Heatmap: Cluster_231 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
-3.57 -6.22 -4.09 -7.82 -5.25 -3.48 -7.05 0.81 1.75 4.29 2.64 -3.12 -4.0 -3.29 -0.09 -6.12 -5.79 -3.18 3.89 -2.81 -8.85 -10.6 - -2.91 -5.44 -3.63 -2.23 - -7.64 -8.23 -4.0 -11.54 -9.96 -14.18 -6.19 -11.92 -7.32 -9.3 -5.74 - - -8.93 - - -11.84 - - -
-2.67 -6.71 -3.99 -6.42 -4.72 -1.87 -4.61 1.82 2.85 3.75 3.34 -3.63 -1.04 -3.65 -0.16 -6.63 -6.38 -3.77 3.47 -3.63 -10.53 -8.79 -11.28 -3.68 -6.91 -4.48 -2.99 - -4.84 -9.49 -4.64 -12.36 -9.79 -12.16 -7.98 -10.35 -8.44 -10.42 -7.43 -12.31 - -11.35 - - -12.26 - - -13.45
-7.2 -7.71 -3.86 -6.13 -5.1 -2.11 -4.63 2.29 2.48 3.7 2.64 -5.94 2.14 -4.85 0.49 -6.04 -5.37 -3.52 3.53 -4.45 -7.58 -9.11 -10.83 -4.45 -6.39 -5.34 -2.9 -8.89 -6.75 -9.45 -4.74 -11.74 -11.63 -12.24 -7.81 - -7.9 -9.79 -7.67 - - - -10.14 -9.56 -11.72 - -16.13 -11.93
-7.53 -5.02 -4.32 -7.52 -5.32 -3.24 -5.64 1.5 2.09 3.95 2.48 -4.31 1.7 -3.71 -0.81 -3.94 -4.22 -2.68 3.85 -3.16 -7.32 -4.23 -4.4 -3.24 -5.83 -3.41 -2.6 -5.5 -5.21 -8.34 -3.62 -5.99 -5.84 -5.53 -4.63 -5.69 -5.77 -5.67 -5.14 -9.58 - -3.82 -6.64 -7.29 -5.39 - - -7.53
-3.91 -2.5 -3.61 -4.43 -3.92 -4.41 -4.27 0.65 2.41 3.65 3.79 -3.33 -0.42 -1.64 -1.47 -2.48 -2.2 -1.99 2.82 -1.46 -1.63 -2.46 -1.75 -2.84 -2.65 -3.56 -1.92 -1.58 -5.83 -2.57 -2.16 -1.66 -3.99 -2.15 -2.15 -3.59 -2.05 -2.07 -2.17 -4.92 -2.55 -2.94 -3.23 -2.63 -3.33 -9.3 -4.72 -3.56
-7.61 -6.94 -3.58 -5.4 -4.29 -1.6 -4.34 2.61 2.88 3.52 2.84 -3.73 -1.21 -4.39 1.16 -7.01 -7.06 -5.19 3.25 -3.74 - -8.68 - -4.27 -7.56 -4.86 -2.9 -7.39 -6.39 - -5.01 -2.24 -4.07 -4.45 -8.86 - -7.13 -8.78 -7.17 - - 0.76 -1.4 -8.84 -1.98 - - -6.27
-6.5 -3.96 -4.29 -6.01 -4.81 -3.04 -4.92 1.47 2.73 3.57 3.37 -4.55 1.63 -3.53 -1.96 -4.41 -5.68 -4.15 3.22 -1.85 -6.58 -4.7 -6.1 -3.92 -2.81 -4.39 -1.51 -3.96 -5.57 -4.04 -4.55 -4.02 -3.17 -2.04 -6.87 -2.83 -2.53 -3.31 -0.2 -3.13 -5.94 -5.15 -5.55 -6.34 -7.44 -3.62 -6.95 -9.83
