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Heatmap: Cluster_73 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.67 0.72 -0.62 -4.15 0.22 0.43 0.59 0.82 0.67 0.7 0.58 0.59 -1.35 0.59 0.6 0.62 0.52 0.5 1.19 0.76 0.72 0.44 -0.44 -0.57 -2.03 -0.35 -1.07 -0.13 -0.21 -0.11 -1.62 -0.87 -0.03 -0.37 -0.17 -1.51 -0.12 -0.21 -0.25 -0.18 -1.4 -0.14 -0.1 -1.46 -0.27 -1.79 0.05 -0.04 -0.32 -0.27 -0.21 -0.37 -0.55 -0.75
0.19 -0.08 -0.52 -4.86 0.12 0.51 0.55 0.82 0.44 0.81 0.74 0.5 -0.32 0.73 0.43 0.37 0.52 0.42 0.43 0.19 0.28 1.17 -0.4 -0.39 -0.9 -0.32 -0.31 0.08 -0.05 0.02 -0.78 -0.38 0.04 -0.26 0.03 -1.24 -0.27 -0.23 -0.43 -0.05 -0.58 -0.03 -0.17 -0.84 -0.32 -0.68 0.12 -0.18 -0.35 -0.31 -0.28 -0.5 -0.76 -1.01
0.53 0.13 -0.31 -6.07 -2.46 0.42 1.13 0.36 0.59 0.4 0.57 0.37 0.37 1.37 -0.04 -0.26 0.05 0.05 0.28 -0.46 -0.12 0.56 0.14 -1.12 -0.45 -0.59 -0.42 0.13 0.7 0.26 -0.75 -0.79 -0.81 -0.42 -0.82 -0.49 -0.52 0.03 -0.42 -0.11 -0.49 -0.77 0.19 -0.16 0.12 -0.32 0.43 0.35 -0.64 0.02 -0.0 -0.11 -0.17 -0.22
0.6 0.3 -4.1 -7.58 -0.65 0.74 1.0 0.5 1.16 0.65 0.34 1.26 -0.64 1.34 0.37 0.16 0.62 0.59 0.32 0.88 0.58 0.31 -0.13 0.15 -1.46 -0.82 -1.24 0.19 0.19 -0.23 -2.14 -0.25 0.16 0.18 0.06 -2.16 -0.99 -0.63 -1.03 -0.97 -1.58 -0.48 -0.04 -1.46 -0.45 -2.31 -0.02 0.05 -0.12 -0.37 -0.2 -0.16 -0.31 -0.44
0.81 0.51 -2.75 -6.83 -0.65 0.84 1.06 1.37 0.55 1.14 1.17 0.26 -1.1 0.23 0.85 0.55 0.86 0.97 0.99 0.57 0.82 1.54 -0.46 -0.85 -1.95 -1.66 0.12 -0.21 -0.75 0.18 -1.71 0.24 -0.63 -0.73 -0.84 -2.64 -1.44 -1.68 -1.57 0.43 -2.22 -0.22 -0.71 -2.21 -0.8 -2.36 -0.32 -0.77 -0.3 -0.73 -0.35 -0.02 -0.69 -1.26
1.08 0.86 -0.37 -3.5 0.73 0.25 0.11 0.62 0.34 0.65 0.38 0.28 -1.51 0.02 0.72 0.55 0.67 0.53 0.24 0.07 0.07 0.21 -0.27 -0.43 -1.13 -0.38 -0.26 -0.14 -0.21 -0.05 -1.12 -0.43 -0.21 -0.68 -0.19 -2.11 -0.08 -0.16 -0.14 -0.04 -0.72 0.06 -0.12 -0.89 -0.03 -0.75 0.07 -0.09 0.01 -0.11 -0.23 -0.07 0.04 0.15
