Heatmap: Cluster_1 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.43 0.73 -1.16 -1.09 -2.39 -7.3 -1.29 -5.28 -7.39 -5.0 -6.5 -3.34 -4.2 0.05 -0.03 -1.46 -4.06 -3.52 -2.2 0.95 2.43 -2.41 -1.11 -1.81 -2.21 -1.71 -1.46 -1.62 -0.02 -2.21 -0.01 -0.54 -0.81 1.66 -0.88 -2.02 0.5 0.23 0.66 -1.64 -2.23 3.31 1.71 -1.22 0.38 -3.79 1.81 -1.04
0.35 0.44 1.16 1.26 0.56 -1.43 1.06 -7.54 -6.15 -6.69 -5.63 - -7.74 0.17 0.02 -0.46 -0.53 -0.83 -0.92 0.46 -0.14 -0.04 0.51 -0.35 -1.46 -0.6 -1.23 0.56 0.85 -2.01 0.31 0.59 -0.45 0.01 0.62 -0.02 0.59 0.28 -0.3 -2.36 -2.66 0.46 0.29 1.08 0.53 -0.48 1.31 0.53
-0.65 0.44 0.48 0.34 -0.15 -0.51 0.68 -1.49 -1.93 -1.85 -2.66 0.7 -1.68 0.08 -0.28 0.3 -0.94 -0.63 -0.59 0.92 0.47 1.18 1.26 -0.3 -0.04 -0.5 -1.04 0.76 -1.47 -0.72 0.23 0.68 -0.9 -0.6 0.93 -0.46 0.33 0.13 -0.21 -2.24 0.49 -1.94 -1.86 0.8 -0.57 - 1.88 -0.79
0.22 0.32 -0.48 0.03 -0.26 -0.38 0.1 -1.19 -1.94 -2.3 -2.42 -10.79 -2.62 0.05 -1.18 0.62 -0.1 0.04 -0.76 0.26 0.16 0.26 0.21 0.22 -0.71 0.48 1.22 -0.04 0.71 -0.98 0.07 -0.06 -0.16 0.34 -0.43 0.18 1.21 0.44 0.8 -1.7 -1.16 0.72 -0.06 0.27 -0.2 -0.67 1.52 -0.6
2.34 -0.13 1.53 1.26 1.54 0.32 1.1 -4.81 -5.11 -5.23 -4.58 -4.95 -2.46 -0.71 -2.25 -1.13 -0.83 -0.37 -1.51 0.04 0.07 -0.45 0.57 -0.93 -0.93 -1.67 -2.66 0.2 -0.6 -1.34 0.22 0.97 -1.71 -1.27 0.69 -0.46 -0.86 -0.44 -1.63 -2.64 -5.94 -1.51 -0.58 1.2 0.93 - 1.63 1.49
1.1 1.23 -1.25 -0.43 -0.9 -3.21 -0.78 -6.67 -7.62 -7.74 -5.32 - -4.2 0.5 0.91 -0.34 -0.44 -0.23 -0.53 0.8 0.3 -0.17 0.45 -0.6 -2.04 -0.48 -0.09 0.55 0.98 -2.63 0.34 0.34 0.23 0.24 0.53 -0.23 0.91 0.08 0.3 -0.54 0.15 0.33 0.24 0.12 0.13 1.26 1.26 -0.46
-0.28 -0.21 0.81 0.99 0.83 0.84 1.12 -2.11 -1.57 -4.83 -3.51 -10.44 -3.47 -0.51 -0.47 -0.1 0.31 0.61 -1.13 0.16 -0.31 -0.43 -0.04 -0.13 -2.1 -0.05 -0.73 0.69 -0.07 -2.39 0.2 0.09 -0.16 0.37 0.06 -0.03 0.45 0.13 1.88 -3.17 -4.06 0.12 0.73 0.08 0.48 -1.23 0.91 0.19
0.36 0.67 -0.33 -0.31 -1.23 -2.43 -0.32 -4.76 -3.88 -7.22 -5.41 -6.03 -5.4 0.83 0.13 0.03 0.21 -0.83 -0.65 0.74 -0.15 0.47 0.82 -0.58 0.25 -0.43 1.0 0.97 1.01 -0.04 -0.14 0.2 0.02 0.21 0.49 -0.3 0.54 0.07 0.94 0.72 0.57 -0.03 -0.47 0.76 -0.04 -1.8 0.16 -0.59