-7.73 -6.33 -3.87 -5.63 -1.51 1.26 -1.78 2.2 2.65 3.62 3.17 -5.44 1.02 -2.75 -0.21 -7.02 -6.54 -3.77 3.11 -3.69 -7.63 -6.12 -4.59 -3.67 -6.61 -4.45 -3.06 - -8.08 -9.35 -4.75 -7.18 -7.07 -9.63 -4.99 -1.43 -6.6 -4.77 -7.28 - - -6.93 -9.55 - -7.84 - - -8.72
-4.26 -2.66 -1.68 -1.61 0.2 1.54 -0.17 2.5 2.94 2.92 2.91 -4.49 -0.05 -2.45 0.36 -3.59 -4.86 -4.06 3.06 -2.64 -3.88 -2.2 -1.9 -3.36 -4.64 -3.67 -4.09 -2.23 -3.71 -4.83 -3.63 -2.42 -4.03 -4.72 -3.19 -3.58 -2.64 -3.52 -4.0 -2.54 - -5.13 -4.21 -2.02 -4.19 - -8.59 -3.69
-1.56 -6.15 -1.97 -3.96 -2.15 -2.42 -3.56 1.72 2.35 4.0 2.82 -3.88 -0.01 -3.5 -0.59 -6.58 -5.96 -3.54 3.64 -3.32 -8.53 -7.9 -7.89 -3.23 -6.43 -4.08 -2.86 -5.92 -5.59 -7.85 -4.22 -8.52 -9.07 -9.78 -6.69 -5.94 -4.4 -8.11 -6.04 -1.87 -11.32 -7.04 -7.62 -5.1 -6.82 -4.46 -5.75 -7.17
0.75 -6.25 -3.73 -6.18 -4.5 -2.69 -4.64 1.48 2.94 3.68 3.4 -3.26 0.71 -3.67 -0.15 -7.38 -6.49 -4.27 3.14 -3.53 -9.15 -9.23 -7.55 -3.55 -7.33 -4.52 -3.15 -9.91 -2.9 -9.71 -4.64 -13.45 -11.74 -9.79 -8.39 -7.85 -3.93 -7.89 -7.34 - - -8.71 - -11.35 -11.93 - - -
-5.01 -4.4 -0.41 -0.44 -0.14 0.65 0.19 2.08 2.61 3.28 3.21 -0.55 -0.08 -4.63 0.41 -6.69 -6.25 -4.52 2.85 -3.87 - -6.98 -7.65 -4.01 -5.31 -5.07 -3.52 -8.3 -3.37 -6.33 -4.5 -3.0 -4.34 -1.55 -8.25 -4.45 -4.0 -5.76 -1.67 -6.25 -4.41 -0.09 -1.47 -7.75 -1.31 -7.58 - -5.08
-7.99 -7.21 -5.09 -7.08 -4.86 -3.26 -5.73 1.16 2.88 3.47 3.61 -4.61 1.42 -4.58 -2.87 -6.95 -6.25 -3.04 3.5 -4.42 - - - -3.34 -5.67 -4.35 -2.37 - -7.99 - -4.09 - -11.01 -8.91 -9.5 - -9.32 -9.09 -7.5 - - -6.56 - - -8.06 - - -7.66
-7.56 -7.12 -3.78 -5.96 -4.64 -1.42 -3.9 2.71 2.38 3.78 3.1 -5.03 1.51 -4.03 0.14 -7.14 -6.52 -4.02 3.15 -3.89 -8.58 -9.3 -13.65 -3.98 -6.58 -4.69 -3.01 - -10.11 -10.25 -4.8 -12.15 -13.08 - -9.07 -13.05 -8.2 -10.01 -6.96 - - -9.74 -14.57 - -13.54 - - -