0.51 0.29 -1.37 -6.29 -0.25 0.85 0.66 1.11 0.76 1.1 0.96 0.69 -0.48 -0.04 0.38 0.16 0.43 0.32 0.48 -0.22 -0.02 0.09 0.09 -0.45 -2.05 -0.91 -0.59 0.52 -0.09 0.42 -2.03 -1.31 0.07 -0.37 -0.06 -2.61 -0.76 -0.91 -0.72 0.6 -1.95 0.25 0.31 -2.1 -0.12 -2.37 0.47 0.42 -0.01 0.44 0.47 -0.36 -0.78 -0.97
1.24 0.91 -0.6 -5.8 0.26 0.52 0.97 0.63 0.89 0.5 0.42 0.9 -1.37 1.06 0.82 0.59 0.83 0.87 1.3 0.62 0.55 1.28 -0.49 -0.07 -0.46 -1.57 -2.43 -0.4 -0.51 -0.77 -0.31 -1.1 -0.01 -0.21 -0.26 -2.79 -1.35 -1.35 -1.49 -1.55 -1.16 -1.12 -0.58 -0.58 -1.35 -1.63 -0.51 -0.43 -0.53 -0.33 -0.23 -0.4 -0.72 -0.81
0.71 0.65 -2.68 -7.03 -2.48 0.25 1.24 0.53 0.92 0.81 0.25 1.21 -1.28 0.83 0.27 0.09 0.42 0.31 0.48 0.27 0.35 0.66 -0.23 0.57 -0.17 -0.16 -1.41 -0.38 -0.18 -0.54 -1.74 -0.64 0.7 0.47 0.86 -3.04 -0.48 -0.12 -0.23 -0.71 -2.07 -0.72 -0.4 -0.64 -0.23 -3.24 -0.41 -0.05 -0.3 -0.46 -0.6 -0.2 -0.03 0.02
0.66 0.33 -0.16 -4.92 -0.07 0.18 0.66 0.72 0.63 0.49 0.53 0.52 -0.47 0.56 0.08 -0.06 0.14 0.01 0.3 0.39 0.44 1.05 -0.37 -0.71 -0.56 -0.38 -0.48 0.15 0.09 0.1 -0.71 -0.61 -0.12 -0.23 -0.17 -0.93 -0.21 -0.11 -0.31 0.1 -0.31 0.04 0.12 -0.47 -0.11 -0.46 0.36 0.09 -0.44 -0.4 -0.27 -0.47 -0.66 -0.86
-0.1 -0.4 -2.54 -5.8 -1.11 0.27 0.9 0.37 0.38 0.14 -0.03 0.54 0.06 1.01 -0.01 -0.23 0.11 -0.13 0.14 0.0 0.22 1.27 0.07 0.09 -0.89 -0.28 0.16 0.13 0.38 0.0 -0.6 0.1 0.14 0.09 0.16 -0.94 -0.22 0.05 -0.19 0.07 -0.75 0.03 0.21 -0.6 0.37 -0.99 -0.01 0.34 -0.1 0.06 0.04 -0.33 -0.6 -0.79
0.55 0.4 -0.16 -5.5 -0.13 0.25 0.78 0.21 0.63 0.02 -0.09 0.59 -0.99 0.89 0.46 0.36 0.5 0.46 0.56 -0.16 -0.01 0.64 -0.1 -0.12 -0.65 -0.5 -0.41 0.01 0.15 -0.13 0.06 -0.34 0.05 0.15 -0.04 -1.34 -0.33 -0.16 -0.42 -0.15 -0.47 -0.14 -0.08 -0.53 -0.1 -0.63 0.02 0.08 -0.17 -0.17 0.06 -0.17 -0.48 -0.8
0.91 0.25 -1.35 -5.22 0.15 0.4 0.61 0.86 0.64 0.86 0.66 0.63 -0.46 1.03 0.9 0.76 0.8 0.76 -0.02 0.78 0.81 1.11 -0.48 -0.49 -1.07 -1.27 -0.76 -0.57 -0.44 -0.24 -0.49 -0.86 -0.53 -0.95 -0.41 -1.95 -0.73 -1.0 -0.63 -0.38 -0.53 -0.45 -0.39 -0.85 -0.44 -0.51 -0.37 -0.32 -0.17 -0.29 -0.2 -0.07 -0.45 -0.53
