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Heatmap: Cluster_83 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.21 -0.25 -0.8 -4.58 -1.41 0.23 0.46 -0.3 0.47 -0.44 -0.33 0.22 0.06 -0.62 -0.89 -0.88 -0.65 -0.64 -0.57 -0.66 -0.5 -1.21 0.45 0.66 -0.98 -0.13 0.32 0.78 0.26 0.44 -0.14 0.29 0.81 0.58 0.82 -1.48 0.01 -0.02 -0.01 0.8 -0.65 0.65 0.45 -0.92 0.3 -0.66 0.59 0.56 0.17 0.33 0.57 0.11 -0.42 -0.69
-0.3 -0.06 0.06 -3.04 -0.52 0.0 -0.64 -1.75 -1.09 -0.97 -1.25 -0.56 -1.17 -1.9 -0.98 -0.56 -1.16 -0.79 -0.94 -1.51 -1.44 -0.92 0.29 0.37 0.24 -0.28 1.11 0.51 -0.34 0.39 0.57 0.28 0.68 0.07 0.53 0.78 -0.11 -0.42 -0.25 0.33 0.9 0.81 0.46 0.43 0.21 0.97 0.78 0.21 0.31 0.06 0.06 0.08 0.29 0.29
-0.61 -0.23 0.06 -5.14 -0.93 -0.2 -1.93 -1.2 1.44 -2.08 -1.79 0.82 -0.43 -1.65 -2.47 -4.86 -2.26 -2.42 -0.77 -0.74 -0.56 -3.6 0.71 -0.93 -0.02 -0.89 0.66 1.38 0.23 0.84 -0.71 -1.0 -0.08 -0.95 -0.52 -1.06 0.11 -0.59 -0.17 0.73 1.29 0.51 1.01 0.11 0.39 1.18 0.81 0.79 -0.74 0.33 0.96 0.3 0.44 0.49
0.49 0.36 0.08 -6.12 0.12 0.26 -0.53 -0.33 -0.32 -0.42 -0.24 -0.25 -0.77 0.04 -0.15 -0.22 -0.2 -0.21 0.4 0.23 0.14 -0.87 -0.18 -0.2 -0.51 0.01 -0.1 0.26 0.36 0.2 -0.11 -0.33 0.23 0.25 0.27 -0.87 0.25 0.31 0.13 0.59 -0.24 0.58 0.52 -0.3 0.52 -0.22 0.62 0.55 -0.06 -0.15 0.08 -0.18 -0.37 -0.63
-0.03 0.09 0.05 -3.91 -0.33 0.06 -0.37 -0.11 -0.05 -0.16 -0.13 0.03 -0.94 0.28 -0.32 -0.38 -0.29 -0.37 -0.11 -0.32 -0.31 -0.22 0.24 -0.0 -0.51 0.11 0.39 0.47 0.59 0.21 -0.82 -0.34 0.23 0.33 0.12 -1.04 0.47 0.59 0.21 0.32 -0.54 0.42 0.44 -0.57 0.46 -0.48 0.37 0.45 0.17 0.1 0.21 0.24 0.05 -0.21
-0.46 0.04 1.16 -1.94 -0.47 -0.49 -0.63 -0.58 -1.06 -0.66 -0.62 -0.86 -1.6 -0.82 -0.6 -0.75 -0.6 -0.58 -0.49 -1.1 -0.95 -0.57 0.34 0.55 0.26 0.25 0.22 0.7 0.7 0.56 -0.06 -0.19 0.38 0.46 0.25 -0.51 0.51 0.35 0.34 0.47 -0.25 0.32 0.46 -0.16 0.25 -0.24 0.66 0.5 0.06 0.16 0.35 0.38 -0.02 -0.04
0.14 -0.03 -0.56 -4.23 -0.53 0.16 -1.08 -0.48 0.03 0.0 -0.32 0.1 -0.57 -1.47 -0.36 -0.36 -0.28 -0.48 -0.07 -0.72 -0.45 -0.53 0.34 -0.09 -0.25 0.15 0.45 0.13 0.43 0.25 -0.19 -0.14 0.07 0.06 0.06 -0.12 0.28 0.48 0.32 0.4 0.1 0.29 0.19 -0.02 0.76 -0.09 0.18 0.48 0.17 0.2 0.24 0.42 0.38 0.42
