Heatmap: Cluster_28 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - - - - - - - 5.4 - - - - - - 1.33 - -1.48 - - - - - - - 1.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.01 1.45 1.94 1.58 1.82 - 4.97 - - - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.6 - -
- 2.66 -1.73 -3.05 - - - - 4.46 -1.03 -1.67 - -0.8 0.31 -2.15 - 1.81 -0.5 - -2.16 -2.28 - - - - -0.55 - -2.45 - -1.27 -2.2 -0.51 - -2.95 - -2.74 -2.03 -0.13 -1.78 -0.23 0.76 1.26 -1.14 -2.1 -2.96 0.7 -2.53 -2.22
- 2.15 1.95 2.13 - - -1.72 - 4.21 - - - - - -5.95 2.89 1.8 -0.49 - - - - - -1.85 - 2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.64 - - - 5.17 - - - - - - - 2.1 - - - - - - - 1.25 1.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.01 1.43 1.73 -1.36 - - - 4.18 - - - - - - 2.67 2.0 -0.95 - - - - - 1.59 - 2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.49 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.83 1.97 0.19 - - - - 4.68 -0.46 - - - 1.32 -1.55 - 2.98 -0.09 - - - - - 0.01 - 1.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.59 0.47 -2.44 - -0.3 - - 3.94 - - - - - - - 1.95 - - - - - - -2.03 - -0.07 - -2.01 - - - -2.31 - - - - -2.01 - - -1.78 - - - - - -2.31 - -
- - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.67 1.17 - -1.8 - - 1.63 4.06 - - - - - - - 2.0 1.05 - - - - - -0.25 - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.67 1.17 - -1.8 - - 1.63 4.06 - - - - - - - 2.0 1.05 - - - - - -0.25 - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.53 - - - - - - - 0.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.87 0.37 - -0.08 1.99 -0.7 4.3 - - - - 0.15 -4.8 - 1.86 0.23 - - - 1.55 - - - 1.29 - - - -3.62 -1.22 -1.24 -2.93 -1.11 -1.28 - - -0.87 - - 0.44 0.2 - - - -1.06 -0.87 -1.06
- - - 2.87 -1.35 - - - 5.11 - - - - - - - 1.38 - - - - - - - - 1.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.77 2.42 -1.24 - - - - 4.98 - - - - - -5.09 - 2.11 - - - - - - - -1.47 2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.83 - - - - - 5.17 - - - - - - - 1.42 - - - - - - - - 2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.46 - - - - - - - 2.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.46 - - - 4.35 - - - - - - 3.57 1.26 1.27 - - - - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.73 - 5.16 - - - - - - - - 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.52 - - - - - - - 0.84 - - - - - - - - - - - - -2.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.73 1.83 1.61 -1.32 -1.36 -1.24 -2.32 4.21 -1.2 -3.65 -3.94 -1.16 - -0.83 -2.15 1.22 0.42 1.97 -0.56 0.75 -0.05 -0.2 -1.36 -1.06 0.58 -0.86 - -3.84 -3.83 -3.39 - - - - -2.8 - -2.41 -3.11 - - - - -1.0 - -1.12 - -5.1
- - - - - - - - 5.08 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.81 2.0 -0.33 - - - - 5.03 - - - - - - - 2.3 - - - - - - - - 1.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -0.76 - - - 0.85 5.05 - - - - - - - 3.38 - - - - - - - - 1.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.4 - - - - - - 5.08 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.04 1.65 1.14 -0.25 -1.05 - -0.1 1.39 3.4 -1.53 - - - - -2.82 1.43 2.2 -0.21 - -1.2 - -0.49 - 0.42 -0.62 2.79 - -2.03 -1.04 -0.6 -1.36 -2.26 - - -1.52 -0.62 -2.29 -1.04 - -1.46 -1.82 -1.18 -0.88 -0.12 -0.88 - -0.96 -1.81
- 3.23 - 1.22 - - - - 5.13 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.46 - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.1 - - - 0.35 - 4.99 - - - - - -3.0 - 2.79 1.46 - - - - - -0.78 - 1.36 - - - -1.18 - - -2.43 - - - - - - - -3.43 - - - - -3.24 - -3.28
- 3.0 - 1.11 - - - - 4.52 - - - - - - 3.56 0.73 - - - - - - - 0.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -0.44 - 0.7 0.94 - 4.94 - - 1.01 - - - - 1.54 0.95 - - - - - - -0.66 2.04 0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.1 -2.82 0.63 0.6 -2.1 -0.22 2.37 1.98 4.38 0.11 -2.96 -1.78 - -2.95 -3.98 -1.38 0.38 -0.36 - -1.83 - -0.16 - -1.97 -0.71 1.76 -2.13 - - -3.41 -1.0 - -4.96 - - - - -1.56 - -2.19 -0.59 -2.93 -1.21 -3.38 - -2.12 -0.51 -4.48
