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Heatmap: Cluster_67 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.51 -0.88 -2.8 -6.54 -0.92 -1.1 -0.62 -0.89 -0.95 -0.91 -0.86 -0.95 -1.59 -0.8 -0.75 -0.88 -0.77 -0.79 -0.95 -0.84 -0.98 -0.28 0.33 0.37 -0.15 0.28 0.49 0.69 0.7 0.55 -0.07 0.17 0.65 0.62 0.64 -0.38 0.55 0.59 0.45 0.7 0.08 0.83 0.74 -0.02 0.75 0.19 0.96 0.83 0.11 0.09 0.27 0.2 0.06 -0.2
-2.73 -2.38 - -2.01 -3.3 -3.1 -2.33 -3.1 -2.15 -2.76 -2.42 -1.62 -2.51 -3.21 -3.14 -2.43 -2.78 -2.79 -3.58 -2.88 -2.32 -2.09 0.45 -1.21 0.41 0.89 0.3 -0.02 1.56 -0.05 0.77 0.02 0.05 1.08 -0.53 1.7 0.5 1.67 0.74 0.55 0.92 -0.29 0.96 0.93 1.58 0.44 0.11 1.36 -0.07 0.52 0.17 0.52 0.22 0.24
-0.79 -0.5 -2.89 -4.45 -0.78 -1.4 -5.0 -0.83 -0.78 -0.93 -0.84 -0.55 -1.08 -0.38 -0.32 -0.47 -0.26 -0.18 -0.01 -0.66 -0.29 -0.87 -0.35 0.1 -0.66 0.33 -0.57 0.26 0.52 0.12 0.13 0.16 0.89 0.7 0.87 0.06 0.68 0.86 0.55 0.7 0.34 0.79 0.94 0.17 0.91 0.22 1.07 0.9 -0.19 -0.26 -0.15 -0.33 -0.33 -0.46
-2.42 -1.37 -0.72 -0.77 - -1.66 -2.56 - - -1.64 - - -3.68 0.56 -3.08 -0.57 -1.0 -1.97 -0.84 -1.2 -0.58 -0.03 0.02 -0.18 -1.88 0.97 0.52 0.31 0.57 -0.29 0.71 1.14 1.13 1.15 1.01 -0.71 0.67 0.78 0.94 1.02 0.04 1.35 1.06 0.21 1.35 -0.33 0.92 1.06 -0.94 -0.23 0.36 -0.66 -0.71 -1.18
-0.51 -0.34 -0.61 -5.02 -0.51 -0.75 -0.71 -0.51 -0.55 -0.65 -0.7 -0.45 -0.58 -0.24 -0.41 -0.51 -0.41 -0.5 -0.18 -0.41 -0.33 -0.51 0.28 0.13 -0.24 0.28 0.41 0.61 0.7 0.37 -0.14 -0.08 0.33 0.49 0.18 0.34 0.43 0.52 0.2 0.38 -0.02 0.49 0.51 -0.05 0.54 0.03 0.56 0.5 0.12 0.11 0.28 0.23 0.05 -0.08
-0.28 -0.07 0.09 -4.96 -0.37 -0.88 -1.04 -0.17 -0.72 -0.41 -0.37 -0.38 -1.14 -0.67 -0.62 -0.91 -0.64 -0.75 -0.23 -0.5 -0.37 -0.6 -0.04 0.24 0.07 0.21 0.23 0.42 0.59 0.29 -0.31 -0.04 0.49 0.42 0.49 -0.29 0.54 0.63 0.34 0.56 0.31 0.73 0.54 -0.0 0.62 0.4 0.65 0.51 -0.1 -0.16 -0.03 0.05 0.01 -0.14
-0.89 -0.89 -1.34 -2.01 -2.85 -1.72 -1.21 -1.17 -1.14 -2.02 -2.26 -1.04 -2.78 -1.9 -1.93 -1.77 -0.86 -1.42 -1.29 -1.14 -2.17 -4.25 0.78 0.59 0.46 0.47 1.0 0.46 0.47 0.43 0.73 0.61 0.94 0.99 0.46 0.44 0.45 0.74 0.33 0.36 0.23 0.69 0.36 0.47 0.74 0.08 0.26 0.64 0.36 0.63 0.59 0.55 0.16 0.25
