Heatmap: Cluster_86 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-1.04 0.58 0.79 -4.81 -1.99 -0.02 1.13 -1.7 1.29 -1.28 -1.26 1.61 1.16 0.73 -1.09 -0.95 -0.65 -0.73 -0.05 0.46 0.64 -2.4 1.11 -1.02 0.22 -0.99 0.08 -0.59 0.5 -1.09 -0.3 0.26 -1.26 -0.03 -1.43 0.02 -3.68 -2.15 -2.99 -1.77 -0.45 -1.33 -0.63 0.39 0.75 -0.27 -2.17 0.71 -1.77 0.07 1.05 1.21 0.82 0.69
1.27 -1.53 - -5.24 - -1.09 0.86 -0.69 -0.33 -1.81 -1.93 -0.01 1.07 1.23 -1.0 -1.37 -2.35 -1.34 - -0.18 0.26 -2.01 0.89 -0.61 1.6 1.44 0.69 -1.2 -0.63 -0.39 -0.85 -0.89 -3.05 -1.36 -2.87 1.12 0.11 1.23 0.72 -0.11 0.38 -1.19 -1.07 1.2 0.2 0.49 -2.73 -0.51 -1.12 -0.14 0.09 1.04 0.94 0.8
1.22 -0.77 - -1.45 -6.93 -0.06 1.42 -0.31 -0.86 -1.54 -2.28 -1.24 1.17 2.36 -1.14 -0.77 -1.23 -0.77 - 0.68 0.34 -2.12 0.76 -0.8 0.97 1.22 0.55 -1.37 -0.6 -1.14 -0.87 -0.54 -2.01 -1.55 -2.46 0.97 0.02 0.98 0.56 -0.27 0.15 -1.35 -1.26 0.94 0.03 -0.09 -2.91 -0.22 -1.57 -0.05 -0.51 0.38 0.62 0.82
-1.2 -1.63 -4.14 -2.53 -1.39 0.03 -0.25 2.71 0.21 1.78 1.96 0.56 0.91 0.04 0.45 0.1 0.83 0.19 -2.51 -0.18 0.44 0.56 0.29 -1.39 -4.15 -0.46 -0.44 -0.19 -1.04 0.25 -2.17 -3.12 -0.5 -2.16 -0.29 -3.32 -0.89 -1.5 -0.36 0.31 -4.25 -0.43 -0.47 -4.25 -0.36 -3.46 -0.67 0.14 1.95 0.98 -1.45 -4.31 -2.55 -0.41
0.87 -2.35 -4.11 -2.97 -1.99 -0.24 1.6 0.95 1.45 1.01 0.98 0.57 1.79 -0.46 -2.32 -2.3 -1.65 -2.99 -1.85 1.15 0.51 1.69 -0.06 -2.86 -1.81 0.13 0.62 0.03 -0.93 -0.11 -2.99 -2.39 -2.29 -1.57 -2.24 -0.1 0.07 -0.79 0.66 1.68 0.09 0.76 -0.89 -0.91 -0.49 0.02 -0.09 -0.59 0.05 -0.47 -0.51 -1.72 -1.66 -2.33
0.09 -1.32 -3.56 -7.12 -4.24 -0.44 0.32 1.04 1.34 0.12 1.02 0.77 -0.02 -0.64 -1.41 -1.28 -1.12 -1.48 -0.4 0.5 0.26 0.83 0.72 -1.01 0.72 -1.44 -0.7 0.49 0.93 0.28 -0.09 -0.57 -1.14 0.07 -1.23 -0.91 -1.22 -1.11 -1.15 -0.22 0.44 -0.78 0.25 0.41 -0.36 0.63 0.08 0.64 -0.59 0.31 0.93 0.32 0.49 0.26
-0.31 -0.22 -0.75 -6.59 -2.07 -0.03 -0.1 0.34 -0.17 0.29 0.19 -0.15 -0.28 -0.45 -0.64 -0.68 -0.68 -0.61 -0.23 -0.57 -0.05 -0.57 0.64 0.45 0.23 -0.76 -0.28 0.42 0.66 0.34 1.18 0.96 0.01 0.9 0.15 -0.32 -0.6 -0.11 -0.68 -0.13 -0.18 -0.68 0.19 0.21 -0.1 -0.36 0.04 0.38 -0.48 -0.04 0.33 0.95 0.32 0.17
