Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.03 0.04 0.31 0.34 0.2 0.03 0.32 0.2 0.2 0.1 0.2 0.05 1.0 0.04 0.06 0.2 0.15 0.25 0.21
0.21 0.27 0.48 0.5 0.45 0.46 0.47 0.9 0.52 0.07 0.75 0.16 0.34 0.48 0.54 1.0 0.82 0.65 0.74
0.0 0.0 0.11 0.06 0.06 0.0 0.12 0.02 0.11 0.03 0.18 0.29 1.0 0.04 0.11 0.35 0.09 0.3 0.08
0.09 0.05 0.05 0.06 0.07 0.05 0.25 0.0 0.21 0.13 0.18 0.07 1.0 0.15 0.04 0.19 0.1 0.09 0.08
0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.32 0.0 0.04 0.02 1.0 0.02 0.15 0.14 0.09 0.05 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.3 0.1 0.09 0.25 0.14 0.1 0.02 0.51 0.29 0.13 0.03 1.0 0.1 0.2 0.14 0.1 0.12 0.03
0.4 0.36 0.32 0.44 0.52 0.45 0.4 0.6 0.37 0.54 0.38 0.12 1.0 0.3 0.57 0.72 0.54 0.48 0.28
0.21 0.28 0.63 0.5 0.53 0.46 0.48 0.73 0.54 0.65 0.53 0.61 1.0 0.49 0.83 0.93 0.75 0.73 0.44
0.11 0.07 0.09 0.29 0.44 0.15 0.33 0.21 0.28 0.21 0.11 0.02 1.0 0.17 0.28 0.12 0.15 0.16 0.1
0.11 0.07 0.09 0.29 0.44 0.15 0.33 0.21 0.28 0.21 0.11 0.02 1.0 0.17 0.28 0.12 0.15 0.16 0.1
0.2 0.13 0.05 0.11 0.12 0.09 0.19 0.11 0.26 0.13 0.06 0.05 1.0 0.05 0.07 0.08 0.07 0.08 0.03
0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 0.02 0.11 0.05 0.13 0.02 1.0 0.17 0.07 0.15 0.12 0.15 0.06
0.05 0.17 0.18 0.12 0.05 0.13 0.12 0.2 0.22 0.19 0.07 0.01 1.0 0.07 0.08 0.13 0.09 0.07 0.04
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
0.69 0.52 0.1 0.18 0.23 0.21 0.1 0.13 0.32 0.23 0.13 0.09 1.0 0.12 0.31 0.18 0.12 0.19 0.09
0.34 0.2 0.08 0.14 0.29 0.18 0.17 0.03 0.21 0.1 0.06 0.09 1.0 0.16 0.26 0.08 0.06 0.2 0.05
0.15 0.11 0.5 0.38 0.46 0.2 0.65 1.0 0.56 0.36 0.82 0.53 0.32 0.5 0.6 0.96 0.91 0.64 0.91
0.03 0.03 0.25 0.28 0.32 0.09 0.28 0.48 0.22 0.32 0.3 0.18 1.0 0.17 0.63 0.37 0.38 0.45 0.3
0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 0.05 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01
0.05 0.02 0.18 0.1 0.02 0.01 0.01 0.0 0.09 0.01 0.03 0.04 1.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.11
0.03 0.01 0.12 0.17 0.04 0.02 0.01 0.0 0.34 0.02 0.0 0.01 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01
0.19 0.09 0.01 0.11 0.36 0.07 0.24 0.07 0.25 0.07 0.06 0.05 1.0 0.1 0.26 0.1 0.08 0.11 0.04
0.4 0.4 0.45 0.54 0.51 0.52 0.62 0.52 0.38 0.32 0.44 0.22 1.0 0.4 0.52 0.36 0.31 0.38 0.37
0.06 0.07 0.01 0.0 0.2 0.02 0.03 0.0 0.02 0.01 0.06 0.07 1.0 0.03 0.0 0.04 0.02 0.05 0.03
0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 0.21 0.07 0.08 0.01 1.0 0.06 0.05 0.18 0.17 0.1 0.06
0.13 0.11 0.11 0.16 0.13 0.03 0.19 0.01 0.27 0.08 0.16 0.25 1.0 0.09 0.04 0.19 0.16 0.14 0.06
0.27 0.1 0.01 0.02 0.02 0.04 0.04 0.08 0.15 0.22 0.06 0.25 1.0 0.05 0.11 0.09 0.1 0.09 0.07
