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Heatmap: Cluster_163 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.09 0.18 0.29 -4.2 1.2 0.71 0.27 -0.37 -0.11 -0.63 -0.48 -0.02 -1.35 0.16 0.3 0.36 0.18 0.09 1.08 -0.29 -0.2 -0.02 -0.34 -0.56 -1.27 0.32 0.07 -0.14 0.04 -0.08 -0.93 -0.82 0.07 -0.36 0.11 -0.86 0.46 0.57 0.56 0.43 -0.65 0.32 0.12 -0.89 0.48 -0.82 0.17 0.1 0.08 -0.23 -0.12 -0.53 -0.08 -0.16
-0.04 0.34 -0.23 -4.1 1.16 1.08 0.45 0.6 0.37 0.62 0.52 0.53 -0.25 0.68 0.61 0.52 0.72 0.55 1.01 0.24 0.36 0.56 -0.45 -0.83 -1.15 -0.54 -0.43 -0.13 -0.12 -0.19 -0.7 -1.0 -0.45 -0.67 -0.5 -1.21 -0.39 -0.3 -0.44 -0.02 -0.95 0.0 -0.17 -1.12 -0.13 -0.95 -0.11 -0.22 -0.27 -0.12 -0.12 -0.3 -0.78 -1.01
-0.1 0.74 1.04 -3.8 1.29 0.88 0.17 -0.27 -0.02 -0.28 -0.4 -0.05 -0.78 -0.25 0.82 0.85 0.78 0.81 1.24 -0.18 -0.16 -0.38 -0.03 -0.34 -1.02 -0.33 -0.53 -0.05 -0.16 -0.16 -1.41 -0.53 -0.13 -0.41 -0.26 -0.82 -0.44 -0.45 -0.43 -0.14 -0.69 -0.2 -0.14 -0.88 -0.13 -0.71 -0.08 0.14 0.23 0.26 0.05 -0.44 -0.25 -0.25
0.53 0.61 -1.12 -4.38 0.93 0.75 0.33 0.35 0.28 0.22 0.05 0.21 -0.96 0.19 0.42 0.45 0.61 0.61 1.27 -0.07 -0.07 0.04 -0.05 -0.36 -1.25 -0.08 -0.32 0.05 -0.25 0.06 -0.96 -0.82 0.12 -0.62 0.04 -1.55 0.03 -0.22 0.06 0.27 -1.06 0.15 -0.13 -0.89 -0.09 -1.44 0.08 -0.03 0.15 0.15 0.14 -0.28 -0.39 -0.63
0.49 0.13 -1.38 -5.26 0.99 0.89 0.55 0.05 -0.06 -0.75 -0.47 0.21 -0.07 0.23 0.51 0.47 0.52 0.57 0.67 0.15 0.28 0.85 -0.39 -0.25 -1.29 0.44 -0.11 -0.55 0.03 -0.43 -0.57 -0.29 -0.12 -0.32 -0.06 0.44 0.38 0.75 0.52 -0.11 -0.92 -0.34 -0.45 -1.01 0.35 -1.29 -0.58 -0.09 0.4 0.06 -0.53 -1.6 -1.22 -0.98
-0.35 -0.28 -2.38 -5.08 2.05 1.08 0.01 -0.83 0.49 -0.09 -0.27 0.14 -0.79 -0.34 0.91 0.79 0.7 0.69 1.1 -0.0 0.14 0.07 -0.43 -0.51 -0.88 -0.59 -0.38 -0.75 -0.46 -0.57 0.27 -0.36 -0.51 -0.83 -1.02 -0.04 -0.56 -0.68 -0.49 -0.23 -0.73 -0.23 -0.52 -0.56 0.13 -0.59 -0.76 -0.37 0.4 -0.02 -0.5 0.27 0.72 0.82
0.26 -0.57 -3.3 -6.77 1.49 1.17 0.44 -0.57 0.34 -0.62 -0.37 0.02 -0.36 -0.08 0.51 0.62 0.37 0.37 0.81 -0.03 0.2 -0.12 -0.27 -1.04 -0.6 0.15 0.04 -0.34 -0.49 -0.1 -0.99 -1.28 -0.69 -1.47 -0.65 -0.77 0.26 0.09 0.44 0.26 -0.16 0.14 -0.27 -0.48 0.05 0.0 -0.22 -0.26 0.48 0.11 -0.11 0.02 0.57 0.57
