Heatmap: Cluster_281 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c11_25800V3.1	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c11_25880V3.1	0.01	0.03	0.03	0.02	0.07	0.06	0.05	0.03	0.03	0.08	0.01	0.01	0.05	0.1	0.1	0.05	0.06	0.23	0.02	0.03	0.04	0.06	0.0	1.0	0.35	0.06	0.05	0.04	0.12	0.1	0.03	0.03	0.07	0.12	0.07	0.05	0.05	0.04	0.05	0.12	0.19	0.19	0.09	0.09	0.09	0.04	0.05	0.07
Pp3c14_25320V3.1	0.26	0.22	0.28	0.09	0.11	0.1	0.09	0.09	0.17	0.16	0.08	0.08	0.17	0.19	0.17	0.17	0.31	0.59	0.16	0.18	0.17	0.22	0.17	1.0	0.27	0.19	0.15	0.06	0.11	0.12	0.08	0.06	0.11	0.11	0.08	0.07	0.08	0.16	0.08	0.16	0.14	0.16	0.16	0.12	0.12	0.16	0.09	0.09
Pp3c15_6310V3.1	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.36	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	1.0	0.22	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01
Pp3c17_19840V3.1	0.0	0.0	0.09	0.0	0.03	0.05	0.02	0.02	0.14	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.25	0.05	0.49	0.0	0.01	0.01	0.03	0.01	1.0	0.26	0.09	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0
Pp3c17_8430V3.1	0.06	0.03	0.03	0.05	0.01	0.0	0.01	0.03	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.54	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	1.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c18_20261V3.1	0.0	0.03	0.04	0.01	0.1	0.14	0.04	0.21	0.0	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.04	0.06	0.29	0.33	0.12	0.14	0.0	1.0	0.04	0.0	0.02	0.12	0.05	0.03	0.11	0.0	0.07	0.01	0.0	0.06	0.1	0.02	0.0	0.04	0.03	0.0	0.09	0.02	0.01	0.02	0.09	0.01
Pp3c18_21007V3.1	0.0	0.0	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.33	0.01	0.03	0.02	0.04	0.0	1.0	0.59	0.14	0.08	0.0	0.05	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02
Pp3c18_21010V3.1	0.01	0.14	0.03	0.04	0.06	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.06	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.32	0.0	0.01	0.01	0.04	0.16	1.0	0.56	0.14	0.09	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01
Pp3c1_1420V3.1	0.0	0.0	0.0	0.06	0.1	0.66	0.49	0.07	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.23	0.1	0.18	0.0	0.07	0.03	0.01	0.0	0.04	0.1	0.0	0.0	0.03	0.06	0.08	0.03	0.0	0.0	0.07	0.08	0.08	0.09	0.03	0.02
Pp3c1_1421V3.1	0.0	0.4	0.04	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.07	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01
Pp3c1_35340V3.1	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.02	0.02	0.01	0.05	1.0	0.41	0.13	0.06	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c1_36500V3.1	0.05	0.07	0.04	0.09	0.06	0.14	0.13	0.13	0.03	0.1	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.19	0.12	0.89	0.09	0.13	0.18	0.06	0.01	1.0	0.25	0.1	0.01	0.04	0.02	0.08	0.05	0.02	0.05	0.08	0.03	0.02	0.04	0.17	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.06	0.21	0.07	0.05
Pp3c1_9050V3.1	0.02	0.15	0.05	0.04	0.01	0.0	0.0	0.01	0.38	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.09	0.06	0.19	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	1.0	0.1	0.24	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c20_12110V3.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c20_13240V3.1	0.02	0.02	0.02	0.0	0.03	0.04	0.06	0.06	0.03	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.19	0.06	0.06	0.01	0.04	0.03	1.0	0.4	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02
Pp3c20_21940V3.1	0.06	0.11	0.12	0.06	0.13	0.1	0.15	0.15	0.06	0.1	0.01	0.01	0.07	0.03	0.08	0.07	0.08	0.24	0.11	0.12	0.13	0.14	0.01	1.0	0.21	0.05	0.08	0.08	0.04	0.07	0.08	0.07	0.06	0.08	0.03	0.07	0.07	0.11	0.05	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.04	0.11	0.07	0.07
Pp3c21_14810V3.1	0.04	0.03	0.06	0.1	0.19	0.07	0.1	0.12	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.33	0.06	0.09	0.07	0.08	0.02	1.0	0.65	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02
Pp3c22_17251V3.1	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.17	0.02	0.03	0.02	0.03	0.0	1.0	0.36	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0
