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Heatmap: Cluster_77 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.77 0.76 -2.16 -5.66 0.8 0.54 0.58 0.54 0.43 0.76 0.63 0.49 -0.78 0.64 0.6 0.75 0.91 0.83 1.18 -0.23 0.0 0.41 -0.14 0.03 -1.5 -0.41 -0.7 -0.2 -0.57 -0.1 -0.83 -1.2 0.35 -0.55 0.28 -2.41 -0.33 -0.67 -0.31 0.05 -1.64 -0.38 -0.37 -1.46 -0.38 -1.93 -0.13 -0.17 0.02 -0.07 -0.0 -0.34 -0.71 -0.79
0.27 0.47 0.0 -4.25 1.01 0.38 0.37 -0.39 -0.15 -0.78 -0.41 -0.17 -0.62 -0.03 0.42 0.35 0.25 0.37 1.28 0.07 0.06 -0.72 -0.07 0.36 -0.61 -0.21 -0.36 -0.09 -0.04 -0.23 0.3 -0.28 0.61 0.26 0.35 -0.76 -0.14 -0.07 -0.14 -0.32 -0.47 -0.34 -0.08 -0.52 -0.1 -0.59 -0.06 -0.08 0.08 0.24 0.2 -0.13 -0.25 -0.52
0.35 0.94 0.58 -4.53 0.81 0.32 0.39 0.34 0.26 0.18 0.17 0.17 -1.49 -0.31 0.87 0.79 0.81 0.85 1.12 -0.09 -0.05 0.11 -0.26 0.02 -1.49 -0.32 -0.49 -0.1 0.25 -0.17 -0.89 -0.52 0.09 0.19 0.07 -1.96 -0.43 0.24 -0.38 -0.12 -1.33 -0.13 -0.05 -1.32 0.04 -1.59 -0.08 0.05 -0.17 -0.09 0.0 -0.52 -0.83 -1.11
0.47 0.43 0.97 -3.53 0.69 0.4 0.28 0.53 0.15 0.58 0.52 0.35 -1.07 0.28 0.21 0.23 0.22 0.17 0.51 0.64 0.54 0.78 -0.61 -0.77 -1.7 -0.17 -0.1 -0.05 -0.07 -0.16 -1.29 -0.71 -0.12 -0.39 -0.19 -2.07 0.27 0.22 0.17 0.36 -1.26 0.76 0.19 -1.32 0.21 -1.43 0.35 -0.06 -0.71 -0.4 -0.3 -0.63 -1.02 -1.59
0.37 0.38 -1.05 -5.04 1.02 0.55 0.97 0.74 0.5 0.7 0.46 0.55 -1.37 0.92 1.1 1.05 0.92 0.95 1.63 0.25 0.33 1.07 -0.52 -0.24 -0.63 -1.32 -1.76 -0.25 -0.71 -0.39 -1.27 -1.17 0.04 -0.65 -0.03 -3.35 -0.92 -1.34 -1.05 -1.05 -1.2 -0.82 -0.65 -0.97 -1.31 -1.62 -0.32 -0.53 -0.31 -0.38 -0.36 -0.21 -0.19 -0.18
0.15 1.04 1.2 -4.6 1.33 0.19 -0.24 -0.23 -0.03 -0.66 -0.3 -0.16 -1.63 -0.23 0.61 0.64 0.48 0.61 1.77 -0.2 0.05 -0.53 -0.63 0.31 -0.73 -0.62 -0.74 -0.28 -0.32 -0.54 0.28 -0.6 0.81 0.37 0.53 -0.89 -0.35 -0.74 -0.61 -0.55 -0.4 -0.09 -0.1 -0.57 -0.4 -0.52 0.06 -0.15 -0.67 -0.5 -0.18 -0.39 -0.44 -0.83
0.81 0.78 1.12 -3.92 0.92 0.71 0.67 0.51 -0.01 0.34 0.02 0.22 -0.57 -0.26 0.34 0.26 0.36 0.29 0.48 -0.06 -0.2 0.5 -0.36 -0.48 -0.95 0.0 -0.0 -0.17 -0.03 -0.23 -1.1 -0.64 -0.28 -0.46 -0.24 -0.72 0.07 0.0 0.08 0.14 -0.73 0.07 -0.08 -0.89 0.2 -0.89 -0.04 -0.15 -0.06 -0.24 -0.21 -0.63 -0.67 -0.97
