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Heatmap: Cluster_45 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.03 0.34 -0.01 -3.98 0.27 0.24 -0.53 0.02 -0.19 0.02 0.02 -0.13 -0.98 0.08 -0.96 -0.88 -0.75 -0.69 0.41 -0.03 -0.14 0.19 0.06 -0.19 -0.14 -0.06 0.25 0.44 0.17 0.28 -0.12 -0.08 0.38 0.13 0.21 -1.07 0.18 0.23 -0.01 0.32 0.16 0.28 0.42 -0.31 0.12 0.06 0.62 0.31 -0.34 -0.21 -0.06 0.3 0.32 0.0
0.26 0.34 0.75 -4.21 -0.01 0.55 0.31 0.42 0.22 0.32 0.31 0.43 -0.91 -0.73 -0.1 -0.17 -0.31 -0.22 -0.2 0.59 0.54 0.33 -0.36 -0.54 -1.4 -0.06 0.2 0.35 -0.42 0.19 -1.14 0.1 0.64 -0.9 0.81 -1.14 0.24 -0.08 0.03 0.37 -0.43 0.92 0.13 -0.9 -0.05 -0.9 0.59 -0.1 -0.39 -0.42 -0.31 -0.38 -0.42 -0.7
1.05 0.12 -1.77 -5.31 -0.46 0.44 0.69 -0.27 -1.71 -0.67 -0.79 -1.71 -2.72 -0.42 -0.12 -0.14 0.29 0.09 -0.54 -1.39 -1.09 -0.89 0.21 0.19 -0.61 -0.5 -0.34 0.61 -0.04 0.3 1.51 0.15 0.73 0.6 0.41 -0.03 -0.01 -0.77 -0.53 0.48 0.42 0.26 0.37 0.03 -0.02 -0.18 0.43 0.53 -0.04 0.31 0.52 -0.23 0.04 -0.38
0.66 0.48 -0.2 -4.59 -0.12 0.14 0.16 -0.11 -0.03 -0.27 -0.21 0.05 -1.09 -0.91 -0.56 -0.7 -0.57 -0.68 -0.33 -0.46 -0.5 -0.17 0.21 0.31 -0.15 -0.28 0.06 0.49 0.48 0.32 0.26 0.05 0.59 0.69 0.59 -0.87 -0.1 -0.17 -0.2 0.27 -0.37 0.4 0.34 -0.29 0.23 -0.34 0.43 0.38 -0.05 0.17 0.4 0.38 -0.15 -0.48
1.27 0.97 0.78 -1.57 0.47 0.69 0.33 0.42 -0.24 -0.44 -0.37 0.18 -1.25 0.2 0.68 0.63 0.49 0.15 0.57 -0.19 0.14 0.71 -0.91 -0.41 -1.88 0.59 -0.42 -0.14 -0.15 -0.49 -1.75 -0.94 0.27 -0.3 0.05 -1.21 0.55 0.79 0.55 -0.23 -0.79 0.29 -0.13 -1.23 -0.07 -1.23 -0.05 -0.36 -0.84 -0.61 -0.26 -0.47 -0.91 -1.18
0.56 -0.57 -3.32 -5.17 -0.08 0.32 0.73 0.72 0.6 0.59 0.62 0.45 -0.17 0.16 -0.63 -0.81 -0.47 -0.76 -0.38 0.31 0.16 1.05 -0.24 -0.73 -1.13 -0.03 0.79 0.35 -0.39 -0.02 -0.7 -1.02 -0.13 -1.44 -0.22 -1.64 0.13 -0.06 0.09 0.97 -0.23 1.15 0.27 -0.81 0.86 -0.37 0.35 0.05 -0.17 -0.26 -0.19 -0.73 -0.59 -0.54
