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Heatmap: Cluster_62 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
1.5 0.6 -3.52 -4.59 -1.53 1.07 1.83 0.71 0.35 0.57 1.2 0.41 -0.87 0.06 -0.05 -0.4 0.01 -0.31 -0.59 0.56 0.37 1.03 -0.19 -1.0 0.26 -0.83 -0.12 -0.47 -0.8 -0.35 0.14 0.09 -1.15 0.25 -1.61 -0.41 -0.81 -1.11 -0.85 0.12 0.43 -0.37 -0.86 0.44 -0.41 0.54 -0.64 -0.71 -0.54 -0.44 -0.54 -1.15 -0.81 -0.76
-0.42 0.59 0.38 -4.53 1.11 0.69 1.57 0.82 0.93 1.5 1.37 0.69 -1.24 -0.74 0.27 0.25 0.35 0.5 1.08 0.19 0.21 -0.11 -0.58 -0.37 -1.22 -0.61 -1.1 -0.44 -0.58 -0.71 -1.2 1.35 -0.22 -0.69 -0.37 -2.0 -0.82 -0.74 -0.7 -0.83 -1.07 -0.72 -0.68 -1.25 -0.94 -1.42 -0.38 -0.59 -0.5 -0.36 -0.4 -0.54 -0.59 -0.66
0.39 0.87 1.43 -4.33 -0.27 0.63 0.97 0.12 1.17 0.53 0.97 0.62 -0.22 -0.51 -0.33 -0.54 -0.4 -0.48 0.07 0.04 0.12 0.12 0.02 -1.33 0.26 -0.39 -0.16 -0.47 -0.48 -0.49 0.18 -0.53 -1.06 -1.51 -1.18 0.11 -0.45 -0.33 -0.51 -0.26 0.66 -0.36 -0.55 0.5 -0.14 0.58 -0.61 -0.47 -0.61 -0.46 -0.41 -0.13 -0.15 -0.2
0.34 -0.51 -3.99 -6.4 -2.9 0.76 1.47 1.15 0.72 1.17 1.22 0.44 -0.22 -0.42 -0.08 0.15 -0.0 -0.0 -0.29 -0.31 -0.09 -0.41 0.16 -0.02 -1.12 -0.44 -0.11 0.19 -0.08 0.16 -1.32 1.81 -0.07 -0.44 -0.08 -1.45 -0.62 -1.34 -0.71 0.04 -1.5 0.07 -0.37 -1.52 -0.37 -1.47 0.06 -0.26 -0.19 0.01 0.21 0.21 -0.13 -0.14
0.59 0.1 0.36 -1.9 -0.36 0.73 0.61 0.57 1.07 0.92 0.46 1.32 -0.14 1.18 -0.16 -0.04 -0.0 -0.17 0.04 0.12 0.29 1.2 -0.47 -1.01 -0.34 -0.0 -0.84 -0.81 -0.02 -0.86 -0.6 -0.54 -0.83 -0.67 -0.99 0.51 -0.33 0.42 -0.27 -0.81 0.2 -0.74 -0.57 -0.08 -0.34 0.04 -0.92 -0.44 -0.98 -0.61 -0.56 -0.37 -0.69 -0.65
0.98 1.07 -0.05 -5.41 -0.54 0.69 1.63 0.15 0.71 -0.03 0.36 0.48 -0.39 0.07 -0.85 -0.69 -0.75 -0.68 -0.56 -0.15 -0.59 -0.29 0.03 0.21 -0.04 -0.65 -0.17 0.0 -0.27 -0.2 0.37 -0.17 0.0 0.32 -0.19 0.32 -0.69 -0.69 -0.71 0.08 0.23 0.06 -0.21 0.3 0.11 0.15 -0.2 -0.09 -0.52 -0.1 0.12 -0.58 -0.52 -0.68
0.39 0.65 -0.17 -6.32 -0.46 0.83 0.79 0.38 0.94 1.32 1.12 0.85 -0.51 0.04 -0.39 -0.56 -0.36 -0.41 -0.35 0.01 -0.23 1.01 -0.32 -0.83 -0.48 0.15 -0.43 -0.6 -0.06 -0.58 -0.31 0.12 -0.86 0.01 -0.76 0.47 -0.21 0.41 0.03 -0.06 -0.3 -0.17 -0.41 -0.15 0.1 -0.22 -0.53 -0.24 -0.99 -0.52 -0.39 -0.13 -0.41 -0.63
