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Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.7 0.63 0.76 -4.71 -0.27 0.55 0.55 0.17 0.7 0.46 0.4 0.78 -0.55 0.32 -0.15 -0.1 -0.1 -0.23 0.25 -0.03 -0.06 0.68 -0.42 0.03 -0.59 -0.15 -0.42 -0.45 0.34 -0.59 -0.08 -0.45 0.28 0.66 0.42 -0.21 -0.31 0.38 -0.18 -0.3 -0.28 -0.32 -0.2 -0.37 0.23 -0.31 -0.47 -0.21 -0.5 -0.5 -0.53 -0.78 -0.79 -0.81
0.53 0.76 0.72 -4.47 -0.24 0.63 0.79 0.31 0.94 0.68 0.54 1.04 -0.6 0.57 -0.11 -0.2 0.03 -0.13 0.22 -0.1 -0.05 0.64 -0.22 -0.0 -0.49 -0.62 -0.18 -0.29 -0.09 -0.3 -0.06 0.2 -0.09 0.42 -0.02 -0.98 -0.69 -0.33 -0.7 -0.2 -0.4 -0.29 -0.3 -0.52 -0.08 -0.59 -0.33 -0.19 -0.28 -0.24 -0.21 -0.45 -0.67 -0.83
0.51 0.66 0.34 -3.92 -0.01 0.64 0.58 0.15 0.49 -0.05 -0.16 0.42 -0.27 -0.01 -0.07 -0.05 -0.03 -0.04 0.48 -0.07 0.11 0.01 -0.07 0.05 -0.58 -0.26 0.05 0.01 0.16 -0.01 0.15 0.34 0.23 0.12 0.21 -0.19 -0.5 -0.08 -0.39 0.1 -0.43 -0.08 -0.09 -0.53 0.17 -0.53 -0.11 0.12 -0.16 0.1 0.05 -0.45 -0.83 -0.98
0.65 0.61 -0.24 -4.76 0.07 0.74 0.86 0.43 0.56 0.56 0.37 0.65 -0.99 0.49 0.27 0.16 0.39 0.25 0.65 -0.25 -0.13 1.03 -0.31 -0.41 -0.57 -0.29 -0.67 -0.1 0.24 -0.23 -0.54 -0.51 -0.25 0.23 -0.34 -0.61 -0.41 0.0 -0.34 -0.16 -0.35 -0.26 -0.06 -0.36 0.02 -0.54 -0.02 0.11 -0.69 -0.35 -0.21 -0.41 -0.64 -0.89
0.7 0.63 0.5 -4.17 -0.13 0.5 0.63 0.33 0.46 0.01 0.21 0.33 -0.32 0.45 -0.49 -0.29 -0.37 -0.41 0.07 0.0 0.15 0.66 -0.21 -0.6 -0.25 0.04 0.0 -0.16 0.01 -0.19 -0.38 -0.17 -0.01 -0.03 0.14 -0.37 -0.19 0.12 -0.14 0.08 0.28 0.02 -0.01 0.12 0.24 0.17 -0.02 -0.03 -0.48 -0.3 -0.38 -0.49 -0.61 -0.72
0.2 0.74 -0.04 -5.01 -0.21 0.69 0.88 0.06 1.74 0.77 0.96 1.73 -0.9 0.18 -0.41 -0.19 -0.34 -0.44 0.2 -0.15 -0.24 0.6 -0.15 -0.25 -0.09 -1.0 -0.63 -0.67 -0.09 -0.52 -0.23 0.32 -0.09 0.27 0.08 -1.31 -1.34 -0.66 -1.2 -0.52 -0.29 -0.81 -0.69 0.13 -0.33 -0.28 -0.73 -0.28 -0.83 -0.47 -0.12 0.13 -0.16 -0.04
