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Heatmap: Cluster_170 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.38 -0.93 - 0.32 1.02 -2.27 -3.67 -0.22 - -1.39 -1.55 -0.34 - 0.24 - -1.68 -0.87 -1.08 - - - - -2.38 -0.17 -1.8 2.05 0.1 -2.36 0.64 -2.37 -1.07 -0.72 -0.89 0.17 -0.85 2.14 1.36 2.94 1.94 0.52 -0.7 -2.04 0.01 -0.42 1.49 -0.12 -0.81 0.85 -0.61 -1.89 -1.18 -0.72 -0.03 -0.19
-0.05 -1.74 -2.04 -5.68 0.9 -0.01 -0.18 -0.5 0.42 -0.48 -0.51 0.71 -1.84 0.53 -0.91 -0.75 -1.0 -0.48 -1.51 1.24 1.01 0.1 -1.28 -1.5 -0.47 1.14 1.07 -1.65 -1.69 -1.1 0.72 0.59 -0.54 -1.79 -0.54 0.38 0.73 0.75 1.1 -0.4 0.01 1.4 -0.87 -0.07 0.41 0.27 -0.66 -1.73 -0.46 0.36 -0.08 0.23 -0.22 -0.13
0.3 1.05 1.67 -3.97 0.22 0.44 -0.49 -0.0 0.19 -0.2 -0.07 0.17 -0.96 -0.12 -0.33 -0.22 -0.32 -0.14 0.95 -0.06 -0.02 0.3 -0.39 -0.73 -1.19 0.36 -0.08 -0.1 0.3 0.03 -0.63 -0.46 -0.07 -0.06 -0.13 -0.57 0.29 0.74 0.37 0.46 -0.9 0.04 0.08 -0.7 0.45 -0.83 0.21 0.28 -0.47 -0.48 -0.23 -0.48 -0.69 -1.22
0.42 0.91 1.79 -1.55 0.28 0.24 -0.47 -0.39 -0.04 -0.44 -0.1 -0.21 -0.55 -0.96 -0.47 -0.39 -0.36 -0.32 -0.31 -0.31 -0.1 -0.77 0.04 0.08 -0.71 0.26 0.32 0.13 0.06 0.1 0.01 -0.26 0.18 0.14 0.23 -0.37 0.51 0.44 0.26 0.41 -0.82 0.24 0.1 -0.65 0.31 -0.79 0.25 0.11 -0.52 -0.11 0.07 -0.18 -0.36 -0.61
-0.19 0.07 0.2 -5.75 0.81 0.01 0.1 -0.0 -0.1 -0.17 -0.37 -0.02 -1.25 -0.16 0.28 0.12 0.19 0.12 0.6 -0.23 -0.19 0.27 -0.2 0.12 -0.44 0.34 0.24 -0.02 0.11 0.03 -0.32 -0.44 0.26 0.05 0.15 -0.76 0.44 0.39 0.33 0.22 -0.01 0.29 -0.03 -0.3 0.26 -0.2 0.1 -0.03 -0.16 -0.21 -0.09 -0.17 -0.14 -0.32
1.29 -0.56 0.22 -0.09 2.19 1.01 -0.88 -2.11 -1.73 -1.36 -1.94 -0.91 -3.57 -1.08 -2.29 -1.29 -2.23 -2.59 -1.94 -3.66 -3.49 -2.09 -0.14 -1.05 -4.91 0.56 -0.5 2.08 -1.12 0.79 -3.68 -1.14 0.94 -1.94 0.07 -1.18 2.15 0.2 1.62 0.31 -0.48 0.88 1.5 -2.85 -0.64 -1.88 1.36 0.55 -1.74 -1.24 -0.78 -0.67 -0.8 -0.78
0.35 0.19 -1.38 -3.96 0.09 -0.19 -0.27 -0.24 -0.44 -0.5 -0.49 -0.42 -1.23 -1.57 -0.92 -0.83 -0.95 -0.88 -0.53 -0.34 -0.28 0.28 -0.31 0.29 -1.18 0.73 0.55 0.02 0.48 0.02 -0.55 0.07 0.49 0.46 0.86 -0.21 0.94 1.02 0.93 1.04 -0.36 0.72 -0.03 -0.49 1.15 -0.29 0.3 0.31 0.11 -0.55 -0.36 -0.47 -0.69 -0.82