1.08 0.83 -0.59 -3.69 -0.07 0.68 1.04 -0.11 0.51 -0.37 -0.27 0.42 -0.94 -0.27 -0.24 -0.08 -0.06 -0.32 -0.02 -0.08 -0.04 0.14 0.03 -0.56 0.03 -0.0 -0.69 -0.07 -0.22 -0.14 0.67 -0.78 0.21 -0.67 -0.2 -0.14 -0.08 -0.05 -0.11 0.0 0.01 -0.17 0.17 0.2 0.24 -0.27 0.11 0.24 -0.26 -0.47 -0.18 -0.42 0.14 0.23
0.94 0.83 1.79 -3.68 -0.47 0.55 1.18 0.51 0.65 0.63 0.74 0.62 -0.32 -0.01 -0.6 -0.54 -0.5 -0.53 -0.67 0.19 0.01 0.76 -0.53 -0.7 -0.17 -0.25 -0.19 -0.48 -0.57 -0.49 0.37 -0.18 -0.34 -0.59 -0.49 -0.79 -0.13 -0.19 -0.18 -0.21 0.07 -0.2 -0.59 -0.15 -0.16 0.18 -0.54 -0.52 -0.76 -0.63 -0.43 -0.32 -0.47 -0.54
1.13 1.1 -0.97 -3.73 -1.82 0.36 0.72 0.24 0.75 0.68 0.79 0.84 -1.09 0.31 -0.2 -0.09 0.07 -0.13 0.07 -0.24 -0.21 0.51 -0.75 0.39 -0.64 0.15 -0.32 -0.82 -0.29 -0.76 0.01 -0.14 0.42 1.06 0.54 -0.02 -0.45 0.56 -0.28 0.44 -0.51 -0.31 -0.69 -0.08 0.38 -0.61 -0.9 -0.25 -0.72 -0.78 -0.69 -1.16 -1.01 -1.12
1.04 0.94 0.38 -4.62 -0.29 0.6 1.05 0.39 0.56 0.32 0.32 0.39 -0.56 -0.16 0.05 0.05 -0.0 0.01 0.16 -0.15 -0.05 1.19 -0.37 0.09 -0.1 -1.05 -0.65 -0.64 -0.09 -0.65 0.8 0.07 0.24 0.71 0.16 -0.57 -1.13 -0.64 -1.07 -0.67 0.11 -0.7 -0.56 0.1 -0.1 0.05 -0.73 -0.32 -0.62 -0.53 -0.47 -0.45 -0.43 -0.5
0.79 1.01 0.69 -5.17 0.04 0.5 0.95 -0.03 0.27 0.01 0.02 0.38 -0.56 0.3 -0.07 -0.09 -0.05 -0.02 0.21 -0.36 -0.17 0.56 -0.15 -0.08 -0.26 -0.46 -0.46 -0.34 0.08 -0.4 0.61 -0.04 0.28 0.48 0.21 -0.38 -0.68 -0.33 -0.57 -0.21 -0.12 -0.49 -0.24 -0.08 0.11 -0.13 -0.38 0.03 -0.23 -0.13 -0.1 -0.52 -0.55 -0.62
1.25 1.25 0.88 -4.29 0.19 0.49 0.79 0.3 0.39 -0.15 -0.02 0.3 -0.34 0.58 0.0 0.14 0.06 0.12 0.35 0.09 0.21 0.79 -0.38 0.04 -0.13 -0.93 -0.44 -0.45 -0.33 -0.47 0.37 -0.38 0.4 0.11 0.31 -1.16 -0.94 -0.76 -0.93 -0.48 0.09 -0.39 -0.47 -0.02 -0.26 -0.09 -0.44 -0.38 -0.34 -0.39 -0.42 -0.71 -0.66 -0.72
1.26 1.52 1.65 -5.38 0.42 0.33 0.85 -0.01 0.43 -0.36 -0.29 0.5 -0.12 0.1 -0.57 -0.42 -0.49 -0.44 -0.52 0.01 0.08 0.73 -0.56 -0.68 0.26 -0.39 -0.38 -0.7 0.15 -0.6 0.77 -1.01 -0.7 -0.12 -0.74 -0.68 -0.79 -0.42 -0.44 -0.22 0.57 -0.47 -0.41 0.57 0.26 0.48 -0.6 -0.13 -0.46 -0.37 -0.64 -1.18 -1.04 -0.79
2.15 0.29 - -1.13 -5.64 1.06 2.04 -0.06 0.71 -0.89 -0.41 0.08 0.27 1.34 -0.06 -0.04 0.3 0.19 1.34 0.12 0.07 1.47 0.08 -0.69 0.65 -1.55 -2.08 -0.78 -0.89 -1.51 0.46 -2.48 -0.42 -1.89 -2.26 -0.81 -2.29 -1.68 -2.58 -2.61 0.02 -1.42 -0.52 0.78 -1.52 -0.5 -0.78 -0.1 -0.58 0.24 0.11 -0.12 -0.2 -0.61