0.96 0.81 0.13 -3.79 -0.61 1.12 1.22 0.41 0.69 -0.06 0.06 0.53 -0.4 0.08 0.22 0.15 0.32 0.17 0.27 -0.11 -0.1 0.63 -0.24 0.37 -0.93 -0.93 -0.66 0.06 0.02 -0.07 -0.43 -0.07 0.71 0.41 0.8 -1.64 -1.02 -0.77 -0.95 -0.24 -0.9 -0.27 -0.09 -0.93 -0.29 -1.27 -0.17 0.04 -0.34 -0.11 0.16 -0.41 -0.9 -1.24
0.84 0.68 0.95 -3.99 -0.15 0.57 0.61 0.49 0.65 0.11 0.61 0.6 -0.26 0.11 -0.44 -0.42 -0.43 -0.54 0.26 0.0 -0.11 0.66 -0.28 -0.32 -0.29 -0.57 -0.22 -0.36 0.31 -0.33 0.21 0.08 -0.05 0.77 -0.06 -0.46 -0.62 -0.18 -0.5 -0.01 -0.15 -0.22 -0.23 -0.15 0.26 -0.24 -0.29 -0.09 -0.6 -0.35 -0.39 -0.63 -0.6 -0.66
0.64 0.82 -0.15 -2.17 -0.55 0.87 0.18 0.77 0.19 0.36 0.45 0.43 -0.56 -0.27 0.33 -0.16 0.54 0.37 0.53 0.24 0.24 0.45 -0.35 -0.36 -0.62 0.01 -0.08 -0.02 -0.04 -0.11 -0.92 -1.29 -0.12 -0.49 -0.21 -1.7 0.15 0.15 0.21 0.1 -0.24 0.2 -0.05 -0.53 0.16 -0.45 0.09 -0.17 -0.02 -0.38 -0.3 -0.48 -0.27 -0.52
0.23 1.37 -7.32 -1.87 -7.6 1.62 -0.45 -1.16 1.13 -0.32 0.18 1.39 -3.52 -0.74 0.35 0.66 0.44 0.6 -0.84 -3.5 -5.69 -1.7 0.12 -0.76 -2.37 -0.68 -1.28 1.01 -0.16 -0.38 -1.53 -1.77 1.08 -0.46 -0.31 0.06 0.35 -0.59 -0.51 0.09 -0.07 0.69 1.01 -1.45 0.44 -0.81 1.08 0.86 -0.59 -0.34 0.45 -0.45 -0.2 -0.52
0.9 0.62 0.39 -2.32 -1.34 0.95 0.65 0.75 0.62 0.11 0.16 0.98 0.04 0.95 -0.79 -0.55 -0.79 -0.83 -1.11 1.01 0.76 0.3 -0.5 0.14 -0.52 -0.07 -0.64 -0.34 0.24 -0.25 -1.06 -0.56 0.26 0.09 0.37 -1.11 0.01 0.7 -0.48 -0.39 -0.27 -0.43 -0.2 -0.51 -0.13 -0.33 -0.15 -0.26 -1.16 -1.02 -0.64 -0.12 -0.07 -0.39
1.3 1.48 0.18 -3.76 -3.64 1.35 0.83 1.19 0.66 0.41 0.6 0.23 -0.47 -0.08 0.04 0.19 -0.0 -0.05 -0.68 0.67 0.53 -0.08 -0.13 0.69 -1.94 -1.21 -0.91 -0.3 0.01 -0.26 -0.06 -1.04 0.68 0.6 0.9 -3.21 -1.35 -1.03 -1.32 -0.25 -2.06 -0.68 -0.42 -2.03 -0.24 -2.62 -0.53 -0.1 -0.08 -0.11 -0.1 -0.34 -0.12 -0.36