-0.08 -2.04 -1.76 -5.17 0.29 -0.39 -0.97 -1.47 -1.54 -3.78 -1.64 -1.59 -1.69 -2.6 -2.06 -0.08 -1.15 -1.92 - -2.29 -1.13 0.33 -0.24 0.07 -0.65 0.7 0.47 0.82 -0.12 0.57 0.05 -0.37 0.71 0.3 0.63 -1.83 1.31 0.56 1.52 1.03 0.66 1.02 0.88 0.07 0.81 -0.41 0.85 0.57 -0.04 0.03 0.12 0.4 0.21 0.41
0.15 0.61 0.48 -2.54 0.42 0.16 -0.81 0.01 0.03 -0.24 -0.13 -0.35 -0.89 -0.39 -0.51 -0.69 -0.72 -1.12 0.09 -0.27 -0.51 -0.19 -0.55 -0.17 -0.42 1.09 0.44 -0.01 -0.14 -0.09 -0.77 -1.11 0.01 -0.09 -0.06 -0.44 1.28 1.04 1.29 0.35 0.13 0.5 -0.01 -0.17 0.49 0.03 0.17 -0.11 -0.58 -0.72 -0.39 -0.37 -0.07 -0.22
-0.24 0.13 0.54 -4.3 0.62 -0.07 0.34 0.09 0.09 -0.27 -0.1 0.26 -1.12 0.39 -0.18 -0.14 -0.2 -0.25 0.65 0.2 -0.03 0.63 -0.47 -0.08 -0.48 0.43 0.27 -0.05 0.09 -0.22 -1.04 -0.92 0.1 -0.3 0.19 -1.41 0.77 0.74 0.6 0.29 0.09 0.61 -0.2 -0.26 0.24 -0.17 0.08 -0.32 -0.53 -0.5 -0.24 -0.28 -0.22 -0.55
-1.62 -1.38 -2.91 -1.54 0.5 -0.2 0.08 -0.46 0.36 -0.99 -1.28 0.46 0.05 0.12 -2.09 -1.85 -0.66 -1.15 - -0.34 0.18 0.24 0.64 -2.1 0.72 0.89 0.43 -0.46 -0.46 -0.45 0.52 -0.4 -2.31 -2.19 -3.7 -0.54 0.98 0.92 1.46 -0.77 1.53 0.15 -0.14 1.03 0.92 1.17 -0.73 -0.21 0.29 0.35 0.2 -2.32 0.54 0.11
-0.36 0.05 0.33 -3.85 0.23 0.35 -0.48 -1.05 -0.83 -1.21 -0.98 -0.28 -1.22 -1.49 -0.14 -0.6 -0.19 -0.49 0.71 -0.12 -0.48 -0.54 0.12 -0.26 -0.03 0.98 0.4 -0.0 -0.27 -0.21 -0.57 -1.58 -0.09 -0.45 -0.28 -0.67 0.94 1.0 0.78 0.55 0.74 0.67 0.03 0.28 0.37 0.61 -0.01 -0.24 0.08 0.06 0.27 0.1 0.27 0.17
0.4 0.08 -1.45 -2.05 0.01 0.23 -0.27 0.79 0.48 0.35 0.17 0.59 -0.89 0.59 0.08 -0.03 -0.08 -0.09 -0.37 0.52 0.3 0.23 -0.28 -1.31 -1.76 0.71 -0.44 -0.0 0.3 0.11 -1.65 -1.13 -0.46 -0.68 -0.34 -1.21 0.73 0.74 0.9 0.7 -1.69 0.66 0.39 -1.25 0.79 -1.84 0.5 0.62 0.36 -0.26 -0.5 -0.81 -1.06 -0.82
0.02 1.01 -6.0 -3.97 -0.09 -0.11 -0.52 -1.08 -0.61 -0.75 -0.78 -0.14 -0.81 -1.55 0.26 -0.47 0.53 0.56 -0.75 0.53 0.45 -2.59 0.45 -2.18 -1.87 1.23 0.44 0.28 -0.02 0.51 -3.14 -1.47 -2.02 -2.19 -2.15 0.0 1.0 1.16 1.32 0.81 -1.81 0.57 0.33 -1.37 0.68 -1.53 0.18 0.44 0.05 -0.26 -0.46 0.66 1.02 0.93
0.7 -1.14 -1.89 -0.71 1.79 -0.19 0.08 -1.88 -0.94 -1.55 -1.63 -1.0 -1.77 -0.95 -1.61 1.22 -1.58 -1.57 - -1.71 -0.53 -1.89 -1.63 -0.98 -0.24 2.29 0.23 -0.97 -1.0 -0.82 -1.32 -0.95 -0.36 -0.28 -0.56 -2.24 2.18 2.19 2.74 0.21 -0.71 -0.46 -0.7 -0.53 -0.2 -0.85 -1.21 -1.01 -1.61 -1.03 -1.11 -0.96 -0.24 -0.01
