Heatmap: Cluster_8 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
6.37 5.74 3.52 3.32 5.59 7.07 3.84 2.53 3.68 0.67 7.27 14.44 9.87 6.83 8.36 13.59 11.04 11.92 7.16
5.42 5.13 4.35 5.01 5.83 7.41 5.57 3.95 4.02 2.08 6.18 9.86 7.6 6.2 7.53 8.89 7.85 7.66 6.04
7.08 10.46 5.02 15.66 16.35 10.78 12.08 7.62 9.97 0.91 12.93 28.07 21.09 8.87 12.05 24.32 27.58 14.73 10.3
4.1 6.51 2.8 2.83 3.67 6.49 3.39 3.37 3.58 2.79 4.01 7.8 6.03 4.58 4.75 6.19 5.02 6.86 4.95
8.37 7.48 5.3 6.41 9.4 10.52 7.01 4.74 6.03 0.8 12.62 19.43 17.78 11.92 12.57 19.57 16.9 14.73 13.08
5.51 6.44 2.82 4.37 6.42 7.87 5.05 3.0 5.55 2.94 5.26 11.28 6.82 5.71 6.37 10.12 7.18 10.27 6.46
8.63 7.98 6.02 6.79 6.78 7.46 6.94 5.55 6.98 0.47 7.6 19.85 6.35 7.02 7.25 8.98 9.02 7.58 6.99
8.63 7.98 6.02 6.79 6.78 7.46 6.94 5.55 6.98 0.47 7.6 19.85 6.35 7.02 7.25 8.98 9.02 7.58 6.99
86.52 88.9 55.69 48.47 51.63 59.62 64.37 93.31 113.01 42.87 106.85 205.26 88.12 102.85 147.73 96.27 107.65 88.9 95.91
26.79 23.82 15.96 15.33 17.87 25.77 11.05 15.74 10.81 5.59 17.04 34.93 16.08 18.16 22.08 25.9 23.91 22.87 23.46
7.69 6.66 5.0 5.92 7.75 9.29 7.73 5.02 7.24 3.06 7.49 15.24 11.84 8.37 8.52 14.04 12.88 11.62 9.25
22.7 21.41 23.43 26.14 23.94 30.21 33.71 31.75 25.77 11.98 27.59 48.9 28.92 26.59 26.33 39.29 37.39 29.7 28.5
7.44 7.17 5.54 6.02 6.12 8.4 10.99 5.22 7.73 0.61 10.36 21.18 11.17 9.75 8.05 16.34 18.79 10.43 10.45
7.98 7.45 8.49 7.97 9.35 11.5 10.51 8.68 9.12 3.57 8.99 14.8 11.31 7.68 7.63 13.87 11.57 11.35 9.92
7.98 7.45 8.49 7.97 9.35 11.5 10.51 8.68 9.12 3.57 8.99 14.8 11.31 7.68 7.63 13.87 11.57 11.35 9.92
10.56 14.7 4.4 7.88 5.46 10.66 10.1 9.45 9.25 3.01 13.08 17.81 21.41 16.62 20.79 19.41 20.21 20.31 12.37
10.56 14.7 4.4 7.88 5.46 10.66 10.1 9.45 9.25 3.01 13.08 17.81 21.41 16.62 20.79 19.41 20.21 20.31 12.37
12.4 11.91 4.28 4.33 11.81 16.87 4.35 2.62 5.02 3.86 10.05 22.13 16.52 15.07 13.56 16.01 12.94 15.91 11.05
12.4 11.91 4.28 4.33 11.81 16.87 4.35 2.62 5.02 3.86 10.05 22.13 16.52 15.07 13.56 16.01 12.94 15.91 11.05
342.1 466.61 311.26 322.09 205.06 282.67 223.01 222.86 271.16 175.65 385.37 689.79 398.97 293.67 347.41 328.37 350.79 254.78 236.93
400.67 458.82 338.08 400.23 411.49 385.16 437.36 325.35 371.99 211.89 352.41 687.08 382.4 337.88 354.55 433.65 376.97 411.44 338.0
35.37 35.43 15.88 28.81 32.38 37.75 30.49 18.17 36.22 5.48 29.78 63.27 39.36 30.04 33.19 42.43 37.76 33.55 23.13
59.99 56.85 87.12 110.54 97.56 51.57 90.25 34.6 104.13 56.27 79.15 162.97 94.7 54.46 57.98 164.19 158.12 77.77 62.37