0.95 1.18 0.81 -4.34 -0.37 0.7 0.76 -0.04 0.77 -0.61 -0.14 0.7 -1.12 0.6 -0.22 -0.08 -0.02 -0.11 0.03 0.21 0.22 0.1 -0.25 -0.58 -0.12 -0.38 -0.53 -0.12 0.1 -0.09 -0.15 -0.28 -0.15 -0.1 -0.08 -0.5 -0.41 -0.23 -0.45 -0.05 0.06 -0.18 -0.1 -0.11 0.16 -0.35 0.06 0.19 -0.46 -0.25 -0.11 -0.13 -0.39 -0.79
0.41 0.21 0.72 -3.1 -0.8 0.64 0.6 0.43 0.84 0.12 0.35 0.82 -0.66 0.38 -0.38 -0.42 -0.22 -0.42 0.2 0.06 0.12 0.69 -0.4 -0.03 -0.09 -0.4 -0.26 -0.25 0.3 -0.21 0.06 -0.31 0.01 0.54 0.13 -0.23 -0.36 0.02 -0.34 -0.06 0.02 -0.32 -0.28 0.01 0.13 -0.13 -0.23 -0.07 -0.38 -0.42 -0.44 -0.38 -0.37 -0.72
0.61 0.78 0.42 -5.09 -0.51 0.7 0.59 -0.02 0.46 -0.63 -0.17 0.04 -0.46 -0.42 0.14 -0.04 0.14 -0.02 0.27 -0.0 0.05 -0.72 0.03 -0.31 -0.38 -0.32 -0.06 0.22 -0.25 0.05 -0.08 -0.75 0.38 -0.4 0.14 -0.86 -0.46 -0.41 -0.46 0.16 0.09 0.26 0.21 -0.18 0.13 -0.14 0.23 0.22 0.07 -0.13 -0.09 -0.08 0.38 0.46
0.44 0.45 0.67 -5.54 -0.29 0.5 0.6 0.14 0.61 -0.1 0.15 0.53 0.01 0.12 -0.19 -0.24 -0.15 -0.18 0.08 0.05 0.17 0.31 0.1 -0.29 -0.34 -0.23 0.18 -0.01 0.05 -0.01 -0.76 -0.68 -0.13 -0.14 -0.01 -0.48 -0.31 -0.06 -0.33 0.18 -0.08 0.05 -0.04 -0.19 0.35 -0.23 -0.01 0.03 0.08 0.14 0.09 -0.23 -0.36 -0.35
0.85 0.47 -0.12 -4.79 0.06 0.59 0.26 0.18 0.22 -0.25 -0.21 0.16 -0.93 -0.03 0.27 0.41 0.47 0.32 0.6 -0.09 -0.16 0.8 -0.28 0.34 -0.89 -0.52 0.02 0.01 0.02 -0.13 0.03 -0.01 0.63 0.35 0.56 -1.1 -0.62 -0.32 -0.52 0.29 -0.64 0.19 0.0 -0.64 0.32 -0.58 0.1 0.19 0.2 -0.37 -0.55 -1.08 -0.87 -0.66
1.16 0.8 0.34 -3.71 0.03 0.87 0.54 0.32 -0.17 0.15 -0.13 -0.13 -0.48 0.36 0.4 0.49 0.42 0.28 0.46 -0.35 -0.32 0.57 -0.49 0.3 -0.92 -0.45 -0.37 -0.32 0.25 -0.31 -0.29 -0.45 0.44 0.37 0.47 -0.68 -0.44 -0.02 -0.43 -0.11 -0.56 -0.12 -0.21 -0.6 0.17 -0.85 -0.19 -0.01 0.03 -0.23 -0.3 -0.75 -0.61 -0.7
0.72 0.82 0.4 -4.5 -0.87 0.74 1.07 0.25 1.2 0.95 0.39 1.51 -0.47 0.09 -0.36 -0.37 -0.19 -0.34 -0.16 0.05 0.12 0.41 -0.18 -0.39 -0.48 -0.51 -0.36 -0.49 0.17 -0.44 -0.15 0.51 -0.34 0.64 -0.09 -0.42 -0.7 -0.2 -0.56 -0.24 -0.45 -0.57 -0.5 -0.4 -0.02 -0.62 -0.66 -0.12 -0.35 -0.2 -0.24 -0.67 -1.05 -1.04