0.98 0.69 -1.56 -7.4 -3.57 0.12 1.09 1.22 0.21 1.07 0.55 0.27 0.22 0.94 -0.02 -0.1 0.12 0.0 -0.16 0.15 0.39 0.98 -0.16 0.63 -2.08 0.14 -0.53 -0.14 -0.12 -0.17 -1.87 0.07 0.4 0.32 0.81 -2.69 0.29 -0.15 0.29 -0.36 -1.99 0.23 -0.17 -2.41 -0.56 -2.78 0.04 -0.11 -0.35 -0.1 -0.2 -0.91 -1.43 -1.99
0.11 -0.0 -0.55 -4.95 -0.28 0.34 0.86 0.53 0.38 0.54 0.39 0.58 -0.4 0.4 0.21 0.06 0.27 0.23 0.51 0.22 0.23 1.05 -0.21 -0.5 0.27 -0.19 -0.28 -0.08 0.15 -0.18 -0.25 -0.53 -0.54 -0.47 -0.45 -0.2 -0.19 -0.04 -0.21 -0.28 0.08 -0.16 -0.21 -0.11 -0.19 0.1 -0.11 -0.15 -0.36 -0.33 -0.32 -0.22 -0.29 -0.4
0.52 0.54 -1.36 -5.22 -1.43 0.59 1.24 1.31 0.39 0.91 1.22 0.07 -0.7 -0.1 0.45 0.31 0.33 0.28 0.92 -0.96 -0.7 0.78 -0.12 -0.56 -2.1 -0.63 0.04 0.31 0.78 0.51 -1.8 -0.65 -0.56 0.28 -0.49 -2.8 -0.38 -0.26 -0.57 0.51 -2.46 -0.03 0.09 -2.33 0.44 -3.02 0.28 0.02 -0.26 -0.33 -0.14 -0.3 -0.52 -0.7
0.92 0.34 -3.45 -2.88 -0.13 0.52 1.11 0.56 0.46 0.59 -0.14 1.05 -0.86 1.14 0.3 0.03 0.42 0.14 0.68 -0.7 -0.51 1.25 -0.14 0.49 -2.8 -0.29 -0.55 -0.02 0.28 -0.15 -1.49 -0.45 0.52 0.67 0.63 -3.11 -0.18 -0.16 -0.22 -0.02 -1.71 -0.1 -0.08 -1.82 0.18 -2.96 0.14 0.31 -0.55 -0.32 -0.25 -1.0 -1.49 -1.6
1.35 0.55 -3.34 -6.37 -0.8 0.37 1.61 0.9 0.33 0.68 0.54 0.55 -0.74 0.42 0.19 0.16 0.01 -0.02 0.0 -0.12 -0.05 0.8 -0.42 0.65 -0.78 -0.55 -0.73 -0.62 -0.24 0.13 -0.85 -0.93 0.23 0.68 0.94 -1.4 -0.81 -0.75 -0.52 0.26 -1.11 -0.25 -0.48 -0.62 -0.02 -1.27 -0.37 -0.18 0.29 0.02 -0.13 -0.6 -0.98 -1.1
0.55 0.07 -0.28 -5.83 -0.37 0.57 0.91 0.48 1.19 0.71 0.38 1.52 -0.38 1.11 0.58 0.45 0.67 0.49 0.16 0.81 0.48 1.18 -0.5 -0.42 -1.42 -0.81 -0.53 -0.39 -0.12 -0.3 -1.26 -0.86 -0.48 -0.48 -0.39 -1.74 -0.83 -0.88 -0.7 -0.23 -0.7 -0.17 -0.39 -1.31 -0.13 -1.07 -0.39 -0.29 0.2 -0.59 -0.61 -0.43 -0.75 -0.68