0.37 -0.5 -1.2 -5.7 0.73 0.55 0.39 0.0 0.58 -0.13 -0.07 0.45 -0.67 0.29 0.46 0.5 0.52 0.45 0.21 -0.3 -0.13 0.54 -0.08 0.23 -0.68 -0.47 -0.07 -0.37 -0.37 -0.33 0.59 0.42 0.58 0.22 0.67 -0.74 -0.61 -0.38 -0.31 0.03 -0.56 -0.12 -0.33 -0.59 0.1 -0.55 -0.4 -0.1 0.22 0.17 0.1 -0.57 -0.53 -0.57
0.8 1.18 1.21 -3.59 0.8 0.69 0.45 0.06 0.51 -0.18 -0.08 0.48 -1.11 -0.05 0.64 0.5 0.62 0.51 0.92 0.18 0.19 0.15 -0.37 -0.16 -1.2 -0.17 -0.58 -0.25 -0.09 -0.44 -0.72 -0.76 0.1 -0.01 0.02 -1.32 -0.15 -0.0 -0.16 -0.27 -0.89 -0.19 -0.23 -0.96 -0.2 -1.17 -0.2 -0.16 -0.36 -0.36 -0.21 -0.54 -0.7 -1.06
1.0 0.88 0.26 -4.09 1.44 0.3 0.24 1.09 0.49 0.69 0.63 0.36 -1.41 0.58 0.73 0.73 0.6 0.74 1.42 0.4 0.3 0.08 -0.46 -0.27 -1.71 -1.3 -0.97 0.06 -0.01 -0.15 -1.57 -0.49 0.04 -0.21 -0.12 -3.27 -0.94 -1.02 -1.28 -0.5 -1.69 -0.26 -0.12 -1.79 -0.51 -2.03 0.1 -0.19 -0.32 -0.24 -0.11 -0.65 -1.05 -1.33
0.59 -0.15 -0.38 -2.79 1.52 0.77 0.52 0.58 0.45 0.31 0.2 -0.01 -1.25 0.6 1.1 1.03 0.96 1.07 0.34 -0.08 0.2 1.09 -0.73 -0.33 -2.05 -0.92 -1.5 -0.66 -0.28 -0.3 -0.65 -0.34 0.1 -0.39 0.28 -2.68 -0.59 -0.46 -0.46 -0.67 -2.06 -0.61 -0.54 -1.91 -0.68 -2.38 -0.4 -0.23 -0.62 0.69 1.13 0.06 -0.76 -1.86
0.3 0.78 1.01 -4.7 1.16 0.24 0.4 0.34 0.39 0.23 0.21 0.36 -0.99 -0.09 0.17 0.12 0.15 0.18 0.79 0.28 0.33 0.41 -0.49 -0.09 -0.96 -0.3 -0.27 -0.18 -0.02 -0.36 -0.59 -0.25 0.25 0.16 0.17 -0.99 -0.11 -0.07 -0.2 -0.08 -0.42 0.22 -0.12 -0.61 -0.04 -0.63 0.03 -0.16 -0.64 -0.48 -0.3 -0.43 -0.68 -0.98
-0.26 -0.26 1.43 -2.13 0.78 1.09 0.79 0.07 0.12 0.42 0.29 0.17 -0.6 0.22 0.73 0.4 0.85 0.43 0.58 -0.15 -0.16 0.77 -0.88 -0.92 -1.82 -0.17 0.05 -0.38 -0.58 -0.33 -2.43 -1.3 -0.66 -0.95 -0.5 -1.92 0.19 0.13 0.19 0.73 -1.17 1.09 -0.18 -1.33 0.45 -1.64 -0.08 -0.47 0.4 -0.55 -0.92 -0.69 -0.44 -0.46
0.29 0.8 1.09 -2.58 0.6 0.38 0.5 0.11 0.16 0.48 0.25 0.29 -1.13 1.09 0.05 0.06 0.09 0.07 0.58 0.19 0.18 0.26 -0.47 -0.37 -1.28 -0.21 -0.48 0.08 0.17 -0.23 -1.4 -0.73 0.16 0.08 -0.06 -1.3 0.16 0.08 0.19 -0.09 -1.23 0.27 0.33 -1.41 0.23 -1.54 0.4 0.34 -0.38 -0.54 -0.39 -0.31 -0.71 -1.16
