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Heatmap: Cluster_165 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.37 0.5 0.1 0.01 0.53 0.88 0.17 -0.92 -0.66 -2.42 -0.13 -0.7 -0.58 -0.06 0.34 0.13 -0.06 0.3 -0.43
0.61 0.75 -0.82 -0.14 0.47 0.89 0.39 0.05 0.12 -1.6 -0.85 -0.57 -0.72 -0.07 -0.08 0.1 -0.24 0.26 -1.03
0.06 0.54 -0.92 -0.64 0.71 0.81 0.55 -1.87 0.08 -2.7 -0.33 0.51 -0.02 -0.12 -0.44 0.18 -0.38 0.25 0.04
0.22 0.25 -0.43 -0.07 0.23 0.65 -0.2 0.13 -0.39 -1.64 -0.43 0.59 -0.82 0.55 0.02 -0.06 -0.32 0.36 -0.28
0.63 0.31 -2.61 -0.82 0.74 1.43 0.6 -1.28 -0.99 -3.74 -0.2 -1.32 -0.65 0.77 0.32 -0.09 -0.73 0.47 -0.29
0.08 0.52 -0.62 -0.33 0.03 0.78 -0.67 0.77 -0.66 -0.86 -0.54 -0.42 -0.69 0.17 0.37 0.16 0.2 0.6 -0.86
0.18 0.44 -0.34 -0.11 0.71 1.07 -0.01 -1.22 -1.16 -3.5 -0.22 -0.6 -0.48 0.07 0.23 0.28 0.22 0.47 -0.22
0.21 0.58 -0.11 0.53 1.11 1.16 0.67 0.12 0.35 -0.69 -1.25 -0.1 -0.57 -1.65 -1.65 -0.23 -0.86 -0.42 -2.33
0.07 0.25 -0.08 0.46 0.7 0.94 0.21 -1.8 -0.59 -3.09 -0.35 -1.15 -0.75 0.38 0.61 0.07 -0.28 0.54 -0.5
0.52 0.1 -0.14 -0.19 0.26 1.02 -0.37 0.38 -1.62 -2.28 -0.29 0.16 -0.57 0.09 0.05 -0.16 -0.57 0.19 0.54
1.23 0.97 -0.87 0.96 1.3 0.85 1.17 -0.59 0.13 -2.06 -1.59 -1.36 0.11 -2.46 -0.72 -1.55 -1.53 -1.57 -3.6
1.26 1.33 0.09 0.94 1.41 1.25 0.79 -0.75 -0.17 -4.9 -2.41 -1.44 -0.66 -2.58 -0.77 -1.6 -2.98 -1.59 -3.72
0.16 0.47 -0.79 -0.05 -0.02 0.68 -0.22 0.36 -0.51 -1.33 -0.79 -0.42 -0.91 0.65 0.5 0.08 0.09 0.58 -0.58
0.3 0.27 -0.39 -0.08 0.37 1.06 -0.68 -0.47 -0.17 -1.44 -0.24 0.04 -0.44 -0.04 0.24 0.02 -0.16 0.19 0.09
0.72 0.46 -0.55 -0.54 -0.3 0.88 -0.32 0.48 -0.59 -2.36 -0.54 -0.92 -0.0 0.28 0.72 -0.39 -0.35 0.21 0.14
0.77 0.71 0.01 0.46 0.73 0.81 0.53 0.01 0.31 -2.79 -0.78 -2.17 -0.89 -0.88 -0.91 -0.04 -0.41 0.29 -0.57
0.19 0.34 -0.24 0.0 0.21 0.59 0.3 0.1 -0.07 -0.78 -0.12 -0.16 -0.74 0.01 0.3 -0.1 -0.12 -0.09 -0.29
0.54 0.5 -1.04 0.28 1.03 0.5 1.11 -0.42 -0.33 -2.56 -0.82 -1.3 0.29 -0.8 0.05 0.15 -0.47 0.06 -1.28