0.26 -1.36 -3.94 -3.11 -6.24 0.57 0.96 -0.13 0.18 -0.82 -0.65 -0.43 0.21 -0.06 -0.61 -0.34 -0.77 -0.76 -0.31 -0.72 -0.56 0.04 0.82 -0.34 0.04 0.14 -0.18 0.46 0.58 0.08 0.96 0.1 0.24 1.27 -0.27 -2.94 -0.7 0.02 -0.01 0.47 -0.87 -0.43 0.46 -0.2 0.93 -1.22 -0.05 0.96 1.1 0.94 -0.02 -1.9 -0.62 0.16
-0.49 -0.06 -0.16 -3.63 -3.46 0.3 0.25 -0.95 -0.93 -1.42 -1.25 -0.3 -1.04 -0.75 -0.32 -0.55 -0.39 -0.12 -0.73 -0.63 -0.23 0.1 0.46 1.23 0.71 -0.48 -0.85 0.1 -0.07 -0.19 0.19 0.66 1.18 1.0 1.13 -1.08 -0.56 -0.68 -0.46 -0.48 -0.52 -0.64 -0.38 0.72 -0.35 -0.49 -0.6 0.08 0.2 0.46 0.36 1.33 0.85 0.82
-4.32 -6.19 - -1.11 -8.38 -0.22 0.72 -0.75 -0.64 -0.36 -0.11 -0.79 0.19 1.48 -2.29 -1.78 -1.06 -1.75 -1.91 -1.46 -0.82 1.45 -0.31 -0.11 1.08 -1.97 -0.85 -0.91 0.54 -0.11 0.63 -0.44 -0.22 1.32 -0.03 -0.05 -1.04 -0.36 -1.49 1.06 0.66 0.11 -0.59 2.32 0.53 0.59 0.12 0.55 -0.52 -0.84 -0.51 -0.06 0.43 0.43
- - - -3.66 - 1.51 1.48 -0.41 -0.58 -0.61 -0.0 0.21 3.25 -1.56 -3.42 -1.95 -2.31 -2.25 -3.34 0.71 0.51 -1.04 0.14 -0.27 1.45 -0.73 -0.81 -2.4 -2.17 -2.89 0.53 -1.72 -3.56 -3.22 -4.03 -1.16 -2.67 -1.64 -2.05 -2.05 1.08 -2.78 -3.31 2.45 -1.68 0.72 -4.15 -3.13 -0.13 -0.49 -0.25 0.12 1.61 1.77
0.58 0.3 -0.02 -5.27 -0.2 -0.04 0.38 -0.21 0.19 -0.55 -0.53 0.14 -0.6 -0.1 -0.07 -0.16 0.01 -0.02 0.4 -0.34 -0.16 -0.24 0.23 0.16 -0.7 -0.08 0.06 0.28 0.43 0.06 0.12 0.26 0.48 0.49 0.31 -0.27 -0.21 0.21 -0.16 0.24 -0.54 0.21 0.22 -0.4 0.35 -0.56 0.17 0.36 -0.11 0.22 0.38 -0.1 -0.7 -0.93
1.5 0.65 0.42 -6.33 -4.01 -0.09 1.21 1.09 0.34 0.69 0.4 0.21 2.03 -0.23 -0.76 -0.95 -0.51 -0.76 -2.36 1.23 1.69 0.39 0.19 -2.14 -3.81 0.3 -0.91 0.34 0.57 0.33 -3.43 -2.43 -2.13 -2.5 -1.95 -3.92 0.46 1.01 0.69 0.71 -4.65 -0.25 0.27 -2.86 0.21 -4.56 0.25 -0.02 -1.07 -0.94 -0.8 -0.82 -2.24 -2.23
1.85 0.17 2.55 0.08 0.51 0.61 1.85 0.02 -0.62 -0.43 -1.3 0.33 1.99 -0.36 -1.27 -1.65 -1.57 0.17 -2.06 1.3 1.79 -1.56 -1.99 -1.57 -2.26 1.06 -2.05 -1.64 -4.59 -1.63 -1.09 -1.78 -2.21 -3.99 -2.21 -1.54 1.62 0.63 2.01 -3.05 -5.05 -0.57 -2.17 -0.63 -2.75 -4.97 -1.03 -2.83 -2.35 -2.76 -1.32 -1.87 -1.22 -1.76
-0.99 -6.1 -7.47 -9.95 -7.43 -1.4 0.56 0.34 0.42 0.34 0.28 0.31 1.39 0.26 -2.01 -1.55 -1.52 -1.83 -2.65 -0.25 -0.13 0.05 -0.48 -0.46 0.94 -0.49 0.66 -0.13 0.86 0.09 0.33 -0.46 -0.97 0.36 -0.72 -1.84 -0.52 -1.0 -0.43 1.01 0.86 0.47 0.75 1.48 1.27 1.09 0.48 1.06 -1.12 -0.75 -0.44 -0.7 -0.73 -0.84