0.05 0.06 0.05 0.06 0.07 0.07 0.08 0.02 0.23 0.17 0.18 0.03 1.0 0.2 0.22 0.23 0.19 0.33 0.13
0.06 0.06 0.03 0.04 0.06 0.05 0.05 0.04 0.05 0.03 0.09 0.05 1.0 0.13 0.17 0.13 0.12 0.14 0.11
0.05 0.03 0.01 0.06 0.12 0.01 0.07 0.02 0.14 0.07 0.01 0.01 1.0 0.03 0.07 0.02 0.02 0.03 0.01
0.07 0.08 0.2 0.0 0.1 0.0 0.11 0.03 0.19 0.03 0.08 0.01 1.0 0.13 0.14 0.12 0.16 0.12 0.15
0.19 0.22 0.28 0.29 0.24 0.09 0.12 0.02 0.18 0.09 0.09 0.1 1.0 0.04 0.05 0.1 0.08 0.11 0.04
0.14 0.19 0.22 0.47 0.33 0.34 0.05 0.02 0.13 0.01 0.06 0.02 1.0 0.03 0.05 0.21 0.22 0.07 0.03
0.05 0.05 0.23 0.19 0.12 0.05 0.14 0.03 0.22 0.11 0.08 0.35 1.0 0.04 0.03 0.05 0.04 0.25 0.08
0.48 0.41 0.05 0.02 0.06 0.05 0.03 0.04 0.34 0.23 0.03 0.08 1.0 0.02 0.05 0.04 0.05 0.02 0.01
0.12 0.26 0.33 0.6 0.49 0.18 0.35 0.05 0.18 0.14 0.24 0.01 1.0 0.24 0.35 0.17 0.16 0.26 0.19
0.03 0.02 0.1 0.11 0.1 0.05 0.07 0.05 0.08 0.1 0.09 0.02 1.0 0.06 0.18 0.1 0.1 0.1 0.06
0.27 0.13 0.08 0.32 0.34 0.11 0.3 0.41 0.4 0.14 0.15 0.15 1.0 0.25 0.43 0.44 0.35 0.34 0.17
0.0 0.0 0.27 0.3 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.07 0.06 0.02 1.0 0.18 0.26 0.3 0.07 0.14 0.0
0.53 0.41 0.11 0.12 0.11 0.22 0.08 0.05 0.19 0.04 0.13 0.03 1.0 0.16 0.23 0.21 0.22 0.15 0.08
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.15 0.19 0.19 0.03 0.09 0.03 1.0 0.09 0.09 0.16 0.12 0.1 0.08
0.1 0.05 0.18 0.31 0.09 0.06 0.09 0.03 0.13 0.1 0.05 0.12 1.0 0.04 0.07 0.06 0.05 0.05 0.03
0.15 0.09 0.1 0.03 0.05 0.11 0.02 0.01 0.22 0.05 0.1 0.15 1.0 0.08 0.25 0.06 0.05 0.2 0.14
0.05 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.07 0.01 0.2 0.12 0.07 0.23 1.0 0.04 0.02 0.03 0.07 0.11 0.03
0.69 0.33 0.03 0.08 0.21 0.11 0.11 0.02 0.26 0.17 0.07 0.08 1.0 0.1 0.23 0.17 0.1 0.15 0.05
0.21 0.19 0.74 0.47 0.46 0.29 0.64 1.0 0.43 0.43 0.57 0.26 0.53 0.4 0.5 0.88 0.78 0.51 0.64
0.03 0.02 0.01 0.04 0.11 0.01 0.1 0.02 0.13 0.07 0.16 0.04 1.0 0.23 0.44 0.2 0.18 0.17 0.12
0.03 0.07 0.02 0.09 0.03 0.06 0.01 0.01 0.01 0.03 0.06 0.05 1.0 0.07 0.15 0.05 0.05 0.12 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.12 0.0 0.07 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.02 0.08 1.0 0.23 0.06 0.05 0.03 0.23 0.11
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.2 0.0 0.06 0.01 0.04 1.0 0.07 0.19 0.05 0.0 0.0 0.33
0.53 0.29 0.02 0.02 0.03 0.08 0.0 0.01 0.13 0.12 0.02 0.25 1.0 0.06 0.14 0.05 0.08 0.07 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.23 1.0 0.03 0.04 0.11 0.0 0.03 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.23 1.0 0.03 0.04 0.11 0.0 0.03 0.02
0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.18 0.01 1.0 0.15 0.28 0.07 0.12 0.31 0.17
0.14 0.17 0.1 0.18 0.28 0.2 0.14 0.07 0.13 0.06 0.17 0.23 1.0 0.17 0.23 0.29 0.32 0.28 0.19
