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Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.36 -0.52 0.11 -2.46 0.0 0.42 0.08 -0.29 -0.13 -0.66 -0.18 -0.12 -0.51 -0.52 -0.99 -1.2 -0.97 -0.91 -0.24 -0.95 -0.72 0.06 -0.0 -0.79 0.32 0.23 0.18 -0.18 0.41 0.12 0.67 -0.22 -0.64 0.28 -0.45 0.92 -0.03 0.51 -0.11 0.36 0.71 0.05 0.11 0.75 0.49 0.93 -0.04 0.16 -0.44 -0.3 -0.33 0.3 0.32 0.24
0.23 0.37 0.94 -3.72 -0.58 -0.04 0.06 -0.66 -0.48 -1.0 -0.44 -0.65 -1.56 -1.53 -0.11 -0.08 -0.61 -0.65 -0.46 -0.29 -0.47 -0.26 0.15 -0.6 0.2 0.27 0.43 0.29 0.21 0.32 -0.25 -0.7 -0.16 -0.32 -0.34 0.19 0.47 0.35 0.4 0.29 0.49 0.38 0.32 0.45 0.27 0.58 0.4 0.32 -0.04 0.03 0.02 0.51 0.26 0.11
-3.22 -3.11 -1.91 -2.19 0.44 1.8 0.66 -3.53 -0.66 -3.21 -2.62 -1.66 -0.13 -0.96 0.24 -0.27 -0.21 0.11 -0.5 -0.86 -0.46 -1.82 0.12 -1.75 1.82 -2.3 -2.9 -1.92 -3.01 -1.49 2.4 1.45 -1.78 -2.0 -1.55 0.66 -2.48 -3.51 -2.49 -2.88 1.98 -2.87 -2.9 1.69 -4.11 1.81 -2.4 -3.26 -0.93 -1.62 -2.06 1.39 1.45 1.66
-0.35 0.12 0.03 -5.7 -0.2 0.29 0.24 -0.0 0.42 -0.09 0.21 0.2 -1.07 -0.34 -0.41 -0.39 -0.3 -0.38 -0.06 -0.15 -0.4 0.67 0.11 -0.59 0.59 0.19 0.26 0.1 -0.02 -0.02 -0.33 -0.89 -0.48 -0.45 -0.59 -0.05 0.2 0.28 0.31 0.31 0.54 0.14 -0.17 0.64 0.09 0.81 -0.1 -0.12 -0.33 -0.04 0.2 0.03 0.16 0.08
0.16 -0.05 -0.17 -6.4 -0.97 -0.25 -0.11 -0.62 -0.31 -0.73 -0.9 -0.57 -1.61 -0.92 -0.7 -0.72 -0.37 -0.78 -0.58 -0.49 -0.5 -0.34 0.41 0.69 0.81 -0.1 0.11 0.39 0.61 0.28 0.47 0.38 0.55 0.61 0.63 -0.53 -0.06 0.15 -0.19 0.1 0.37 0.08 0.18 0.49 0.24 0.27 0.19 0.36 0.15 0.1 0.29 0.18 0.21 0.09
-0.8 -1.97 -8.06 -6.93 -0.32 1.11 0.89 -1.16 0.76 -0.16 0.05 0.29 -0.62 -0.42 -1.93 -2.7 -1.88 -2.15 -0.72 -2.16 -2.03 -0.26 0.48 -0.03 1.5 -0.51 0.48 -0.32 -0.73 -0.44 0.83 0.79 -0.74 -0.85 -0.66 1.57 -0.85 -1.01 -0.91 0.09 0.69 -0.26 -1.25 1.34 -0.23 0.68 -1.13 -1.42 -0.21 0.01 0.25 0.82 1.34 1.28
-0.01 0.28 0.7 -3.39 0.52 0.37 0.34 -0.01 0.58 0.43 0.54 0.34 -0.68 -0.59 -1.03 -0.89 -0.93 -1.03 -0.29 -0.58 -0.81 0.32 -0.23 -1.39 0.75 -0.03 0.18 -0.3 0.09 -0.08 0.38 -0.99 -1.12 -1.15 -1.41 0.75 0.15 0.21 0.09 0.41 0.8 -0.03 -0.3 0.6 0.35 1.22 -0.22 -0.06 -0.58 -0.63 -0.36 -0.04 0.05 0.02