-0.18 -0.27 -3.95 -3.42 -7.54 0.8 2.03 0.61 0.37 0.15 0.47 0.06 0.15 1.13 -0.44 -0.78 -0.47 -0.52 1.27 -1.02 -0.74 2.61 -0.17 -0.57 -2.18 -2.29 -0.12 0.28 0.63 1.14 -1.07 0.47 -0.3 0.01 0.17 -5.16 -1.47 -1.4 -1.44 0.56 -2.59 -0.83 0.21 -1.62 -0.5 -1.94 0.34 0.22 -0.61 -0.98 -1.06 -0.36 -0.82 -1.26
1.15 0.49 -8.62 -6.11 -6.92 0.79 1.77 1.82 0.15 1.22 1.08 0.97 0.16 0.98 0.3 0.86 0.37 0.42 0.69 0.31 0.82 2.01 -0.17 0.06 -1.2 -2.22 -2.9 -0.63 0.01 -0.17 -3.77 -2.54 -0.98 -1.41 -0.66 -4.07 -2.38 -2.8 -1.97 -1.21 -4.13 -2.06 -0.18 -1.92 -1.34 -3.16 -0.86 0.3 -0.41 0.3 0.09 -0.04 -1.07 -1.27
1.36 0.77 -1.14 -4.02 0.5 0.34 0.86 1.02 0.46 0.73 0.75 0.44 -1.51 1.06 0.47 0.47 0.6 0.54 0.64 -0.05 -0.33 0.56 0.08 -0.28 -2.43 -1.15 -0.67 0.35 -0.87 -0.07 -1.37 -1.19 0.25 -1.25 -0.14 -2.67 -0.73 -1.9 -0.99 -0.35 -1.06 0.11 0.07 -2.44 -0.62 -1.84 0.33 -0.04 0.01 0.07 0.15 -0.01 -0.03 -0.02
0.54 0.18 -0.17 -5.16 -0.59 0.36 0.63 0.56 0.42 0.53 0.34 0.41 -0.34 1.01 0.27 0.09 0.29 0.18 0.38 0.18 0.29 0.96 -0.08 -0.09 -0.87 -0.34 -0.15 0.07 -0.01 -0.09 -0.56 0.12 0.04 0.07 0.06 -1.5 -0.33 -0.4 -0.43 -0.03 -0.79 0.16 -0.15 -0.93 -0.09 -0.97 0.14 -0.09 -0.21 -0.18 -0.19 -0.16 -0.49 -0.6
0.46 -1.68 -2.9 -2.61 -1.63 0.77 0.83 0.15 0.35 -0.81 -0.69 -0.65 1.22 0.18 -1.0 0.05 -0.29 -0.45 -0.77 -0.18 -0.39 0.72 -0.04 0.7 -0.58 -0.09 0.06 0.17 0.79 0.12 -0.17 -0.6 0.65 0.95 0.8 -1.36 -0.5 0.46 -0.24 0.07 -1.11 -0.01 0.39 -0.68 0.9 -1.1 0.2 0.23 0.55 -0.44 -0.24 -0.85 -0.58 -0.19
-7.83 -11.12 - - -8.69 0.32 1.42 -0.59 -0.22 0.12 0.18 -0.22 -0.8 2.1 0.02 -0.39 -0.09 0.24 0.79 -0.79 -0.98 2.56 0.1 -0.02 -0.94 -2.22 -0.97 0.25 0.06 0.69 -0.04 -0.1 0.34 -0.33 0.54 -2.23 -0.98 -1.15 -1.06 -0.27 -2.19 -0.88 0.17 -1.15 -0.94 -1.79 1.11 0.26 0.25 0.16 0.26 0.16 0.05 -0.32
-9.24 -8.99 -10.71 -7.34 -13.94 1.23 1.24 -0.49 0.43 0.09 0.22 0.4 -0.55 0.45 0.16 -0.24 -0.03 0.52 0.88 -1.3 -1.45 2.59 0.27 0.17 -0.54 -2.17 -1.28 0.03 0.39 0.52 0.57 0.18 0.15 -0.12 0.29 -1.72 -1.59 -1.3 -1.33 -0.96 -2.13 -2.09 -0.19 -0.85 -1.36 -0.98 0.64 0.14 0.27 0.58 0.79 0.49 0.27 -0.17