-0.22 0.69 0.98 0.28 0.84 -0.11 0.51 -3.26 -2.59 -3.79 -3.59 -6.22 -3.01 0.28 0.43 0.32 0.56 -0.32 -1.56 0.33 0.41 1.17 1.04 0.26 -1.3 0.42 -0.5 0.44 -0.92 -1.28 -0.58 0.18 0.36 -0.5 -0.37 0.3 -0.84 0.4 -0.41 -0.6 -2.46 -0.54 -0.26 0.48 -0.53 -6.03 2.23 -0.34
0.3 0.9 -0.14 -0.06 -0.34 -0.45 -0.0 -2.02 -2.63 -3.61 -3.28 -0.05 -2.95 0.07 0.32 0.16 0.02 -0.59 -1.19 0.79 -0.56 0.01 0.27 -0.32 -0.88 -0.04 0.03 0.26 0.56 -0.83 0.34 -0.37 -0.31 -0.21 0.14 -0.09 0.82 0.15 1.24 -1.34 -0.13 -0.09 -0.09 0.55 -0.36 0.03 1.99 -0.54
1.2 -0.1 0.37 0.46 0.18 -0.15 0.51 -0.94 -1.66 -3.56 -2.8 -8.52 -3.74 -0.04 -1.18 -0.46 -0.06 -0.09 -1.11 -0.13 -0.03 -0.45 -0.21 -0.63 -1.55 -0.52 0.18 -0.44 0.63 -2.16 -0.15 -0.19 -0.72 0.25 -0.41 -0.02 0.58 -0.26 0.47 -0.63 1.73 0.25 0.81 -0.24 0.85 1.7 0.49 -0.09
1.74 -3.71 0.02 1.63 -0.25 1.35 1.48 - - - - - - -3.4 - - - -0.83 -0.67 - - - -1.39 - -1.78 -3.41 -0.24 - -1.15 -2.14 - - -1.98 - -2.33 -1.37 - -1.4 -2.56 - - - - - - 4.23 3.4 -
0.31 0.0 -5.68 -3.44 -5.81 -6.58 -3.04 - -8.12 - -6.77 -7.28 - -1.64 -3.91 -4.58 -4.92 0.22 -2.23 -2.86 -4.28 -8.22 -4.78 1.79 -4.81 -0.12 -4.63 -1.44 4.16 -3.45 1.63 -6.25 -7.41 -6.83 -7.19 -4.78 -2.54 -4.81 -7.73 -3.21 -7.36 -5.79 - - - 0.9 3.93 -8.92
1.65 0.16 2.01 1.99 1.35 -1.15 1.59 -5.91 -3.63 -5.68 -4.21 -3.4 -6.19 -0.45 0.0 -1.58 -1.88 -1.12 -1.61 0.52 -0.02 0.25 1.12 -1.09 -1.4 -2.22 -4.08 0.54 0.05 -1.49 0.38 0.34 -1.3 -2.12 0.31 -0.94 -1.73 -0.28 -2.99 -3.02 -5.89 -1.99 -1.01 1.64 0.38 -2.72 1.6 0.91
0.84 0.65 -0.01 0.79 -0.04 -0.19 0.89 -2.18 -2.03 -3.99 -3.29 -5.98 -1.87 0.83 -0.0 -0.47 -0.07 -0.79 -0.69 0.26 -0.07 -0.89 -0.73 -0.32 0.45 -0.38 0.29 -0.69 0.81 0.37 0.25 -1.1 -0.88 -0.36 -0.71 -0.22 0.16 -0.21 1.19 -0.02 0.93 0.81 0.07 -0.87 -0.25 0.13 1.7 -1.36
1.47 0.99 0.44 -0.57 0.6 0.15 -0.51 -2.08 -2.31 -5.47 -2.59 -4.07 -3.91 0.37 -0.06 -0.11 -0.28 -0.92 -1.99 0.66 0.06 0.07 0.25 -0.72 -0.72 -0.45 0.03 0.09 -1.38 -0.91 -0.04 -0.37 -0.45 -0.52 -0.56 -0.37 0.28 0.21 0.44 -1.69 -1.2 0.57 0.21 1.08 -0.6 1.12 2.28 -0.04