-2.86 -6.67 -9.61 -6.99 -5.57 -0.65 0.45 0.25 0.71 -0.04 0.02 0.64 1.21 0.37 -1.5 -1.26 -1.2 -1.18 -0.67 0.08 0.25 0.51 0.55 0.33 0.57 0.16 0.83 0.24 -0.19 0.53 1.04 0.08 -0.17 -0.34 -0.02 -0.0 -0.02 -0.54 0.05 0.21 -0.23 0.02 0.05 0.22 -0.13 0.13 -0.09 -0.0 -0.12 0.13 0.45 0.37 0.1 -0.2
0.43 -2.19 -7.77 -4.06 -1.31 0.34 1.05 0.07 0.12 -0.28 -0.49 -0.24 0.44 0.71 0.01 -0.22 0.5 0.37 0.16 0.62 -0.1 3.17 -0.63 1.01 -3.25 -0.3 -0.96 -0.18 -0.63 -0.32 -2.12 -0.65 1.26 -0.32 1.64 -2.69 -0.57 -1.61 -0.45 -0.68 -2.72 -0.35 -0.6 -3.16 -1.25 -3.56 -0.08 -0.51 0.9 -0.24 -0.86 -1.78 -2.18 -2.1
-0.84 -0.63 -1.1 -7.15 -0.62 -0.37 0.02 -0.48 -0.37 -0.32 -0.51 -0.23 -0.02 0.29 -0.26 -0.34 -0.16 -0.33 -0.57 -0.42 -0.09 -0.31 0.55 0.75 0.14 -1.1 0.05 0.54 0.08 0.45 0.66 0.5 1.05 0.62 1.02 -1.21 -0.92 -0.92 -1.03 0.26 -0.16 0.04 0.44 -0.14 -0.03 -0.09 0.44 0.66 0.89 0.1 -0.17 -0.37 -0.12 0.45
-0.02 -0.64 -2.98 -7.24 -1.1 -0.35 0.99 0.45 0.68 -0.01 0.7 0.11 0.22 0.35 -1.01 -1.17 -1.07 -0.93 -0.32 -0.93 -0.79 1.84 0.4 -0.75 1.04 -1.35 0.05 0.19 0.66 0.07 0.43 -0.16 -0.9 0.32 -1.27 -0.22 -1.77 -1.64 -2.0 -0.36 0.93 -0.68 0.05 1.41 0.55 1.11 0.09 -0.05 -0.42 -0.03 -0.17 -0.52 -0.78 -0.75
-1.37 2.11 -3.0 -3.7 0.8 -1.07 1.46 -1.31 1.8 1.63 2.57 1.58 0.97 -0.54 -2.1 -2.71 -2.37 -2.94 -0.86 0.54 -0.36 -0.47 2.21 -1.76 -2.22 -1.52 0.04 -1.78 -0.73 0.32 -0.56 1.64 -1.68 0.01 -1.18 -0.48 -1.72 -1.44 -2.04 0.08 -3.83 -0.84 -2.1 -2.27 0.17 -3.5 -1.06 -1.21 -1.96 -2.63 -2.62 -1.74 -2.27 -2.66
-0.49 -2.48 -3.77 -1.42 -2.59 0.12 -0.23 -0.67 -2.04 -0.19 -0.29 -0.61 -0.13 -0.32 0.44 -0.36 0.25 -0.07 0.85 -1.6 -1.95 1.81 0.17 -0.05 -1.98 0.17 0.19 0.77 1.23 0.34 -1.89 -0.16 -0.07 -0.52 -0.5 -1.9 1.08 0.13 0.73 0.87 -1.19 1.16 0.44 -1.27 0.72 -1.66 0.7 0.34 0.23 -0.1 -0.29 0.38 -0.56 -0.2
-0.47 1.62 -2.37 -4.0 1.11 -0.29 1.52 -1.36 0.51 0.9 1.76 -0.0 0.72 0.21 -0.66 -0.96 -0.61 -1.38 -1.79 0.31 -0.01 -1.98 2.08 -0.38 -0.04 -2.38 -0.94 -0.61 0.8 1.02 -1.66 0.12 -0.85 0.31 -0.67 -2.06 -1.64 -2.32 -2.63 -0.1 -1.13 -1.36 -0.28 -0.09 -0.07 -1.28 -0.52 0.57 -0.59 -0.17 -0.29 0.95 -1.0 -0.91
