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Heatmap: Cluster_160 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
1.43 1.16 1.04 -1.05 -0.52 0.55 0.79 0.44 0.42 0.21 0.29 0.17 -0.28 -0.06 -0.16 -0.13 -0.16 -0.08 -0.16 0.53 0.51 0.4 -0.3 -1.2 -0.41 0.32 -0.07 -0.29 -0.48 -0.3 -1.06 -1.06 -0.97 -1.68 -1.02 0.01 0.29 0.37 0.23 0.17 -0.2 0.16 -0.4 -0.2 -0.11 -0.32 -0.38 -0.39 -0.49 -0.29 -0.18 -0.5 -0.58 -0.71
0.56 0.66 0.59 -4.18 -1.7 0.85 0.76 0.67 0.92 0.65 0.41 0.87 -0.4 0.72 0.45 0.24 0.43 0.29 0.22 0.09 0.17 0.95 0.23 -1.2 -0.94 -0.34 -0.49 0.11 0.23 -0.12 -1.68 -0.84 -1.11 -1.02 -1.27 -0.35 -0.43 -0.19 -0.36 -0.26 -0.95 -0.59 -0.16 -0.96 -0.22 -1.15 -0.1 -0.06 -0.46 -0.15 0.03 0.2 0.01 -0.13
0.94 1.25 1.38 -2.47 -0.37 0.71 1.1 1.34 1.01 0.86 1.23 0.94 -0.3 0.13 -0.4 -0.3 -0.3 -0.29 -0.07 0.48 0.13 1.09 -0.65 -1.17 -0.84 -0.3 -0.63 -0.43 0.05 -0.45 -1.09 -1.89 -0.78 -0.93 -0.89 -1.17 -0.48 -0.02 -0.32 -0.15 -0.95 -0.29 -0.44 -0.68 0.1 -0.96 -0.5 -0.28 -0.76 -0.65 -0.59 -1.06 -0.99 -0.95
0.72 0.94 0.68 -3.92 -0.35 0.56 0.65 0.78 0.68 0.93 0.67 1.1 -0.37 0.44 0.29 0.28 0.29 0.31 0.46 0.76 0.71 0.65 -0.33 -0.77 -0.56 -0.96 -0.76 -0.19 -0.13 -0.08 -1.04 -1.22 -0.42 -0.7 -0.25 -1.74 -0.7 -0.96 -0.61 -0.02 -0.67 -0.3 -0.31 -0.41 -0.35 -0.82 -0.2 -0.17 -0.49 -0.33 -0.21 -0.21 -0.64 -0.7
0.43 0.45 0.7 -5.7 -0.91 0.72 1.03 0.67 0.72 0.45 0.43 0.87 -0.56 0.98 0.0 -0.04 0.22 0.08 0.48 0.21 0.36 1.27 -0.24 -0.46 -1.16 -0.07 -0.62 -0.14 0.29 -0.28 -1.12 -0.69 -0.3 -0.03 -0.22 -1.41 -0.17 0.21 -0.04 -0.25 -0.98 -0.31 -0.18 -0.95 0.16 -1.43 -0.3 0.04 -0.24 -0.24 -0.42 -0.91 -1.01 -1.05
0.51 1.0 0.85 -5.66 -0.42 0.6 0.84 0.53 0.96 0.29 0.5 0.63 -0.31 0.06 0.01 0.01 -0.17 -0.18 0.28 0.6 0.58 0.34 -0.21 -0.21 -0.46 -0.39 -0.55 -0.47 0.05 -0.53 -1.12 -0.29 -0.19 0.41 -0.17 -0.58 -0.55 -0.2 -0.45 -0.28 -0.43 -0.41 -0.3 -0.42 0.1 -0.53 -0.42 -0.05 -0.66 -0.36 -0.29 -0.1 -0.08 -0.21
1.53 0.96 0.12 -1.3 -0.99 0.8 1.19 0.58 0.8 0.02 0.16 0.52 0.53 0.32 0.29 -0.02 0.04 0.2 0.28 0.47 0.36 -0.39 -0.11 -0.49 -1.04 0.17 -0.49 0.17 0.01 0.02 -1.92 -1.11 -0.51 -0.63 -0.5 -3.09 0.07 0.19 0.28 0.1 -0.9 0.16 -0.12 -0.92 -0.03 -1.36 -0.03 -0.12 -0.84 -0.77 -0.35 -0.34 -0.59 -1.39