1.16 0.25 0.32 0.17 0.03 -0.78 0.09 -1.06 -2.35 -4.34 -4.72 -8.3 -2.88 0.17 -0.59 -0.27 0.03 0.14 -1.23 0.12 -0.36 -0.04 0.4 -0.19 -1.26 -0.11 -0.19 0.51 1.12 -1.67 0.02 -0.09 -0.45 0.18 -0.16 0.17 0.08 0.07 0.08 -0.43 1.63 0.21 0.73 0.21 1.03 0.55 -0.23 0.17
0.04 0.96 -0.66 -0.69 -1.13 -2.47 -0.94 -4.87 -5.23 -5.38 -5.62 - -3.92 0.37 0.85 -0.21 -0.12 -0.74 -0.93 0.95 -0.27 -0.14 0.33 -0.33 -0.25 -0.26 0.4 0.58 2.3 -0.11 0.45 -0.26 -0.2 -0.16 0.34 -0.32 0.97 0.09 1.18 -1.22 0.09 -0.3 -0.58 0.09 -0.37 -5.04 1.9 -1.02
1.86 1.15 -0.75 -0.58 -0.78 -2.18 -0.86 -2.47 -2.0 -1.29 -1.47 -4.48 -1.84 -0.33 -0.18 -1.08 -2.12 -1.4 -0.16 1.05 -1.95 -0.62 0.09 -1.43 -0.26 -1.98 -0.43 1.56 1.0 -0.0 1.01 -1.0 -1.19 -1.14 1.12 -1.06 -0.2 -0.38 0.34 -0.36 1.25 -0.79 -1.06 0.37 -1.19 0.2 2.46 -0.79
0.86 0.61 0.59 -0.08 0.19 -1.18 -0.1 -3.35 -4.46 -6.27 -6.74 -7.68 -6.5 0.07 -0.39 -0.16 -0.22 -0.41 -0.69 1.16 0.01 0.18 0.72 -0.37 -0.61 -0.42 -0.58 1.13 0.38 -0.85 0.76 0.33 -0.02 0.03 0.86 -0.32 0.65 0.12 0.91 -3.14 -1.31 -0.89 -0.39 1.19 0.61 0.42 0.51 0.24
2.43 0.84 1.24 1.03 0.38 -1.9 0.66 -10.04 -8.87 -7.28 -5.96 - - 0.16 -0.39 -0.68 -1.15 -1.4 -1.44 0.64 -0.24 -0.42 -0.02 -0.67 0.05 -0.81 -0.96 0.63 0.77 -0.52 0.43 -0.4 -0.61 -0.47 -0.19 -0.74 0.64 -0.35 0.48 -1.0 1.43 -0.67 -1.0 0.38 -0.47 -2.99 1.53 -0.65
0.33 0.56 0.93 0.62 0.58 -0.23 0.59 -1.99 -2.98 -2.64 -3.44 -3.15 -2.47 0.07 0.65 0.34 1.84 0.41 -1.01 0.17 0.19 0.14 0.27 -0.01 -1.07 -0.01 0.3 -0.15 -0.06 -0.9 0.38 0.03 -0.67 -0.52 -0.32 -0.02 0.68 -0.15 -0.25 -3.6 -3.63 0.04 0.11 -0.37 -0.57 0.41 1.48 -1.05
0.36 1.25 -0.32 -1.2 -1.32 -5.23 -1.54 -7.21 -7.3 -7.48 -6.91 -6.5 -6.28 0.46 -0.17 0.16 0.12 0.02 -0.84 1.16 -0.06 0.08 0.52 -0.05 -0.36 -0.01 0.27 1.24 1.28 -0.92 0.97 0.1 0.18 0.33 0.7 -0.4 0.49 0.15 0.86 -1.2 0.51 0.09 -0.1 0.5 0.27 -7.99 0.99 -0.57
-2.36 0.3 0.37 0.43 0.78 0.86 0.61 -0.37 -0.13 -0.28 -0.12 -1.82 -1.71 0.32 0.49 -0.1 -0.1 -0.33 0.18 -0.24 -0.06 -0.35 0.08 -0.37 -1.61 -0.24 0.32 -0.27 1.13 -1.92 -0.19 0.26 -0.7 0.03 -0.25 0.02 0.42 -0.24 0.43 -2.71 -0.54 1.47 -0.04 0.02 0.61 -3.82 0.27 -0.33