0.0 0.47 -0.37 -4.06 1.5 1.24 0.01 0.16 0.08 0.28 0.01 0.23 -0.72 -0.36 0.41 0.75 0.36 0.49 0.94 0.23 0.32 -0.1 -0.24 -0.45 0.17 -1.0 -0.68 -0.3 -0.45 -0.1 0.16 -0.37 -0.08 -0.37 0.1 -0.17 -1.19 -1.18 -1.02 -0.53 -0.15 -0.65 -0.13 -0.09 -0.58 0.17 -0.19 -0.06 -0.01 0.14 -0.11 -0.26 -0.12 -0.1
0.32 0.33 0.19 -4.87 1.35 0.91 0.37 -0.08 0.14 0.09 -0.08 0.25 -0.72 -0.36 0.7 0.58 0.65 0.67 0.46 -0.07 0.15 0.11 -0.56 -0.31 -0.86 -0.05 -0.28 -0.53 -0.23 -0.29 -0.15 -0.04 0.02 -0.39 -0.07 -0.72 0.14 -0.04 0.21 0.02 -0.28 0.05 -0.33 -0.53 0.05 -0.74 -0.37 -0.22 -0.01 -0.09 -0.47 -0.46 -0.44 -0.36
0.35 0.37 -3.02 -6.93 1.54 0.9 0.07 -0.12 -0.27 0.16 0.11 -0.29 -1.3 -0.34 0.66 0.51 0.66 0.62 0.73 -0.06 -0.3 -1.01 -0.3 0.42 -2.13 -0.09 -0.19 -0.09 -0.77 0.15 -0.2 -0.04 0.59 -0.33 0.44 -2.95 -0.02 -0.56 0.25 0.21 -2.36 0.11 -0.2 -2.82 0.05 -2.04 -0.02 -0.08 0.61 0.13 -0.01 0.29 0.43 0.4
0.36 0.09 -1.7 -4.29 1.19 1.37 0.57 -0.22 0.33 -0.1 -0.14 0.1 -0.42 0.34 1.05 1.03 0.95 0.99 0.3 0.53 0.57 0.03 -0.42 -0.38 -2.52 -0.43 -0.5 -0.33 -0.63 0.03 -0.86 -0.4 -0.0 -0.42 0.28 -2.56 -0.72 -0.77 -0.6 0.1 -1.56 -0.14 -0.17 -2.03 -0.29 -2.09 0.07 -0.13 0.25 0.18 -0.01 0.01 -0.02 -0.02
0.12 0.43 0.16 -4.49 1.03 0.77 0.05 0.03 -0.06 -0.41 -0.14 -0.28 -0.76 -0.27 0.72 0.32 0.63 0.57 0.63 0.29 0.32 0.43 -0.55 -0.54 -1.36 0.38 -1.13 -0.27 -0.21 -0.34 -1.19 -0.71 0.3 -0.57 0.2 -2.0 0.46 0.41 0.62 0.14 -0.91 0.19 -0.03 -0.49 0.14 -1.07 0.21 0.18 0.65 -0.21 -0.83 -0.85 -0.36 0.27
-0.03 -0.08 -1.86 -5.33 1.33 0.9 -0.08 -0.17 0.21 0.02 -0.14 0.06 -0.61 0.14 0.79 0.52 0.76 0.78 0.78 0.03 0.05 -0.05 -0.17 -1.09 -0.83 0.05 -0.11 0.01 -0.74 0.07 -1.12 -1.25 -0.59 -1.28 -0.82 -1.89 0.49 -0.15 0.47 0.26 -0.27 0.22 -0.09 -0.55 -0.19 -0.62 0.08 -0.07 0.33 0.11 -0.13 0.09 0.39 0.47
0.06 -0.48 -2.73 -4.73 1.55 0.92 0.49 -0.56 0.25 -0.45 -0.05 0.12 -0.26 -0.04 0.45 0.37 0.33 0.37 0.57 0.02 0.06 0.06 -0.24 -0.34 -0.78 0.09 -0.05 -0.55 -0.53 -0.39 0.03 -0.36 -0.33 -0.48 -0.67 -0.57 0.11 0.47 0.24 -0.17 -0.07 -0.16 -0.43 -0.64 -0.05 -0.39 -0.47 -0.42 0.37 -0.06 -0.49 0.19 0.68 0.94
0.3 0.79 0.75 -3.14 0.94 0.61 -0.11 0.09 0.32 0.01 0.02 0.26 -0.27 0.51 0.36 0.26 0.49 0.43 0.87 0.34 0.29 -0.01 -0.22 -0.91 -0.44 -0.03 -0.82 -0.12 -0.34 -0.15 -1.06 -1.15 -0.55 -0.82 -0.7 -1.16 0.03 0.1 -0.14 -0.3 -0.15 -0.26 -0.27 -0.51 -0.37 -0.29 -0.02 -0.15 0.04 -0.11 0.08 0.23 0.23 0.11