-0.02 0.22 0.09 -0.73 -1.67 0.12 0.8 -0.02 -1.01 -0.47 0.49 -0.65 -1.29 -1.77 -0.73 -0.81 -1.05 -0.98 -0.79 -1.59 -1.87 -0.33 0.69 0.07 -0.09 -0.94 0.01 0.69 1.03 0.54 0.97 0.03 -0.35 1.74 -0.12 -0.32 -0.67 -0.12 -0.69 0.68 -0.69 -0.16 0.29 -0.17 0.62 -0.58 0.23 0.72 0.07 0.4 0.62 -0.09 -0.13 -0.55
0.16 0.28 0.08 -5.95 -0.67 -0.34 0.52 0.23 0.28 0.07 -0.02 0.41 -0.97 0.19 -0.19 -0.27 -0.12 -0.23 0.33 -0.16 -0.15 0.37 0.15 0.19 -0.5 -0.34 -0.21 0.21 0.27 0.03 -0.06 -0.01 0.5 0.64 0.56 -0.78 -0.42 -0.06 -0.39 0.13 -0.24 0.02 0.12 -0.25 0.25 -0.18 0.19 0.34 0.07 0.04 0.05 -0.27 -0.21 -0.15
-1.52 -2.47 - -4.98 - -2.62 0.19 0.82 0.92 1.84 1.91 1.02 -3.4 1.45 -6.32 - - - -5.36 -3.78 -4.14 0.16 -1.7 -1.63 1.43 -5.19 0.21 -0.96 1.64 -1.18 -0.61 -1.58 -3.62 1.7 -2.01 0.01 -4.83 -1.27 -4.36 1.67 1.99 -1.36 -1.83 1.09 1.58 2.47 -1.62 -0.32 -4.17 -4.45 -4.86 -3.47 -2.17 -1.79
-0.28 -0.89 - 0.52 -4.17 -0.51 1.0 0.67 -0.38 1.96 2.44 -0.43 -0.88 1.11 -1.45 - - -3.18 -1.81 -1.13 -0.55 1.8 -1.68 -1.27 1.63 -3.91 -0.09 -1.58 0.5 -0.81 -1.29 -1.42 - 0.99 -3.08 -1.43 -1.67 -1.18 -2.07 1.69 1.57 -2.49 -2.6 0.76 1.04 1.97 -1.2 -1.96 -2.65 -3.67 -1.37 -1.44 -1.69 -1.52
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-2.77 -6.97 -11.16 -11.38 -10.16 -0.64 -0.35 2.46 2.12 2.01 2.72 2.04 1.19 1.01 -2.88 -4.72 -2.03 -3.01 -2.35 0.17 0.08 0.63 0.67 0.05 -0.86 -0.83 0.39 -0.91 -0.31 -0.09 -0.74 -0.58 -1.79 -1.48 -1.31 -1.55 -1.38 -0.91 -2.01 -0.27 -2.58 -2.02 -1.36 -0.99 -1.51 -2.15 -2.94 -1.59 -0.05 -1.02 -0.98 -0.49 0.1 0.02
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-4.26 - - -4.35 - -0.39 -0.19 -0.35 2.07 0.06 2.35 2.01 1.58 1.6 - -1.98 - -1.61 -1.83 0.69 0.01 - 1.47 0.37 -1.15 -0.26 -1.19 -2.59 -5.0 -0.41 1.77 1.0 -5.44 - -0.94 1.97 -4.51 -1.46 -2.4 1.22 -1.64 -5.37 - -3.17 -3.23 -2.19 -5.37 - 0.47 -3.37 -1.76 0.09 0.71 1.47
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-2.84 -5.14 - -5.12 -4.89 -0.02 1.67 -1.41 -0.39 -0.77 -0.52 -0.45 0.84 -3.53 -0.45 0.02 0.17 -0.37 -6.36 -0.06 0.61 2.82 0.53 -1.74 -5.04 0.44 -0.44 0.85 0.43 1.0 -6.52 -1.75 -1.29 -2.7 -1.75 -4.4 1.3 -0.16 1.7 0.44 -3.45 0.7 0.84 -3.46 0.47 -2.5 0.75 1.14 -0.83 -0.07 0.4 -0.61 -1.04 -2.56
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.