1.29 0.68 -0.29 -4.55 -0.65 0.61 0.96 0.42 0.31 0.03 0.05 0.14 -1.23 -1.01 0.28 0.11 0.39 0.27 0.25 -0.08 -0.32 0.63 0.11 -0.69 -0.5 0.1 0.12 0.26 0.46 0.12 -1.31 -0.83 -0.74 -0.43 -0.77 -1.14 0.11 0.12 0.19 0.37 -0.18 0.12 0.31 -0.55 0.38 -0.47 0.07 0.51 -0.62 -0.47 -0.41 -0.44 -0.24 -0.49
1.19 1.09 -0.28 -3.61 -3.14 0.59 1.01 0.66 0.07 0.35 0.51 0.3 -0.25 -0.16 -0.04 -0.09 0.19 -0.09 -0.05 0.01 -0.35 0.64 -0.01 -0.68 -0.11 -0.08 0.25 -0.05 0.08 -0.15 -0.2 -1.43 -0.4 -0.83 -0.31 -0.88 -0.27 -0.16 -0.04 0.18 -0.23 0.18 -0.11 -0.03 0.44 -0.35 -0.17 0.07 -0.21 -0.15 0.02 -0.36 -0.22 -0.46
0.79 0.84 0.72 -4.35 -1.12 0.26 0.56 0.05 0.44 0.04 0.22 0.08 -0.77 -0.26 -0.31 -0.23 -0.41 -0.29 -0.05 -0.12 -0.14 0.09 -0.1 -0.12 0.22 -0.07 -0.28 -0.07 0.28 0.01 -0.38 -0.89 -0.12 0.08 -0.09 0.21 -0.09 0.28 -0.02 -0.12 0.46 -0.26 -0.12 0.37 -0.08 0.35 -0.12 0.07 -0.27 -0.15 -0.07 -0.05 0.03 -0.27
0.53 0.57 1.18 -4.36 -0.41 0.21 0.95 -0.03 0.39 -0.31 -0.26 0.37 0.43 0.27 -0.02 -0.02 0.08 0.04 -0.09 0.21 0.35 0.77 -0.06 -0.91 -0.4 -0.2 -0.03 -0.08 0.08 -0.15 -0.37 -0.75 -0.59 -0.64 -0.65 -0.28 -0.1 -0.21 -0.04 -0.25 0.05 -0.08 0.13 -0.28 0.15 -0.12 -0.06 0.19 -0.41 -0.07 -0.12 0.03 -0.27 -0.35
0.83 0.99 0.56 -3.98 -0.6 0.51 0.09 0.58 0.42 0.81 0.61 0.48 -0.63 0.78 -0.01 -0.12 -0.05 -0.09 0.63 -0.44 -0.04 0.83 -0.41 -0.15 -0.46 -0.77 -0.41 -0.22 0.29 -0.32 0.2 -0.13 0.02 0.31 0.17 -1.63 -0.44 -0.23 -0.52 0.06 -0.15 -0.19 -0.21 -0.43 0.25 -0.27 -0.11 -0.08 -0.58 -0.59 -0.33 -0.66 -0.74 -1.03
1.54 0.86 0.45 -2.84 0.08 0.56 0.87 0.69 0.24 0.54 0.48 0.08 -0.78 0.48 0.16 -0.05 0.04 -0.15 -0.2 -0.08 -0.09 1.23 -0.42 -0.58 -0.77 -0.22 -0.32 0.05 0.15 0.03 -0.63 -0.89 -0.34 -0.28 -0.32 -1.33 -0.04 -0.09 -0.06 -0.08 -0.55 -0.05 -0.03 -0.88 0.04 -0.78 0.13 0.08 -0.53 -0.48 -0.37 -0.37 -0.72 -1.05
0.74 0.73 0.74 -3.38 -0.55 0.19 0.67 0.07 0.23 -0.07 -0.08 0.24 -0.72 0.09 -0.25 -0.23 -0.22 -0.25 0.31 -0.3 -0.25 0.5 -0.15 0.09 -0.0 -0.4 -0.37 -0.16 0.15 -0.31 0.28 -0.17 0.21 0.52 0.11 0.03 -0.45 -0.02 -0.52 -0.11 0.08 -0.22 -0.1 0.17 0.21 0.17 -0.15 0.09 -0.35 -0.1 0.09 -0.21 -0.35 -0.46
