Heatmap: Cluster_45 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.06 1.26 0.03 0.0 0.27 0.02 0.16 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 2.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.6 0.0 0.0 1.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 0.0 0.6 0.42 0.52 0.92 2.25 0.47 0.28 0.42 0.35 0.0 4.78 0.71 1.21 0.27 0.59 0.23 2.11
0.0 0.24 0.43 0.77 1.69 0.1 0.28 0.12 0.74 0.0 0.32 0.0 4.49 0.7 0.66 0.2 0.61 0.76 0.28
0.29 0.68 0.0 0.11 0.63 0.24 0.66 0.06 0.14 0.36 0.28 5.51 3.15 1.0 0.92 0.85 0.33 0.87 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 1.68 2.89 0.31 0.0 0.0 0.14 0.05 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 2.76 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.76 1.6 0.1 0.0 0.0 0.09 0.0 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.04 0.0 1.31 0.11 0.1 0.34 0.04 0.1 0.0
0.0 0.0 2.13 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.09 0.0 6.93 0.04 1.3 0.08 0.0 1.47 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.16 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.13 0.07 0.16 0.0 2.06 0.14 0.09 0.1 0.15 0.26 0.22
0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.22 0.0 0.0 2.55 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.03
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.51 0.0 0.86 0.0 0.0 0.23 1.14 0.0 0.09 0.06 2.12 0.11 0.0 0.0 0.07 0.11 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.52 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.18 0.66 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.29 1.96 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.2 0.81 4.63 0.0 0.0 0.06 0.99 0.0 0.0
0.94 8.6 76.91 27.88 16.19 7.32 8.86 8.0 23.26 55.69 0.18 11.68 257.36 0.22 1.08 0.22 0.5 0.21 1.75
2.09 16.69 151.9 53.56 20.23 2.63 33.65 39.99 93.33 114.06 0.9 10.07 361.03 1.49 2.41 1.65 2.28 3.44 3.91
0.35 0.0 0.0 0.0 0.77 0.41 0.0 0.0 0.0 0.65 0.16 0.0 2.0 0.23 0.11 0.18 0.42 0.19 0.0
0.14 0.0 0.22 0.1 0.0 0.08 0.26 0.0 0.16 0.14 0.09 0.09 2.53 0.07 0.1 0.0 0.12 0.1 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 5.7 0.0 1.49 2.25 3.6 0.0 0.0 0.6 14.52 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.38 0.22 1.51 2.73 0.73 1.41 0.21 0.3 0.14 0.72 0.18 4.83 1.25 0.42 1.17 0.13 0.33 0.63 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.16 0.14 0.02 0.03 0.07 0.0 0.0 0.19 0.02 0.02 0.46 0.07 0.08 0.07 0.06 0.23 0.05
0.0 0.0 0.3 0.0 0.29 0.0 0.0 0.27 0.72 2.06 0.1 0.27 3.18 0.5 0.0 0.0 0.31 0.27 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.08 0.08 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 4.46 0.0 0.0 1.99 0.43 0.0 0.0 0.46 0.32 0.15 8.33 0.15 0.0 0.13 0.0 0.0 0.23
0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.03 0.42 0.03 0.29 0.4 0.0 1.21 1.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
0.21 0.25 0.65 0.91 0.57 0.91 0.03 2.26 0.07 1.7 0.1 5.68 19.76 0.33 0.17 0.58 4.6 0.53 0.1
7.05 4.3 7.27 8.99 5.16 9.15 0.18 27.8 0.48 11.19 5.43 9.84 54.94 11.73 8.64 8.37 16.78 5.64 6.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.2 0.0 0.09 4.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.07 0.09 0.1 0.07 0.1 0.09 0.05 0.09 0.03 0.24 0.13 1.47 0.36 0.35 0.26 0.32 0.46 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 3.57 0.05 0.0 0.09 0.31 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.89 0.0 1.44 0.28 0.0 0.0 0.35 0.9 6.75 0.13 1.55 0.66 0.59 0.27 1.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.72 0.04 0.01 0.02 0.05 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 1.78 0.08 1.03 0.07 0.18 0.0 0.06
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.15 0.02 0.17 0.34 0.0 0.0 0.0 0.22 0.01 0.0 2.79 1.47 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 2.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.26 2.77 0.76 0.59 0.0 3.86 1.91 5.72 3.23 3.38 1.86 4.3 10.17 1.51 1.77 3.24 2.61 2.47 4.8
0.0 0.06 0.2 0.27 0.0 0.05 0.0 0.0 0.07 0.0 0.26 0.1 4.39 0.07 0.11 0.13 0.11 0.17 0.37
0.0 0.0 2.15 1.06 0.0 0.0 0.09 0.08 0.68 0.3 0.0 0.05 10.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.17 0.33 0.2 0.18 0.83 0.0 4.31 0.76 0.4 0.15 0.09 0.16 0.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.97 0.03 0.0 0.02 0.15 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.27 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
8.75 8.98 3.8 1.83 8.06 10.48 2.16 2.85 2.45 2.81 6.6 31.31 13.24 10.11 6.99 8.43 8.84 12.82 5.21
0.39 0.0 0.04 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.72 0.04 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0
0.29 0.16 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.13 0.56 0.01 0.0 1.1 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.85 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.63 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.37 0.07 0.19 0.0 0.07 0.05 0.0
0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 2.18 0.15 0.08 0.08 0.19 0.0 0.19
0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.13 0.02 0.0 0.94 0.02 0.23 0.06 0.0 0.27 0.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.25 3.3 0.1 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 4.65 0.15 1.5 1.9 0.7 0.65 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)