0.05 0.07 0.63 0.56 0.5 0.25 0.56 1.0 0.46 0.5 0.56 0.49 0.59 0.43 0.61 0.83 0.67 0.55 0.54
0.05 0.07 0.63 0.56 0.5 0.25 0.56 1.0 0.46 0.5 0.56 0.49 0.59 0.43 0.61 0.83 0.67 0.55 0.54
0.04 0.04 0.12 0.17 0.13 0.05 0.02 0.0 0.12 0.07 0.18 0.08 1.0 0.14 0.18 0.19 0.17 0.19 0.32
0.02 0.03 0.15 0.11 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.15 0.02 1.0 0.05 0.01 0.05 0.03 0.04 0.14
0.2 0.12 0.12 0.14 0.1 0.17 0.06 0.22 0.09 0.13 0.13 0.02 1.0 0.09 0.14 0.18 0.22 0.13 0.04
0.31 0.13 0.11 0.16 0.22 0.14 0.28 0.01 0.19 0.1 0.15 0.26 1.0 0.08 0.04 0.22 0.17 0.14 0.07
0.31 0.13 0.11 0.16 0.22 0.14 0.28 0.01 0.19 0.1 0.15 0.26 1.0 0.08 0.04 0.22 0.17 0.14 0.07
0.0 0.02 0.04 0.04 0.02 0.0 0.03 0.12 0.02 0.04 0.04 0.01 1.0 0.01 0.05 0.05 0.06 0.04 0.05
0.01 0.0 0.02 0.04 0.02 0.01 0.05 0.04 0.03 0.02 0.03 0.01 1.0 0.01 0.02 0.06 0.05 0.02 0.02
0.0 0.0 0.14 0.15 0.18 0.01 0.15 0.01 0.05 0.01 0.18 0.0 1.0 0.11 0.17 0.17 0.18 0.16 0.38
0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 1.0 0.04 0.09 0.0 0.01 0.09 0.05
0.0 0.0 0.16 0.25 0.06 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.16 0.25 0.06 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.02 0.0 0.02 0.17 0.04 0.07 0.02 0.11 0.09 0.03 0.01 1.0 0.03 0.13 0.03 0.02 0.05 0.01
0.18 0.08 0.01 0.03 0.05 0.02 0.04 0.01 0.31 0.12 0.01 0.02 1.0 0.04 0.05 0.03 0.02 0.03 0.02
0.23 0.18 0.13 0.09 0.08 0.11 0.13 0.07 0.35 0.04 0.17 0.06 1.0 0.2 0.28 0.16 0.16 0.3 0.11
0.18 0.12 0.05 0.15 0.18 0.16 0.32 0.41 0.28 0.38 0.16 0.08 1.0 0.25 0.32 0.16 0.17 0.27 0.25
0.03 0.06 0.09 0.12 0.19 0.06 0.16 0.09 0.08 0.1 0.05 0.01 1.0 0.05 0.12 0.05 0.03 0.15 0.04
0.02 0.02 0.03 0.04 0.06 0.02 0.1 0.06 0.05 0.07 0.06 0.02 1.0 0.07 0.11 0.05 0.04 0.06 0.06
0.16 0.06 0.0 0.01 0.04 0.03 0.03 0.0 0.13 0.09 0.04 0.08 1.0 0.06 0.07 0.1 0.06 0.08 0.02
0.16 0.06 0.0 0.01 0.04 0.03 0.03 0.0 0.13 0.09 0.04 0.08 1.0 0.06 0.07 0.1 0.06 0.08 0.02
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 1.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.55 0.03 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.04 0.01 1.0 0.01 0.16 0.07 0.06 0.09 0.02
0.29 0.09 0.09 0.02 0.27 0.03 0.09 0.2 0.14 0.17 0.12 0.0 1.0 0.19 0.17 0.11 0.11 0.17 0.11
0.41 0.28 0.02 0.04 0.06 0.06 0.04 0.23 0.19 0.22 0.02 0.01 1.0 0.02 0.02 0.18 0.14 0.01 0.0
0.21 0.2 0.39 0.19 0.23 0.18 0.42 0.38 0.29 0.57 0.29 0.15 1.0 0.24 0.36 0.27 0.23 0.28 0.5
0.06 0.04 0.04 0.07 0.06 0.04 0.28 0.07 0.31 0.13 0.17 0.09 1.0 0.17 0.16 0.36 0.29 0.16 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.04 0.04 0.02 0.04 1.0 0.06 0.22 0.08 0.12 0.13 0.05