0.33 0.74 0.89 -4.68 -0.11 0.31 0.85 0.34 0.62 0.11 0.33 0.54 -0.24 0.08 -0.3 -0.36 -0.25 -0.4 0.31 0.39 0.44 0.66 -0.12 -0.22 -0.0 -0.55 -0.36 -0.09 -0.06 -0.12 -0.18 -0.31 -0.1 -0.12 -0.14 -1.15 -0.54 -0.2 -0.62 -0.28 0.21 -0.33 -0.17 0.08 -0.16 0.09 -0.17 -0.12 -0.5 -0.32 -0.09 0.02 0.06 -0.22
0.47 0.72 0.86 -4.0 0.18 0.49 0.72 0.35 0.65 0.36 0.4 0.76 0.16 -0.07 -0.43 -0.39 -0.36 -0.31 0.14 0.4 0.35 -0.04 0.24 -1.11 -0.49 -0.53 -0.14 0.04 0.23 -0.01 -1.0 -0.57 -0.74 -0.36 -0.8 -0.47 -0.71 -0.35 -0.58 0.28 -0.41 -0.16 0.01 -0.37 0.21 -0.31 0.0 0.34 -0.29 0.35 0.48 0.03 -0.33 -0.53
0.96 1.04 1.28 -2.45 -1.07 0.75 1.02 0.73 0.49 0.43 0.59 0.33 -0.63 -0.25 0.15 0.09 0.05 0.07 -0.17 0.52 0.25 0.34 -0.29 -0.16 -0.34 0.1 -0.67 -0.44 -0.34 -0.51 -0.82 -0.96 -0.3 -0.3 -0.39 -0.43 -0.05 0.42 -0.08 -0.53 -0.2 -0.5 -0.65 -0.33 -0.48 -0.43 -0.6 -0.57 -0.81 -0.63 -0.39 -0.06 0.27 -0.1
0.7 0.79 1.34 -3.48 0.13 0.45 1.22 0.33 0.84 0.11 0.28 0.65 0.27 -0.16 -0.57 -0.61 -0.51 -0.45 -0.46 0.44 0.3 0.09 0.08 -1.18 0.12 -0.1 -0.02 -0.09 0.03 -0.27 -0.64 -0.95 -1.3 -0.84 -1.33 -0.23 -0.59 -0.1 -0.5 -0.31 0.02 -0.34 -0.26 0.07 -0.17 -0.07 -0.31 -0.09 -0.36 -0.02 0.12 0.17 0.22 -0.14
0.74 1.02 0.8 -4.71 -0.74 0.41 0.89 0.42 0.32 0.33 0.53 0.38 0.24 -0.37 -0.42 -0.47 -0.37 -0.48 -0.48 -0.11 0.28 0.54 0.05 -0.33 0.08 -0.62 -0.37 -0.09 0.42 -0.12 -0.07 -0.46 -0.27 -0.04 -0.21 -0.16 -0.74 -0.36 -0.65 -0.09 -0.08 -0.47 -0.16 0.09 0.21 -0.09 -0.19 0.22 -0.38 -0.18 0.04 -0.01 -0.05 -0.27
2.61 0.76 -1.64 -3.69 - 1.07 2.04 -0.03 1.13 -0.68 0.4 0.2 0.09 1.2 -0.7 -0.49 -0.54 -0.79 -2.27 -0.27 -0.15 0.31 0.12 -1.54 0.79 -1.87 -1.04 -1.03 -1.01 -1.22 0.44 0.57 -1.75 -1.53 -2.26 -0.17 -2.61 -1.89 -2.55 -0.7 0.87 -1.64 -1.27 1.34 -1.01 1.01 -1.42 -1.06 -0.94 -0.15 0.04 -0.31 -0.64 -0.45
0.94 0.8 0.79 -3.99 -0.94 0.55 0.82 0.35 -0.37 0.05 0.45 -0.35 -0.18 0.15 -0.36 -0.42 -0.24 -0.19 0.34 -0.24 -0.11 1.17 -0.3 -0.22 -0.17 -0.45 -0.43 0.07 0.19 -0.02 0.64 -0.91 0.13 -0.51 0.08 -0.28 -0.46 -0.53 -0.6 0.29 0.09 -0.21 -0.12 0.06 0.05 -0.14 0.16 -0.16 -0.45 -0.42 -0.35 -0.19 -0.18 -0.22
1.5 1.51 0.87 -3.58 -0.51 0.71 0.93 0.39 0.63 0.42 0.48 0.35 -0.2 0.12 -0.31 -0.27 -0.22 -0.39 -0.06 0.12 0.27 0.32 -0.33 -0.48 -0.4 -0.65 -0.5 0.01 0.09 -0.13 -0.52 -0.87 -0.42 -0.4 -0.44 -1.49 -0.44 -0.3 -0.32 -0.0 -0.25 -0.23 -0.05 -0.52 0.14 -0.27 -0.05 -0.03 -0.5 -0.46 -0.33 -0.11 -0.37 -0.67
