Heatmap: Cluster_281 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
1.61 0.0 0.32 0.81 2.06 1.45 1.2 0.45 0.1 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 68.64 0.0 0.0 0.06 0.03 0.12 224.74 107.68 0.18 0.15 0.03 0.14 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01
2.86 6.89 6.87 5.16 16.9 14.45 12.59 8.79 6.83 21.38 3.22 2.77 13.77 25.19 26.44 13.35 14.5 59.35 4.74 8.56 9.82 14.32 1.02 256.63 89.21 15.13 13.71 10.43 30.12 25.19 8.7 7.11 17.96 31.61 18.74 13.28 13.24 10.86 13.26 29.51 48.81 48.54 24.11 23.52 23.7 10.04 11.71 17.58
293.81 252.74 315.52 99.68 125.94 113.43 103.39 105.74 193.25 183.29 86.97 88.36 196.65 211.38 188.14 192.72 345.16 662.44 184.56 208.1 192.8 247.87 186.57 1125.68 298.41 215.46 173.01 70.83 122.31 136.17 87.58 72.96 119.59 119.09 89.33 82.98 92.44 174.69 93.77 184.14 156.48 176.94 184.85 129.64 134.88 176.63 100.45 101.98
8.42 10.37 6.54 27.75 15.09 7.38 5.76 6.19 8.04 5.75 5.22 4.93 8.39 18.2 8.09 4.69 14.16 215.44 13.05 11.7 9.14 14.65 6.51 590.49 130.04 8.58 13.24 3.17 2.73 4.72 3.14 3.65 4.06 4.35 1.66 2.55 2.87 5.5 2.55 5.16 17.36 18.69 6.6 5.02 4.9 5.17 2.51 8.04
0.0 0.0 0.5 0.01 0.15 0.29 0.09 0.1 0.79 0.05 0.12 0.18 0.05 0.05 0.06 1.4 0.28 2.81 0.03 0.05 0.07 0.15 0.03 5.69 1.48 0.52 0.06 0.01 0.03 0.0 0.02 0.1 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.0 0.05 0.05 0.05 0.04 0.04 0.01
4.28 2.52 2.61 3.68 0.53 0.0 0.47 2.55 3.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 3.84 2.58 41.54 0.0 0.0 0.0 1.27 0.87 77.61 0.0 4.87 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.33 0.41 0.1 0.94 1.31 0.34 2.01 0.04 0.29 0.0 0.0 0.19 0.0 0.19 0.0 0.37 0.63 2.79 3.17 1.17 1.33 0.0 9.67 0.4 0.0 0.23 1.21 0.53 0.25 1.08 0.0 0.72 0.12 0.0 0.56 0.98 0.21 0.0 0.42 0.25 0.0 0.83 0.22 0.12 0.17 0.87 0.14
0.0 0.0 0.1 0.29 0.2 0.37 0.14 0.27 0.0 0.02 0.05 0.16 0.04 0.16 0.04 0.0 0.57 3.65 0.12 0.32 0.19 0.49 0.0 11.15 6.6 1.51 0.84 0.0 0.55 0.07 0.05 0.07 0.03 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.09 0.07 0.75 0.11 0.09 0.17 0.0 0.03 0.0 0.22
0.14 2.44 0.43 0.63 0.99 0.4 0.5 0.51 0.36 0.09 0.97 1.47 0.07 0.03 0.09 0.04 0.76 5.47 0.06 0.11 0.24 0.64 2.8 16.97 9.45 2.41 1.52 0.02 0.34 0.05 0.04 0.13 0.04 0.05 0.01 0.03 0.07 0.02 0.05 0.04 0.53 0.3 0.07 0.26 0.04 0.08 0.07 0.13
0.0 0.0 0.0 0.52 0.87 5.94 4.42 0.6 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.99 2.03 0.94 1.66 0.0 0.59 0.25 0.13 0.0 0.37 0.94 0.0 0.0 0.27 0.5 0.7 0.31 0.0 0.0 0.61 0.68 0.75 0.83 0.25 0.22
