Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Diurnal Dark 2h	Diurnal Dark 6h	Diurnal Light 2h	Diurnal Light 6h	Diurnal Light 10h	Diurnal Light 14h	20°C Liquid	4°C Liquid	20°C Desiccation	4°C Desiccation	20°C plate	CadmiumCl 250 µM, 24h	Dark, 24h	HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)	Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h	Mannitol 300 mM,24h	NaCl 150 mM, 24h	UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)	pH = 9, 24h
Zci_00108.1	0.0	0.0	0.18	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.12	0.0	0.0	0.18	0.0	0.14	0.14	0.08	0.04
Zci_00250.1	0.0	0.06	0.8	1.0	0.0	0.28	0.21	0.0	0.0	0.66	0.15	0.2	0.14	0.27	0.18	0.36	0.16	0.8	0.09
Zci_00297.1	0.38	0.25	0.23	0.0	0.64	0.11	0.0	0.0	0.0	0.5	0.36	0.04	0.0	0.54	0.42	1.0	0.02	0.27	0.97
Zci_00443.1	0.18	0.0	0.59	0.67	0.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.11	0.03	0.26	0.17	0.48	0.15	0.88	0.52	1.0	0.25
Zci_00491.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0
Zci_00494.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.07	0.03	0.03	0.05	0.04
Zci_01090.1	0.0	0.09	1.0	0.38	0.05	0.0	0.0	0.06	0.12	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_01126.1	0.0	0.66	0.0	0.31	0.59	0.56	0.18	0.0	0.09	1.0	0.13	0.0	0.27	0.24	0.06	0.22	0.29	0.11	0.88
Zci_01399.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.35	0.91	0.15	0.83	0.16	0.66	0.28	0.0	0.0	0.23	0.15	0.33	0.13	0.32	0.0
Zci_01732.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.35	0.57	0.0	0.0	0.61	0.78	0.0	0.0	1.0	0.0	0.26	0.54	0.85	0.37
Zci_02145.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_02377.1	0.0	0.0	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_02526.1	0.0	0.0	0.78	0.76	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.04	0.0	0.14	0.0	0.04	0.07	0.41
Zci_02631.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_02943.2	0.19	0.1	0.14	1.0	0.11	0.0	0.0	0.25	0.04	0.12	0.05	0.0	0.18	0.02	0.18	0.15	0.06	0.06	0.01
Zci_03217.1	0.07	0.28	0.41	0.33	0.47	0.67	0.36	0.12	0.48	0.13	0.21	0.35	0.07	0.4	0.17	0.31	0.31	0.54	1.0
Zci_03291.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.39	0.14	0.0	0.0	0.59	0.6	0.0	0.1	0.92	0.09
Zci_03386.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_03559.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_03823.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_03859.1	0.41	0.07	0.0	0.2	0.55	0.56	0.18	0.23	0.28	0.29	0.06	0.0	0.0	1.0	0.02	0.08	0.15	0.52	0.09
Zci_03974.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_04474.1	0.58	0.4	0.26	0.95	0.62	1.0	0.55	0.64	0.65	0.71	0.12	0.27	0.21	0.39	0.15	0.12	0.33	0.29	0.07
Zci_04527.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.05	0.04	0.0	0.02	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0
Zci_05294.1	0.0	0.0	0.75	1.0	0.8	0.69	0.33	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.26
Zci_05397.1	0.25	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.06	0.0	0.17	0.07	0.0	0.11	0.0	0.07
Zci_05488.1	0.25	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_05562.1	0.0	0.0	0.0	0.32	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	1.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.43	0.8
Zci_05584.1	0.0	0.0	0.59	1.0	0.0	0.66	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.04	0.0	0.0	0.23	0.12	0.1
Zci_05598.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.25	0.77	0.33	0.0	0.25	0.65	0.02	0.0	0.0	0.07	0.0	0.04	0.0	0.0	0.16
Zci_05599.1	0.0	0.35	0.03	1.0	0.0	0.0	0.39	0.11	0.07	0.25	0.0	0.04	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Zci_05655.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_06247.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_06279.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.51
Zci_06648.1	0.0	0.14	0.0	1.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.25	0.84	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06
Zci_06729.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_06916.1	0.0	0.37	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.09	0.0	0.02	0.54
Zci_06932.1	0.0	0.0	0.59	1.0	0.0	0.67	0.27	0.24	0.28	0.58	0.25	0.0	0.29	0.19	0.09	0.18	0.12	0.53	0.15
Zci_06950.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.23	0.23	0.0	0.54	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44
Zci_07339.2	0.0	0.59	0.7	1.0	0.28	0.08	0.0	0.0	0.13	0.19	0.14	0.04	0.02	0.03	0.14	0.09	0.1	0.01	0.02
Zci_07378.1	0.0	0.0	1.0	0.24	0.0	0.0	0.53	0.0	0.27	0.0	0.0	0.02	0.0	0.04	0.0	0.03	0.0	0.07	0.0
Zci_07379.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.21	0.16	0.0	0.0	0.22	0.0	0.33	0.08	0.1	0.0
Zci_07730.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_07909.2	0.0	0.0	0.18	0.08	0.0	0.37	0.0	0.0	0.23	1.0	0.41	0.0	0.2	0.23	0.16	0.09	0.37	0.21	0.72
Zci_08023.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.17	0.0	0.07	0.07	0.12	0.09	0.0	0.19	0.02
Zci_08429.1	0.0	0.0	0.27	1.0	0.12	0.0	0.0	0.6	0.0	0.99	0.04	0.0	0.0	0.03	0.16	0.35	0.13	0.52	0.05