-3.63 -3.14 -1.51 -5.74 -5.57 0.68 -1.21 -1.77 -2.14 -4.38 -2.24 -0.61 -1.89 -0.69 -1.05 0.18 -0.28 -1.97 -2.0 -3.52 -1.32 -0.92 0.17 -0.28 -0.76 0.28 1.35 0.85 0.14 1.1 -0.59 1.03 0.12 -0.69 0.16 -0.61 1.87 0.15 1.24 0.89 0.74 1.12 0.93 0.55 0.36 -0.08 0.72 0.36 -0.41 0.14 -0.06 -0.54 0.59 0.27
0.56 0.6 -0.62 -5.81 -0.36 0.25 0.8 0.38 0.3 -0.28 -0.2 0.03 -0.62 0.03 -0.42 -0.37 -0.25 -0.54 -0.57 -0.33 -0.3 0.23 0.17 0.93 -0.4 -1.06 -0.68 0.15 0.13 -0.05 0.54 -1.15 1.11 0.79 1.3 -1.32 -1.01 -1.19 -0.87 0.06 -0.07 -0.27 0.2 -0.25 0.17 -0.09 -0.06 0.46 0.13 0.37 0.62 -0.57 -0.57 -0.95
-0.49 -0.31 -1.92 -3.01 -2.81 -0.14 -2.35 -0.19 0.49 -0.42 -0.5 0.8 -0.21 1.63 -1.35 -1.25 -1.43 -1.38 -1.63 0.54 0.22 0.01 0.18 0.28 -0.85 0.16 -0.15 0.57 0.68 0.44 -0.92 0.34 0.37 0.85 0.61 -1.91 -0.07 0.01 0.14 0.09 -1.38 0.16 0.8 -1.35 0.73 -1.26 0.95 0.99 0.1 0.22 0.23 -0.02 -0.28 -0.22
0.52 0.51 1.17 -2.45 -0.67 0.21 0.9 -0.35 -1.2 -1.05 -0.88 -2.37 -2.83 1.05 0.45 0.49 0.19 0.26 -0.25 -0.79 -0.55 0.02 -0.07 -0.17 -0.85 0.17 -0.61 0.14 0.1 -0.0 0.13 -0.01 0.44 0.02 0.2 -0.84 0.23 0.17 0.28 0.24 -0.35 0.32 0.09 -0.41 0.54 -0.92 0.29 0.35 0.04 -0.0 0.08 -0.25 -0.24 -0.19
0.79 0.48 0.17 -0.43 -3.39 -1.29 0.22 -2.29 - -2.01 -3.62 - -4.36 0.72 -0.09 -0.38 0.03 0.49 0.53 -1.7 -1.53 -3.3 0.84 -0.52 -0.77 0.34 -1.67 0.85 0.36 0.3 -0.25 -1.22 1.42 0.61 0.47 -1.58 0.08 0.15 0.02 -0.21 0.12 -0.16 0.89 0.27 0.73 -1.64 0.22 1.34 0.66 0.62 0.68 0.39 -0.01 -0.26
0.14 0.42 0.05 -4.1 0.03 0.19 -0.28 -0.19 0.05 -0.5 -0.42 -0.03 -0.85 0.51 -0.58 -0.64 -0.37 -0.77 0.14 -0.31 -0.18 -0.83 -0.02 0.34 -1.07 -0.22 0.29 0.33 0.44 0.24 0.36 -0.24 0.73 0.72 0.64 -1.07 0.01 0.22 -0.07 0.63 -0.65 0.56 0.53 -0.77 0.48 -0.56 0.47 0.55 0.17 -0.07 -0.1 -0.35 -0.34 -0.49
-1.19 -1.22 -0.08 -3.22 -1.65 0.9 -0.66 -1.1 0.82 -0.95 -0.62 0.74 0.44 -0.79 -0.98 -0.47 -0.62 -0.42 0.55 0.14 0.11 -1.13 1.02 -1.96 -0.41 -0.55 1.75 1.05 -0.18 0.52 -1.61 -0.56 -1.37 -2.51 -1.43 -0.47 -1.12 -0.75 -1.11 0.48 -0.41 0.69 0.58 -0.28 0.8 -0.5 0.46 0.64 1.24 0.84 0.68 -0.6 -0.18 0.16
-2.51 -3.33 - -2.97 -3.53 0.64 -0.19 -1.32 0.11 -1.26 -1.62 -0.24 -0.54 -2.25 -4.03 -2.02 -1.15 -3.42 -2.79 -2.11 -1.53 -0.84 1.85 0.22 -0.31 0.14 1.57 2.16 -0.2 0.04 -2.37 1.07 0.77 -0.64 -0.0 -1.54 -0.13 -0.15 0.1 0.19 -1.15 1.15 0.82 -0.48 0.74 -0.33 0.88 0.15 0.03 -0.0 1.65 0.34 -0.22 0.12
