Heatmap: Cluster_237 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.04 0.02 0.02 0.0 0.01 0.19 0.01 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.06 0.06 0.69 0.2 1.0 0.07 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.66 0.03 0.14 0.11 0.11 0.08 0.03 0.01 0.03 0.04 0.01 0.03 0.33 0.46 0.08 0.06 0.03 0.04 0.3 0.03 0.06 0.09 0.11 0.04 0.14 0.29 0.18 0.11 0.03 0.17 0.02 0.14 0.08 0.07 0.13 0.41 0.2 1.0 0.0 0.03 0.07 0.1 0.13 0.05 0.47 0.0 0.05
0.06 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.1 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.09 0.07 0.21 1.0 0.0 0.09 0.01 0.01 0.02 0.04 0.04 0.0 0.0 0.63 0.06 0.28 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.51 0.33 0.34 0.1 0.29 0.06 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.05 0.15 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.05 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.47 0.06 1.0 0.0 0.0 0.2 0.03 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0
0.09 0.13 0.15 0.14 0.14 0.1 0.13 0.12 0.08 0.06 0.1 0.55 0.07 0.46 0.16 0.25 0.2 0.1 0.22 0.1 0.3 0.09 0.08 0.15 0.27 0.25 1.0 0.08 0.12 0.28 0.1 0.1 0.08 0.08 0.07 0.1 0.24 0.14 0.57 0.06 0.08 0.1 0.06 0.06 0.04 0.0 0.09 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.34 0.18 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.06 0.03 0.51 0.97 0.19 0.01 0.06 0.04 0.14 0.04 0.15 0.02 0.13 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.04 0.01 0.03 0.01 0.42 0.28 0.06 1.0 0.03 0.0 0.12 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.04 0.1 0.1 0.35 0.07 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0 0.02 0.94 0.06 1.0 0.08 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.08 0.01 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.35 0.59 0.01 0.03 0.02 0.04 0.21 0.39 0.17 0.23 0.04 0.45 0.8 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.37 0.04 0.03 0.16 0.62 0.38 0.72 0.05 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.13 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.28 0.14 0.02 0.04 0.09 0.02 0.03 0.01 0.11 0.19 0.1 0.28 0.0 0.01 0.11 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.08 0.8 0.08 1.0 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.12 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 0.04 0.01 0.05 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.2 0.18 0.01 0.2 1.0 0.17 1.0 0.07 0.0 0.36 0.03 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.01 0.13 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.23 0.0 0.0 0.0 0.01 0.43 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.01 0.02 0.02 0.06 0.14 1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.23 0.1 1.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.03 0.15 0.2 0.2 0.28 0.29 0.18 0.26 0.11 0.19 0.0 0.14 0.05 0.04 0.12 0.05 0.08 0.12 0.03 0.1 0.11 0.09 0.04 0.26 0.05 0.1 0.15 0.06 0.22 0.01 0.44 0.1 0.2 0.04 0.08 0.24 0.13 1.0 0.14 0.14 0.19 0.11 0.08 0.04 0.0 0.02 0.02
0.08 0.2 0.07 0.01 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.18 0.35 0.16 0.08 0.01 0.2 0.05 0.15 0.12 0.2 0.06 0.29 0.28 0.05 0.07 0.02 0.1 0.08 0.26 0.44 0.09 0.14 1.0 0.23 0.42 0.02 0.0 0.54 0.04 0.05 0.08 0.0 0.0 0.02
0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.07 0.01 0.02 0.01 0.04 0.01 0.05 0.05 0.02 0.01 0.04 0.1 0.08 0.01 0.0 0.01 0.04 0.08 0.1 0.02 0.02 0.22 0.05 1.0 0.54 0.14 0.13 0.06 0.01 0.04 0.0 0.0 0.02
0.19 0.07 0.15 0.38 0.56 0.62 0.55 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.11 0.05 0.08 0.06 0.05 0.02 0.09 0.09 0.04 0.05 0.07 0.07 0.07 0.05 0.09 0.1 0.08 0.04 0.06 0.05 0.08 0.06 0.2 0.5 0.12 1.0 0.17 0.23 0.09 0.07 0.1 0.05 0.0 0.11 0.05
0.22 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.11 0.06 0.1 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.1 0.06 0.11 0.31 0.0 0.14 0.01 0.01 0.07 0.03 0.1 0.01 0.3 1.0 0.07 0.73 0.05 0.34 0.17 0.07 0.01 0.04 0.0 0.17 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.02 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.05 1.0 0.05 0.65 0.01 0.02 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.3 0.05 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.13 0.17 0.06 0.01 0.1 0.09 0.03 0.05 0.16 0.01 0.22 0.13 0.03 0.03 0.0 0.05 0.02 0.06 0.07 0.03 0.23 0.64 0.11 1.0 0.1 0.02 0.12 0.05 0.02 0.05 0.0 0.11 0.02
0.0 0.03 0.02 0.1 0.07 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.41 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 0.05 0.06 0.01 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.23 0.26 0.12 0.07 0.11 0.03 0.06 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.24 0.17 0.3 0.14 0.11 0.06 0.23 0.16 0.26 0.22 0.15 0.11 0.2 0.22 0.36 0.22 0.12 0.15 0.19 0.14 0.18 0.12 0.15 0.6 0.23 1.0 0.14 0.25 0.11 0.07 0.06 0.11 0.0 0.02 0.03
0.14 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.2 0.05 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.03 0.04 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.08 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.04 0.07 0.02 0.11 0.49 0.08 1.0 0.09 0.06 0.16 0.02 0.03 0.03 0.0 0.34 0.02
