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Heatmap: Cluster_8 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
-0.13 -0.28 -0.99 -1.07 -0.32 0.02 -0.86 -1.46 -0.93 -3.39 0.06 1.05 0.5 -0.03 0.26 0.96 0.66 0.77 0.03
-0.18 -0.26 -0.5 -0.29 -0.07 0.27 -0.14 -0.63 -0.61 -1.56 0.01 0.68 0.31 0.01 0.3 0.53 0.36 0.32 -0.02
-0.93 -0.37 -1.42 0.22 0.28 -0.32 -0.16 -0.82 -0.43 -3.89 -0.06 1.06 0.65 -0.6 -0.16 0.85 1.03 0.13 -0.39
-0.2 0.46 -0.75 -0.74 -0.36 0.46 -0.48 -0.49 -0.4 -0.76 -0.24 0.72 0.35 -0.04 0.01 0.39 0.09 0.54 0.07
-0.36 -0.53 -1.02 -0.75 -0.2 -0.03 -0.62 -1.18 -0.84 -3.76 0.23 0.85 0.72 0.15 0.22 0.86 0.65 0.45 0.28
-0.19 0.03 -1.16 -0.52 0.03 0.32 -0.32 -1.07 -0.18 -1.1 -0.26 0.84 0.12 -0.14 0.02 0.69 0.19 0.71 0.04
0.19 0.07 -0.33 -0.16 -0.16 -0.03 -0.13 -0.45 -0.12 -4.0 0.0 1.39 -0.26 -0.11 -0.07 0.24 0.25 -0.0 -0.12
0.19 0.07 -0.33 -0.16 -0.16 -0.03 -0.13 -0.45 -0.12 -4.0 0.0 1.39 -0.26 -0.11 -0.07 0.24 0.25 -0.0 -0.12
-0.09 -0.05 -0.72 -0.92 -0.83 -0.62 -0.51 0.02 0.3 -1.1 0.22 1.16 -0.06 0.16 0.69 0.07 0.23 -0.05 0.06
0.45 0.28 -0.3 -0.36 -0.14 0.39 -0.83 -0.32 -0.86 -1.81 -0.2 0.83 -0.29 -0.11 0.17 0.4 0.28 0.22 0.26
-0.17 -0.38 -0.79 -0.55 -0.16 0.1 -0.16 -0.79 -0.26 -1.5 -0.21 0.82 0.45 -0.05 -0.02 0.7 0.57 0.42 0.09
-0.34 -0.42 -0.29 -0.13 -0.26 0.08 0.24 0.15 -0.15 -1.26 -0.05 0.77 0.01 -0.11 -0.12 0.46 0.38 0.05 -0.01
-0.36 -0.42 -0.79 -0.67 -0.64 -0.19 0.2 -0.87 -0.31 -3.97 0.12 1.15 0.22 0.03 -0.25 0.77 0.97 0.12 0.13
-0.26 -0.36 -0.17 -0.26 -0.03 0.27 0.14 -0.14 -0.07 -1.42 -0.09 0.63 0.24 -0.32 -0.33 0.54 0.27 0.25 0.05
-0.26 -0.36 -0.17 -0.26 -0.03 0.27 0.14 -0.14 -0.07 -1.42 -0.09 0.63 0.24 -0.32 -0.33 0.54 0.27 0.25 0.05
-0.3 0.17 -1.57 -0.73 -1.25 -0.29 -0.37 -0.46 -0.49 -2.11 0.01 0.45 0.72 0.35 0.67 0.58 0.63 0.64 -0.07
-0.3 0.17 -1.57 -0.73 -1.25 -0.29 -0.37 -0.46 -0.49 -2.11 0.01 0.45 0.72 0.35 0.67 0.58 0.63 0.64 -0.07
0.16 0.1 -1.37 -1.36 0.09 0.61 -1.35 -2.08 -1.14 -1.52 -0.14 1.0 0.58 0.44 0.29 0.53 0.22 0.52 -0.0
0.16 0.1 -1.37 -1.36 0.09 0.61 -1.35 -2.08 -1.14 -1.52 -0.14 1.0 0.58 0.44 0.29 0.53 0.22 0.52 -0.0
0.09 0.54 -0.05 0.0 -0.65 -0.19 -0.53 -0.53 -0.25 -0.87 0.26 1.1 0.31 -0.13 0.11 0.03 0.13 -0.34 -0.44
0.04 0.23 -0.21 0.04 0.08 -0.02 0.16 -0.26 -0.07 -0.88 -0.15 0.82 -0.03 -0.21 -0.14 0.15 -0.05 0.08 -0.21
0.14 0.15 -1.01 -0.15 0.02 0.24 -0.07 -0.82 0.18 -2.55 -0.1 0.98 0.3 -0.09 0.05 0.41 0.24 0.07 -0.47
-0.54 -0.62 -0.0 0.34 0.16 -0.76 0.05 -1.34 0.25 -0.64 -0.14 0.9 0.12 -0.68 -0.59 0.91 0.86 -0.17 -0.49