0.31 0.94 0.73 -3.78 0.99 0.83 0.38 0.4 0.19 0.25 0.16 0.07 -0.78 0.22 0.63 0.58 0.63 0.64 1.01 0.25 0.33 0.11 -0.48 -0.02 -1.59 -0.6 -0.96 -0.13 -0.17 -0.18 -0.37 -0.38 0.32 -0.14 0.21 -1.79 -0.5 -0.66 -0.53 -0.35 -0.93 -0.2 0.0 -1.04 -0.33 -1.2 0.05 0.07 0.02 -0.02 -0.38 -0.62 -0.57 -0.6
0.46 0.96 0.75 -4.31 1.78 0.71 0.0 0.09 -0.31 -0.07 -0.43 -0.34 -1.31 -0.08 1.05 1.08 0.96 1.04 1.62 0.06 0.25 -0.26 -0.43 -1.11 -1.81 -0.07 -0.8 -0.09 -0.22 -0.01 -2.85 -2.11 -0.9 -1.27 -0.94 -0.99 0.34 -0.09 0.12 -0.37 -1.52 0.11 -0.22 -1.55 -0.34 -1.67 0.07 -0.13 -0.29 -0.04 0.01 -0.28 -0.4 -0.89
-0.33 -0.16 -0.21 -5.34 2.36 0.68 0.07 1.2 0.48 1.02 0.88 0.41 -1.67 0.54 0.63 0.7 0.57 0.43 1.09 0.05 0.06 1.66 -1.11 0.43 -1.98 -0.73 -1.51 -0.67 -0.39 -0.75 -1.11 -1.75 0.28 -0.4 0.48 -3.35 -0.32 -0.58 -0.21 -0.74 -2.12 -0.5 -0.68 -1.96 -0.93 -2.31 -0.38 -0.57 -0.63 -0.58 -0.38 -1.01 -0.99 -1.56
1.26 1.7 0.79 -4.13 2.14 -0.33 -0.52 0.55 -0.74 1.46 0.85 -0.7 -2.65 -0.21 0.38 1.24 0.46 0.4 1.11 -0.97 -1.0 0.55 -1.07 -0.98 -2.15 -0.29 -0.49 -0.27 -0.73 -0.14 -2.49 -2.08 -0.14 -1.05 0.52 -0.48 -0.03 -0.28 0.04 0.29 -1.23 -0.03 -0.33 -1.86 -0.24 -0.98 -0.08 -0.35 -0.82 -1.15 -0.92 -1.2 -1.35 -1.31
1.18 1.52 -0.3 -4.22 1.24 0.84 0.09 0.69 -0.04 0.73 0.85 0.17 -0.85 0.13 0.91 0.87 0.85 0.79 0.44 0.69 0.5 0.15 -0.52 -1.51 -1.37 -0.32 -1.03 -0.27 -0.24 -0.22 -1.89 -1.96 -0.78 -1.15 -0.72 -1.34 -0.35 -0.31 -0.34 -0.13 -1.17 0.07 -0.06 -1.3 -0.36 -1.28 0.03 -0.03 -0.37 -0.0 -0.2 -0.76 -1.07 -1.51
0.61 1.16 1.12 -4.03 1.08 0.89 0.63 0.12 0.44 0.13 -0.09 0.41 -0.63 -0.17 0.66 0.63 0.67 0.67 0.94 0.25 0.28 0.08 -0.26 -0.73 -1.37 -0.38 -0.2 -0.29 -0.14 -0.24 -1.16 -0.44 -0.35 -0.65 -0.37 -1.56 -0.71 -0.5 -0.46 -0.08 -1.25 -0.03 -0.22 -1.2 0.07 -1.48 -0.21 -0.07 0.02 0.05 -0.13 -0.55 -0.75 -0.9
0.79 1.07 0.56 -4.45 1.13 0.52 0.53 0.59 0.54 0.72 0.6 0.55 -0.89 0.28 0.77 0.7 0.67 0.62 1.31 0.54 0.6 0.8 -0.55 -0.95 -1.56 -0.4 -0.77 -0.28 -0.47 -0.34 -1.72 -1.42 -0.67 -0.93 -0.72 -1.65 -0.14 -0.29 -0.28 -0.15 -1.3 -0.19 -0.33 -1.37 -0.47 -1.5 -0.11 -0.33 -0.46 -0.49 -0.53 -0.59 -0.76 -0.97