0.46 0.41 0.01 -4.54 0.13 0.8 0.83 0.01 1.16 0.5 0.75 1.03 -0.18 0.54 -0.05 0.12 -0.07 -0.21 -0.2 -0.3 -0.12 0.64 -0.21 -1.35 0.5 0.14 -0.74 -0.86 -0.2 -0.63 -0.08 -0.52 -1.51 -0.09 -1.5 0.44 -0.34 0.68 -0.13 -0.34 0.13 -0.77 -0.7 0.49 -0.17 -0.35 -0.93 -0.44 -0.84 -0.42 -0.61 -0.12 0.06 0.18
0.72 0.51 1.7 -3.44 0.15 0.59 0.96 0.53 0.75 0.62 0.75 0.59 -0.8 -0.21 -0.1 -0.08 -0.17 -0.23 0.13 -0.44 -0.46 0.75 -0.51 -0.3 -0.19 -0.77 -1.17 -0.66 -0.09 -0.53 1.18 -0.09 -0.51 0.67 -0.41 0.34 -0.76 -0.35 -0.75 -0.49 0.08 -0.89 -0.58 0.0 -0.49 -0.02 -0.68 -0.42 -0.88 -0.59 -0.6 -0.58 -0.85 -0.82
0.41 0.34 -1.47 -4.08 -0.57 0.75 1.28 0.45 1.16 1.03 0.89 1.13 -0.25 0.22 -0.29 -0.38 -0.3 -0.46 -0.44 -0.48 -0.17 0.63 0.03 -0.32 -0.21 -0.17 -0.45 -0.78 0.17 -0.62 0.71 0.29 -0.65 0.53 -0.61 0.31 -0.63 0.01 -0.36 0.07 -0.37 -0.9 -0.66 -0.06 0.08 -0.44 -1.03 -0.15 -0.86 -0.42 -0.41 -0.28 -0.35 -0.33
1.03 1.27 0.31 -4.17 -0.24 0.95 1.51 0.51 1.22 0.85 0.99 0.65 -0.3 0.24 0.05 -0.14 -0.2 -0.2 -0.29 -0.09 -0.08 0.36 0.08 -0.34 -0.61 -0.44 -0.55 -0.56 -0.33 -0.5 -0.29 -0.8 -0.43 -0.03 -0.45 -0.46 -0.45 -0.17 -0.38 -0.48 -0.32 -0.62 -0.75 -0.39 -0.16 -0.57 -0.78 -0.5 -0.85 -0.45 -0.33 -0.21 -0.33 -0.63
0.57 0.14 -3.39 -4.39 -1.55 0.65 0.89 0.44 0.33 0.04 -0.07 0.62 -0.39 -0.35 0.22 -0.1 0.33 0.14 0.03 0.03 0.17 -0.37 0.04 1.2 0.04 -0.41 -0.58 -0.05 -0.32 -0.49 0.32 -0.86 1.13 0.55 1.16 -1.07 -0.7 -0.81 -0.73 -0.7 0.26 -0.39 -0.49 0.27 -0.48 -0.09 -0.46 -0.31 0.19 0.08 0.02 -0.57 -0.32 -0.22
0.38 0.55 -1.96 -3.89 -0.64 1.03 1.91 0.42 0.89 0.71 0.9 0.76 -1.16 0.81 -0.35 -0.59 0.1 -0.38 -0.19 -0.59 -0.87 1.07 -0.25 0.07 -0.5 -0.46 -0.37 -0.58 -0.14 -0.35 0.65 0.14 -0.04 1.15 -0.15 -0.8 -0.79 -0.55 -0.82 0.13 -0.59 -0.42 -0.6 -0.19 -0.02 -0.72 -0.48 -0.37 -0.64 -0.46 -0.4 -0.93 -0.88 -1.11
0.3 0.98 -0.45 -3.47 -0.54 0.88 1.59 0.48 1.16 0.9 1.03 1.08 -0.64 0.65 -0.51 -0.47 -0.34 -0.65 -0.01 -0.36 -0.53 0.93 -0.04 0.23 -0.38 -0.78 -0.26 -0.48 -0.05 -0.23 0.4 -0.15 -0.35 1.08 -0.32 -1.09 -1.0 -0.74 -0.94 -0.04 -0.61 -0.53 -0.69 -0.37 -0.2 -0.67 -0.6 -0.5 -0.56 -0.39 -0.36 -0.84 -0.66 -1.07