Zci_08503.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0
Zci_08508.1	0.0	0.22	0.4	1.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.12	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Zci_08904.1	0.0	0.37	0.25	1.0	0.0	0.0	0.3	0.28	0.0	0.28	0.4	0.0	0.05	0.18	0.16	0.35	0.18	0.33	0.4
Zci_08962.1	0.4	0.08	0.0	0.0	1.0	0.69	0.11	0.11	0.19	0.15	0.01	0.0	0.0	0.11	0.09	0.1	0.14	0.18	0.74
Zci_08981.1	0.0	0.0	0.65	1.0	0.0	0.04	0.06	0.0	0.0	0.07	0.0	0.12	0.01	0.23	0.14	0.0	0.14	0.49	0.15
Zci_09167.1	0.4	1.0	0.56	0.31	0.81	1.0	0.33	0.48	0.14	0.65	0.33	0.57	0.23	0.95	0.42	0.3	0.34	0.73	0.26
Zci_09365.1	0.0	0.0	0.42	1.0	0.15	0.0	0.19	0.17	0.24	0.35	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.23	0.13	0.08
Zci_09596.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_09707.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15
Zci_09925.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_10231.1	0.0	0.09	0.41	1.0	0.28	0.15	0.21	0.0	0.18	0.6	0.0	0.08	0.0	0.16	0.02	0.0	0.11	0.07	0.0
Zci_10325.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	0.27	0.0	0.17
Zci_10449.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.2	0.09	0.0	0.73
Zci_10615.2	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.31	0.0	0.21	0.0
Zci_10688.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_10846.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_10900.3	0.06	0.22	0.0	0.61	0.63	1.0	0.13	0.04	0.21	0.0	0.15	0.0	0.09	0.1	0.0	0.03	0.34	0.12	0.08
Zci_10923.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_10992.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.12	0.0	0.03	0.03	0.05
Zci_11240.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4
Zci_11323.1	0.0	0.0	0.66	1.0	0.18	0.15	0.0	0.0	0.15	0.88	0.1	0.0	0.0	0.21	0.29	0.07	0.12	0.27	0.0
Zci_11409.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0
Zci_11420.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.71	0.56	0.0	0.0	0.0	0.16
Zci_11439.1	0.0	0.0	0.0	0.67	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Zci_11537.1	0.21	0.0	0.19	1.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.26	0.04	0.07	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0
Zci_11591.1	0.05	0.13	0.52	1.0	0.23	0.1	0.0	0.0	0.05	0.0	0.11	0.0	0.0	0.05	0.07	0.08	0.2	0.01	0.13
Zci_11642.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0
Zci_11772.1	0.0	0.0	0.89	0.52	0.0	0.15	0.0	0.59	0.58	1.0	0.0	0.0	0.18	0.03	0.0	0.46	0.12	0.64	0.16
Zci_12123.1	0.0	0.0	0.42	1.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.88	0.08	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.04	0.23	0.0
Zci_12576.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_12621.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0
Zci_12722.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_12792.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.32	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0
Zci_12930.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.0	0.37	0.84	0.1	0.32	0.35	0.5	0.38
Zci_13110.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_13205.3	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_13227.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_13296.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_13315.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_13988.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.38	0.0	0.24	0.07	0.1	0.52	0.04	0.0	0.0	0.04	0.1	0.12	0.12	0.0	0.12
Zci_14079.1	0.0	0.51	0.0	1.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.2	0.07	0.14	0.0	0.54	0.16	0.0	0.31	0.26	0.0
Zci_14223.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.08	0.0
Zci_14230.1	0.0	0.14	0.12	1.0	0.14	0.62	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.04	0.25	0.0	0.0	0.13	0.0	0.07
Zci_14487.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_14963.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_15029.1	0.21	0.0	0.36	0.45	0.0	1.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.13	0.2	0.06	0.07	0.19	0.13
Zci_15257.1	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.32	0.0	0.0	0.12	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.21	0.04	0.08	0.39	0.0
Zci_15323.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.31	0.37	0.04	0.27	0.37	0.13	0.13	0.16	0.0
Zci_15389.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.19	0.3	0.03	0.05	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.26
Zci_15679.5	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.02
Zci_15947.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_16059.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_16299.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Zci_16462.2	0.37	0.01	0.0	0.69	0.32	0.99	0.31	0.35	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.05
Zci_16615.2	0.3	1.0	0.0	0.28	0.44	0.23	0.0	0.0	0.47	0.52	0.38	0.0	0.26	0.72	0.29	0.94	0.33	0.17	0.69

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)