-8.11 -6.91 -3.86 -7.13 -4.79 -2.35 -6.27 1.94 3.11 3.65 3.29 -5.11 -2.24 -5.89 1.3 -7.12 -6.57 -4.1 3.28 -4.29 -8.98 -9.69 -7.72 -4.45 -6.9 -5.44 -3.03 -7.3 -7.97 - -4.73 -7.96 -8.95 -9.57 -7.11 -6.28 -6.47 -6.82 -7.92 - - -8.74 -7.35 -6.26 -9.65 - - -8.79
-6.57 -7.19 -1.73 -2.27 -2.73 -2.51 -2.15 1.26 2.86 3.24 3.26 -2.73 1.86 -4.02 -0.51 -6.98 -6.46 -3.93 3.09 -3.85 - -8.8 - -3.51 -0.48 -4.18 -2.95 -6.3 -3.69 0.18 -4.68 -5.39 -6.79 -4.87 -8.59 -10.74 -6.66 -8.16 -6.78 - - -4.53 -4.2 -1.94 -4.61 - 1.16 -4.62
-7.59 -7.25 -4.2 -7.5 -5.39 -2.65 -5.76 1.89 2.61 3.68 3.16 -4.37 2.64 -4.12 -0.74 -7.01 -6.23 -4.13 3.14 -3.89 -9.49 -9.14 -11.9 -3.88 -6.55 -4.77 -3.04 -9.11 -8.92 -9.54 -4.54 -12.24 -12.71 - -8.62 - -7.9 -10.13 -6.97 - - -10.93 -12.86 - -12.84 - - -
-7.75 -7.61 -3.78 -6.59 -2.82 0.85 -3.01 2.6 2.81 3.48 3.18 -4.67 2.16 -4.47 0.04 -7.77 -7.1 -4.36 2.73 -4.37 -9.68 -9.8 -13.0 -4.42 -6.72 -5.18 -3.31 -15.24 -9.74 -10.06 -5.1 -12.23 -13.24 - -9.56 -14.35 -8.78 -10.8 -7.61 -15.16 - -9.96 -12.29 - -13.68 - -9.6 -
-7.8 -7.08 -3.97 -6.87 -5.25 -2.39 -6.42 2.03 2.43 3.81 3.19 -4.69 1.93 -4.1 -0.35 -6.03 -5.51 -3.92 3.29 -3.66 -8.39 -9.27 - -3.64 -6.49 -4.32 -2.97 -10.86 -6.94 -10.21 -4.48 -10.66 -13.38 -10.2 -8.03 -9.97 -7.97 -9.96 -7.07 - - - - - -8.89 - - -
-6.08 -4.08 -4.36 -7.96 -5.15 -2.92 -5.76 1.94 2.34 3.88 2.67 -1.88 1.48 -3.77 -1.23 -4.88 -5.95 -3.62 3.68 -3.14 -6.39 -4.97 -4.51 -3.55 -5.15 -4.1 -2.95 -4.5 -3.98 -6.09 -3.21 -4.71 -5.42 -6.29 -4.43 -5.08 -3.46 -5.15 -3.49 -8.12 -7.99 -6.29 -6.77 -4.53 -5.34 - -7.1 -6.14
-7.28 -6.26 -4.3 -7.2 -5.06 -2.67 -5.91 1.76 2.8 3.47 3.28 -4.69 2.51 -4.13 -0.67 -7.0 -6.58 -4.13 3.27 -3.91 -9.15 -9.71 -12.76 -3.81 -6.72 -4.7 -2.96 -12.62 -8.94 -9.04 -4.19 -13.58 -11.98 -12.01 -9.03 -8.73 -8.82 -10.27 -7.17 - - -10.15 -11.67 -12.06 -12.64 - - -
-6.67 -6.87 -3.12 -1.7 -0.66 1.11 -0.16 2.36 2.77 3.15 2.84 -4.2 1.95 -3.89 0.57 -7.49 -3.99 -4.24 3.01 -3.83 -9.14 -9.48 -12.53 -4.17 -7.08 -5.04 -3.27 - -9.73 -8.44 -4.88 -3.03 -6.41 -4.93 -9.47 -12.5 -8.82 -10.33 -7.64 -10.15 - -0.32 -1.2 -8.84 -0.98 - - -4.29