0.77 1.27 0.2 0.72 -0.03 -0.65 0.36 -2.62 -3.58 -5.61 -5.13 -3.03 -2.68 0.29 -0.35 -0.62 -0.54 -0.67 -1.14 1.21 -0.51 -0.18 0.62 -0.51 -1.65 -0.75 -1.11 1.46 0.25 -1.68 0.9 -0.38 -0.44 -0.28 0.98 -0.68 -0.06 0.12 -0.18 -2.38 -0.69 -0.9 -0.51 0.9 0.18 1.93 0.95 -0.14
0.53 0.87 0.72 0.45 -0.06 -1.76 0.32 -5.79 -6.67 -7.44 -7.15 -5.81 - -0.03 0.56 0.01 -0.23 -0.54 -1.24 1.03 -0.32 0.2 0.59 -0.61 -1.09 -0.67 -2.36 1.61 0.24 -1.65 0.23 0.06 -0.06 -0.31 0.79 -0.44 -0.56 0.02 -0.76 -1.77 -3.17 -1.45 -0.4 1.05 -0.2 -0.31 2.77 -0.11
0.05 0.79 -1.07 -0.51 -1.11 -1.14 -0.41 -1.38 -0.89 -1.94 -1.33 -5.71 -3.9 0.83 -0.73 -0.0 0.16 0.36 -0.27 0.61 0.32 -0.49 -0.23 0.08 -0.84 -0.01 0.84 0.11 1.75 -1.08 0.72 -0.16 -0.59 0.39 0.63 -0.21 0.87 0.18 0.7 -1.38 -0.36 0.58 0.36 -0.04 0.13 -1.27 0.92 -0.62
1.1 0.69 0.08 0.04 -0.41 -1.41 -0.27 -2.57 -3.21 -6.0 -5.67 -7.67 -4.08 0.55 0.16 -0.16 -0.03 -0.42 -0.95 0.44 -0.42 -0.18 0.31 -0.41 -1.27 -0.44 0.57 0.41 1.13 -1.65 0.3 0.1 -0.22 0.18 0.34 -0.52 0.43 -0.1 0.64 -0.81 0.83 0.75 0.43 0.39 0.39 0.83 0.92 -0.18
0.32 1.36 -0.13 0.09 -0.03 -0.46 -0.01 -3.76 -3.7 -6.84 -6.14 - - 1.12 0.3 0.84 0.02 -0.09 -1.57 1.03 -0.02 0.28 0.39 -0.7 -2.14 -0.93 -0.64 0.75 -0.89 -2.87 0.7 -0.16 -0.84 -0.48 0.41 0.29 0.52 0.46 -2.06 -3.64 -1.47 0.31 0.04 1.04 0.08 -3.0 2.44 0.19
0.74 -0.03 1.02 1.04 0.8 -0.23 0.87 -1.01 -1.57 -2.0 -1.6 -8.77 -1.81 -0.12 0.42 -0.47 -0.7 -0.87 -0.55 -0.05 -0.28 -0.19 0.13 -0.34 -0.23 -0.47 1.04 0.09 0.77 -0.51 -0.0 0.24 -0.83 -0.63 0.14 -0.55 -0.09 -0.47 0.08 -2.58 -3.18 -0.28 -0.44 0.13 0.04 0.9 2.06 -0.36
0.29 0.43 1.45 1.2 0.73 0.26 1.02 -2.69 -3.37 -5.1 -5.39 - -7.41 -0.04 1.02 -0.49 -0.77 -0.95 -2.13 0.36 -0.76 0.14 1.0 -0.36 -1.53 -0.58 -0.86 1.0 -0.05 -1.78 -0.03 0.08 -0.26 -0.84 0.84 -0.12 0.4 0.12 -1.22 -6.25 -6.14 -1.04 -0.01 1.04 0.54 0.81 1.09 0.78
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1.71 0.82 -4.6 -1.38 -3.81 -6.54 -2.44 - - - - -6.27 -5.53 1.09 1.37 -0.42 -0.15 0.23 -2.0 0.93 -0.93 0.22 0.41 0.04 -3.25 -0.13 -0.58 -0.08 0.52 -5.06 0.22 -1.42 -0.32 -0.41 0.62 0.75 -0.52 0.46 -1.4 -2.34 -2.06 0.48 -0.08 0.49 0.19 -1.78 3.25 -1.0