0.2 -0.14 0.87 -3.37 0.09 0.09 -0.25 -0.33 -0.17 -0.29 -0.28 0.35 -0.65 0.14 -1.03 -1.19 -0.94 -1.22 -0.89 0.07 -0.2 0.18 -0.15 -0.67 -1.59 0.84 0.69 -0.02 0.38 -0.0 -2.28 0.44 -0.29 0.07 0.11 -0.24 0.65 0.92 0.72 0.94 -1.05 0.88 0.23 -1.15 1.14 -1.18 0.16 0.34 0.04 -0.02 -0.11 -0.16 -0.44 -0.41
-0.43 -1.38 -4.4 -5.17 1.07 0.13 0.26 -0.1 0.42 -0.08 -0.18 0.41 0.49 0.45 -0.62 -0.48 -0.29 -0.47 0.37 0.29 -0.05 0.59 -0.54 0.16 -1.4 1.33 -0.08 -0.25 -0.28 -0.55 -1.3 -0.56 0.12 -0.06 0.29 -0.31 1.21 1.36 1.33 0.2 -0.79 0.45 -0.35 -1.24 0.21 -1.13 -0.12 -0.27 0.06 -0.72 -0.89 -0.85 -0.61 -0.53
-0.48 -2.3 -1.7 -2.76 -0.61 -0.37 -0.93 0.26 0.88 0.47 0.29 1.44 -0.11 1.32 -3.27 -3.21 -2.87 -3.52 -0.78 1.24 1.1 0.5 -2.05 -4.16 -2.96 1.52 1.26 -0.95 -1.45 -1.13 -1.6 0.53 -1.49 -2.23 -2.1 -0.25 1.46 2.1 1.66 0.89 -1.39 1.98 -0.77 -1.37 0.97 -1.73 -0.34 -1.17 -2.66 -3.44 -3.08 -3.47 -3.12 -3.17
0.48 0.58 0.52 -4.71 0.09 0.16 -0.31 0.28 -0.49 0.15 0.15 -0.27 -0.92 -1.76 -0.44 -0.56 -0.48 -0.55 0.03 -0.37 -0.49 0.29 -0.1 0.14 -0.7 1.06 -0.29 0.09 0.13 -0.12 -0.72 -0.7 0.06 0.34 -0.05 0.27 1.12 1.17 1.09 0.05 -0.96 0.04 -0.01 -0.68 0.19 -0.94 -0.06 0.07 -0.38 -0.29 -0.1 0.0 0.12 -0.1
-0.27 -0.61 0.2 0.32 -0.06 -0.07 -0.61 -0.71 -0.07 -0.39 -0.84 0.19 -0.67 -0.13 -1.47 -1.43 -0.81 -1.24 -1.47 0.34 0.02 0.85 -1.11 -2.08 -1.09 1.78 1.05 -0.53 -0.77 -0.83 -2.51 -1.06 -1.51 -1.38 -1.73 -0.12 1.81 1.69 1.78 0.47 0.76 1.26 -0.47 -0.25 0.83 0.18 -0.23 -0.82 -1.12 -1.49 -1.68 -0.93 -0.35 -0.46
-0.36 -0.34 -0.05 -3.22 0.44 -0.03 0.02 -0.38 -0.21 -0.7 -0.22 -0.33 -0.63 -0.12 -0.49 -0.47 -0.27 -0.78 -0.52 -0.33 -0.52 0.44 -0.4 -1.04 -0.88 1.42 0.26 -0.16 -0.08 -0.27 -1.36 -1.44 -0.65 -0.89 -0.83 -0.94 1.69 1.91 1.65 0.45 -0.16 0.95 0.11 -0.36 0.78 -0.6 0.09 -0.1 -0.12 -0.51 -0.89 -0.76 -0.31 -0.53
0.65 -0.99 - 0.74 0.72 -0.24 -0.64 0.62 - - -0.14 - - -0.51 - -0.0 -0.04 - 1.7 -0.82 - 0.61 0.73 -1.33 0.47 1.14 - -2.72 1.11 -1.75 -0.47 -0.11 -2.81 -0.43 0.17 0.65 1.19 2.83 1.23 -1.3 -0.65 0.58 -0.84 0.98 0.44 -0.85 0.15 0.2 - -1.91 -0.14 -0.93 -2.74 -1.57
0.17 0.77 1.38 -2.48 0.44 0.11 -0.35 -0.44 -0.23 -0.53 -0.44 -0.48 -1.23 -0.02 -0.26 -0.24 -0.47 -0.32 0.62 0.03 0.17 -0.38 -0.16 -0.42 -0.78 0.27 0.14 0.13 0.04 0.11 -0.52 -0.48 0.32 0.02 0.18 -0.68 0.61 0.23 0.55 0.4 -0.26 0.58 0.28 -0.31 0.41 -0.51 0.54 0.34 -0.64 -0.33 0.05 -0.21 -0.53 -0.76