0.68 0.74 -0.2 -4.04 0.64 0.76 0.38 0.54 0.49 0.47 0.46 0.6 -1.18 -0.11 0.36 -0.15 0.37 0.23 0.34 0.56 0.26 0.67 -0.4 -0.22 -0.87 -0.51 -0.88 0.14 -0.12 -0.14 -1.26 -1.03 0.17 -0.12 0.03 -1.6 -0.22 -0.21 -0.64 -0.12 0.12 0.16 0.11 -0.34 -0.32 -0.45 0.27 -0.13 -0.55 -0.38 -0.14 -0.12 -0.11 -0.48
0.28 0.31 0.12 -3.87 -0.1 0.2 -0.3 -0.18 -0.2 -0.59 -0.4 -0.02 -0.72 0.2 -0.45 -0.48 -0.55 -0.52 0.18 0.01 -0.23 0.22 -0.09 -0.04 -0.3 0.05 0.42 0.17 0.02 0.14 -0.4 -0.33 0.44 0.1 0.44 -1.77 0.36 0.01 0.18 0.46 0.4 0.62 0.26 0.04 0.33 0.3 0.5 0.16 -0.04 -0.12 -0.1 -0.14 0.05 -0.06
0.06 0.37 -0.43 -4.12 0.49 0.59 0.27 0.5 0.4 0.11 0.29 0.52 -0.45 0.81 -0.18 -0.33 -0.17 -0.26 0.18 0.29 0.33 0.68 -0.34 -0.67 -0.62 0.02 -0.09 0.12 0.46 -0.0 -0.87 -0.75 -0.06 0.01 -0.16 -0.59 0.04 0.24 0.09 0.15 -0.35 0.05 0.29 -0.44 0.33 -0.38 0.38 0.36 -0.6 -0.53 -0.31 -0.35 -0.45 -0.73
0.52 0.52 0.44 -3.36 0.0 0.07 -0.11 0.09 0.05 0.02 0.04 -0.01 -0.63 -1.49 -0.75 -0.81 -0.79 -0.69 -0.16 -0.04 -0.1 -0.11 0.15 0.31 -0.09 -0.18 -0.01 0.26 0.31 0.2 -0.03 0.27 0.62 0.41 0.54 -0.73 -0.1 0.02 -0.16 0.39 -0.08 0.31 0.37 -0.14 0.19 -0.01 0.26 0.13 -0.49 -0.19 0.18 0.26 -0.17 -0.24
0.46 0.72 0.25 -3.37 -0.13 0.32 -0.23 -0.23 0.05 -0.72 -0.62 0.06 -1.05 -0.24 -0.25 -0.05 -0.16 -0.27 0.38 -0.02 -0.08 -0.08 -0.34 0.11 0.08 -0.05 -0.12 -0.04 -0.01 0.17 0.36 -0.4 0.54 0.26 0.47 -0.72 0.04 0.05 -0.06 0.06 0.68 0.3 0.06 0.28 -0.1 0.14 0.28 0.09 -0.32 -0.12 -0.15 0.03 -0.14 -0.23
-0.15 -0.09 -0.43 -2.74 0.8 0.48 -0.41 -0.25 -0.32 -0.39 -0.31 -0.25 -0.83 -1.06 -0.17 -0.17 -0.31 -0.45 -0.07 -0.67 -0.56 -0.84 -0.13 -0.26 -0.43 0.61 0.61 -0.06 -0.03 0.05 -0.47 -0.24 0.01 -0.11 0.01 -0.15 0.58 0.67 0.81 0.58 0.1 0.62 0.16 -0.21 0.71 0.33 0.16 0.04 0.02 0.02 0.1 0.02 0.14 0.06
-0.06 -0.06 -0.44 -3.4 -0.19 0.44 -0.3 0.48 0.54 0.28 0.3 0.47 -0.71 0.6 -0.58 -0.58 -0.64 -0.79 -0.36 0.11 0.15 -0.02 -0.24 -0.83 -0.44 0.13 0.41 0.1 0.35 0.27 -0.83 -0.45 -0.18 0.22 -0.15 -0.59 0.34 0.38 0.33 0.6 0.04 0.51 0.02 -0.23 0.3 -0.13 0.21 0.15 -0.33 -0.39 -0.23 0.28 0.25 -0.04