0.03 0.12 -0.42 -0.23 -0.48 0.04 -0.17 0.15 -0.01 -1.26 -0.08 0.82 -0.03 0.01 0.14 0.11 0.15 -0.0 0.22
-0.25 0.15 -1.76 -1.15 -1.08 -0.32 -0.6 -1.43 -0.59 -2.38 -0.08 0.84 0.48 0.34 0.45 0.79 0.55 0.93 0.35
-0.27 0.24 -0.24 -0.15 -0.0 0.38 -0.18 0.11 -0.46 -1.67 -0.11 1.18 -1.11 0.1 0.32 0.07 -0.04 0.21 -0.32
-0.3 -0.23 0.04 -0.16 -0.1 0.11 -0.49 -0.78 -0.49 -2.01 0.25 1.04 0.1 -0.24 -0.47 0.7 0.38 0.38 0.04
-0.59 -1.4 -2.55 -3.2 -0.95 0.16 -1.86 -1.28 -2.06 -4.33 0.02 1.11 1.09 0.41 0.95 0.92 0.75 0.75 0.32
0.2 0.12 -0.52 -0.23 -0.53 -0.01 0.09 -0.4 -0.18 -3.42 -0.03 0.98 0.04 0.13 -0.01 0.46 0.28 0.27 -0.21
0.32 0.49 -0.62 -0.52 -0.26 0.16 -0.7 -0.66 -0.41 -2.21 -0.35 1.03 0.2 -0.08 0.3 0.42 0.3 0.42 -0.38
-0.04 0.03 -0.66 -0.21 -0.35 0.02 0.03 -0.08 0.05 -2.39 -0.02 0.88 0.52 -0.3 -0.12 0.31 0.26 -0.11 0.21
-0.14 0.14 -0.75 -0.41 -0.62 -0.33 -0.63 -0.26 -0.26 -1.58 0.2 0.65 0.45 0.08 0.31 0.64 0.47 0.43 -0.17
0.2 0.09 -0.75 -0.18 0.09 0.01 -0.49 -2.12 -0.17 -1.31 -0.03 0.92 0.06 -0.08 -0.24 0.74 0.34 0.41 0.05
0.19 0.16 -0.79 -0.33 -0.34 -0.3 -0.58 -1.1 -0.24 -2.04 0.01 1.2 0.32 0.07 0.08 0.54 0.53 0.4 -0.58
-0.07 -0.72 -0.34 0.23 0.56 -0.13 0.65 -2.82 0.53 -3.3 0.13 0.53 0.26 -0.44 -0.66 0.78 0.23 0.28 -0.67
0.29 0.28 0.1 -0.29 -0.59 -0.04 -0.45 -0.12 0.16 -1.49 0.05 0.72 -0.03 0.01 -0.0 0.25 0.14 0.05 -0.11
-0.09 -0.01 -0.72 -0.37 -0.03 0.25 -0.04 -0.55 0.02 -0.91 -0.18 0.46 0.01 0.08 -0.05 0.37 0.4 0.37 0.17
0.07 -0.15 -0.53 -0.42 -0.03 0.17 0.06 -0.92 -0.14 -4.35 -0.04 0.93 0.49 -0.01 -0.17 0.47 0.58 0.16 -0.32
-0.55 -0.34 -1.28 -0.93 -0.14 0.26 -0.85 -1.36 -0.9 -2.53 -0.27 1.0 0.45 0.18 0.21 0.99 0.55 0.96 -0.08
-0.66 -0.49 -2.01 -1.76 -1.54 -0.97 -0.61 0.02 -0.55 -2.33 -0.26 0.65 0.98 0.81 1.09 0.52 0.32 0.94 -0.24
-0.52 -0.24 0.14 0.27 0.02 0.41 -1.58 -1.25 -1.56 -0.66 0.02 1.32 0.25 -0.01 0.35 -0.34 -0.06 -0.31 0.64
0.24 0.15 -0.17 -0.43 -0.21 -0.28 0.32 -1.18 0.41 -2.06 -0.15 0.91 -0.09 -0.12 -0.02 0.5 0.11 0.32 -0.41
-0.17 -0.06 -0.46 -0.11 -0.34 -0.2 0.08 0.12 0.44 -1.18 -0.07 0.91 0.06 -0.18 -0.25 0.15 0.28 0.05 -0.12
-1.29 -2.41 -1.94 -2.0 -1.32 -0.91 -0.11 -0.5 -0.52 -1.12 0.03 1.3 0.84 0.3 0.36 0.9 0.92 0.72 -0.04
-0.14 0.02 -0.46 -0.37 -0.37 0.03 -0.29 -0.22 -0.31 -1.02 -0.05 0.44 0.24 0.04 0.14 0.64 0.42 0.37 -0.04
0.0 0.01 -0.76 -0.44 -0.23 0.47 -0.78 -0.25 -0.1 -2.19 -0.3 1.09 -0.05 0.09 0.17 -0.0 0.12 0.35 0.46
-0.43 -0.34 -0.64 -0.46 -0.43 0.14 -0.39 -0.26 -0.81 -1.33 -0.01 0.53 0.16 0.2 0.37 0.74 0.58 0.51 0.17