-1.89 -1.91 0.31 -6.59 -0.1 -0.71 -0.13 -0.79 1.06 -0.08 -0.13 0.97 -1.07 -0.02 -2.31 -2.0 -2.23 -2.34 -0.81 -2.06 -1.79 0.57 -0.61 -1.57 -0.66 0.63 0.86 -1.46 1.52 -1.32 -1.19 1.25 -3.26 0.86 -2.29 2.37 -0.19 1.8 0.1 -0.26 0.13 -0.53 -0.24 0.2 1.29 0.45 -1.35 0.29 -2.97 -2.59 -1.83 0.02 0.46 0.25
0.57 0.1 -0.13 -4.39 -0.44 0.27 0.62 0.04 0.32 -0.46 -0.19 -0.03 -0.56 -0.67 -0.65 -0.61 -0.72 -0.81 -0.62 -0.08 0.14 -0.03 -0.24 -0.34 0.42 -0.03 0.07 0.07 0.12 -0.1 0.45 -0.09 0.07 0.32 -0.06 -0.05 -0.08 0.11 0.02 0.29 0.6 0.22 0.05 0.74 0.51 0.57 0.03 0.14 -0.38 -0.29 -0.18 0.1 0.02 -0.19
2.55 2.02 1.65 0.5 -2.97 0.6 0.62 0.54 0.88 0.46 0.54 -0.1 -1.86 -0.43 -1.68 -0.4 -1.06 -1.19 -0.95 0.86 0.77 -0.37 -1.64 -1.26 -0.6 -0.64 -0.27 -1.62 -2.04 -2.03 -0.76 1.01 -1.38 -1.19 -1.32 -0.31 0.39 0.16 -0.06 -0.78 1.03 -0.48 -2.21 0.72 -1.33 0.47 -1.86 -1.68 -2.37 -1.58 -1.72 -1.45 -1.13 -0.95
-0.35 -0.21 0.65 -3.29 -1.35 -0.14 -0.51 -1.18 -0.61 -1.46 -1.19 -0.4 -0.57 -1.25 -1.05 -1.0 -1.0 -1.08 -1.17 -0.88 -0.6 -1.26 0.27 -0.71 0.47 -0.15 1.05 0.18 0.07 0.26 0.67 -0.04 -0.41 0.02 -0.47 -0.37 -0.04 -0.02 0.06 1.02 0.42 0.85 0.3 0.48 1.04 0.73 0.34 0.28 0.12 -0.22 -0.19 0.92 0.94 0.94
2.1 1.63 -0.98 -5.15 -5.79 0.2 -0.38 0.45 0.05 0.11 0.41 -0.3 -2.22 -0.48 -0.68 -0.74 -0.75 -0.69 -1.5 1.2 0.68 -1.03 -0.68 -1.4 -0.51 0.43 -0.76 0.15 -0.78 -0.34 -0.45 -1.72 -0.16 -1.05 -0.96 -0.33 1.02 0.19 0.37 0.01 1.56 0.21 0.14 0.43 -0.3 0.63 0.52 -0.2 -0.83 -0.87 -1.03 -0.61 -0.33 -0.27
0.23 -0.07 -0.3 -3.43 -0.4 0.2 0.18 -0.64 -0.81 -0.96 -1.06 -0.29 -0.84 -1.31 -0.58 -0.54 -0.92 -0.71 -0.36 -0.27 -0.24 -0.44 -0.05 -0.96 0.61 0.68 0.11 -0.06 0.16 -0.11 0.43 -0.81 -0.44 -0.61 -0.54 0.67 0.48 0.74 0.65 0.1 0.93 0.25 0.1 0.71 0.39 1.07 0.11 0.24 -0.7 -0.36 -0.04 0.66 0.72 0.3
-0.41 0.15 1.24 -6.12 -0.39 -0.67 -1.12 -1.56 -1.64 -1.63 -1.49 -1.3 -1.38 -2.38 -1.32 -1.46 -1.42 -1.35 -1.0 -0.85 -0.82 -1.14 0.22 -0.09 0.41 0.61 0.66 0.28 0.37 0.27 0.79 0.02 -0.29 -0.2 -0.27 0.12 0.66 0.65 0.6 0.64 0.42 0.64 0.43 0.43 0.68 0.46 0.44 0.42 0.25 0.26 0.31 0.48 0.49 0.57
-0.56 -1.42 - 0.04 -1.72 1.25 0.54 -2.12 -0.84 -0.62 -2.84 -1.21 -2.01 -0.83 -1.75 -0.47 -0.61 -0.63 -0.27 -2.2 -1.75 -1.1 0.33 -1.8 1.41 -0.82 -0.99 -0.22 -0.01 -0.33 1.21 0.44 -1.26 -1.51 -1.41 1.66 -0.35 -0.9 -0.3 -1.85 1.07 -0.63 -0.66 0.92 -1.09 0.98 -0.32 -0.65 -0.79 -0.08 -0.19 1.75 2.13 1.69