0.47 0.48 -0.76 -3.17 1.43 0.83 0.34 0.49 0.07 0.46 0.5 -0.17 -1.17 0.31 0.81 0.85 0.8 0.87 1.23 0.11 0.02 0.09 -0.37 -1.03 -1.29 -0.61 -0.17 -0.19 -0.26 -0.05 -0.71 -1.07 -0.52 -0.72 -0.64 -1.44 -0.16 -0.5 -0.06 0.02 -0.96 -0.08 -0.21 -1.32 0.05 -0.88 -0.14 -0.19 0.16 0.01 -0.21 -0.33 -0.25 -0.41
0.12 0.52 0.25 -3.97 1.2 1.18 0.22 -0.02 0.15 0.0 -0.02 -0.31 -0.71 -0.23 0.58 0.63 0.65 0.76 1.36 -0.11 0.27 -0.38 -0.36 -0.78 -1.85 -0.39 -0.21 -0.21 -0.52 0.03 -1.04 -0.83 -0.17 -0.8 -0.31 1.16 -0.3 -0.59 -0.37 0.01 -0.6 -0.04 -0.23 -1.39 -0.29 -0.7 -0.13 -0.12 0.31 0.01 -0.07 -0.47 -0.23 -0.27
-0.23 0.11 -1.62 -4.17 1.25 1.11 0.29 0.01 0.48 0.01 -0.02 0.45 -0.48 0.64 0.69 0.7 0.7 0.69 0.98 0.25 0.22 0.3 -0.18 -1.1 -0.49 -0.26 -0.35 -0.28 -0.51 -0.17 -0.68 -1.4 -0.5 -1.21 -0.58 -0.48 -0.33 -0.29 -0.2 0.05 -0.24 -0.18 -0.32 -0.34 -0.18 -0.19 -0.23 -0.12 0.31 0.1 -0.15 -0.28 -0.16 -0.12
0.42 0.04 -0.92 -3.96 1.14 1.27 0.58 -0.06 -0.19 -0.03 -0.02 -0.23 -0.54 -0.2 0.9 1.04 0.9 0.83 0.66 -0.01 0.14 0.43 -0.29 -0.85 -1.23 0.35 -0.01 -0.26 -0.73 0.02 -1.43 -1.75 -0.48 -1.34 -0.53 -0.81 0.45 0.11 0.57 0.07 -1.04 -0.01 -0.22 -1.3 -0.2 -1.09 -0.01 -0.25 0.16 0.1 -0.31 -0.39 -0.1 0.01
0.29 0.9 -0.55 -4.28 1.22 0.84 0.17 0.5 0.53 0.53 0.56 0.61 -0.35 -0.47 0.09 -0.04 0.62 0.52 1.12 -0.11 0.02 0.32 -0.24 -0.71 -0.87 -0.49 -0.04 -0.17 -0.21 -0.12 -0.4 -0.55 -0.52 -0.69 -0.51 -0.86 -0.45 -0.31 -0.53 -0.03 -0.42 -0.14 -0.24 -0.67 0.06 -0.38 -0.14 -0.18 -0.05 0.02 -0.16 -0.34 -0.19 -0.18
0.25 0.24 -0.15 -4.26 1.01 0.97 0.15 0.25 0.61 0.35 0.32 0.57 -0.51 0.5 0.75 0.7 0.62 0.63 0.36 0.45 0.4 0.36 -0.49 -0.74 -1.64 0.09 -0.7 -0.22 -0.29 -0.21 -1.22 -0.88 -0.18 -0.45 -0.13 -0.83 0.19 0.06 0.19 0.0 -1.04 -0.14 -0.18 -1.18 -0.21 -1.03 -0.03 -0.17 -0.06 -0.12 -0.23 -0.3 -0.45 -0.66
0.37 0.7 0.15 -4.46 1.08 0.78 0.32 0.3 0.33 0.03 -0.08 0.18 -1.1 0.01 0.38 0.46 0.54 0.47 1.15 -0.01 -0.08 0.09 -0.26 -0.85 -1.3 0.24 -0.22 0.08 0.03 -0.1 -1.16 -0.7 -0.25 -0.66 -0.48 -0.73 0.21 0.41 0.24 0.18 -0.69 0.08 0.06 -1.07 0.14 -1.06 0.1 0.12 -0.15 -0.03 0.06 -0.7 -0.82 -0.94
