1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.0 0.0 1.05 5.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.7 0.0 0.0 1.05 0.0 0.8 0.81 0.48 0.21
0.0 0.06 0.82 1.02 0.0 0.28 0.22 0.0 0.0 0.67 0.15 0.2 0.14 0.28 0.19 0.36 0.17 0.81 0.09
0.05 0.03 0.03 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.01 0.0 0.07 0.06 0.13 0.0 0.04 0.13
0.05 0.0 0.16 0.18 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.07 0.04 0.13 0.04 0.23 0.14 0.26 0.07
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 8.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.16 0.0 0.0 0.54 0.25 0.28 0.37 0.3
0.0 0.04 0.46 0.18 0.02 0.0 0.0 0.03 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 4.11 0.0 1.97 3.71 3.5 1.12 0.0 0.57 6.26 0.79 0.0 1.69 1.48 0.35 1.4 1.82 0.68 5.5
0.0 0.0 0.0 4.01 1.39 3.66 0.59 3.31 0.66 2.66 1.13 0.0 0.0 0.91 0.6 1.31 0.54 1.29 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.05 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.05 0.07 0.03
0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 1.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.51 1.47 0.0 1.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.27 0.0 0.07 0.13 0.79
0.0 0.0 0.0 3.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.21 0.61 0.85 6.3 0.67 0.0 0.0 1.58 0.27 0.73 0.34 0.0 1.16 0.14 1.16 0.96 0.37 0.35 0.08
0.06 0.27 0.41 0.32 0.47 0.66 0.36 0.12 0.47 0.13 0.21 0.34 0.07 0.39 0.17 0.31 0.31 0.53 0.99
0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.26 0.09 0.0 0.0 0.39 0.39 0.0 0.07 0.6 0.06
0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.76 0.14 0.0 0.37 1.01 1.03 0.33 0.42 0.51 0.54 0.11 0.0 0.0 1.84 0.04 0.16 0.28 0.96 0.17
0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.5 0.32 1.18 0.77 1.24 0.68 0.8 0.81 0.89 0.14 0.33 0.27 0.49 0.19 0.15 0.41 0.36 0.09
0.0 0.0 0.0 1.89 0.0 0.0 1.17 0.0 0.0 0.09 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.23 0.18 0.16 0.08 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.06
0.53 0.0 0.0 2.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.12 0.0 0.37 0.14 0.0 0.23 0.0 0.14
2.44 0.0 0.0 9.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.55 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.24 0.44
0.0 0.0 0.16 0.27 0.0 0.18 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.06 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.23 0.06 0.17 0.07 0.0 0.06 0.15 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04
0.0 2.42 0.2 6.92 0.0 0.0 2.71 0.73 0.51 1.72 0.0 0.31 0.1 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 1.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12
0.0 0.53 0.0 3.81 0.35 0.0 0.0 0.0 0.94 3.22 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
0.0 0.0 1.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.51 0.34 4.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.04 0.0 0.38 0.0 0.08 2.21
0.0 0.0 0.07 0.12 0.0 0.08 0.03 0.03 0.03 0.07 0.03 0.0 0.04 0.02 0.01 0.02 0.02 0.07 0.02
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0 0.22 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
0.0 14.73 17.42 24.9 6.95 2.06 0.0 0.0 3.3 4.85 3.46 1.06 0.41 0.67 3.55 2.16 2.44 0.26 0.57
0.0 0.0 2.81 0.69 0.0 0.0 1.48 0.0 0.75 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.0 0.09 0.0 0.18 0.0
0.0 0.0 0.0 2.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.52 0.4 0.0 0.0 0.55 0.0 0.82 0.19 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.06 0.0 0.27 0.0 0.0 0.17 0.74 0.3 0.0 0.14 0.17 0.12 0.07 0.27 0.15 0.53
0.0 0.0 0.0 4.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.81 0.0 0.32 0.35 0.58 0.41 0.0 0.92 0.09
0.0 0.0 0.06 0.23 0.03 0.0 0.0 0.14 0.0 0.23 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.08 0.03 0.12 0.01
0.0 0.0 0.0 2.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0
0.0 0.86 1.58 3.99 0.0 0.0 0.0 1.31 0.0 0.49 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0
0.0 0.65 0.44 1.78 0.0 0.0 0.53 0.5 0.0 0.51 0.71 0.0 0.09 0.33 0.28 0.62 0.31 0.59 0.71
0.91 0.18 0.0 0.0 2.27 1.57 0.26 0.24 0.44 0.34 0.02 0.0 0.0 0.24 0.2 0.22 0.33 0.4 1.67
0.0 0.0 0.2 0.3 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.07 0.04 0.0 0.04 0.15 0.04
7.74 19.44 10.95 6.0 15.84 19.38 6.34 9.32 2.64 12.64 6.48 11.0 4.45 18.44 8.13 5.86 6.63 14.26 5.04
0.0 0.0 0.16 0.37 0.06 0.0 0.07 0.06 0.09 0.13 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.09 0.05 0.03
0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.32 1.46 3.53 0.98 0.52 0.76 0.0 0.65 2.1 0.0 0.29 0.0 0.55 0.08 0.0 0.39 0.25 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.26 0.0 0.73 0.75 1.19 0.16 0.04 0.25 0.0 0.18 0.0 0.11 0.12 0.0 0.04 0.41 0.14 0.09
0.0 0.0 0.0 1.06 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.37 0.0 0.08 0.09 0.16
0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39
0.0 0.0 1.66 2.52 0.45 0.37 0.0 0.0 0.38 2.21 0.25 0.0 0.0 0.54 0.74 0.19 0.3 0.67 0.0
0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0
0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.57 0.44 0.0 0.0 0.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0
0.04 0.0 0.04 0.2 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.08 0.23 0.93 1.79 0.41 0.18 0.0 0.0 0.09 0.0 0.2 0.0 0.0 0.09 0.13 0.15 0.35 0.02 0.23
0.0 0.0 0.0 8.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.15 0.0 0.15 0.0
0.0 0.0 0.12 0.07 0.0 0.02 0.0 0.08 0.08 0.13 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.08 0.02
0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.4 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.05 0.12 0.02 0.05 0.05 0.07 0.05
0.0 0.0 7.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 4.01 0.0 1.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 4.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.17 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.46 0.18 0.0 0.11 0.03 0.05 0.24 0.02 0.0 0.0 0.02 0.04 0.06 0.06 0.0 0.06
0.0 0.26 0.0 0.5 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.07 0.0 0.27 0.08 0.0 0.15 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 1.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.09 0.0
0.0 0.08 0.07 0.57 0.08 0.36 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.03 0.14 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 0.0 0.61 0.77 0.0 1.71 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.23 0.34 0.1 0.13 0.32 0.22
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.02 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 5.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.52 0.0 1.56 1.88 0.22 1.35 1.85 0.67 0.63 0.81 0.0
0.0 0.0 0.0 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.24 0.37 0.04 0.06 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.32
0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.01
0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.01 0.0 0.46 0.21 0.66 0.2 0.23 0.0 0.0 0.67 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03
0.33 1.09 0.0 0.3 0.48 0.25 0.0 0.0 0.52 0.56 0.41 0.0 0.28 0.78 0.32 1.03 0.36 0.18 0.75

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)