0.45 0.22 -0.58 -0.37 0.66 1.0 0.34 -0.62 -0.69 -1.44 -0.05 -1.02 -1.45 -0.06 0.38 0.1 -0.04 0.55 -0.09
0.09 0.48 -1.04 -0.08 0.12 0.93 -0.01 -0.3 -0.41 -2.82 -0.47 -0.07 -3.05 0.27 0.66 0.35 -0.08 0.7 0.0
0.88 0.82 0.04 0.45 0.36 1.24 -1.17 -0.77 -0.62 -2.41 -0.28 -1.98 -1.25 -0.16 0.15 0.1 0.04 -0.13 -0.03
0.35 0.61 -0.22 -0.55 0.4 0.54 -0.24 0.08 -0.09 -1.2 -0.66 -1.67 -0.35 0.18 0.66 -0.19 -0.24 0.58 -0.08
0.22 0.47 -0.74 -0.36 0.07 0.62 0.3 0.07 -0.13 -1.9 -0.23 -0.93 -1.13 0.19 0.75 -0.19 0.31 0.45 -0.17
0.14 0.66 -0.72 0.0 -0.09 0.77 0.21 0.09 0.31 -2.3 -0.11 -0.57 -0.59 -0.25 0.14 0.21 0.17 0.37 -0.68
0.56 0.63 -0.06 -0.17 -0.3 0.26 0.21 0.14 -0.55 -2.21 0.17 -0.62 -0.23 0.05 0.67 -0.49 -0.38 0.36 -0.07
0.51 0.47 -0.27 0.5 0.71 0.59 0.52 -0.19 -0.22 -0.87 -0.43 -0.62 -0.15 -0.63 -0.0 -0.12 -0.46 -0.11 -0.76
0.51 0.47 -0.27 0.5 0.71 0.59 0.52 -0.19 -0.22 -0.87 -0.43 -0.62 -0.15 -0.63 -0.0 -0.12 -0.46 -0.11 -0.76
0.51 0.47 -0.27 0.5 0.71 0.59 0.52 -0.19 -0.22 -0.87 -0.43 -0.62 -0.15 -0.63 -0.0 -0.12 -0.46 -0.11 -0.76
0.52 0.59 -0.85 0.6 1.16 0.83 0.56 -0.43 0.21 -0.66 -1.37 -0.48 -0.69 -0.82 -0.29 -0.11 -0.42 -0.21 -1.67
0.33 0.81 -0.62 0.09 0.17 0.63 -0.12 0.18 -0.5 -2.34 -0.26 0.19 -0.53 -0.03 0.33 -0.23 -0.71 0.66 -0.51
0.68 1.12 0.28 0.86 1.24 1.14 0.33 -0.3 -0.06 -0.67 -1.35 -3.54 -0.41 -1.56 -0.52 -0.99 -1.29 -1.1 -1.57
0.33 0.75 -0.85 0.02 0.86 1.64 -0.29 -1.24 -1.21 -4.02 -0.96 -0.71 -1.63 0.09 -0.3 0.1 -0.25 0.64 0.04
0.53 0.59 -0.39 -1.69 0.92 1.44 0.14 -0.29 -0.96 -2.11 0.03 -0.53 -2.28 -0.4 0.33 -0.51 -0.54 0.24 0.25
0.4 0.33 -0.9 0.21 0.25 0.87 0.5 -1.53 -0.31 -2.46 -0.3 -0.1 -0.52 0.38 0.56 -0.43 -0.48 0.38 -0.01
-0.02 0.13 -0.59 -0.29 0.17 0.1 0.4 -0.1 0.05 -1.4 -0.07 0.27 0.08 -0.01 0.14 0.17 0.04 0.35 -0.25
0.36 0.16 -0.45 0.39 -0.25 0.41 0.05 -0.03 -0.21 -1.36 0.06 -0.68 -0.32 0.46 0.4 -0.27 -0.05 0.32 -0.13
0.44 -0.77 -1.45 -0.17 0.71 1.38 0.14 -1.55 -0.22 -0.98 -0.39 -0.36 -0.58 0.26 0.45 -0.33 -0.31 0.6 -0.2