0.0 5.7 0.52 0.15 0.1 1.08 0.79 0.19 0.0 0.1 0.04 0.0 0.05 0.0 0.04 0.06 0.53 1.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 14.12 1.14 0.72 0.53 0.26 0.19 0.12 0.07 0.0 0.12 0.29 0.04 0.0 0.13 0.08 0.0 0.32 0.0 0.0 0.35 0.18 0.0 0.12 0.17 0.1
0.0 0.0 0.05 0.02 0.06 0.07 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.08 0.08 0.02 0.19 3.66 1.51 0.49 0.21 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.93 2.84 1.49 3.42 2.23 5.5 5.13 5.17 1.05 3.68 0.92 0.47 1.82 0.44 1.83 7.31 4.67 34.36 3.35 5.09 7.05 2.17 0.37 38.56 9.61 3.79 0.45 1.54 0.63 3.05 2.07 0.84 2.04 3.16 1.13 0.71 1.49 6.53 1.16 1.65 1.64 1.39 2.07 1.35 2.25 8.02 2.86 2.08
0.17 1.5 0.5 0.4 0.1 0.03 0.05 0.12 3.8 0.07 0.03 0.12 0.02 0.01 0.04 0.96 0.56 1.95 0.12 0.12 0.41 0.42 0.08 10.12 0.96 2.45 0.06 0.06 0.04 0.05 0.02 0.01 0.03 0.01 0.13 0.07 0.06 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.04 0.03 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.55 1.71 1.78 0.18 2.05 3.5 4.8 4.89 2.03 1.94 0.06 0.02 1.81 1.26 2.25 0.53 1.36 14.98 4.47 4.97 1.14 3.25 2.62 78.64 31.25 3.32 1.97 1.98 0.79 1.05 2.11 1.41 1.57 0.8 1.07 1.71 2.62 1.74 0.62 0.96 3.03 6.32 1.06 0.93 0.82 1.47 0.72 1.74
20.95 34.66 38.09 18.9 41.27 32.68 48.81 47.1 18.96 32.96 2.28 1.95 22.2 11.22 25.27 23.85 27.01 78.26 34.75 37.62 40.37 45.13 4.4 322.65 67.92 14.93 27.37 26.6 12.39 23.21 25.04 21.87 20.79 26.78 8.13 24.02 21.68 36.7 16.61 19.52 19.98 21.07 19.98 20.93 13.77 35.81 21.9 21.71
8.82 6.31 12.39 23.11 42.26 16.26 22.79 26.25 6.32 7.82 1.74 1.9 7.11 5.19 8.89 2.52 8.39 74.3 14.2 19.79 16.1 17.46 4.28 224.92 146.31 10.44 9.93 5.94 2.17 3.17 2.4 5.12 3.72 4.06 1.84 4.89 4.56 5.66 4.98 2.86 5.49 5.98 5.86 3.84 3.58 5.54 5.14 5.55
7.34 0.51 1.33 0.75 0.66 0.49 0.48 0.41 0.0 0.59 0.15 0.05 0.32 0.25 0.14 0.16 2.21 49.98 6.19 9.04 6.8 10.07 0.0 289.6 105.64 1.02 3.86 6.17 6.01 2.33 2.89 0.25 2.11 4.29 1.93 1.99 2.56 2.28 2.07 1.03 0.4 0.71 0.56 3.21 1.91 2.08 0.74 0.98
47.39 14.82 14.13 0.12 2.3 9.27 5.42 9.11 26.8 1.21 0.0 0.33 2.34 0.81 1.84 6.23 37.01 220.7 52.66 131.6 161.17 102.03 8.39 1312.5 182.77 5.69 9.3 9.93 5.9 3.1 4.05 0.27 1.7 5.62 1.28 1.41 2.47 5.28 3.06 1.46 0.95 1.12 1.62 3.46 3.91 4.7 0.69 2.03
0.39 0.2 0.19 0.36 0.17 0.3 0.82 0.53 1.98 0.19 0.04 0.15 0.08 0.03 0.08 0.36 0.51 11.75 0.08 0.04 0.84 3.53 0.0 90.61 22.45 0.3 0.42 7.39 2.99 0.37 0.12 0.0 0.84 0.59 0.04 2.54 2.02 0.17 0.26 0.35 0.02 0.33 0.79 2.7 0.66 0.17 0.33 0.32