0.77 0.95 -4.62 -5.56 1.59 1.02 -0.84 -0.81 0.16 -0.52 -0.63 0.09 -1.15 0.78 0.98 0.97 0.88 0.83 1.4 0.11 0.24 -1.55 -0.09 -1.23 -2.02 -0.02 -0.09 -0.3 -0.37 0.01 -2.25 -1.01 -1.12 -1.72 -1.12 -1.39 0.02 -0.25 0.22 0.15 -1.64 -0.04 -0.15 -1.74 0.14 -1.32 -0.14 -0.01 0.66 0.5 0.02 -0.13 0.15 0.22
0.61 0.29 -0.88 -4.76 1.08 0.72 -0.05 0.2 0.43 0.0 0.0 0.3 -1.56 -0.02 0.52 0.57 0.43 0.49 1.08 -0.06 0.05 0.69 -0.51 -0.78 -0.62 -0.16 -0.59 -0.39 0.32 -0.31 -0.57 -0.82 -0.54 0.1 -0.49 -0.54 -0.1 0.52 -0.08 -0.02 -0.06 -0.25 -0.15 -0.13 0.22 -0.2 -0.19 0.01 -0.4 -0.53 -0.43 -0.24 -0.03 -0.12
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0.38 -0.24 -0.84 -4.05 1.24 1.09 0.55 -0.37 0.29 -0.9 -0.61 0.08 -1.07 0.62 0.8 0.71 0.71 0.69 1.29 0.2 0.43 0.67 -0.74 -0.71 -0.97 0.04 -1.03 -0.8 -0.57 -0.64 0.71 -0.47 0.14 -0.41 -0.19 -0.84 0.0 0.12 0.13 -0.67 -0.13 -0.36 -0.49 -0.46 -0.38 -0.53 -0.55 -0.31 -0.48 -0.46 -0.42 -0.14 0.17 -0.02
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0.55 0.51 -0.14 -4.88 1.13 0.97 0.42 -0.09 0.42 -0.02 -0.06 0.46 0.16 -0.53 0.52 0.38 0.35 0.33 1.12 0.32 0.31 0.27 -0.17 -0.48 -1.0 -0.44 -0.24 -0.07 -0.3 -0.25 -1.07 -1.19 -0.14 -0.81 -0.24 -1.14 -0.17 -0.24 -0.31 0.03 -0.75 0.18 -0.17 -0.95 -0.13 -0.83 -0.24 -0.21 0.03 0.23 0.13 0.19 0.01 -0.23
0.3 0.32 0.19 -5.33 0.89 0.74 0.34 0.08 0.49 0.03 0.05 0.59 -0.37 -0.29 0.21 0.21 0.27 0.25 0.34 0.09 0.01 0.11 -0.21 -0.18 -0.43 -0.44 0.22 -0.24 -0.19 -0.1 0.21 0.38 0.12 -0.32 0.1 -1.78 -0.53 -0.34 -0.35 0.22 -0.97 0.25 -0.13 -0.85 0.19 -0.96 -0.1 -0.11 0.24 0.22 -0.01 -0.29 -0.18 -0.1
0.52 -0.17 0.53 -3.14 0.93 0.95 0.69 -0.02 -0.17 -0.49 -0.38 -0.22 -0.25 0.17 0.62 0.79 0.78 0.77 0.69 -0.13 0.26 0.55 -0.45 -0.96 -0.71 0.12 -0.22 -0.35 -0.09 -0.08 -0.72 -1.41 -0.51 -1.04 -0.65 -0.37 0.03 0.39 0.37 -0.0 -0.42 -0.19 -0.26 -0.48 0.15 -0.46 -0.27 -0.18 0.35 0.05 -0.33 -0.51 -0.5 -0.45
0.27 0.51 0.77 -4.4 1.18 0.81 0.44 -0.39 0.01 -0.77 -0.52 -0.24 -1.06 0.21 0.47 0.53 0.53 0.49 0.9 0.0 0.05 0.47 -0.53 -0.68 -0.57 0.23 -0.38 -0.41 -0.39 -0.54 0.25 -0.7 -0.2 -0.54 -0.35 0.04 0.19 0.33 0.29 -0.24 -0.07 -0.06 -0.36 -0.36 -0.04 -0.27 -0.44 -0.27 -0.37 -0.28 -0.2 -0.19 -0.07 -0.29