-8.83 -7.04 -3.89 -6.82 -4.45 -2.11 -5.91 2.22 3.4 3.41 3.47 -4.75 -1.99 -4.79 0.18 -6.56 -6.46 -3.59 3.14 -4.88 -9.37 - - -4.41 -6.28 -4.95 -2.67 - - -9.78 -4.66 - - - -8.9 - -9.03 -10.55 -7.41 - - - - - - - - -
-1.22 -4.02 -3.17 -3.54 -2.94 -1.61 -3.33 1.68 2.11 3.64 3.33 -2.54 -0.14 -2.14 -3.15 -0.89 -3.09 -2.74 3.06 -3.08 -4.54 -3.05 -3.46 -1.07 -0.96 -0.85 -1.13 -3.77 -3.31 -3.64 -3.59 -2.86 -3.9 -2.58 -5.26 -1.44 -0.79 -2.01 -0.5 -6.48 -7.74 -1.65 -2.37 -3.29 -4.7 -1.81 -3.29 -4.69
-0.72 -3.67 -0.53 -1.83 -1.51 -1.24 -1.99 2.33 2.63 3.16 2.51 -2.86 0.54 -3.62 0.96 -4.74 -2.24 -1.27 2.82 -2.96 -1.34 -2.97 -3.98 -3.47 -6.46 -4.31 -3.33 -4.44 -3.54 -7.39 -3.48 -3.28 -2.58 -0.18 -5.14 -0.8 -6.19 -3.7 -4.31 -4.01 -2.06 -1.0 0.52 -3.77 -1.27 1.11 - -2.68
-7.34 -7.5 -4.76 -7.87 -5.22 -2.56 -6.0 1.6 2.73 3.63 3.33 -5.13 -4.4 -4.47 1.93 -6.44 -6.25 -3.46 3.47 -4.03 -9.8 -9.87 - -3.5 -5.28 -4.59 -2.72 - -9.88 -11.29 -4.32 - - - -9.12 - -9.61 -9.85 -7.32 - - - - - - - - -
-7.7 -6.67 -2.97 -7.44 -4.21 -2.08 -5.76 2.74 -1.58 4.28 -1.41 -4.1 -7.6 -3.49 -0.03 -6.38 -5.78 -2.98 4.22 -3.0 -9.02 -8.6 -11.93 -3.0 -4.61 -4.05 -1.54 -10.89 -8.56 -10.55 -3.99 -12.72 -12.05 -15.0 -8.29 -10.2 -8.34 -10.26 -6.45 - - - - - -12.91 - - -
-9.66 -7.14 -3.33 -8.63 -4.53 -1.88 -5.06 2.97 1.99 4.07 1.8 -6.54 -2.52 -4.13 1.18 -6.8 -6.55 -3.68 3.63 -3.8 -9.59 -12.37 - -3.96 -5.94 -4.99 -2.33 -11.82 -7.64 -9.63 -4.3 -13.58 -13.34 -9.84 -8.88 -10.92 -8.08 -9.84 -7.19 - - - - - - - - -
0.05 -1.68 -3.22 -2.31 -2.31 -0.9 -1.7 1.58 2.46 3.03 3.14 -5.91 -1.21 -1.68 -0.58 -2.26 -2.01 -1.62 2.78 -1.75 -1.52 -2.04 -1.85 -2.02 -3.87 -1.92 -0.89 -2.71 -0.98 -5.01 -2.01 -2.27 -1.99 -1.86 -2.49 -1.57 -2.02 -1.9 -0.97 -1.69 0.83 -1.24 -1.25 -2.01 -1.3 -0.04 -1.08 -2.3