0.59 0.34 0.97 -1.42 -0.61 0.3 0.21 0.01 0.25 -0.34 -0.05 0.12 -0.01 1.19 -0.43 -0.62 -0.77 -0.34 1.51 -0.43 -0.19 0.89 -0.9 0.5 -1.26 -0.68 0.15 -0.65 -0.65 -0.21 0.56 -0.46 0.61 0.69 0.73 -1.68 0.07 -0.66 0.0 0.4 -1.35 0.5 -0.21 -0.69 0.46 -0.59 0.15 -0.36 -0.08 -0.67 -1.07 -1.18 -0.95 -0.62
-0.22 -0.66 -2.64 -5.63 -1.0 0.55 0.19 0.85 0.52 0.67 0.64 0.63 -0.27 1.04 -0.43 -0.52 -0.58 -0.73 -0.53 0.79 0.48 1.64 -0.62 -1.17 -1.35 -0.11 0.63 -0.23 -0.9 -0.34 -1.83 -0.68 -0.62 -1.8 -0.63 -0.86 0.12 -0.08 0.08 0.69 -0.2 1.28 -0.06 -1.03 0.8 -0.32 0.29 -0.42 0.08 -0.82 -0.93 -0.53 0.35 0.58
-0.82 -1.02 -2.38 -5.32 0.03 -0.07 -0.29 -0.02 -0.27 -0.01 0.14 -0.03 -1.98 0.35 -0.59 -0.73 -0.74 -0.7 -0.74 -0.66 -0.74 0.1 0.05 -0.18 -0.35 -0.06 0.08 0.46 0.85 0.35 0.22 0.32 0.27 1.07 0.31 -0.51 0.22 0.53 -0.01 0.56 -0.12 0.48 0.7 -0.13 0.67 -0.21 0.74 0.72 -0.1 -0.22 -0.13 0.17 -0.05 -0.32
0.46 0.58 -0.15 -3.05 0.22 0.52 0.57 0.35 0.4 0.32 0.27 0.52 -0.7 0.94 0.13 -0.23 -0.01 -0.17 -0.05 0.22 0.13 0.45 -0.21 -1.16 -0.75 -0.16 -0.19 0.08 0.23 0.11 -0.81 -0.9 -0.42 -0.5 -0.4 -1.19 0.1 0.14 0.03 0.58 -0.22 0.25 0.26 -0.38 0.31 -0.39 0.42 0.23 -0.46 -0.21 -0.09 -0.28 -0.52 -0.79
0.08 0.23 0.25 -4.37 0.53 0.4 -0.28 0.14 0.37 -0.23 -0.15 0.57 -1.28 0.33 -0.33 -0.44 -0.5 -0.66 0.47 0.25 0.09 0.55 -0.32 -0.33 -0.14 -0.11 0.07 0.12 0.29 -0.05 -0.57 -0.6 0.11 -0.04 -0.03 -0.75 0.32 0.23 -0.11 0.29 0.39 0.54 0.21 0.14 0.22 0.14 0.33 0.08 -0.38 -0.5 -0.13 -0.14 -0.23 -0.6
0.57 0.59 0.26 -4.09 -0.4 -0.14 -0.7 0.15 -0.12 0.14 0.44 -0.05 -0.85 -0.29 -0.7 -0.79 -0.76 -0.84 -0.72 -0.11 -0.15 0.09 -0.16 -0.04 -1.36 -0.06 -0.11 0.4 0.26 0.31 -0.41 -0.41 0.47 0.64 0.55 -3.28 0.58 0.16 0.41 0.88 -0.67 0.88 0.52 -0.89 0.86 -1.06 0.65 0.54 0.59 -0.18 -0.62 -0.7 -0.42 -0.12
0.66 0.84 0.61 -4.4 -0.08 0.28 0.39 0.2 0.16 0.05 0.01 0.12 -1.14 -1.12 -0.59 -0.59 -0.46 -0.45 -0.08 -0.12 -0.13 0.1 0.0 -0.17 -0.35 -0.05 -0.17 0.22 0.11 0.12 0.46 -0.11 0.3 0.12 0.25 -0.59 0.2 0.14 0.1 0.11 -0.14 0.04 0.06 -0.14 0.05 -0.22 0.16 0.16 -0.3 -0.04 0.12 0.24 -0.05 -0.21