0.15 0.05 0.37 0.19 0.08 0.2 0.0 0.04 0.21 0.0 0.09 0.09 1.0 0.31 0.24 0.01 0.19 0.43 0.05
0.0 0.2 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.07 1.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03
0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 1.0 0.04 0.02 0.03 0.05 0.07 0.01
0.0 0.01 0.18 0.32 0.07 0.02 0.1 0.01 0.15 0.04 0.04 0.03 1.0 0.04 0.03 0.01 0.0 0.07 0.19
0.12 0.09 0.02 0.03 0.07 0.05 0.09 0.01 0.12 0.04 0.07 0.03 1.0 0.08 0.13 0.13 0.06 0.1 0.02
0.33 0.28 0.17 0.13 0.27 0.23 0.15 0.13 0.22 0.21 0.21 0.22 1.0 0.21 0.32 0.23 0.33 0.26 0.17
0.17 0.22 0.03 0.03 0.02 0.01 0.05 0.0 0.16 0.02 0.13 0.04 1.0 0.1 0.11 0.09 0.1 0.1 0.12
0.09 0.05 0.01 0.03 0.09 0.09 0.24 0.25 0.12 0.09 0.09 0.14 1.0 0.2 0.23 0.08 0.08 0.28 0.08
0.33 0.22 0.17 0.14 0.12 0.12 0.08 0.0 0.25 0.09 0.15 0.05 1.0 0.07 0.02 0.07 0.06 0.08 0.04
0.32 0.14 0.01 0.03 0.04 0.03 0.01 0.0 0.19 0.08 0.01 0.01 1.0 0.02 0.04 0.02 0.01 0.02 0.01
0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.11 1.0 0.06 0.11 0.08 0.07 0.08 0.04
0.34 0.2 0.29 0.38 0.29 0.19 0.26 0.04 0.38 0.36 0.2 0.15 1.0 0.16 0.26 0.38 0.2 0.36 0.25
0.28 0.28 0.39 0.46 0.52 0.49 0.3 0.64 0.29 0.72 0.36 0.34 1.0 0.24 0.8 0.56 0.42 0.45 0.3
0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.14 0.12 0.22 0.09 0.04 0.01 1.0 0.08 0.5 0.26 0.21 0.14 0.06
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.05 0.24 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.05 0.24 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.09 0.04 0.09 0.06 0.05 0.14 0.21 0.13 0.13 0.12 0.11 1.0 0.35 0.44 0.06 0.17 0.22 0.27
0.04 0.02 0.2 0.15 0.08 0.04 0.1 0.01 0.23 0.04 0.15 0.13 1.0 0.21 0.08 0.1 0.11 0.23 0.38
0.43 0.19 0.02 0.05 0.12 0.08 0.09 0.0 0.31 0.11 0.17 0.01 1.0 0.1 0.16 0.19 0.1 0.17 0.17
0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.11 0.09 0.04 0.07 0.12 0.29 1.0 0.1 0.2 0.09 0.07 0.15 0.08
0.01 0.01 0.0 0.03 0.38 0.16 0.08 0.06 0.07 0.15 0.01 0.02 1.0 0.03 0.33 0.04 0.02 0.11 0.02
0.43 0.21 0.03 0.1 0.25 0.2 0.09 0.09 0.23 0.08 0.08 0.08 1.0 0.18 0.23 0.16 0.13 0.19 0.08
0.32 0.19 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.24 0.07 0.01 0.02 1.0 0.02 0.06 0.02 0.01 0.03 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.04 1.0 0.0 0.3 0.31 0.14 0.01 0.09
0.05 0.02 0.01 0.02 0.04 0.02 0.11 0.06 0.06 0.12 0.11 0.05 1.0 0.17 0.34 0.06 0.07 0.21 0.11
0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 1.0 0.06 0.0 0.26 0.18 0.54 0.15
0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.05 0.09 0.02 1.0 0.05 0.06 0.38 0.16 0.06 0.12
0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 1.0 0.03 0.02 0.09 0.13 0.02 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)