-8.9 -6.85 -3.8 -6.79 -4.32 -2.14 -5.86 2.44 2.28 4.05 2.38 -4.48 -2.28 -4.68 0.33 -6.12 -5.62 -3.48 3.74 -3.73 -9.73 -7.26 -8.85 -3.79 -6.3 -4.45 -2.58 -8.75 -4.88 -7.91 -4.14 -10.86 -9.64 -9.67 -8.0 -7.1 -7.91 -8.11 -7.24 -9.99 - - -9.12 - -9.1 - -10.91 -11.3
-8.88 -6.91 -1.56 -2.18 -2.48 -0.39 -2.26 1.83 3.15 3.44 3.03 -4.13 1.49 -3.86 1.1 -7.16 -5.69 -3.73 3.2 -3.85 -7.74 -7.87 -9.72 -3.93 -6.33 -4.56 -3.11 - -7.11 - -4.82 -5.14 -8.62 -10.94 -8.93 - -8.72 -9.38 -7.87 -7.51 - -4.7 -7.63 - -5.52 - - -
- -5.62 -3.11 - -3.01 -3.23 - 1.37 0.06 4.27 1.02 -3.66 -2.04 -4.28 -1.27 -5.75 -5.59 -3.53 4.38 -4.22 - -5.46 - -2.37 -4.23 -3.0 -1.45 -5.39 -6.17 - -3.29 - - - -8.44 - - - -7.3 - - - - - - - - -
-9.74 -6.16 -4.72 -5.53 -5.39 -3.44 -4.74 1.41 2.93 3.45 3.52 0.73 1.97 -4.42 -1.31 -7.36 -7.05 -3.98 3.09 -4.06 -9.1 -10.44 -9.83 -4.02 -4.49 -4.92 -3.15 -6.61 -7.94 -4.54 -4.35 -6.46 -7.99 -6.09 -7.69 -7.68 -5.8 -8.64 -6.23 - - -6.73 -9.02 -8.69 -10.27 -6.31 - -9.26
-3.3 -7.09 -3.38 -2.13 -1.49 0.22 -0.61 2.5 2.93 3.48 2.98 -4.63 1.05 -4.44 -0.15 -7.21 -6.13 -4.02 3.25 -3.96 -10.17 -8.71 -10.49 -3.96 -7.49 -4.93 -3.49 - -4.17 -13.33 -4.92 -11.56 - - -8.77 -11.48 -7.87 -10.31 -7.84 -6.82 - - -11.39 - -11.39 - - -
-7.88 -5.09 -4.08 -5.44 -4.41 -1.65 -4.21 2.1 2.53 3.64 3.0 -5.09 2.14 -3.67 0.52 -6.51 -5.93 -3.59 3.36 -3.43 -7.01 -6.26 -6.3 -3.72 -6.21 -4.4 -2.76 -7.52 -6.52 -7.94 -3.94 -9.18 -7.64 -8.16 -6.83 -6.67 -6.76 -6.97 -6.19 -8.23 -9.0 -7.72 -8.17 -6.89 -9.48 - - -7.99
-2.54 -2.34 -2.9 -3.62 -3.25 -1.78 -3.09 1.6 2.49 2.8 3.05 -0.1 0.89 -1.54 -0.53 -1.37 -0.13 -0.25 2.91 -1.74 -2.18 -3.33 -3.32 -1.69 -3.82 -1.98 -0.44 -3.02 -5.76 -8.14 -2.82 -1.66 -2.69 -1.29 -4.77 -1.23 -1.25 -2.7 -1.29 -7.34 - 1.35 -0.21 -4.78 -0.02 - -2.01 -2.97
-7.61 -6.3 -4.08 -6.14 -4.82 -2.63 -5.1 1.59 2.52 3.73 3.1 0.51 1.45 -3.17 0.66 -6.14 -5.8 -3.62 3.39 -2.77 -8.31 -9.98 -9.84 -3.02 -6.32 -3.93 -2.33 - -6.45 -10.06 -4.54 -11.97 -12.47 -13.92 -8.5 -10.28 -7.57 -10.0 -6.39 -10.83 - -10.87 - - -11.77 - - -12.96