0.09 0.52 0.05 -4.86 1.39 0.49 0.24 0.36 0.44 0.47 0.24 0.33 -1.12 -0.21 1.04 0.7 0.93 0.96 1.5 -0.06 0.12 0.15 -0.42 -0.11 -1.42 -0.59 -0.28 -0.05 -0.25 -0.06 -1.02 -0.32 0.12 -0.24 0.06 -1.35 -0.51 -0.6 -0.55 -0.14 -1.4 -0.06 -0.26 -1.39 -0.34 -1.54 0.11 -0.15 -0.22 -0.14 -0.22 -0.56 -0.81 -1.07
0.38 -0.16 -0.88 -5.53 0.81 0.54 0.88 -0.1 0.1 -0.32 -0.21 -0.0 -0.49 -0.15 0.28 0.43 0.44 0.37 0.33 -0.36 -0.44 0.63 -0.34 0.42 -0.93 0.14 -0.04 -0.48 -0.31 -0.33 0.67 0.63 0.55 0.35 0.47 -0.57 -0.07 0.15 0.17 0.26 -0.46 -0.04 -0.43 -0.74 0.42 -0.68 -0.38 -0.1 0.98 -0.04 -1.38 -3.1 -1.84 -0.75
0.8 0.89 1.24 -4.83 1.02 0.67 0.44 0.38 0.11 0.08 -0.02 0.08 -1.31 0.57 0.43 0.47 0.42 0.35 1.04 0.14 0.04 0.56 -0.51 -0.25 -1.28 -0.14 -0.18 -0.27 -0.22 -0.29 -0.73 -0.7 0.02 -0.41 -0.1 -1.78 -0.1 -0.07 -0.1 -0.09 -0.9 0.15 -0.26 -1.02 -0.07 -1.24 -0.15 -0.23 -0.12 -0.17 -0.1 -0.68 -0.9 -1.22
0.28 0.45 0.38 -5.45 1.28 0.83 0.32 0.11 0.32 0.04 -0.05 0.1 -0.66 0.03 0.9 0.84 1.02 0.97 0.83 0.18 0.25 0.75 -0.43 -0.41 -1.79 -0.14 -0.81 -0.35 -0.42 -0.22 -1.45 -1.21 -0.15 -0.67 -0.06 -2.46 0.09 0.02 0.1 -0.3 -1.44 -0.2 -0.34 -1.4 -0.25 -1.88 -0.2 -0.16 0.91 -0.23 -0.97 -0.86 -0.34 0.28
0.44 0.93 0.94 -4.77 1.07 0.78 0.48 -0.01 0.16 -0.28 -0.25 0.16 -1.14 0.17 0.62 0.66 0.51 0.64 1.18 -0.07 0.1 0.4 -0.4 -0.52 -0.87 -0.15 -0.42 -0.24 0.23 -0.37 -0.61 -0.53 -0.13 -0.24 -0.2 -1.21 -0.1 0.19 -0.12 -0.18 -0.79 -0.22 -0.12 -0.74 0.05 -0.98 -0.16 -0.07 -0.49 -0.43 -0.24 -0.42 -0.46 -0.87
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0.47 0.75 0.64 -4.51 1.12 0.41 0.43 0.56 0.32 0.32 0.13 0.48 -1.16 0.27 0.49 0.55 0.49 0.46 1.06 0.26 0.41 0.61 -0.76 0.43 -0.87 -0.76 -0.49 -0.5 -0.39 -0.66 -0.01 0.2 0.53 0.35 0.52 -1.32 -0.72 -0.47 -0.76 -0.42 -0.53 -0.15 -0.48 -0.75 -0.4 -0.77 -0.44 -0.42 -0.58 -0.72 -0.53 -0.64 -0.85 -1.22
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-0.19 -0.15 0.15 -2.47 0.77 0.46 0.05 0.32 0.18 0.38 0.12 0.26 -1.33 0.41 0.63 0.44 0.53 0.46 1.51 0.0 -0.01 1.29 -0.44 -0.66 -2.18 -0.17 -0.8 0.05 0.11 -0.11 -2.19 -0.87 -0.01 -0.23 -0.26 -1.35 0.23 0.22 0.11 -0.23 -1.53 0.02 0.21 -1.77 -0.24 -1.97 0.37 0.17 0.0 -0.27 -0.17 -0.05 0.05 -0.21