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0.67 0.82 -3.37 -3.87 -0.82 0.72 1.63 0.34 0.75 0.72 0.41 1.09 -0.96 1.44 0.46 0.22 0.65 0.56 -0.21 -0.08 0.07 0.61 -0.02 -0.55 -2.41 -0.37 -1.2 0.22 0.58 -0.33 -1.99 -0.98 -0.22 0.0 -0.73 -2.92 -0.2 -0.07 -0.36 -0.88 -2.03 -0.36 0.41 -1.88 0.18 -3.04 0.26 0.52 -0.78 -0.38 -0.15 -0.11 -0.5 -1.03
0.55 -0.0 -2.58 -5.81 -3.65 0.58 0.75 0.66 0.43 0.91 0.64 0.48 -0.44 -0.49 0.35 0.13 0.65 0.58 -0.23 -0.65 -0.22 1.18 0.19 -0.07 -1.28 -0.42 0.02 0.15 0.43 0.2 -0.52 0.36 -0.12 0.68 0.07 -0.66 -0.81 0.49 -0.63 0.67 -1.11 -0.31 -0.16 -1.11 0.6 -1.38 -0.27 0.11 0.21 -0.59 -0.49 -0.46 -1.33 -1.03
0.35 -0.05 -0.57 -5.55 -0.72 0.05 0.58 0.32 0.58 0.17 0.18 0.59 -0.39 1.11 0.24 0.05 0.32 0.22 0.33 0.17 0.15 0.72 -0.07 -0.32 -0.13 -0.14 0.07 -0.07 0.17 -0.17 -0.49 -0.27 -0.19 -0.25 -0.24 -0.28 -0.15 -0.0 -0.2 -0.26 -0.12 0.05 -0.14 -0.24 0.02 -0.12 -0.05 -0.12 -0.33 -0.35 -0.3 -0.1 -0.1 -0.28
0.96 0.27 -2.54 -2.73 -0.9 0.13 1.06 0.31 -0.11 0.29 0.05 0.34 -0.63 1.9 0.03 -0.53 0.14 -0.08 0.9 -0.46 -0.2 1.48 -0.27 -0.57 -0.66 -0.11 -0.65 -0.2 0.5 -0.35 -0.65 -0.84 0.22 -0.01 0.06 -0.16 -0.42 0.23 -0.41 -0.25 -0.23 -0.39 -0.16 -0.08 0.08 -0.54 -0.21 -0.01 -0.49 -0.31 -0.2 -0.33 -0.97 -1.28
1.65 2.42 - -3.64 -8.96 1.21 2.48 -1.45 1.07 -0.05 -0.79 0.79 1.13 2.73 0.75 0.51 0.37 0.41 -3.77 -0.76 -0.36 0.27 -0.01 -1.82 -1.02 -1.3 -2.88 -1.75 -0.23 -1.89 -2.31 0.3 -1.48 -0.71 -2.26 -1.4 -2.07 -1.93 -1.54 -3.64 -2.41 -3.97 -0.4 -1.54 -1.13 -2.22 -1.66 0.82 -1.09 -1.0 -0.81 -0.87 -1.44 -1.32
1.3 0.56 -0.44 -4.45 -2.61 0.41 1.03 0.4 0.64 0.06 0.05 1.15 -0.86 1.77 0.5 0.16 0.43 0.32 0.94 0.38 0.05 1.22 -0.43 -0.56 -1.19 -0.56 -0.92 0.14 -0.2 0.0 -1.85 -0.8 0.13 -0.4 -0.23 -1.1 -0.28 -0.8 -0.47 -0.35 -0.69 -0.14 -0.11 -1.07 -0.55 -1.42 0.44 0.02 -0.46 -0.54 -0.69 -0.61 -1.1 -1.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.