-2.19 -2.35 0.23 -1.36 -2.86 -2.15 -4.24 -2.5 -2.56 -2.94 -2.55 -1.96 -3.34 -0.28 -2.03 -2.07 -1.58 -1.71 -2.8 -2.13 -2.96 -1.92 0.73 0.64 0.01 0.3 0.48 0.91 0.62 0.44 -0.05 0.44 1.02 1.14 1.01 -0.51 0.98 0.72 0.67 0.54 0.29 0.78 0.77 0.34 0.8 -0.11 1.07 1.07 0.1 0.26 0.47 0.52 0.28 0.32
-0.03 -0.11 -0.67 -4.79 -0.57 -0.71 -0.11 -0.78 -0.59 -0.83 -0.54 -0.74 -0.75 -1.52 -0.67 -0.79 -0.68 -0.71 -0.14 -0.57 -0.4 -0.89 0.29 0.04 0.31 0.17 0.22 0.51 0.66 0.51 0.03 -0.16 0.28 0.15 0.36 -0.39 0.32 0.43 0.3 0.46 0.26 0.5 0.43 0.22 0.45 0.35 0.62 0.49 0.27 0.25 0.39 0.3 0.38 0.3
-2.29 -2.56 -2.25 -0.15 -3.34 -2.72 -1.22 - -2.02 - -3.71 -3.08 -3.17 -2.28 -2.25 -1.81 -0.93 -1.02 -1.46 -4.34 -3.2 -1.97 0.7 0.04 0.57 0.82 0.08 0.23 0.38 -0.13 1.53 0.51 1.2 1.05 0.59 1.35 0.21 0.7 0.53 0.54 0.64 0.09 0.19 1.02 1.16 0.59 0.08 0.7 0.58 0.67 0.49 -0.28 0.47 0.17
-1.92 -1.89 -1.43 -5.71 -2.29 -1.91 -2.21 -2.6 -2.52 -2.25 -1.18 -2.73 -2.79 -3.85 -3.1 -1.19 -2.16 -1.67 -1.03 -3.18 -1.88 -1.9 0.61 0.51 0.37 0.51 0.5 0.39 0.78 0.46 1.32 0.81 1.06 1.09 1.04 0.72 0.48 0.42 0.29 0.75 0.44 0.39 0.45 0.75 0.79 0.21 0.58 0.81 -0.03 0.3 0.55 0.62 0.41 0.17
-1.12 -1.17 -0.81 -6.1 -1.39 -2.25 -0.98 -2.07 -1.78 -3.72 -3.06 -1.84 -3.91 -2.41 -0.83 -1.07 -0.62 -0.82 -1.72 -3.41 -2.54 -1.1 0.48 0.1 0.0 0.61 0.75 0.63 0.48 0.4 -0.74 1.3 0.78 0.71 0.96 -0.69 0.46 0.48 0.42 0.79 0.5 1.18 0.98 0.4 1.18 0.08 1.05 1.03 0.71 0.21 0.18 0.02 -0.21 -0.12
-0.27 -0.49 0.29 -5.02 -1.06 -1.12 -1.31 -1.48 -0.91 -1.46 -1.24 -1.15 -1.48 -1.94 -1.53 -1.39 -1.58 -1.44 -1.15 -1.48 -1.15 -1.44 0.4 0.01 0.04 0.68 0.4 0.41 0.43 0.3 0.76 0.31 0.35 0.77 0.37 0.7 0.84 0.84 0.79 0.83 -0.05 0.46 0.64 0.33 0.8 0.01 0.61 0.8 0.27 0.48 0.5 -0.06 -0.08 -0.25
-5.15 -3.41 -1.01 -1.07 -2.52 -1.9 -3.99 -3.39 - -4.55 -2.71 - -2.75 -1.88 -3.95 -2.81 -3.03 -4.0 -3.87 -4.82 -3.61 -1.8 0.44 -0.22 0.41 1.62 0.91 -0.65 1.17 0.16 1.29 -0.77 -0.18 0.18 0.05 1.5 0.99 2.17 1.42 0.9 0.41 0.13 0.3 0.96 1.54 0.34 -0.11 0.75 0.3 0.13 0.22 -0.23 0.01 -0.6
-0.84 -1.12 -0.09 -2.99 -3.43 -0.84 -1.57 -1.29 -2.03 -1.47 -1.13 -1.3 -2.4 -1.67 -1.14 -1.9 -1.19 -1.5 -2.64 -2.62 -3.26 -1.39 0.37 0.43 -0.02 0.3 0.21 0.4 0.24 0.19 0.93 0.21 0.69 1.05 0.93 0.81 0.49 0.63 0.49 0.86 0.73 0.6 0.44 0.63 0.78 0.65 0.72 0.87 0.2 0.28 0.35 0.25 0.19 0.19