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0.65 -0.01 -0.18 -4.84 1.14 0.71 0.66 -0.04 -0.13 -0.49 -0.38 -0.39 -0.98 0.49 0.95 0.97 0.94 0.89 1.37 -0.04 0.13 0.9 -0.44 -0.44 -0.81 -0.52 -0.62 -0.36 -0.53 -0.45 0.2 -0.37 0.21 -0.59 -0.18 -1.0 -0.53 -0.43 -0.47 -0.45 -0.27 -0.25 -0.43 -0.55 -0.37 -0.59 -0.32 -0.3 -0.19 -0.17 -0.15 -0.3 -0.22 -0.38
0.78 0.61 -1.34 -5.49 1.0 0.68 0.03 -0.26 0.31 0.18 -0.04 0.23 -0.21 0.91 0.69 0.59 0.66 0.61 0.21 0.14 0.16 -0.33 -0.32 -0.5 -1.35 0.33 -0.31 -0.53 -0.62 -0.32 -1.55 -0.72 -0.46 -0.61 -0.28 -0.82 0.35 0.16 0.55 -0.11 -1.06 -0.25 -0.29 -1.31 -0.15 -0.97 -0.26 -0.25 0.42 0.27 0.14 0.03 0.15 0.25
-0.05 -0.17 0.19 -4.17 1.25 0.77 0.79 -0.08 0.64 0.02 0.13 0.51 -0.16 -0.17 1.17 0.96 1.17 1.14 1.29 0.18 0.38 0.11 0.0 -0.7 -1.29 -0.72 -0.67 -0.12 -0.27 -0.08 -0.93 -1.18 -0.87 -1.02 -0.85 -1.73 -0.46 -0.7 -0.49 -0.26 -1.17 -0.33 -0.56 -1.36 -0.91 -1.34 -0.35 -0.41 0.0 0.41 0.5 0.03 -0.3 -0.61
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0.58 0.79 0.7 -6.42 0.78 0.52 0.73 -0.15 -0.06 -0.61 -0.52 -0.1 -1.03 0.56 0.6 0.63 0.58 0.65 1.03 -0.16 0.09 0.69 -0.34 -0.29 -1.11 0.23 -0.45 -0.13 -0.09 -0.25 -0.51 -0.76 0.07 -0.13 -0.17 -0.67 0.06 0.32 0.06 -0.15 -0.72 -0.12 -0.2 -0.8 -0.15 -0.93 -0.1 -0.01 -0.19 -0.15 -0.06 -0.57 -0.73 -1.08
0.18 0.49 0.33 -4.46 1.37 0.4 0.01 0.09 0.15 0.01 -0.12 0.22 -0.85 -0.73 0.37 0.26 0.3 0.37 1.35 0.24 0.3 -0.05 -0.46 0.03 -0.65 -0.49 -0.24 -0.25 -0.13 -0.34 0.08 -0.02 0.41 0.16 0.35 -1.05 -0.39 -0.22 -0.52 -0.05 -0.39 0.06 -0.12 -0.51 0.01 -0.38 0.01 -0.1 -0.17 -0.29 -0.25 -0.42 -0.38 -0.59
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0.67 0.54 -1.65 -6.5 0.86 0.58 1.03 0.69 0.84 0.58 0.61 0.59 -0.11 -0.12 0.87 0.89 0.92 0.97 0.76 0.27 0.37 0.82 -0.26 0.04 -1.26 -0.79 -1.3 -0.39 -0.31 -0.44 -0.98 -0.96 -0.07 -0.09 -0.18 -2.0 -0.79 -0.7 -0.76 -0.72 -1.58 -0.83 -0.44 -1.49 -0.81 -1.55 -0.45 -0.33 -0.03 0.02 -0.03 -0.2 -0.2 -0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.