0.04 0.15 0.04 0.01 0.06 0.07 0.01 0.06 0.03 0.05 0.03 0.01 0.51 0.15 0.08 0.09 0.09 0.06 0.05 0.16 0.05 0.04 0.06 0.07 0.02 0.11 0.08 0.19 0.06 0.01 0.06 0.06 0.05 0.07 0.05 0.13 0.25 0.11 1.0 0.02 0.0 0.52 0.24 0.07 0.12 0.03 0.0 0.05
0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.21 0.03 0.02 0.01 0.1 0.02 0.1 0.14 0.07 0.0 0.08 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.04 0.02 0.13 0.3 1.0 0.07 0.68 0.01 0.0 0.08 0.01 0.02 0.07 0.0 0.0 0.01
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.02 0.03 0.03 0.06 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.16 0.2 0.02 0.11 0.26 0.12 1.0 0.11 0.52 0.46 0.14 0.03 0.07 0.0 0.0 0.05
0.03 0.06 0.55 0.3 0.15 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.07 0.04 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.05 0.13 0.06 0.02 0.07 0.17 0.15 0.02 0.0 0.04 0.04 0.1 0.05 0.09 0.05 0.21 0.07 1.0 0.3 0.28 0.18 0.01 0.1 0.05 0.0 0.0 0.05
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.06 0.0 0.02 0.12 0.03 1.0 0.06 0.1 0.07 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.04 0.12 1.0 0.02 0.01 0.04 0.02 0.0 0.11 0.0 0.15 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.21 0.04 0.43 0.0 0.04 0.05 0.03 0.09 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.03 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.12 0.53 0.02 0.01 0.12 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.39 0.01 0.23 0.02 0.01 0.02 0.2 0.25 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.01 0.17 0.0 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.05 0.02 0.49 0.16 0.92 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.08 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.06 0.03 1.0 0.01 0.0 0.08 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.06 0.21 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.04 0.02 0.01 0.05 0.62 0.09 1.0 0.04 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.02 0.0 0.11 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.12 0.4 0.13 1.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.23 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.02 0.03 0.13 0.03 0.02 0.01 0.07 0.02 0.02 0.01 0.06 0.02 0.05 0.07 0.0 0.05 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0 0.08 0.96 0.06 1.0 0.02 0.02 0.07 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.04 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.07 0.02 0.04 0.47 0.15 1.0 0.03 0.03 0.17 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.1 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.04 0.46 0.06 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.21 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.02 0.02 0.05 0.0 0.05 0.0 0.02 0.06 0.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.0 0.04 0.27 0.21 0.42 0.06 0.0 0.52 0.11 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0
0.01 0.28 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.07 0.15 0.03 0.03 0.06 0.27 0.04 0.24 0.19 0.12 0.08 0.19 0.67 0.26 0.03 0.05 0.14 0.14 0.21 0.24 0.17 0.14 1.0 0.33 0.44 0.01 0.02 0.81 0.48 0.05 0.2 0.0 0.0 0.08
0.02 0.09 0.04 0.03 0.04 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.05 0.03 0.04 0.04 0.07 0.05 0.05 0.04 0.04 0.02 0.05 0.2 0.09 0.05 0.01 0.04 0.05 0.06 0.13 0.05 0.03 0.33 0.08 0.12 0.0 0.0 1.0 0.18 0.1 0.11 0.05 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.16 0.08 1.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 0.43 0.34 0.28 0.17 0.29 0.13 0.18 0.04 0.07 0.0 0.16 0.06 0.03 0.05 0.01 0.02 0.06 0.04 0.02 0.05 0.02 0.03 0.01 0.04 0.05 0.07 0.02 0.01 0.02 0.09 0.09 0.15 0.05 0.12 0.23 0.17 0.27 0.02 0.11 1.0 0.23 0.01 0.16 0.02 0.0 0.02
0.2 0.2 0.05 0.12 0.07 0.03 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.31 0.12 0.35 0.46 0.07 0.19 1.0 0.07 0.06 0.22 0.26 0.26 0.35 0.04 0.1 0.31 0.15 0.06 0.08 0.13 0.06 0.05 0.61 0.13 0.27 0.0 0.02 0.14 0.01 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0
0.34 0.72 0.55 0.48 0.41 0.14 0.32 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.5 0.87 0.59 0.77 0.5 0.13 0.65 0.54 0.6 0.75 0.47 0.14 0.55 0.3 0.27 0.17 0.1 0.63 0.4 0.55 0.54 0.43 0.76 1.0 0.68 0.61 0.43 0.0 0.45 0.82 0.65 0.57 0.0 0.0 0.37
0.19 0.07 0.14 0.1 0.1 0.04 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.11 0.07 0.03 0.05 0.12 0.11 0.04 0.04 0.1 0.06 0.14 0.17 0.1 0.14 0.06 0.05 0.07 0.06 0.07 0.02 0.24 0.36 0.07 1.0 0.24 0.08 0.11 0.03 0.02 0.04 0.06 0.19 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.05 0.09 0.0 0.01 0.48 0.06 1.0 0.08 0.09 0.19 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.15 0.22 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.11 0.25 0.5 0.24 0.07 0.29 0.09 0.11 0.07 0.21 0.13 0.21 0.66 0.12 0.48 0.07 0.09 0.09 0.11 0.15 0.05 0.23 0.83 0.2 1.0 0.09 0.1 0.3 0.19 0.02 0.08 0.45 0.02 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)