-1.09 -2.69 -0.64 -2.46 -2.18 -2.27 -0.35 - -3.1 -4.21 -1.78 - -3.75 -2.94 -2.74 -1.95 -1.77 -2.1 -3.53 -2.83 -3.27 -2.04 0.61 -0.24 0.23 0.62 0.36 -0.24 0.56 -0.24 0.92 0.18 0.9 0.98 0.57 1.84 0.64 0.99 0.76 0.97 0.77 0.43 0.35 1.05 1.23 0.08 0.27 0.88 0.53 0.64 0.49 -0.04 0.11 0.24
0.06 -0.22 -0.07 -4.52 -0.5 -0.74 -0.52 -0.83 -0.86 -0.91 -0.95 -0.65 -1.33 -1.52 -1.08 -1.29 -1.07 -0.97 -0.15 -0.88 -0.92 -0.99 0.22 -0.31 0.31 0.44 0.29 0.48 0.43 0.34 0.46 0.32 0.3 0.25 0.35 0.0 0.49 0.49 0.55 0.71 0.16 0.5 0.55 0.34 0.61 0.27 0.67 0.71 0.06 0.07 0.23 0.27 0.35 0.22
-0.38 -0.26 -0.56 -6.2 -0.26 -0.7 -0.62 -1.77 -1.37 -2.02 -1.8 -1.2 -1.73 -1.8 -0.67 -1.21 -1.16 -1.25 -0.23 -0.92 -1.22 -2.16 0.12 0.58 -0.25 0.57 -0.05 0.21 0.55 0.0 0.85 0.01 1.23 1.09 1.25 0.07 0.68 0.66 0.64 0.28 0.18 0.5 0.69 0.17 0.52 0.13 0.55 0.62 0.08 0.18 0.34 0.18 0.09 -0.33
-1.19 -0.31 -0.24 -4.62 -1.85 -1.88 -1.23 -2.05 -1.83 -2.26 -2.01 -1.89 -3.22 -1.3 -1.51 -1.92 -1.18 -1.35 -1.19 -1.74 -1.86 -1.82 0.48 0.4 0.41 0.84 0.25 0.51 0.49 0.41 0.76 0.16 0.78 0.68 0.52 0.61 0.68 0.82 0.81 0.79 0.25 0.58 0.6 0.44 0.75 0.36 0.5 0.83 0.4 0.62 0.71 0.08 0.01 0.01
-0.06 -0.5 -0.94 -5.19 -0.83 -0.66 -0.59 -0.7 -0.91 -0.84 -0.77 -0.63 -0.93 -0.83 -0.63 -0.7 -0.64 -0.61 -0.33 -0.64 -0.51 -0.55 0.42 0.45 -0.04 0.2 0.45 0.72 0.81 0.57 -0.05 0.28 0.52 0.78 0.43 -0.11 0.28 0.49 0.1 0.44 -0.43 0.45 0.71 -0.47 0.55 -0.46 0.69 0.73 0.13 0.29 0.49 0.36 0.02 -0.22
-1.93 -1.41 -2.61 -3.02 -2.22 -0.64 -2.26 -1.44 -1.14 -5.06 -2.22 -1.42 -2.28 -0.53 -0.97 -1.28 -1.21 -1.17 -1.8 -2.99 -4.13 -0.99 0.56 0.88 -0.34 0.32 -0.05 -0.07 0.33 -0.02 1.33 0.78 1.88 1.66 1.89 -0.45 0.23 0.37 0.49 0.41 -0.29 0.04 0.29 0.23 0.75 -0.48 0.03 0.94 0.43 0.27 0.09 0.33 0.06 0.23
-1.67 -1.92 -2.96 -3.96 -2.2 -0.76 -1.02 -2.92 -1.23 -1.52 -1.57 -1.28 -1.9 -1.74 -2.25 -1.12 -0.74 -1.03 -0.99 -1.71 -2.14 -1.32 0.22 1.24 -0.43 0.12 0.01 0.22 1.02 0.38 1.11 0.6 0.58 1.89 0.79 -1.08 0.43 0.88 0.01 0.62 0.32 0.41 0.59 0.21 0.9 -0.39 0.27 0.71 -0.21 0.01 0.2 0.88 0.78 0.63
-0.71 -1.05 -1.1 -3.06 -1.63 -0.78 -0.62 -2.26 -3.35 -2.46 -2.78 -2.41 -3.67 -0.86 -0.45 -0.26 -0.52 -0.77 -0.96 -1.63 -0.8 -1.6 0.35 -0.22 0.11 0.97 0.15 0.15 0.21 0.09 0.8 0.37 0.85 0.37 0.69 0.58 0.72 0.64 0.9 0.84 0.6 0.28 0.37 0.76 0.78 -0.07 0.32 0.87 0.03 0.36 0.44 0.29 0.4 0.41