0.74 0.7 0.89 -4.09 -0.18 0.48 0.62 -0.12 0.35 -0.24 -0.22 0.56 -0.85 1.24 -0.2 -0.28 -0.14 -0.23 0.41 0.07 0.1 0.42 -0.32 -0.42 -0.41 -0.13 -0.46 -0.38 -0.0 -0.43 -0.6 0.51 -0.12 -0.07 -0.01 -0.38 -0.16 0.31 -0.13 -0.33 0.16 -0.35 -0.25 -0.14 -0.06 -0.0 -0.3 -0.15 -0.42 -0.45 -0.45 -0.11 0.03 -0.07
0.63 0.92 1.07 -3.79 -1.09 0.98 0.68 0.18 0.55 -0.23 -0.29 0.69 -0.98 1.65 0.22 0.18 0.29 0.29 0.54 0.14 0.22 0.7 -0.35 0.1 -1.35 -1.26 -0.77 -0.15 0.25 -0.35 0.07 0.14 0.21 0.99 0.2 -1.53 -0.96 -0.84 -1.09 -0.69 -1.1 -0.55 -0.07 -1.14 -0.31 -1.6 -0.09 0.2 -0.42 -0.43 -0.34 -0.7 -0.92 -1.24
0.62 0.83 -0.55 -2.99 -0.28 0.8 0.61 0.5 0.18 0.38 0.42 0.26 -0.52 0.08 0.09 0.27 0.27 0.05 0.01 0.33 0.47 0.32 -0.39 -0.36 -0.28 0.18 0.01 -0.25 -0.5 -0.28 -0.29 -0.87 0.15 -0.47 -0.03 -0.04 0.15 0.31 0.19 0.01 0.07 0.11 -0.34 -0.26 -0.01 0.04 -0.26 -0.39 -0.3 -0.28 -0.39 -0.67 -0.61 -0.59
0.61 0.46 0.42 -3.74 0.05 0.49 0.84 0.16 0.61 0.21 -0.0 0.72 0.43 -0.36 -0.17 -0.12 -0.07 -0.04 -0.01 0.17 0.36 0.21 -0.41 -0.52 -0.49 -0.05 -0.19 -0.57 0.27 -0.45 -0.51 0.46 -0.3 0.57 -0.27 -0.1 -0.22 0.24 -0.13 -0.05 0.06 -0.13 -0.17 -0.26 0.44 -0.02 -0.46 0.22 -0.71 -0.45 -0.37 -0.47 -0.76 -0.82
1.26 1.19 -0.36 -5.84 -1.96 1.25 1.05 0.56 0.14 0.04 0.24 0.09 -0.94 -0.02 0.39 0.48 0.3 0.44 1.05 -0.04 0.03 0.35 -0.23 0.72 -1.96 -1.11 -0.12 -0.08 -0.26 -0.18 0.32 -0.21 0.73 0.62 0.51 -1.8 -1.1 -1.31 -1.17 -0.09 -1.05 -0.33 -0.28 -1.53 0.04 -1.7 -0.25 -0.07 -0.3 0.06 -0.11 -1.21 -1.07 -1.08
0.87 0.69 0.4 -3.07 -0.78 1.0 0.55 0.52 0.25 0.63 0.77 -0.08 -0.81 0.28 -0.22 -0.3 -0.14 -0.3 -0.44 -0.4 -0.58 0.37 -0.49 0.41 -1.3 -0.87 -0.72 -0.23 0.72 -0.05 -0.49 0.12 0.18 1.78 0.56 -1.15 -0.49 -0.07 -0.42 0.55 -1.07 -0.32 0.07 -1.37 0.58 -1.55 -0.24 0.43 -0.51 -0.5 -0.73 -0.98 -0.85 -0.83