-1.42 -2.27 - -2.25 -7.54 0.87 -1.06 -1.65 -1.7 -0.85 -0.22 -2.76 -3.27 -3.19 0.81 -0.16 0.56 0.03 - -4.08 - -3.65 0.88 -0.6 -4.23 1.03 0.09 0.26 -0.37 1.39 -3.83 -1.49 -2.0 -1.55 -0.3 -2.2 1.08 0.93 1.82 1.6 -4.94 0.28 0.56 -4.22 0.6 -2.64 0.98 0.56 1.07 1.6 1.26 1.0 0.49 0.59
0.09 -1.9 - -0.18 - 1.0 -1.74 -1.35 -1.41 -0.56 -1.1 -0.47 - -1.75 -0.23 -1.58 -1.53 -0.28 -1.85 - - - 0.94 -2.46 -3.28 0.35 -0.83 1.72 -0.35 -0.23 -0.54 -0.53 0.1 -0.97 -0.5 -2.49 0.73 -0.12 1.74 1.03 -1.58 0.67 0.95 -0.38 1.09 -0.46 0.9 1.28 0.18 1.1 1.96 0.83 0.05 0.5
0.44 -0.07 -0.89 -1.31 -0.7 0.31 -0.16 0.31 0.06 0.74 0.67 0.11 -1.84 0.71 -0.45 -0.62 -0.29 -0.59 -0.09 -0.08 -0.22 0.73 -0.31 0.53 -1.36 -0.98 -0.64 0.41 0.51 -0.17 -0.12 0.49 1.23 0.88 0.82 -2.26 -0.27 -0.76 -0.68 -0.45 -0.14 0.7 0.6 -0.5 0.02 -1.05 0.91 0.62 -0.85 -0.72 -0.83 -0.58 -0.52 -0.49
0.84 0.82 -0.98 -0.64 -1.36 -0.87 -0.23 -0.74 - -0.95 -2.34 -1.44 -2.91 0.19 -1.0 -0.44 -0.41 -0.61 -0.82 -2.14 -2.56 -1.33 -0.02 -0.35 -0.87 0.31 0.46 0.25 0.59 -0.23 1.31 0.58 0.98 0.27 0.66 0.88 0.49 0.31 0.27 0.91 -0.29 0.35 0.34 0.36 0.94 -0.18 0.11 0.9 -0.38 -0.15 -0.01 0.26 -0.27 -0.5
-0.19 -0.5 -1.79 -2.45 -0.91 -0.17 -0.07 -0.45 -0.7 -0.06 -0.71 -0.54 -2.77 0.62 0.35 0.33 0.42 -0.04 0.05 -1.19 -1.43 -1.01 0.64 0.53 -0.88 0.05 0.13 0.16 0.18 0.45 -0.29 0.31 0.93 0.95 0.89 -1.38 -0.04 -0.0 0.11 1.14 -0.85 0.3 0.26 -0.89 0.71 -1.32 0.55 0.72 0.08 0.19 0.03 -0.06 -0.24 -0.45
-0.12 0.36 0.82 -3.95 -0.32 0.08 -0.15 -0.73 -0.78 -0.95 -0.85 -0.36 -0.92 -0.21 -0.45 -1.08 -0.79 -1.35 -0.13 -0.62 -0.49 -1.25 0.21 0.64 -0.01 -0.27 0.49 0.42 0.78 0.14 0.07 0.17 0.64 0.85 0.66 -0.75 0.11 0.09 -0.28 0.6 0.03 0.45 0.5 -0.31 0.71 -0.19 0.38 0.32 0.5 0.05 0.11 -0.16 -0.39 -0.42
-0.45 -0.06 -0.08 -4.39 -0.53 -0.27 -0.74 -0.91 -1.08 -0.92 -1.08 -0.91 -1.63 -1.35 -0.82 -0.71 -0.85 -0.81 -0.56 -0.95 -1.03 -1.52 0.39 0.37 -0.19 0.39 0.73 0.67 0.77 0.46 0.18 0.15 0.55 0.51 0.53 -0.48 0.61 0.66 0.43 0.68 -0.24 0.66 0.6 -0.48 0.74 -0.29 0.67 0.64 0.25 0.29 0.45 0.29 -0.06 -0.21