0.46 -0.03 0.51 -3.78 -1.23 -1.14 -0.82 -0.76 -0.95 -0.95 -0.91 -0.88 -1.6 -1.02 -1.11 -1.25 -1.21 -1.23 -0.78 -0.88 -0.81 -1.29 0.33 0.6 0.14 0.09 0.13 0.58 0.75 0.32 0.47 0.37 0.79 0.92 0.66 -0.49 0.34 0.42 0.09 0.45 0.01 0.58 0.8 -0.04 0.47 -0.11 0.84 0.76 -0.01 0.08 0.23 0.22 0.0 -0.17
-0.32 -0.08 0.19 -4.53 -0.33 -0.64 -0.48 -0.41 -0.24 -0.42 -0.62 -0.25 -1.21 -1.13 -0.53 -0.68 -0.67 -0.72 0.05 -0.44 -0.37 -0.16 0.17 0.27 -0.4 -0.14 0.22 0.57 0.62 0.46 0.17 0.05 0.68 0.46 0.61 -0.42 0.33 -0.02 0.07 0.64 -0.5 0.69 0.68 -0.34 0.47 -0.43 0.88 0.64 0.06 0.21 0.26 0.14 -0.26 -0.34
-3.09 -0.87 -0.93 -0.44 - -2.24 -2.98 -2.28 -2.33 - - -1.38 - -5.98 -2.4 -1.61 -1.39 -0.83 -2.76 -2.64 -2.5 -3.27 0.39 0.27 0.6 0.86 0.21 0.53 0.06 -0.15 0.96 0.44 0.85 0.35 0.13 1.74 0.92 1.21 0.81 0.5 1.01 0.5 -0.02 0.91 0.78 0.82 -0.0 0.37 0.11 0.43 0.34 0.66 0.62 0.52
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-1.21 -0.64 -2.36 -1.44 -2.22 -1.51 -0.65 -3.43 - -1.82 -2.94 - -3.56 -0.35 -1.96 -0.89 -0.49 -0.8 -1.92 -3.82 - -1.25 0.21 0.23 -1.08 0.95 -0.59 0.41 0.48 0.26 -0.07 -0.69 1.56 1.31 1.0 0.4 1.36 1.22 1.28 0.89 -0.2 0.54 0.81 0.33 1.05 -0.51 0.64 1.33 -0.06 0.32 0.38 -0.26 -0.31 -0.29
-0.34 -0.03 0.32 -5.48 -0.75 -1.07 -0.62 -0.83 -0.43 -1.09 -0.84 -0.52 -0.85 -1.15 -1.2 -1.16 -1.26 -1.34 -0.52 -0.58 -0.55 -1.2 0.56 0.38 0.18 0.38 0.55 0.5 0.5 0.32 0.31 0.13 0.54 0.56 0.45 0.42 0.29 0.36 0.32 0.28 -0.02 0.37 0.35 0.14 0.47 0.06 0.32 0.41 -0.14 0.38 0.7 0.57 0.29 0.14
-0.04 -0.16 -0.85 -6.33 -0.41 -0.73 -0.66 -0.25 -0.45 -0.45 -0.55 -0.34 -1.04 -0.45 -0.45 -0.45 -0.44 -0.47 -0.07 -0.54 -0.27 -0.22 0.1 0.71 0.05 -0.12 0.31 0.32 0.41 0.22 0.36 0.34 0.69 0.85 0.77 -0.24 0.08 0.13 0.05 0.37 0.2 0.43 0.34 -0.06 0.29 0.28 0.51 0.38 -0.12 -0.19 0.07 0.08 0.02 -0.17
0.22 -0.01 -0.23 -2.9 -1.04 0.1 0.4 -0.59 -0.65 -1.09 -0.21 -0.04 -0.89 -0.18 -1.06 -0.51 -1.3 -0.8 -0.14 -1.12 -0.79 -0.4 0.29 0.45 0.45 0.21 -0.21 0.33 0.89 0.1 0.06 -0.2 0.13 0.88 0.04 0.3 0.05 0.73 0.14 -0.07 0.53 -0.15 0.25 0.68 0.31 0.48 0.06 0.23 -0.52 -0.05 0.12 0.01 0.21 0.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.