0.83 0.45 -0.03 0.54 0.78 1.07 0.42 -0.31 -0.08 -2.48 -0.9 -0.59 0.1 -0.7 -0.86 -0.18 -0.31 -0.51 -0.94
0.14 -0.15 -0.27 0.43 0.65 0.83 0.55 -0.43 -0.04 -2.1 -0.28 -0.87 -0.32 -0.25 0.23 0.08 -0.12 0.25 -0.49
0.65 0.65 -0.18 0.3 0.54 0.86 0.52 -0.42 -0.19 -3.92 -0.66 -1.3 -0.08 -0.32 0.16 -0.21 -0.28 0.15 -0.62
0.15 0.3 -0.83 -0.33 0.71 0.94 0.65 -0.17 -0.85 -2.75 -0.43 -0.01 -0.96 0.15 0.37 -0.03 -0.29 0.3 -0.15
0.8 0.81 -0.44 0.05 0.3 0.83 0.41 -0.09 -0.9 -0.58 -1.45 -0.67 -0.96 0.25 0.32 -1.36 -1.55 1.0 -0.8
0.25 0.56 -0.22 0.08 0.23 0.59 0.3 -0.41 -0.04 -1.72 -0.31 -0.93 -0.44 -0.26 0.36 0.31 -0.06 0.28 -0.18
0.48 0.36 -0.15 -0.02 0.27 0.19 0.2 0.01 -0.05 -0.42 -1.03 -0.64 -0.76 -0.56 0.54 -0.05 0.1 0.69 -0.51
0.7 0.55 -0.39 -0.03 0.53 1.49 -0.12 -0.77 -0.59 -3.9 -0.45 -1.22 -1.05 -0.13 0.22 -0.25 -0.12 0.3 -0.06
0.34 0.55 -0.66 -0.06 1.05 0.9 0.27 0.59 -0.29 -0.56 -1.4 -0.25 -0.2 -0.7 -0.26 -0.21 -0.39 -0.25 -0.94
0.31 0.5 -0.92 -0.02 0.22 0.76 0.01 0.17 -0.34 -1.45 -0.37 -0.66 -0.24 0.07 0.49 -0.03 -0.34 0.37 -0.14
0.76 0.55 -0.77 -0.1 1.06 1.35 0.17 -0.78 -0.81 -2.61 -0.82 -1.67 -0.19 -0.19 0.07 -0.18 -0.52 0.19 -0.25
0.3 0.31 -0.27 0.07 0.59 0.68 0.27 -0.73 -0.34 -2.95 -0.26 -0.8 -0.2 -0.02 0.28 0.15 -0.01 0.25 0.08
0.76 1.01 -1.2 -0.13 0.31 1.48 -0.57 -2.36 -0.96 -2.16 -1.44 -0.51 -1.77 0.18 0.72 -0.45 -0.67 0.87 -0.04
0.27 0.72 -0.55 -0.13 -0.03 0.76 -0.06 0.0 0.07 -2.68 -0.26 -1.0 -0.49 0.03 0.71 -0.26 0.01 0.51 -0.42
0.61 0.33 -0.35 -0.35 0.12 0.67 0.07 -0.91 -0.34 -2.17 -0.12 -1.26 -1.08 0.41 0.8 -0.15 -0.13 0.66 0.14
0.86 0.56 0.11 -0.09 0.43 0.91 -0.57 -1.47 -1.16 -1.95 -0.18 -1.29 -0.8 0.07 0.68 -0.09 -0.47 0.54 0.12
0.17 0.44 -0.65 -0.08 0.87 1.23 0.47 -1.48 -1.06 -3.91 -0.71 -1.07 -1.19 -0.25 0.4 0.76 0.24 0.57 -1.24
0.49 0.11 -0.81 0.06 1.12 0.76 0.49 -0.93 -0.26 -2.85 -0.89 -1.77 -0.3 -0.07 0.23 0.42 0.08 0.38 -0.6

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.