13.78 14.66 10.09 11.5 9.65 13.91 11.98 14.95 13.41 5.63 12.73 23.81 13.24 13.62 14.86 14.55 15.01 13.49 15.71
14.69 19.32 5.15 7.87 8.27 13.97 11.51 6.45 11.56 3.36 16.46 31.27 24.32 22.06 23.84 30.18 25.43 33.33 22.17
29.6 42.0 30.14 32.12 35.55 46.54 31.41 38.36 25.92 11.17 33.01 80.7 16.53 38.3 44.49 37.36 34.64 41.14 28.5
14.6 15.39 18.52 16.11 16.77 19.44 12.84 10.52 12.86 4.46 21.37 37.15 19.35 15.23 13.0 29.22 23.37 23.47 18.51
1.76 1.01 0.45 0.29 1.38 2.97 0.73 1.09 0.63 0.13 2.69 5.73 5.64 3.52 5.1 5.01 4.46 4.44 3.31
28.56 27.05 17.37 21.29 17.32 24.69 26.51 18.89 22.08 2.33 24.4 49.24 25.7 27.23 24.79 34.26 30.3 30.17 21.57
25.29 28.38 13.17 14.17 16.89 22.69 12.48 12.84 15.23 4.38 15.87 41.48 23.35 19.24 24.91 27.11 25.02 27.04 15.57
17.14 18.08 11.19 15.25 13.83 17.86 18.11 16.75 18.35 3.36 17.38 32.59 25.38 14.34 16.31 21.9 21.11 16.4 20.44
33.95 41.43 22.25 28.18 24.39 29.89 24.16 31.37 31.42 12.53 43.21 58.78 51.12 39.53 46.5 58.26 52.04 50.4 33.37
13.72 12.73 7.12 10.51 12.71 12.04 8.47 2.76 10.63 4.8 11.68 22.59 12.44 11.28 10.08 19.93 15.14 15.89 12.35
12.25 12.04 6.22 8.54 8.47 8.72 7.16 5.0 9.07 2.61 10.78 24.65 13.41 11.28 11.35 15.65 15.46 14.19 7.2
17.75 11.29 14.73 21.8 27.52 17.03 29.34 2.64 26.92 1.89 20.33 26.83 22.31 13.75 11.76 32.1 21.82 22.56 11.74
48.8 48.34 42.7 32.7 26.54 38.89 29.26 36.87 44.56 14.26 41.39 65.85 38.99 40.25 39.83 47.38 43.97 41.26 37.06
5.62 5.91 3.63 4.6 5.85 7.07 5.78 4.06 6.03 3.19 5.27 8.23 6.0 6.33 5.76 7.69 7.88 7.72 6.72
16.23 13.93 10.71 11.55 15.07 17.36 16.04 8.15 14.0 0.75 15.05 29.46 21.68 15.29 13.67 21.42 23.09 17.19 12.34
1.95 2.27 1.18 1.5 2.61 3.43 1.59 1.12 1.53 0.5 2.37 5.75 3.92 3.25 3.32 5.69 4.19 5.56 2.71
13.69 15.39 5.35 6.4 7.4 11.02 14.16 21.82 14.79 4.28 18.0 33.89 42.67 37.89 45.91 31.03 26.89 41.41 18.33
170.79 207.23 268.78 293.49 247.87 324.41 81.91 102.97 83.09 154.2 248.1 607.72 290.25 243.15 312.29 192.74 233.42 197.31 379.55
11.34 10.7 8.56 7.15 8.34 7.94 12.02 4.25 12.78 2.3 8.68 18.08 9.02 8.84 9.47 13.65 10.4 12.02 7.22
16.69 18.01 13.68 17.39 14.8 16.31 19.88 20.44 25.5 8.29 17.91 35.3 19.52 16.56 15.79 20.83 22.77 19.45 17.21
2.21 1.01 1.41 1.34 2.16 2.86 4.97 3.81 3.74 2.47 5.49 13.2 9.65 6.63 6.88 10.04 10.19 8.83 5.24
12.35 13.82 9.9 10.55 10.51 13.9 11.17 11.7 10.99 6.73 13.19 18.5 16.11 13.99 15.01 21.21 18.26 17.56 13.22
38.33 38.46 22.61 28.21 32.69 53.04 22.26 32.17 35.59 8.4 31.04 81.47 36.94 40.79 43.13 38.1 41.6 48.86 52.56
4.09 4.35 3.53 4.01 4.09 6.08 4.2 4.63 3.15 2.2 5.5 7.96 6.17 6.33 7.15 9.21 8.26 7.88 6.2