-1.75 1.3 -4.71 -3.75 -3.6 -3.52 -3.3 -3.86 -5.72 -6.39 -8.93 -2.39 -5.26 0.72 0.5 -0.01 1.19 0.55 -1.11 1.05 0.13 0.2 0.24 0.43 -2.3 0.66 -0.36 0.9 0.0 -3.25 0.46 -0.1 -0.06 1.15 0.14 0.34 -0.53 -0.07 -0.75 -0.91 -3.13 2.04 1.21 -1.45 0.97 -0.47 1.74 -1.74
-0.94 0.66 -0.48 0.17 -0.23 -1.04 0.08 -2.04 0.3 -0.61 0.46 -4.56 -2.11 0.35 0.12 0.38 0.19 -0.25 -0.67 0.64 0.36 0.49 0.52 0.01 -0.5 0.09 0.4 -0.06 0.49 -0.73 0.14 0.41 -0.42 0.03 -0.18 -0.1 0.52 0.04 1.19 -2.43 -2.36 -0.72 -0.21 0.05 -0.67 0.61 1.36 -1.02
0.2 -0.63 -0.97 -1.87 -1.4 -1.99 -2.18 0.51 0.56 0.62 0.77 -6.1 -2.29 -0.3 -0.02 -0.51 -0.1 -0.42 0.55 -0.59 0.01 -0.65 -0.56 -0.53 -1.42 -0.46 0.33 -1.05 0.31 -1.97 -0.76 -0.16 -0.41 0.27 -0.86 0.41 0.44 -0.1 0.63 0.4 0.31 0.46 0.75 -0.25 0.55 2.36 0.66 -0.35
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1.31 1.18 0.42 -0.19 0.3 -0.88 0.05 -1.68 -1.72 -1.75 -1.1 -7.34 -1.99 0.12 1.1 0.1 0.31 -0.15 -0.68 0.79 0.13 -0.1 0.35 -0.17 -1.07 -0.14 -0.03 0.05 0.72 -1.05 0.52 -0.4 -0.51 -0.44 0.15 0.15 0.43 0.19 -0.08 -3.16 -2.58 0.25 -0.02 0.39 -0.66 - 1.9 -0.63
-0.9 1.03 -0.08 -0.31 -0.22 -0.66 -0.06 -2.75 -1.74 -2.69 -2.59 -2.47 -1.15 0.34 0.21 0.48 -0.47 -0.44 -0.39 1.04 0.66 1.06 1.05 0.16 -0.12 -0.03 -3.02 0.68 1.04 0.32 0.8 0.73 -0.13 -0.06 0.58 0.08 -0.25 0.29 -0.45 -2.86 -3.12 -1.17 -0.37 0.49 -0.52 - 1.49 -0.06
0.9 0.93 0.01 -0.04 -0.15 -0.82 -0.1 -2.34 -2.47 -4.05 -3.72 -2.84 -3.01 0.13 0.43 -0.44 -0.33 -0.81 -1.09 1.2 -0.38 0.09 0.68 -0.39 -0.37 -0.59 0.0 0.9 0.53 -0.56 0.52 0.25 -0.51 -0.64 0.82 -0.62 0.11 -0.11 -0.38 -0.82 -3.01 -0.42 -0.06 0.77 0.0 0.34 2.24 -0.17
0.15 0.69 -1.75 -2.46 -2.09 -3.4 -1.77 -6.76 -5.1 -6.26 -6.25 - -4.76 0.36 0.24 0.25 -0.37 -0.94 -0.64 0.71 -1.02 -0.47 0.34 -0.06 0.13 0.38 0.69 -0.03 0.61 -0.44 -0.78 -0.29 -0.15 0.27 0.47 -0.24 1.89 0.46 1.09 2.03 0.62 1.09 -0.63 -1.39 -0.55 -3.81 1.77 -2.03
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.