1.89 1.55 0.27 -3.55 -1.29 0.66 1.03 -0.1 1.15 1.18 0.71 1.32 0.4 0.11 -0.14 -0.05 -0.1 -0.09 -0.26 0.29 0.31 -0.25 -0.05 -1.27 -0.77 -0.36 -0.46 -0.55 -0.53 -0.32 -1.28 -0.8 -1.33 -1.14 -1.41 -0.68 -0.37 -0.25 -0.37 -0.13 -0.67 -0.53 -0.59 -0.73 -0.33 -0.83 -0.57 -0.5 -0.54 -0.45 -0.56 0.26 -0.27 -0.08
0.29 0.56 0.67 -3.57 -0.28 0.22 0.54 0.37 0.47 0.26 0.35 0.28 -0.39 0.28 -0.56 -0.5 -0.59 -0.63 0.07 0.14 0.14 0.69 -0.08 -0.61 0.23 -0.1 -0.14 -0.14 0.07 -0.19 -0.12 -0.37 -0.34 -0.3 -0.48 -0.64 -0.02 0.15 -0.09 -0.05 0.38 -0.09 -0.16 0.28 0.14 0.32 -0.14 -0.09 -0.55 -0.12 -0.01 0.04 0.05 -0.09
0.79 0.8 0.69 -6.56 -0.42 0.34 1.04 0.5 0.65 0.54 0.56 0.56 -0.54 0.5 -0.05 -0.22 -0.06 -0.11 0.13 0.16 0.15 0.73 -0.48 0.05 -0.15 -0.19 -0.79 -0.43 -0.1 -0.46 0.12 -0.78 -0.09 0.15 -0.04 -0.86 -0.29 0.09 -0.27 -0.09 -0.04 -0.36 -0.38 0.02 -0.08 -0.21 -0.38 -0.15 -0.61 -0.42 -0.27 -0.58 -0.5 -0.68
0.96 1.19 1.47 -4.05 -0.16 0.39 0.99 0.46 0.57 0.81 0.49 0.74 -1.21 0.55 0.01 -0.07 0.01 0.1 0.43 -0.12 -0.07 0.77 -0.36 0.32 -1.3 -0.78 -0.88 -0.38 -0.12 -0.33 -0.9 -0.32 0.43 0.47 0.63 -1.98 -0.61 -0.44 -0.62 0.01 -1.4 -0.29 -0.3 -1.27 -0.13 -1.79 -0.16 -0.03 -0.48 -0.6 -0.47 -0.71 -0.93 -0.98
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1.31 1.26 1.44 -2.78 -1.27 0.31 1.33 0.87 0.09 0.08 0.16 0.12 0.06 0.07 -0.68 -0.51 -0.33 -0.47 -0.28 0.29 0.48 0.98 -0.82 0.61 -1.07 0.19 -0.31 -0.53 0.12 -0.43 -0.65 0.06 0.2 0.31 0.44 -0.25 -0.21 0.61 -0.06 -0.07 -0.99 -0.31 -0.69 -1.21 -0.14 -1.23 -0.55 -0.51 -0.98 -0.49 -0.43 -1.19 -1.83 -2.22
1.31 1.03 1.12 -4.54 -0.84 0.32 0.9 0.63 0.46 0.39 0.4 0.62 -0.74 0.11 -0.39 -0.39 -0.2 -0.34 0.12 -0.02 0.11 0.64 -0.39 -0.31 -0.58 -0.09 -0.54 -0.42 0.05 -0.48 -0.44 -0.55 0.09 0.26 0.04 -0.12 -0.1 0.39 -0.12 -0.28 -0.19 -0.41 -0.18 -0.3 -0.03 -0.32 -0.34 -0.13 -0.68 -0.34 -0.3 -0.32 -0.73 -1.01
1.24 0.94 -0.65 -3.25 -0.68 0.78 0.82 0.78 0.8 0.65 0.69 0.86 -0.7 0.55 0.17 0.07 0.17 0.25 0.97 -0.14 -0.07 0.82 -0.23 -1.02 -0.81 -0.53 -0.41 0.18 0.6 0.02 -1.24 -0.61 -0.58 -0.25 -0.82 -3.2 -0.69 -0.55 -0.34 -0.07 -1.01 -0.16 0.13 -0.88 0.12 -1.16 0.13 0.34 -0.69 -0.59 -0.38 -0.48 -0.51 -0.86

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.