 0.4 0.83 0.12 -0.07 0.62 -0.13 0.36 -0.61 -0.13 0.01 -0.0 -0.05 -0.12 0.37 0.08 0.77 0.33 0.67 -0.95 -0.21 -0.2 -0.13 0.15 -0.27 0.2 0.03 -0.45 0.3 -0.38 0.1 0.06 0.07 0.01 -0.08 -0.69 -0.68 -0.88
-0.49 -1.33 -2.18 -2.82 -0.29 -0.27 -1.82 -1.38 0.77 -0.84 -0.22 1.52 -0.99 -1.39 -0.75 -0.79 -1.53 -0.89 -0.86 0.19 -0.08 -1.0 0.3 -0.73 0.65 0.3 0.84 -0.06 1.39 0.74 -1.49 -1.76 -1.78 -1.62 -1.39 -0.68 0.08 0.09 0.26 -0.55 0.44 -0.69 -0.47 0.5 -0.45 0.51 -0.08 -0.15 0.9 0.99 0.63 1.2 1.27 0.97

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.