-0.06 -0.43 -0.88 -4.7 0.05 0.07 -0.19 -0.07 -0.15 -0.12 -0.07 0.02 -1.08 -0.74 -0.44 -0.39 -0.53 -0.48 0.08 -0.12 -0.28 0.03 0.22 -0.04 -0.18 -0.27 0.38 0.69 0.53 0.56 -0.3 -0.12 0.24 0.27 0.26 -1.4 0.15 0.09 -0.04 0.59 -0.13 0.57 0.46 -0.39 0.45 -0.22 0.67 0.5 -0.04 0.0 0.22 0.22 0.14 0.02
-0.29 -0.36 0.11 -2.94 0.06 0.3 -0.56 -0.56 -0.02 -0.42 -0.65 0.13 -1.25 -0.42 -0.68 -0.51 -0.57 -0.62 0.2 -0.53 -0.43 0.64 -0.01 -0.25 0.1 0.23 0.58 -0.12 0.11 0.0 0.14 0.6 0.14 -0.29 0.19 0.13 0.27 0.41 0.4 0.54 0.29 0.56 0.1 0.15 0.57 0.12 0.01 0.08 0.05 0.02 -0.06 -0.1 -0.04 0.09
0.01 0.66 0.44 -3.4 0.31 0.58 0.16 0.71 0.79 0.35 0.54 1.0 -1.07 -0.12 -0.65 -0.54 -0.43 -0.68 0.31 0.34 0.36 0.65 -0.55 -0.29 -0.46 -0.05 -0.36 -0.48 0.47 -0.48 -0.82 -0.37 -0.19 1.22 -0.4 -0.42 -0.03 0.5 -0.06 -0.03 0.0 -0.15 -0.17 -0.07 0.38 -0.17 -0.32 -0.14 -0.86 -0.8 -0.75 -0.67 -0.42 -0.64
-1.0 -0.55 -1.45 -5.48 0.1 0.1 -1.63 0.02 0.27 -0.36 0.27 -0.1 -1.14 -1.24 -0.35 -0.95 -0.62 -0.74 -0.17 0.32 0.02 -1.08 0.06 -0.02 0.49 0.11 0.17 0.46 0.39 0.27 -0.19 -0.25 0.25 0.03 0.17 -0.8 0.33 0.11 0.28 0.64 0.83 0.58 0.43 0.5 0.22 0.53 0.61 0.34 -0.48 -0.6 -0.08 0.23 0.42 0.28
0.13 0.57 1.18 -4.56 0.26 0.26 -1.09 -0.07 0.04 -0.23 -0.36 0.05 -1.56 -1.59 -0.5 -0.6 -0.55 -0.47 -0.53 0.23 -0.43 -1.18 -0.34 0.39 -1.08 0.24 0.79 -0.16 -0.41 0.01 -0.99 0.49 0.83 0.47 0.69 -0.63 0.37 0.22 0.34 0.55 -0.25 0.99 0.02 -0.63 0.46 -0.39 0.22 -0.11 -0.06 -0.3 -0.07 0.0 -0.05 0.06
0.85 0.94 0.62 -4.28 -0.15 0.15 -0.13 -0.05 0.01 -0.09 -0.16 0.15 -0.58 0.55 -0.61 -0.71 -0.63 -0.65 -0.31 -0.24 -0.23 0.03 -0.15 0.12 -0.17 0.04 -0.06 0.05 0.25 -0.16 -0.06 -0.07 0.34 0.39 0.24 -0.1 0.11 0.47 0.04 0.02 0.08 0.01 0.06 0.03 0.32 -0.03 0.08 0.08 -0.37 -0.36 -0.22 -0.2 -0.1 -0.25
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0.33 -0.21 -1.27 -3.94 0.11 0.32 0.16 0.99 0.8 0.96 0.72 1.03 -0.54 0.23 -0.43 -0.44 -0.19 -0.32 -0.2 0.33 0.28 1.03 -0.53 -0.89 -1.22 -0.43 1.12 -0.13 0.06 0.07 -1.29 0.52 -0.37 -0.48 -0.29 -0.57 -0.75 -0.2 -0.63 0.76 -0.57 0.71 -0.0 -0.8 0.9 -0.63 0.08 -0.04 -0.3 -0.8 -0.87 -0.92 -0.84 -0.93