- - - 1.12 -2.3 - - - 4.67 - - - - - - 4.05 0.72 - - - - - - - - 1.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.47 -0.8 -0.37 - - - - 4.52 - - - - - -3.78 - 1.92 - - - - - - 0.51 - 2.87 - - - -5.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.26 3.51 0.48 -1.03 -10.23 - - -10.36 3.93 - - - - - - 0.4 2.92 - - - - - - 2.02 - 2.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.6 - - - - - 5.35 - - - - - -4.09 - 0.99 - - - - - - - - 1.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.47 -
- - - - 2.65 - - - 5.14 - - - - - - 2.03 1.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.61 0.61 -1.19 0.05 -0.07 0.78 4.19 0.22 -0.97 -1.05 -1.2 0.77 -0.64 - 1.56 -0.64 -2.39 - -1.62 - -1.61 -1.07 -0.08 2.1 -0.99 - -0.78 -0.83 -2.5 -2.23 -2.16 -2.23 - -2.0 -2.24 -1.8 - -1.05 -2.59 -1.83 0.07 -0.62 -1.18 -1.22 -3.16 -0.77
- 4.25 - - - - - - 4.61 - - - - - -0.47 - - - - - - - - - 0.69 1.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.46 2.9 - - - - 5.12 - - - - - -3.01 - 1.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.99 0.66 0.74 - - - - 4.42 - - - - - - -0.03 2.14 1.26 - - - 1.39 - 1.75 -1.13 0.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.01 - - -0.44 - - - 4.86 -1.47 - - -0.72 0.18 -1.38 - 1.65 - -1.99 - - 0.73 0.63 - -0.79 -0.3 - - -0.82 -1.29 -0.89 -0.58 - - - -0.21 - - 0.26 - - -0.08 - - -0.65 - - -
2.38 - 2.38 - 2.57 - - - 4.87 - - - - - - - 1.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.02 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.03 - - - - - - 4.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.07 - - - - - - 3.34 1.35 -0.96 - - - - - - -1.08 -0.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.67 -2.1 0.3 -3.6 - - - 5.08 - - - - - -6.51 0.13 2.09 -0.44 - - - - - - - 1.78 - - - -6.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.58 -1.14 - - - - 5.4 - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - 1.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.99 - - - 5.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.93 -1.01 1.59 -3.55 - - 0.68 4.52 - - - - - -5.15 1.88 1.49 -1.03 - - - - - -4.04 - 2.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.28 - - - - - - - 2.04 - - - - - - - - 2.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.61 - 0.11 - - - - 5.3 - -1.0 - - - - - 0.34 -0.71 - - - - - - 0.08 -0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.21 -0.02 - - - - - 4.25 - - - - - - - 1.34 - - - - - - - - 2.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.3 - - - - - 4.84 - - - 1.57 - - 2.6 - - - - - - - - - 2.9 - - - -1.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.99 - - - - - - - 3.09 - - - - - - - - 2.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.76 - - - - - - 3.74 2.19 -1.11 - -0.27 - - - - -0.32 -0.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 0.74 - - 4.58 - - - - - - 1.47 2.88 -0.83 - - - - - - - 3.54 - - - -3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.6 - 0.2 2.17 - - 4.73 - - - - - - 2.91 - 2.19 - - - - - - - 1.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.9 - - - 5.16 - - - - - - - 1.98 -0.92 - - 2.24 - - 0.77 - -0.92 - - - -3.73 - - - -1.16 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.4 - - 5.22 - - - - - -2.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.61 - 2.18 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.83 -0.64 -0.55 - 1.17 - 5.06 - - - - - - 0.23 0.57 0.52 - - - - - - - 1.65 - - -0.9 - 0.26 - - - - -0.09 - - - -0.61 - - - - - - - -2.87
- - -0.69 2.76 -1.39 -0.7 - - 5.13 - -1.55 -1.84 - - - - 0.67 -0.09 - - - - - - - -0.47 - - - - - - - - -1.9 - - - - - - - - - - - - -0.89
- 2.07 1.94 0.14 - - - - 5.1 - - - - - -6.72 -0.11 1.35 -2.34 - - - - - -2.41 - -0.5 - -3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.6 -0.4 - -0.9 - - - 4.55 - - - - - - 4.36 - - - - - - - - - 0.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.62 - - - - - - 3.25 0.2 1.15 - - - - - - - 3.36 - - - -2.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.32 - - - -1.03 - - 3.94 - - -0.72 - - -2.71 - 1.36 -1.6 - -0.87 - - - -0.59 0.61 2.02 0.55 - -2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.51 - - - - - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.63 - 0.68 - - - - 4.69 0.3 - -1.54 0.04 - -2.12 1.34 1.39 -1.37 - - - - - - - 1.66 - - - -1.64 - -0.47 - - - - - -1.19 - - - -0.12 - - - -1.38 - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.