-0.63 - -1.38 1.5 0.58 0.24 -1.37 -2.25 - -1.45 -1.97 - -0.15 0.56 -0.95 0.08 0.17 0.66 -0.72 -2.66 -1.46 0.86 -1.17 -2.95 0.31 1.51 0.24 -1.7 0.81 -1.05 -2.8 -2.11 -1.67 -1.08 -3.18 0.32 1.74 2.3 1.96 0.49 -0.18 0.2 0.14 0.42 0.88 -0.24 -0.69 -0.81 -0.36 -0.47 -1.77 -0.16 -0.89 -0.79
0.65 1.48 1.87 -2.46 0.47 0.07 -0.83 -1.16 -0.63 -1.0 -0.49 -0.39 -1.67 -0.35 -0.24 -0.81 -0.52 -0.93 0.12 -1.14 -0.73 -0.22 -0.62 -0.53 -1.36 0.95 -0.39 -0.07 -0.04 -0.37 -0.93 -0.37 0.25 0.22 0.08 -0.85 1.27 1.42 1.08 0.22 -0.71 0.34 0.23 -0.89 0.61 -0.97 0.21 0.2 -0.99 -0.73 -0.08 -0.16 -0.18 -1.07
0.13 0.09 -0.14 -3.81 0.78 0.6 0.01 -0.27 -0.06 -0.34 -0.24 -0.12 -0.16 -0.36 0.83 0.78 0.86 0.69 0.61 -0.11 0.05 -0.37 -0.25 -0.06 -1.16 -0.23 0.08 -0.28 -0.49 -0.11 -0.2 -0.0 0.45 -0.35 0.26 -0.91 -0.12 -0.28 -0.0 0.43 -0.92 0.26 -0.03 -0.92 0.4 -0.8 -0.05 0.06 0.63 0.01 -0.24 -0.53 -0.29 -0.15
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0.28 1.21 1.91 0.46 0.87 -0.45 0.34 -2.11 -2.25 -1.4 -4.52 -2.3 -4.48 0.79 0.11 -0.05 -0.12 0.35 -3.27 -5.21 - - -0.75 -1.25 -3.83 0.53 0.8 1.04 -2.24 -1.15 -3.55 -1.13 1.35 -1.39 -0.15 -4.02 2.1 -0.95 0.88 -1.22 -0.32 2.14 1.34 -3.57 -0.38 -4.45 1.77 -0.38 -1.48 -1.43 -1.49 -0.25 -0.83 -0.94
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-2.9 - - -2.0 -1.21 -1.15 -1.21 -0.16 - - - - -1.2 -0.84 -0.82 - - - - - - -0.13 -0.39 0.01 -1.92 1.24 2.46 1.68 -1.74 1.09 -0.32 -0.87 0.59 -0.62 0.79 -0.66 2.35 0.06 3.03 0.93 -0.16 1.9 -1.0 -2.43 -0.83 -0.34 0.49 -1.4 -1.35 -0.25 -1.07 -0.51 -1.21 -
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0.25 -0.42 0.79 -2.62 -0.41 -0.35 -1.85 -0.59 -0.77 -0.66 -1.28 -0.57 -0.88 -0.64 -1.73 -1.39 -1.29 -2.23 -1.95 -0.65 -1.27 -1.23 0.12 0.22 -1.18 1.12 -0.43 0.34 0.51 0.34 -1.21 0.35 0.64 0.5 0.22 -3.05 1.21 1.29 1.15 1.34 -0.49 0.78 0.59 0.12 0.77 -1.44 0.64 0.86 -0.68 -0.21 -0.13 -0.09 0.21 0.22
0.34 0.66 1.15 -1.56 1.38 0.44 0.01 -0.36 -0.16 -0.1 -0.85 -0.08 -2.46 0.23 0.7 0.63 0.29 0.15 0.83 -0.58 -0.29 0.22 -0.93 -1.0 -2.13 1.29 -1.09 -0.31 -1.0 -0.84 -1.64 -1.04 -0.78 -1.35 -0.89 -0.47 1.43 1.88 1.39 -0.07 -0.55 0.01 -0.66 -1.67 -0.2 -0.79 -0.25 -0.57 -0.98 -1.48 -1.09 -0.45 -0.17 -0.62
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.