-0.43 -0.34 -0.64 -0.46 -0.43 0.14 -0.39 -0.26 -0.81 -1.33 -0.01 0.53 0.16 0.2 0.37 0.74 0.58 0.51 0.17
0.32 0.1 -0.17 0.08 -0.15 0.54 -0.34 -0.21 -1.02 -2.5 -0.1 0.85 -0.16 -0.14 0.18 0.04 0.13 0.17 0.2
-0.81 0.38 -1.07 -0.86 -0.93 -0.14 -1.68 -1.1 -1.01 -1.57 -0.05 0.53 0.74 0.61 0.43 0.45 0.68 0.94 0.28
0.08 0.51 0.08 0.09 -0.21 0.6 -1.44 -0.36 -1.19 -3.09 -0.07 1.22 -0.24 -0.44 0.24 -0.33 -0.2 -0.08 0.72
-0.54 0.07 -0.57 -0.04 -0.52 0.13 -0.54 0.27 -0.51 -1.18 0.15 0.72 -0.09 0.07 0.33 0.43 0.24 -0.1 0.41
0.18 0.08 -1.2 -1.21 -1.06 -0.31 -1.31 -1.79 0.05 -2.36 -0.29 1.43 0.54 0.11 0.19 0.31 0.72 0.8 -0.12
0.18 0.46 -0.38 -0.34 -0.39 -0.02 -0.39 0.1 -0.47 -0.66 -0.43 1.07 -0.1 -0.16 -0.01 0.38 0.24 0.15 -0.44
-0.38 -0.47 -0.97 -0.55 -0.41 0.05 -0.43 -0.37 -0.75 -0.72 0.06 0.76 0.22 0.1 0.39 0.61 0.45 0.52 0.26
-0.38 -0.47 -0.97 -0.55 -0.41 0.05 -0.43 -0.37 -0.75 -0.72 0.06 0.76 0.22 0.1 0.39 0.61 0.45 0.52 0.26
-0.25 -0.69 -0.68 -0.54 -0.45 0.03 -0.19 -0.34 -0.22 -1.11 0.08 0.74 0.41 0.15 0.32 0.49 0.46 0.38 -0.01
-0.25 -0.69 -0.68 -0.54 -0.45 0.03 -0.19 -0.34 -0.22 -1.11 0.08 0.74 0.41 0.15 0.32 0.49 0.46 0.38 -0.01
0.05 0.22 -0.37 -0.54 0.05 0.2 -0.25 0.08 -0.54 -0.78 -0.33 1.01 0.06 -0.34 -0.18 0.39 0.32 -0.03 -0.11
0.08 0.15 -0.7 -0.55 -0.49 -0.03 -0.46 -0.42 -0.26 -2.09 -0.02 0.76 0.02 0.27 0.09 0.65 0.38 0.61 -0.1
-0.78 -0.61 -0.4 -0.45 -1.13 -0.29 -0.57 -0.0 -1.49 -1.35 0.11 0.63 0.13 -0.15 0.39 1.12 0.78 0.79 0.0
-0.03 0.4 -0.84 -0.9 -0.24 0.19 -0.54 -0.23 -0.7 -1.42 -0.17 1.13 0.12 -0.36 0.38 0.36 0.3 0.39 0.03
0.14 0.45 -1.11 -0.57 -0.28 0.02 -0.1 -0.31 -0.11 -2.0 -0.27 0.54 -0.17 -0.01 0.32 0.69 0.51 0.39 -0.18
0.14 0.45 -1.11 -0.57 -0.28 0.02 -0.1 -0.31 -0.11 -2.0 -0.27 0.54 -0.17 -0.01 0.32 0.69 0.51 0.39 -0.18
-0.31 0.45 -0.49 -0.58 -0.17 0.59 -0.32 -0.6 -0.4 -5.03 -0.38 1.07 0.14 0.04 0.11 0.54 0.51 0.41 -0.99
-0.18 0.39 -0.61 -0.41 -0.4 0.18 -0.21 0.39 -0.39 -2.08 -0.26 1.18 -0.05 -0.06 0.05 0.27 0.14 0.15 -0.27
0.23 0.25 -0.69 -0.32 -0.03 0.58 -0.7 -1.69 -0.63 -4.31 -0.27 1.09 0.12 -0.03 -0.05 0.48 0.38 0.29 0.27
0.35 0.35 -0.94 -0.52 -0.35 0.04 -0.35 -1.56 0.38 -1.99 -0.25 1.31 0.2 0.12 -0.05 0.12 0.05 0.31 -0.24
0.31 0.39 -0.36 -0.5 -0.3 0.61 -0.87 -0.63 -1.89 -2.88 -0.15 1.37 -0.36 0.07 0.03 0.34 0.28 0.02 0.26
-1.04 -1.13 -0.77 -0.52 -0.31 0.25 -0.85 -0.88 -1.47 -0.65 0.3 0.74 0.2 0.16 0.41 0.8 0.35 0.74 0.59

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.