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0.69 0.54 0.25 -3.95 0.37 0.62 0.76 0.23 0.32 -0.03 0.03 0.45 -0.12 -0.06 0.06 -0.02 0.19 0.1 -0.01 0.35 0.31 0.81 -0.47 -1.44 -0.88 0.64 0.45 -0.32 -0.48 -0.31 -1.0 -1.16 -0.83 -1.57 -0.74 -0.6 0.7 0.49 0.7 0.42 -0.18 0.62 -0.32 -0.71 0.33 -0.29 -0.23 -0.41 -0.42 -0.34 -0.33 -0.47 -0.51 -0.48
0.32 0.46 -0.4 -2.19 0.65 0.45 -0.6 -0.29 -0.72 -0.72 -0.45 -0.3 -1.6 -0.29 -0.27 -0.37 -0.12 -0.09 0.6 -0.32 -0.23 -0.33 -0.24 -0.22 -0.92 0.59 -0.06 0.17 0.22 -0.01 -0.48 -1.02 0.39 0.03 0.15 -0.5 0.85 0.9 0.72 0.54 -0.18 0.69 0.43 -0.22 0.45 -0.14 0.35 0.19 -0.22 -0.15 0.11 -0.26 -0.31 -0.6
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0.59 0.46 0.2 -4.95 0.62 0.63 0.61 0.62 0.52 0.53 0.52 0.56 -0.47 0.29 0.08 0.08 0.02 -0.09 0.48 0.21 0.2 0.87 -0.17 -1.06 -0.65 -0.25 -0.06 0.02 -0.06 0.02 -0.92 -0.73 -0.58 -0.7 -0.7 -0.27 -0.36 -0.11 -0.18 0.28 -0.45 0.13 -0.02 -0.52 0.18 -0.44 0.16 0.09 -0.39 -0.15 -0.11 -0.42 -0.77 -0.93
0.29 0.3 -0.0 -4.35 -0.42 0.51 -0.17 0.79 0.84 1.21 1.03 1.0 -2.09 0.32 -0.48 -0.43 -0.53 -0.38 -0.07 -0.04 -0.03 1.4 -1.08 0.01 -1.06 -0.5 -1.0 -0.6 0.51 -0.16 0.78 0.32 0.35 1.14 0.53 -1.72 -0.1 0.31 -0.21 0.65 -0.79 -0.24 -0.3 -0.73 0.07 -1.0 -0.2 0.01 -1.09 -1.06 -1.18 -1.1 -1.83 -1.94
-0.53 -2.48 -4.88 -4.56 0.87 0.76 -1.89 -1.04 0.68 -1.13 -0.79 0.85 -3.1 -0.38 -2.36 -1.45 -1.85 -2.91 -0.85 -0.61 -1.52 -1.35 0.69 0.7 -3.68 -2.07 -0.95 1.62 1.75 0.65 -3.51 -0.84 1.51 1.16 0.94 -1.14 -1.69 0.63 -2.32 -0.29 -2.25 -0.02 2.21 -1.7 0.51 -2.24 1.32 1.87 -1.69 -0.79 0.4 -0.5 -1.41 -1.7
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0.78 -0.07 -2.48 -5.42 0.02 -0.25 -0.73 0.16 -0.52 0.11 0.09 0.06 -1.09 -0.09 -0.48 -0.74 -0.6 -0.68 -0.68 0.03 -0.01 -0.11 0.22 0.21 -2.18 0.16 0.16 0.52 0.71 0.31 -1.8 -0.18 0.61 0.53 0.56 -2.51 0.44 0.55 0.36 0.93 -1.75 1.0 0.64 -1.55 0.49 -1.86 0.81 0.77 0.06 0.34 0.58 0.11 -0.68 -1.49

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.