0.0 0.46 0.77 3.78 1.15 1.17 1.01 0.82 0.0 0.11 0.81 0.0 0.1 0.0 0.37 0.07 1.19 2.74 0.29 4.9 3.4 7.38 0.12 20.24 10.77 0.76 10.17 0.0 0.09 0.73 0.72 3.45 1.24 0.24 0.11 0.87 0.93 0.0 0.19 0.55 1.45 1.5 0.55 0.0 0.59 0.06 0.87 0.42
0.0 0.0 0.08 2.31 0.35 0.88 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.12 0.23 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 7.82 0.93 0.15 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
39.63 17.99 0.28 1.58 18.93 22.32 8.9 14.96 33.06 21.33 17.93 14.99 98.28 64.74 15.49 17.04 15.56 52.71 12.98 27.61 38.57 31.48 3.39 497.92 38.15 1.97 3.34 3.01 89.27 39.27 26.38 3.52 27.99 26.01 50.74 19.05 59.56 44.88 30.86 60.31 121.77 166.77 99.43 33.35 18.3 49.47 7.47 76.6
0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.16 0.0 0.0 0.12 0.32 0.0 0.0 1.79 0.33 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 1.91 1.76 0.14 0.26 0.61 0.74 0.51 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.36 0.45 145.28 0.03 0.02 0.03 10.35 0.11 1576.34 68.06 0.28 0.03 0.21 0.01 0.03 0.04 0.03 0.05 0.03 0.0 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.1 0.02
0.53 0.6 0.27 3.14 0.33 0.37 1.73 0.66 1.44 0.03 0.02 0.03 0.02 0.02 0.1 1.0 0.85 6.65 0.06 0.17 0.24 1.52 0.03 24.24 4.61 0.92 0.76 0.4 0.24 0.16 0.09 0.08 0.14 0.17 0.09 0.12 0.08 0.12 0.16 0.1 0.18 0.13 0.06 0.2 0.13 0.12 0.05 0.22
5.97 14.22 22.95 4.05 22.52 16.98 23.53 24.0 10.76 20.39 5.24 5.18 17.77 14.53 15.33 10.87 20.18 36.45 25.95 32.67 38.49 53.97 7.17 110.46 49.06 14.95 19.21 19.16 7.01 12.2 25.05 12.69 15.26 10.02 4.35 19.42 19.28 21.39 10.68 13.06 10.08 9.77 15.3 11.9 11.31 20.0 18.0 9.61
13.97 27.65 65.75 9.55 76.01 44.69 58.16 57.59 26.18 29.75 23.41 21.74 20.41 7.74 21.86 18.57 31.91 72.0 40.47 36.15 45.06 39.1 68.91 152.8 114.01 24.14 35.8 24.01 17.4 20.67 26.81 30.22 23.64 19.38 17.13 19.01 25.75 30.56 10.94 20.87 11.52 10.85 22.9 23.79 18.33 27.72 23.3 19.9
3.25 4.17 7.79 1.25 2.45 2.07 1.5 2.08 0.62 0.69 0.51 0.36 0.96 1.36 0.78 2.52 4.86 75.25 5.72 5.5 3.42 3.63 1.72 183.46 50.74 3.52 2.36 0.18 0.37 0.38 0.27 0.22 0.21 0.17 0.18 0.13 0.17 0.65 0.68 0.97 1.14 1.73 1.29 0.83 0.43 0.45 0.44 0.77
0.08 0.0 0.29 0.06 0.15 0.58 0.51 0.17 2.25 0.59 0.02 0.01 0.38 0.22 0.84 1.17 2.08 6.87 0.07 0.06 1.33 8.35 0.0 18.57 4.98 2.15 0.5 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.07 0.08 0.22 0.04 0.0