-6.8 -5.38 -3.2 -5.08 -1.12 1.54 -1.61 2.91 2.05 3.69 1.74 -4.63 1.81 -4.2 -0.07 -6.42 -6.75 -3.83 3.48 -3.8 -8.87 -8.04 -10.99 -3.95 -6.43 -4.78 -2.94 -13.48 -8.62 -9.75 -4.1 -10.19 -7.24 -9.91 -8.82 -9.53 -8.6 -8.44 -6.11 -9.7 -7.55 -10.59 - - -12.5 - - -16.19
-8.21 -6.5 -4.07 -6.81 -4.89 -3.44 -5.93 0.93 2.64 3.95 3.49 -3.83 -2.38 -3.56 -1.15 -6.72 -6.06 -3.46 3.52 -3.13 -10.94 -10.98 -9.81 -3.28 -5.87 -3.88 -2.78 -10.69 -8.22 -8.68 -4.22 -8.01 -8.45 -10.25 -8.79 -9.48 -7.69 -8.9 -6.74 - - -8.49 -9.72 - -8.26 - - -
-9.73 -6.92 -4.28 -9.42 -4.64 -1.79 -5.59 2.48 1.96 3.93 1.86 -4.45 -5.84 -4.09 0.83 -6.2 -6.12 -3.82 4.07 -3.45 -9.03 -9.85 -11.72 -3.51 -6.15 -4.6 -2.38 - -8.63 -9.15 -4.35 -12.99 -11.5 -13.03 -8.32 -11.79 -8.85 -10.32 -7.05 - - - - - - - - -
-8.65 -8.23 -3.26 -6.04 -3.76 -2.23 -7.18 1.98 2.88 3.75 3.42 -2.92 1.18 -4.37 -1.04 -8.12 -5.84 -3.51 3.12 -4.79 - -8.64 - -3.49 -5.13 -4.77 -2.72 - - -8.49 -4.51 - - - -9.45 - -8.57 -11.46 -8.12 - - - - - - - - -
-7.92 -7.01 -3.81 -8.57 -4.49 -1.48 -6.13 2.65 1.84 3.93 2.0 -5.14 2.48 -3.97 0.32 -6.4 -5.94 -3.59 3.43 -3.26 -8.29 -9.82 -11.89 -3.71 -5.85 -4.4 -2.25 - -8.22 -8.84 -4.23 -11.43 -13.48 - -8.29 -12.86 -8.08 -9.83 -6.61 - - - - - -12.78 - - -
-3.47 -1.99 -2.85 -2.99 -3.08 -1.72 -2.87 1.73 2.67 3.17 2.96 -0.43 -0.15 -1.34 -0.21 -2.11 -1.29 -1.86 3.08 -1.71 -1.8 -2.61 -2.58 -1.77 -4.06 -1.9 -0.72 -3.14 -2.32 -6.07 -2.24 -2.27 -3.1 -2.28 -3.09 -2.59 -2.35 -2.54 -2.37 -2.52 0.51 -0.15 -0.52 -1.8 -1.45 -4.84 -8.7 -2.19
-4.05 -3.32 -3.86 -6.51 -4.32 -1.31 -4.57 2.54 2.4 3.83 2.39 -5.24 2.3 -3.76 -1.03 -6.43 -6.24 -3.89 3.39 -3.03 -5.95 -6.1 -6.75 -3.88 -6.03 -4.77 -2.83 -6.66 -5.78 -11.83 -3.58 -11.26 -10.05 -12.84 -8.46 -8.65 -9.33 -8.72 -6.9 -4.17 -11.8 -9.13 -11.3 - -11.56 -8.74 - -12.98

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.