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0.82 -0.0 -2.19 -4.84 1.15 1.18 0.68 0.13 0.04 -0.37 -0.32 -0.05 -0.39 0.17 0.56 0.43 0.63 0.59 0.6 0.08 0.25 0.65 -0.04 -0.06 -0.89 -1.02 -0.35 -0.21 -0.37 0.01 0.65 -0.42 0.27 -0.66 0.12 -1.83 -0.9 -1.07 -0.74 -0.17 -0.93 -0.42 -0.37 -0.76 -0.15 -0.9 -0.37 -0.14 0.33 0.17 0.0 0.12 0.36 0.28
0.38 -0.38 -1.04 -3.07 1.28 0.94 0.46 0.53 0.39 0.37 0.3 0.32 -1.15 0.18 0.63 0.74 0.45 0.47 0.77 0.92 0.78 0.1 -0.43 -1.45 -1.07 -0.03 0.34 -0.13 -0.65 0.07 -0.9 -1.44 -0.96 -1.75 -1.25 -1.43 0.08 -0.4 0.11 0.27 -0.77 0.46 -0.23 -1.05 0.11 -0.74 0.17 -0.33 0.0 0.05 -0.23 -0.5 -0.34 -0.34
0.61 0.13 -0.31 -2.91 1.26 1.15 0.84 -0.24 -0.0 -0.03 -0.18 -0.31 -0.11 0.06 0.8 0.72 0.77 0.84 0.83 0.08 0.24 -0.31 -0.26 -0.36 -1.3 -0.45 -0.31 -0.3 -0.46 -0.2 -0.47 -0.84 -0.0 -0.33 0.11 -1.39 -0.56 -0.59 -0.45 0.05 -0.97 -0.05 -0.09 -1.13 0.01 -0.93 -0.08 -0.01 0.42 0.18 -0.0 -0.35 -0.34 -0.21
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-0.43 -0.5 -0.19 -5.55 1.23 1.19 -0.16 -1.01 0.51 -0.23 -0.53 0.63 -0.29 0.01 0.9 0.83 0.96 0.77 0.71 -0.05 0.16 -0.5 -0.27 -0.73 -2.01 0.08 0.46 -0.35 -0.78 0.02 0.53 0.67 -0.38 -1.86 -0.96 -1.75 -0.12 -0.49 0.17 0.11 -1.82 0.34 -0.19 -2.01 0.11 -2.08 -0.17 -0.25 0.77 -0.08 -0.19 -0.05 0.15 0.02
-0.05 0.18 0.39 -4.58 1.23 0.59 -0.32 0.36 -0.06 0.02 0.07 -0.02 -1.3 -0.55 0.48 0.49 0.36 0.28 1.11 -0.01 0.09 0.49 -0.63 -0.3 -1.68 0.14 -0.2 0.02 0.07 -0.11 -1.03 -0.59 0.24 -0.41 0.06 -1.89 0.66 0.49 0.47 0.55 -1.26 0.66 0.15 -1.45 0.35 -1.69 0.35 0.06 -0.27 -0.35 -0.19 -0.48 -0.76 -1.15
-0.51 -0.78 -3.8 -8.03 1.22 0.74 0.21 -0.53 0.21 0.01 -0.43 0.1 -0.04 -0.13 0.69 0.58 0.67 0.64 0.48 0.35 0.41 -0.29 0.04 -0.89 -2.78 0.36 0.58 -0.04 -0.65 0.12 -3.16 -0.91 -0.78 -1.57 -0.67 -5.32 0.37 -0.24 0.53 0.63 -2.63 0.62 0.04 -2.86 0.54 -2.69 0.04 0.02 0.67 0.47 0.32 0.54 0.68 0.61
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0.28 0.13 -0.27 -5.01 1.01 0.76 0.65 -0.03 0.46 -0.31 -0.29 0.18 -0.47 0.4 0.74 0.78 0.81 0.77 1.27 -0.19 -0.07 0.74 -0.05 -0.36 -1.08 -0.15 -0.11 -0.08 0.2 -0.11 -1.53 -1.08 -0.13 -0.61 -0.03 -1.28 -0.38 -0.26 -0.24 0.11 -0.7 -0.0 -0.19 -0.97 0.11 -0.84 -0.17 0.06 -0.25 0.33 0.21 -0.74 -1.14 -1.41

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.