0.0 0.0 0.05 0.04 0.07 0.07 0.11 0.05 0.0 0.11 0.0 0.0 0.03 0.04 0.05 0.0 0.09 63.76 0.04 0.11 0.2 0.05 0.0 340.88 134.03 0.06 0.13 0.15 0.31 0.14 0.21 0.04 0.2 0.28 0.05 0.09 0.21 0.03 0.22 0.2 0.27 0.49 0.22 0.19 0.11 0.08 0.24 0.2
0.27 4.15 0.65 25.27 4.22 17.07 17.0 15.01 0.83 0.46 0.0 0.01 0.22 0.1 0.41 0.34 1.06 12.85 0.61 5.98 19.43 71.12 0.56 91.93 54.94 0.42 1.77 0.54 0.47 0.63 0.52 0.1 0.9 0.82 0.06 0.54 0.38 0.32 1.09 0.2 0.0 0.1 0.53 0.43 0.56 0.42 1.03 0.23
0.0 3.63 0.82 0.63 1.42 0.44 0.18 0.68 0.02 0.37 0.03 0.01 0.29 0.27 0.05 0.15 0.35 28.12 0.44 0.58 0.28 0.33 0.0 60.16 36.65 0.32 0.58 0.0 0.04 0.1 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.29 0.0 0.11 1.03 0.45 0.2 0.1 0.0 0.3 0.01 0.05
0.0 0.0 0.42 0.03 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.04 0.19 0.19 0.0 0.15 0.05 0.0 0.14 0.04 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 1.82 0.19 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.12 0.05 0.0 0.04 0.13 0.17 0.0 0.2 0.0 0.08
0.0 0.02 0.03 0.94 0.54 0.6 1.03 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 19.52 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 101.08 24.78 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.23 0.02 0.29 0.14 0.03 0.11 0.0 0.65 0.0 0.0 0.27 0.04 1.83 0.55 0.92 29.0 0.0 0.02 0.0 1.07 0.0 74.5 30.72 0.32 0.39 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0
0.21 21.34 28.91 16.49 2.63 8.06 15.14 24.03 0.36 0.05 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.05 0.25 41.95 0.0 0.52 0.81 0.23 0.03 189.54 23.82 1.08 0.76 0.22 0.37 0.38 1.23 0.1 0.3 0.79 0.4 0.14 0.64 0.37 0.48 0.17 0.05 0.44 0.17 0.14 0.14 0.36 0.21 0.2
10.68 8.03 18.02 3.83 7.5 24.21 32.14 17.99 5.93 17.15 6.05 3.81 9.87 6.37 17.74 24.03 20.45 387.53 35.08 14.83 24.52 58.17 11.16 882.01 207.51 13.89 2.9 2.83 2.36 4.48 5.17 0.38 5.84 12.62 2.25 3.35 5.66 7.57 7.38 7.1 0.54 1.63 7.0 8.26 8.75 7.23 3.5 4.63
23.38 42.8 66.96 14.42 33.86 37.46 20.24 23.62 3.79 28.78 0.63 0.63 9.07 2.63 28.79 4.77 17.62 82.65 17.72 16.14 20.48 53.52 1.0 444.33 256.58 50.73 41.25 0.37 0.71 0.98 6.83 0.29 0.58 0.29 0.18 0.71 0.55 3.94 0.36 6.78 17.66 16.75 4.45 2.39 0.27 2.75 4.42 4.66
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.86 0.0 1.84 0.69 0.47 0.31 0.53 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.4 0.52 0.51 0.29 0.64 0.03 0.1 35.55 8.43 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.01

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)