4.09 4.35 3.53 4.01 4.09 6.08 4.2 4.63 3.15 2.2 5.5 7.96 6.17 6.33 7.15 9.21 8.26 7.88 6.2
39.4 33.83 28.17 33.39 28.5 46.03 24.98 27.27 15.55 5.58 29.42 57.07 28.29 28.69 35.72 32.48 34.62 35.51 36.27
4.67 10.69 3.91 4.52 4.31 7.47 2.57 3.84 4.08 2.77 7.96 11.86 13.72 12.57 11.08 11.2 13.13 15.75 9.99
126.68 171.49 126.95 128.29 103.91 182.01 44.36 93.8 52.74 14.08 114.58 280.47 101.75 88.44 141.87 95.93 104.98 113.96 197.69
12.81 19.6 12.51 18.17 12.97 20.36 12.8 22.39 13.08 8.19 20.64 30.63 17.54 19.6 23.39 25.02 21.93 17.42 24.69
10.74 10.09 4.13 4.1 4.57 7.67 3.83 2.75 9.87 1.86 7.77 25.68 13.79 10.29 10.85 11.82 15.62 16.53 8.77
13.41 16.23 9.06 9.36 9.01 11.66 9.02 12.7 8.53 7.46 8.75 24.8 11.05 10.56 11.75 15.32 13.9 13.07 8.7
3.59 3.38 2.4 3.19 3.54 4.86 3.47 3.63 2.78 2.84 4.89 7.95 5.47 5.02 6.14 7.13 6.4 6.73 5.61
3.59 3.38 2.4 3.19 3.54 4.86 3.47 3.63 2.78 2.84 4.89 7.95 5.47 5.02 6.14 7.13 6.4 6.73 5.61
9.42 6.93 7.01 7.73 8.22 11.43 9.83 8.88 9.62 5.18 11.81 18.67 14.94 12.43 14.03 15.7 15.43 14.55 11.16
9.42 6.93 7.01 7.73 8.22 11.43 9.83 8.88 9.62 5.18 11.81 18.67 14.94 12.43 14.03 15.7 15.43 14.55 11.16
37.17 41.87 27.94 24.78 37.32 41.22 30.37 38.04 24.83 20.99 28.6 72.58 37.43 28.41 31.73 47.33 44.78 35.23 33.33
14.85 15.57 8.66 9.56 10.0 13.74 10.19 10.45 11.72 3.29 13.85 23.72 14.24 16.93 14.92 21.95 18.29 21.45 13.08
2.58 2.89 3.35 3.22 2.03 3.62 2.99 4.41 1.58 1.73 4.78 6.85 4.85 3.99 5.78 9.63 7.59 7.64 4.43
32.48 43.96 18.6 17.83 28.12 37.94 22.87 28.42 20.54 12.44 29.53 72.71 36.24 25.84 43.41 42.67 40.81 43.64 33.85
14.76 18.28 6.2 8.99 10.98 13.59 12.49 10.79 12.37 3.34 11.08 19.4 11.9 13.22 16.67 21.49 18.95 17.52 11.75
14.76 18.28 6.2 8.99 10.98 13.59 12.49 10.79 12.37 3.34 11.08 19.4 11.9 13.22 16.67 21.49 18.95 17.52 11.75
8.42 14.24 7.41 6.95 9.24 15.69 8.33 6.84 7.86 0.32 7.96 21.9 11.44 10.71 11.23 15.14 14.79 13.86 5.23
26.0 38.7 19.25 22.1 22.3 33.44 25.44 38.68 22.42 6.95 24.54 66.87 28.49 28.28 30.58 35.61 32.53 32.75 24.34
6.56 6.61 3.46 4.47 5.48 8.37 3.44 1.73 3.6 0.28 4.61 11.89 6.05 5.45 5.38 7.79 7.27 6.8 6.73
38.25 38.14 15.59 20.79 23.4 30.72 23.45 10.12 38.9 7.54 25.2 74.33 34.47 32.62 28.95 32.45 30.87 37.16 25.33
88.28 92.86 55.44 50.39 57.64 108.65 38.86 45.8 19.2 9.67 63.98 184.09 55.45 74.45 72.48 89.85 86.61 72.03 84.84
3.46 3.27 4.18 4.99 5.77 8.49 3.95 3.86 2.58 4.54 8.81 11.89 8.18 7.98 9.47 12.39 9.11 11.9 10.74

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)