1.27 0.79 -3.0 0.09 -8.24 0.18 -0.71 0.21 0.84 -0.18 0.72 0.17 0.33 1.06 -0.82 -1.29 -1.24 -1.45 -0.11 -0.42 0.04 - -0.32 -2.82 1.56 -2.22 -1.13 -0.43 0.27 -0.06 1.13 -1.51 -1.99 -1.23 -1.5 -0.78 -2.64 -1.83 -2.85 1.05 1.06 -1.26 -0.36 1.64 -0.02 1.1 -0.65 -0.23 -1.44 -0.33 -1.02 0.31 1.15 1.06
0.02 0.34 0.53 -3.6 -0.54 0.3 0.02 -0.02 0.07 -0.11 -0.15 0.18 -0.6 -0.17 -0.68 -0.62 -0.59 -0.43 -0.48 -0.16 -0.01 -0.56 0.21 -1.04 0.96 -0.08 0.02 -0.07 0.15 0.03 -0.45 -0.43 -0.59 -0.22 -0.76 0.54 -0.29 0.16 -0.28 -0.13 0.91 -0.21 -0.14 0.82 0.06 1.06 -0.08 0.02 -0.2 0.04 0.03 0.59 0.33 0.3
-0.64 -0.32 0.74 -4.63 -0.58 -0.24 -0.76 -1.19 -1.09 -1.0 -0.75 -1.24 -1.7 -1.63 -1.5 -1.47 -1.26 -1.4 -1.16 -1.17 -1.17 -0.66 0.46 -0.19 0.91 -0.48 0.46 0.67 0.33 0.57 0.28 -0.5 -0.27 -0.18 0.0 0.26 -0.16 -0.11 -0.18 0.75 1.06 0.53 0.37 1.01 0.34 1.03 0.58 0.45 0.25 0.2 0.49 0.26 0.78 0.83
1.64 1.63 -0.9 -5.29 -8.71 0.34 -0.02 -0.23 0.05 -0.77 -0.48 -0.36 -1.71 -1.12 -0.6 -0.58 -0.58 -0.45 -1.39 0.13 -0.04 -2.19 0.09 -0.44 -0.01 -0.66 -0.69 0.46 0.2 -0.27 -0.56 -1.82 0.06 -0.29 -0.31 -0.31 -0.02 -0.76 -0.42 0.29 1.45 0.52 0.5 0.51 0.22 0.63 0.64 0.55 -0.64 -0.1 0.13 0.22 0.46 0.58
1.53 0.46 - -4.99 -4.53 1.12 -1.05 -1.35 -1.22 -1.2 -0.96 -0.68 -1.74 -3.28 -1.31 -2.98 -0.83 -2.65 - -2.23 -1.07 -1.84 0.48 -0.9 0.93 -0.36 -1.94 0.65 -0.78 -0.38 0.8 -0.43 -0.16 -1.22 -0.65 2.09 -0.57 -0.74 -0.37 -1.09 1.89 -1.11 -0.14 1.66 -1.3 2.0 0.02 -0.47 -0.46 -0.27 -0.19 0.82 0.37 1.63
-0.27 0.26 0.51 -3.42 -0.13 0.06 0.2 0.05 -0.33 -0.28 -0.12 -0.22 -0.4 -0.15 -0.88 -0.77 -0.82 -0.9 -0.78 -0.46 -0.21 0.62 -0.04 -0.74 0.62 0.16 0.39 0.01 -0.19 0.03 0.2 -1.09 -0.57 -0.8 -0.67 0.72 0.4 0.18 0.18 0.3 0.92 0.3 -0.04 0.61 0.23 1.01 -0.01 -0.08 0.02 -0.1 -0.11 -0.1 0.19 0.3
-0.06 -0.19 1.25 -3.22 -0.93 0.22 -0.17 -1.22 -0.27 -1.16 -1.17 -0.3 -0.63 -0.09 -0.7 -0.77 -0.46 -0.57 -1.07 -0.55 -0.43 -1.13 -0.08 -1.05 0.92 0.51 -0.11 -0.44 -0.29 -0.51 0.27 -0.13 -0.62 -0.5 -0.71 0.75 0.46 0.55 0.58 -0.43 1.32 -0.37 -0.21 0.75 -0.12 1.22 -0.29 -0.12 -0.53 -0.14 -0.1 1.0 0.94 0.64
-0.03 -0.03 -0.94 -6.99 -0.75 -0.12 0.15 -0.52 0.18 -0.56 -0.41 0.26 -0.22 -0.31 -0.49 -0.38 -0.39 -0.38 -0.33 -0.25 -0.11 -0.35 0.03 0.07 0.3 0.17 -0.09 -0.27 0.09 -0.29 0.38 -0.16 0.13 0.23 0.13 1.21 -0.01 0.51 0.09 -0.2 0.87 -0.27 -0.16 0.66 0.3 0.89 -0.37 0.02 -0.23 -0.21 -0.2 0.09 0.23 0.32