0.92 1.31 0.87 -3.95 0.3 0.73 0.43 0.01 0.19 -0.32 -0.05 -0.16 -0.7 -0.2 -0.01 0.06 -0.12 -0.04 0.65 -0.18 0.3 0.0 -0.25 0.21 -0.55 -0.42 -0.49 -0.05 -0.26 -0.32 0.69 0.16 0.77 0.37 0.54 -0.55 -0.48 -0.46 -0.45 -0.37 -0.33 -0.45 -0.2 -0.37 -0.46 -0.43 -0.16 -0.11 -0.33 -0.1 -0.16 -0.37 -0.61 -0.96
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0.4 1.07 0.97 -3.75 -0.45 0.43 0.95 0.36 1.09 0.9 0.8 0.92 -0.27 0.08 -0.73 -0.74 -0.64 -0.7 -0.16 -0.16 -0.23 0.35 -0.08 -0.02 -0.35 -0.04 -0.26 -0.53 -0.09 -0.49 -0.23 -0.06 0.04 0.66 0.13 -0.22 -0.11 0.33 -0.11 -0.15 -0.44 -0.24 -0.58 -0.21 0.12 -0.3 -0.68 -0.34 -0.85 -0.6 -0.48 -0.73 -0.71 -0.88
0.08 0.76 -0.96 -3.78 -0.02 0.58 0.72 0.33 0.9 0.76 1.06 0.67 -0.09 0.12 -0.59 -0.53 -0.59 -0.58 -0.18 0.09 0.11 -0.65 -0.28 0.02 0.16 -0.31 -0.82 -0.64 -0.14 -0.35 0.67 0.28 0.29 1.15 0.4 0.11 -0.35 -0.03 -0.33 0.0 0.05 -0.55 -0.5 0.25 -0.19 0.06 -0.57 -0.35 -1.0 -0.72 -0.64 -0.3 -0.56 -0.83
0.64 0.57 0.56 -3.29 -0.73 0.77 0.48 0.41 0.08 -0.04 0.16 0.01 -1.05 -0.38 -0.47 -0.27 -0.15 -0.24 0.52 -0.61 -0.85 0.28 -0.23 0.66 -1.51 -0.51 -0.07 -0.14 0.53 -0.28 0.7 0.45 0.6 1.46 0.58 -0.17 -0.66 -0.37 -0.62 0.31 -1.01 -0.02 0.06 -0.99 0.53 -1.27 -0.14 0.27 -0.04 0.02 -0.18 -1.28 -0.99 -1.13
0.52 0.51 0.6 -4.77 -0.46 0.86 0.86 -0.12 0.51 -0.13 0.21 0.5 -0.94 0.57 0.24 0.29 0.24 0.27 0.55 -0.39 -0.57 0.32 -0.07 -0.65 -0.29 -0.38 -0.66 -0.01 0.12 -0.0 0.09 -0.41 0.05 0.12 0.01 -1.69 -0.25 -0.15 -0.37 -0.14 -0.17 -0.15 0.08 -0.15 -0.16 -0.68 0.22 0.14 -0.2 -0.12 -0.06 -0.2 -0.16 -0.24
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0.38 0.93 0.95 -2.1 -0.48 0.88 0.84 0.64 1.65 -0.15 0.78 1.04 0.28 0.46 -0.36 -0.15 0.03 -0.3 0.92 0.32 0.52 1.66 -0.47 -0.55 -0.17 -1.14 -0.89 -0.83 0.43 -0.7 -0.48 -1.21 -1.17 -0.25 -0.96 -0.56 -1.27 -0.52 -1.42 -0.73 -0.24 -0.97 -0.96 0.26 -0.26 -0.53 -1.0 -0.59 -1.29 -0.69 -0.74 -0.33 -0.63 -0.42

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.