Pp3c22_17260V3.1	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.17	0.04	0.1	0.12	0.08	0.01	1.0	0.14	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c23_20550V3.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.13	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0	1.0	0.25	0.0	0.0	0.08	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0
Pp3c24_3410V3.1	0.0	0.02	0.04	0.19	0.06	0.06	0.05	0.04	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.06	0.14	0.01	0.24	0.17	0.36	0.01	1.0	0.53	0.04	0.5	0.0	0.0	0.04	0.04	0.17	0.06	0.01	0.01	0.04	0.05	0.0	0.01	0.03	0.07	0.07	0.03	0.0	0.03	0.0	0.04	0.02
Pp3c24_3430V3.1	0.0	0.0	0.01	0.3	0.04	0.11	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.12	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c25_11400V3.1	0.08	0.04	0.0	0.0	0.04	0.04	0.02	0.03	0.07	0.04	0.04	0.03	0.2	0.13	0.03	0.03	0.03	0.11	0.03	0.06	0.08	0.06	0.01	1.0	0.08	0.0	0.01	0.01	0.18	0.08	0.05	0.01	0.06	0.05	0.1	0.04	0.12	0.09	0.06	0.12	0.24	0.33	0.2	0.07	0.04	0.1	0.01	0.15
Pp3c25_190V3.1	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.07	0.18	0.0	0.0	1.0	0.19	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c25_7190V3.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c26_14156V3.1	0.02	0.02	0.01	0.13	0.01	0.02	0.07	0.03	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.27	0.0	0.01	0.01	0.06	0.0	1.0	0.19	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01
Pp3c26_14520V3.1	0.05	0.13	0.21	0.04	0.2	0.15	0.21	0.22	0.1	0.18	0.05	0.05	0.16	0.13	0.14	0.1	0.18	0.33	0.23	0.3	0.35	0.49	0.06	1.0	0.44	0.14	0.17	0.17	0.06	0.11	0.23	0.11	0.14	0.09	0.04	0.18	0.17	0.19	0.1	0.12	0.09	0.09	0.14	0.11	0.1	0.18	0.16	0.09
Pp3c26_4590V3.1	0.09	0.18	0.43	0.06	0.5	0.29	0.38	0.38	0.17	0.19	0.15	0.14	0.13	0.05	0.14	0.12	0.21	0.47	0.26	0.24	0.29	0.26	0.45	1.0	0.75	0.16	0.23	0.16	0.11	0.14	0.18	0.2	0.15	0.13	0.11	0.12	0.17	0.2	0.07	0.14	0.08	0.07	0.15	0.16	0.12	0.18	0.15	0.13
Pp3c26_540V3.1	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.41	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	1.0	0.28	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c3_33930V3.1	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.03	0.03	0.01	0.12	0.03	0.0	0.0	0.02	0.01	0.05	0.06	0.11	0.37	0.0	0.0	0.07	0.45	0.0	1.0	0.27	0.12	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Pp3c3_35060V3.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c4_1190V3.1	0.0	0.05	0.01	0.27	0.05	0.19	0.18	0.16	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.14	0.01	0.07	0.21	0.77	0.01	1.0	0.6	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0
Pp3c5_12130V3.1	0.0	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.47	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	1.0	0.61	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Pp3c5_20169V3.1	0.0	0.0	0.23	0.02	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.02	0.11	0.11	0.0	0.08	0.03	0.0	0.08	0.02	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	1.0	0.11	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.07	0.03	0.0	0.02	0.07	0.1	0.0	0.11	0.0	0.05
Pp3c6_4209V3.1	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c6_5885V3.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.39	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.41	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c8_1040V3.1	0.0	0.11	0.15	0.09	0.01	0.04	0.08	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.13	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c8_16620V3.1	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.44	0.04	0.02	0.03	0.07	0.01	1.0	0.24	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01
Pp3c8_24460V3.1	0.05	0.1	0.15	0.03	0.08	0.08	0.05	0.05	0.01	0.06	0.0	0.0	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.19	0.04	0.04	0.05	0.12	0.0	1.0	0.58	0.11	0.09	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01
Pp3c9_2910V3.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3s752_10V3.1	0.0	0.0	0.02	0.0	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	1.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)