0.82 0.86 -1.46 -4.18 -1.32 1.06 1.4 0.72 1.2 1.93 1.44 1.3 -1.08 0.11 -0.07 0.1 0.02 0.16 0.44 -0.68 -0.26 -0.3 0.34 -0.48 -0.55 -1.21 -0.84 -0.43 -0.9 0.02 0.17 0.85 -0.39 -0.49 -0.77 -0.88 -2.01 -1.36 -1.27 0.34 -1.21 -1.24 -1.41 -0.45 -0.81 -0.42 -1.43 -0.8 -0.57 0.67 0.39 -1.55 -1.54 -1.53
0.71 0.13 -1.51 -5.67 -6.39 0.89 1.31 0.27 -0.01 -0.55 -0.48 -0.47 -0.62 -0.18 -0.08 0.02 0.22 0.02 0.52 0.08 0.02 0.81 -0.09 0.65 -0.14 -0.66 -0.64 0.33 -0.38 -0.39 0.95 0.09 0.9 0.54 0.75 -1.81 -0.41 -1.08 -0.97 -0.65 0.44 -0.29 -0.05 0.02 -0.6 -0.09 -0.01 -0.14 -0.27 0.11 0.39 -0.35 -0.22 -0.69
-0.64 0.32 -6.82 -3.27 -4.62 1.48 2.0 0.78 2.03 1.32 2.32 1.31 -0.39 -0.96 -0.25 -0.82 -1.15 -0.66 -1.2 -1.0 -1.07 -0.41 0.22 -1.17 0.36 -1.4 -1.39 -1.42 -0.39 -1.28 -0.35 1.29 -2.09 0.62 -2.24 -0.35 -2.42 -1.27 -2.19 -0.41 -0.99 -1.37 -1.48 0.31 -0.14 -0.99 -1.69 -0.57 -2.51 -1.28 -0.99 0.36 0.96 0.58
2.34 0.13 -1.18 0.98 - -2.43 -0.42 -0.31 0.63 -1.48 1.16 - -0.96 -1.44 - -2.16 -1.96 - - - -0.55 - 0.72 -3.42 0.9 -0.15 -0.98 1.19 -0.38 0.97 0.49 1.56 -0.58 -2.56 -0.65 -0.38 -1.27 -0.44 0.17 1.31 0.69 -0.45 0.28 0.97 0.55 0.86 1.37 -0.56 0.02 -1.34 -0.06 -0.68 -1.12 -0.73
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0.59 -0.36 -4.44 -5.22 0.6 0.38 1.93 0.91 0.68 1.35 1.27 0.64 -1.72 0.75 0.24 0.49 0.26 0.29 0.71 0.1 -0.01 1.41 -0.91 -2.26 -0.91 -0.53 0.27 -0.47 -0.77 -0.42 -2.46 -0.06 -1.51 -1.7 -1.68 -0.17 -0.59 -0.81 -0.43 0.3 -0.1 0.41 -0.54 -0.62 -0.04 -0.19 -0.26 -0.48 -0.41 -0.64 -0.84 -1.15 -1.23 -1.28
0.48 0.93 -0.59 -4.56 -0.74 0.54 0.58 1.21 0.78 0.85 1.18 0.68 -0.62 0.23 -0.07 -0.65 -0.02 -0.15 -0.17 -0.07 -0.2 0.32 -0.33 -0.39 -0.57 -0.94 -0.85 -0.27 0.62 -0.2 0.01 -0.42 -0.23 0.66 -0.32 -0.15 -1.3 -0.18 -1.18 0.0 -0.43 -0.32 0.05 -0.3 0.52 -0.37 -0.11 0.37 -0.41 -0.69 -0.36 -0.26 -0.15 -0.68
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1.05 0.96 -1.41 -4.93 -2.68 0.55 0.83 0.35 0.21 0.26 -0.06 0.66 -1.23 0.65 -0.18 -0.05 0.0 0.07 0.44 0.1 -0.01 1.13 0.0 -0.11 0.58 -1.33 -1.45 0.28 -0.34 0.09 0.19 -1.03 0.49 -0.54 0.19 -2.29 -0.86 -1.57 -1.09 -0.3 0.5 -0.37 -0.09 0.41 -0.72 0.03 0.24 0.04 -0.38 0.23 0.27 -0.17 -0.15 -0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.