0.34 0.33 -0.2 -3.9 0.13 0.24 0.25 0.13 0.0 -0.2 -0.34 -0.02 -0.69 -0.03 -0.37 -0.14 -0.18 -0.26 0.52 -0.6 -0.09 0.63 -0.38 0.57 -0.72 -0.33 -0.06 -0.05 0.43 -0.13 0.04 0.0 0.87 1.2 1.09 -0.63 -0.14 0.29 -0.22 0.22 -0.45 0.21 0.05 -0.57 0.3 -0.55 0.26 0.14 -0.37 -0.5 -0.41 -0.69 -0.66 -0.91
0.66 0.09 -1.39 -6.12 -0.65 -0.02 0.01 -0.48 -0.13 -0.03 -0.24 0.0 -1.01 0.79 0.0 -0.26 -0.08 -0.37 0.63 -0.47 -0.43 0.06 -0.01 0.25 -0.34 -1.08 -0.06 0.6 0.72 0.31 -0.56 -0.23 0.7 0.52 0.58 -1.83 -0.5 -0.17 -0.6 0.29 -0.08 0.56 0.62 -0.19 0.2 -0.19 0.85 0.5 -0.03 -0.34 -0.12 -0.08 -0.18 -0.36
-0.75 -1.27 -5.38 -4.68 -3.78 0.86 -0.08 -0.03 0.0 0.09 -0.16 0.27 1.49 0.96 0.04 -0.24 -0.05 -0.28 1.07 0.3 0.77 1.64 -0.04 -0.27 -0.61 -1.33 -0.6 0.56 0.4 0.45 -1.66 -0.62 0.28 0.19 0.25 -2.74 -0.23 -0.61 -0.63 -0.24 -1.05 0.23 0.39 -0.69 -0.17 -1.73 0.92 0.37 -0.2 -0.29 -0.18 -0.31 -0.19 -0.32
0.13 0.36 -0.24 -3.8 -0.37 0.3 -0.05 0.35 -0.44 -0.23 0.05 0.14 -1.4 -0.08 -0.47 -0.47 -0.46 -0.6 0.02 -0.52 -0.78 -0.21 0.1 0.27 -1.17 0.01 -0.04 0.71 0.72 0.4 -0.19 0.25 0.65 0.99 0.47 -0.33 0.2 0.15 -0.12 0.31 -0.97 0.63 0.55 -0.72 0.37 -1.4 0.89 0.77 -0.23 -0.19 0.03 -0.32 -0.9 -1.25
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-1.99 -1.46 - -4.22 -2.58 -0.64 -1.64 -0.87 -0.3 -1.05 -0.94 -0.48 -1.15 -0.35 -0.86 -0.74 -0.65 -0.72 0.6 0.03 0.63 -2.08 0.41 0.43 -2.09 0.31 0.51 0.89 0.68 0.7 -2.4 -0.49 0.9 0.35 0.66 -2.97 1.22 0.35 0.86 1.02 -1.63 1.1 1.11 -1.3 1.07 -2.29 1.4 1.11 0.09 -0.04 0.07 -0.23 -0.57 -0.82
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1.1 -0.62 - -0.43 -3.92 -1.65 -0.17 - - - - - - -0.41 0.33 -0.81 -1.52 -0.08 - -1.45 -0.25 - 1.11 -0.07 -1.21 0.44 - 0.84 0.28 1.14 -3.24 -0.08 1.48 0.47 -0.52 -2.23 -0.19 -0.86 0.77 -0.33 -1.8 0.57 0.17 -0.11 1.68 -3.35 -1.46 1.5 1.61 1.18 1.49 1.51 0.65 0.07
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-0.35 -0.45 0.62 -4.33 -1.11 -0.08 -0.25 0.09 -0.19 0.16 0.03 0.22 -0.69 -1.57 -0.97 -1.22 -1.02 -1.38 -0.51 -1.19 -0.68 -0.91 0.55 0.05 0.55 0.15 0.03 0.27 0.62 0.15 0.38 -1.04 0.06 0.38 0.06 -0.2 0.3 0.32 0.27 0.38 -0.05 -0.14 0.24 0.24 0.6 -0.01 0.16 0.62 -0.26 0.31 0.63 0.84 0.54 0.11
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.