-0.07 0.29 0.22 -5.58 -1.1 -0.48 -1.1 -0.39 -0.5 -0.37 -0.3 -0.49 -0.79 -0.9 -0.8 -0.97 -0.82 -0.72 -0.32 -0.54 -0.64 -0.98 0.27 -0.07 0.37 0.03 0.31 0.33 0.45 0.26 0.31 0.05 0.18 0.22 0.2 0.09 0.08 0.34 0.06 0.59 0.4 0.48 0.53 0.34 0.53 0.47 0.59 0.67 0.22 0.15 0.24 0.25 0.09 -0.03
0.48 1.34 2.13 -1.8 -0.73 0.17 0.06 0.38 0.68 0.28 0.81 0.27 -0.37 0.31 -1.04 -0.79 -0.9 -0.59 -1.37 -1.23 -0.85 -0.62 -0.09 -0.19 -0.37 -0.1 0.1 -0.2 -0.81 -0.21 1.23 0.64 0.14 -1.19 0.08 -1.43 -0.29 -0.2 0.03 0.08 -0.03 0.29 -0.28 -0.64 0.27 -0.3 -0.21 -0.41 0.13 0.1 -0.15 -1.14 -1.28 -1.12
0.81 0.77 0.37 -4.29 -0.53 -0.04 0.16 -0.08 -0.4 -0.74 -0.46 0.17 -0.84 -0.4 -0.97 -0.77 -0.56 -0.98 -0.35 -0.36 -0.26 -0.14 0.15 -0.58 0.37 -0.05 0.32 0.23 0.05 0.17 -0.99 -1.38 -0.66 -0.79 -0.73 0.21 0.19 -0.11 -0.07 0.14 0.89 0.35 -0.1 0.75 0.06 1.12 0.16 -0.19 -0.25 -0.13 0.2 0.66 0.81 0.68
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0.87 0.67 0.73 -4.16 0.01 0.21 0.41 0.19 0.38 -0.26 0.2 0.38 -1.1 -0.64 -1.05 -1.11 -1.13 -1.36 -0.79 -0.17 -0.34 -0.11 -0.38 -0.4 0.52 -0.05 -0.07 0.06 -0.15 -0.08 0.7 -1.0 0.17 0.04 0.04 0.91 -0.16 0.17 0.02 0.26 0.68 -0.0 -0.14 0.52 0.15 0.7 -0.05 -0.05 -0.4 -0.39 -0.25 -0.23 -0.15 -0.58
-0.18 0.45 0.62 -4.78 -0.26 0.04 -0.14 -0.38 -0.49 -0.67 -0.64 -0.3 -1.12 -0.95 -0.7 -0.9 -0.7 -0.77 -0.05 -0.17 -0.27 -0.18 0.24 -0.25 0.23 -0.05 0.28 0.32 0.49 0.21 0.03 -0.11 -0.0 0.24 -0.09 -0.19 0.13 0.23 0.01 0.39 0.47 0.41 0.38 0.35 0.4 0.44 0.44 0.45 -0.11 -0.02 0.07 0.27 0.31 0.21
-0.19 0.5 0.69 -2.05 -0.92 0.12 -0.44 -0.16 -1.33 -0.94 -0.28 -0.8 -0.82 -1.51 -0.97 -1.31 -1.19 -0.91 -0.6 -0.25 -0.34 -0.63 0.19 -1.51 0.99 0.4 0.58 0.27 -0.29 0.14 -0.64 -1.65 -0.82 -1.51 -1.15 -0.54 0.35 0.0 0.49 0.62 1.48 0.55 -0.01 1.02 0.26 1.42 0.16 -0.06 -0.27 -0.51 -0.17 0.77 1.09 0.54
0.35 1.04 0.93 -3.79 -0.39 -0.03 0.22 -0.06 0.49 0.12 0.22 -0.1 -0.42 0.1 -0.76 -0.52 -0.72 -0.94 -0.61 -0.16 -0.18 -0.34 -0.09 -0.15 -0.45 0.1 -0.32 -0.29 -0.01 -0.13 1.11 -0.13 -0.06 0.16 0.02 0.08 0.12 0.19 0.1 -0.04 0.18 -0.14 -0.1 -0.12 0.3 0.2 -0.2 -0.06 -0.5 -0.16 -0.14 0.18 0.21 0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.